MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 1154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GCGTG	2	10	5981	5990	0 %	20 %	60 %	20 %	384538255
2	NC_017326	GGCTC	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	384538255
3	NC_017326	TGCCG	2	10	7688	7697	0 %	20 %	40 %	40 %	384538257
4	NC_017326	GCGCC	2	10	9097	9106	0 %	0 %	40 %	60 %	384538258
5	NC_017326	CCGCG	2	10	10132	10141	0 %	0 %	40 %	60 %	384538260
6	NC_017326	CAAGC	2	10	10498	10507	40 %	0 %	20 %	40 %	384538260
7	NC_017326	GCGCC	2	10	10860	10869	0 %	0 %	40 %	60 %	384538260
8	NC_017326	GTAAT	2	10	15045	15054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017326	CCGAG	2	10	17191	17200	20 %	0 %	40 %	40 %	384538266
10	NC_017326	GGCTC	2	10	17658	17667	0 %	20 %	40 %	40 %	384538267
11	NC_017326	GGATG	2	10	18793	18802	20 %	20 %	60 %	0 %	384538269
12	NC_017326	CGCAG	2	10	19606	19615	20 %	0 %	40 %	40 %	384538270
13	NC_017326	GCCGA	2	10	20115	20124	20 %	0 %	40 %	40 %	384538270
14	NC_017326	GCCGG	2	10	21992	22001	0 %	0 %	60 %	40 %	384538272
15	NC_017326	TGACG	2	10	25114	25123	20 %	20 %	40 %	20 %	384538274
16	NC_017326	GCCAG	2	10	25720	25729	20 %	0 %	40 %	40 %	384538274
17	NC_017326	GAGGG	2	10	28218	28227	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017326	GGTCG	2	10	28575	28584	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017326	GCTCG	2	10	29577	29586	0 %	20 %	40 %	40 %	384538277
20	NC_017326	GCCCT	2	10	30976	30985	0 %	20 %	20 %	60 %	384538277
21	NC_017326	TCCAC	2	10	32514	32523	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017326	CGATC	2	10	32904	32913	20 %	20 %	20 %	40 %	384538279
23	NC_017326	CCGCA	2	10	38226	38235	20 %	0 %	20 %	60 %	384538283
24	NC_017326	TCGCC	2	10	40215	40224	0 %	20 %	20 %	60 %	384538285
25	NC_017326	CGGCC	2	10	41805	41814	0 %	0 %	40 %	60 %	384538285
26	NC_017326	GAAAA	2	10	42413	42422	80 %	0 %	20 %	0 %	384538286
27	NC_017326	TCCGG	2	10	42768	42777	0 %	20 %	40 %	40 %	384538286
28	NC_017326	CGGCG	2	10	44289	44298	0 %	0 %	60 %	40 %	384538287
29	NC_017326	TGTCA	2	10	44340	44349	20 %	40 %	20 %	20 %	384538287
30	NC_017326	CGCGG	2	10	44686	44695	0 %	0 %	60 %	40 %	384538288
31	NC_017326	TTCGC	2	10	45194	45203	0 %	40 %	20 %	40 %	384538288
32	NC_017326	ACGAA	2	10	47848	47857	60 %	0 %	20 %	20 %	384538290
33	NC_017326	CCGGT	2	10	48006	48015	0 %	20 %	40 %	40 %	384538290
34	NC_017326	CGGCA	2	10	49109	49118	20 %	0 %	40 %	40 %	384538291
35	NC_017326	CGTGC	2	10	49859	49868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017326	GGCGA	2	10	54530	54539	20 %	0 %	60 %	20 %	384538296
37	NC_017326	GCAGG	2	10	57090	57099	20 %	0 %	60 %	20 %	384538298
38	NC_017326	GGATG	2	10	59560	59569	20 %	20 %	60 %	0 %	384538301
39	NC_017326	TGCCG	2	10	60753	60762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017326	CGGGT	2	10	62932	62941	0 %	20 %	60 %	20 %	384538304
41	NC_017326	CTCGA	2	10	64304	64313	20 %	20 %	20 %	40 %	384538305
42	NC_017326	CTCGC	2	10	67580	67589	0 %	20 %	20 %	60 %	384538307
43	NC_017326	AACAC	2	10	68819	68828	60 %	0 %	0 %	40 %	384538308
44	NC_017326	CGGCG	2	10	73739	73748	0 %	0 %	60 %	40 %	384538313
45	NC_017326	GCCGA	2	10	77040	77049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017326	GGCCG	2	10	78543	78552	0 %	0 %	60 %	40 %	384538318
47	NC_017326	GGCGG	2	10	81740	81749	0 %	0 %	80 %	20 %	384538321
48	NC_017326	GTGGC	2	10	83173	83182	0 %	20 %	60 %	20 %	384538323
49	NC_017326	TGCGC	2	10	85489	85498	0 %	20 %	40 %	40 %	384538324
50	NC_017326	TGCCG	2	10	88649	88658	0 %	20 %	40 %	40 %	384538327
51	NC_017326	GGGAC	2	10	91712	91721	20 %	0 %	60 %	20 %	384538329
52	NC_017326	GATCG	2	10	92533	92542	20 %	20 %	40 %	20 %	384538331
53	NC_017326	GAAAT	2	10	93939	93948	60 %	20 %	20 %	0 %	384538333
54	NC_017326	TGTCG	2	10	95076	95085	0 %	40 %	40 %	20 %	384538334
55	NC_017326	GATGC	2	10	96528	96537	20 %	20 %	40 %	20 %	384538336
56	NC_017326	CGGAG	2	10	97112	97121	20 %	0 %	60 %	20 %	384538336
57	NC_017326	AGGGC	2	10	97544	97553	20 %	0 %	60 %	20 %	384538336
58	NC_017326	TGCCG	2	10	100543	100552	0 %	20 %	40 %	40 %	384538339
59	NC_017326	GGCCG	2	10	102598	102607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017326	GGCCC	2	10	105770	105779	0 %	0 %	40 %	60 %	384538345
61	NC_017326	TCGGC	2	10	106403	106412	0 %	20 %	40 %	40 %	384538345
62	NC_017326	CGGTC	2	10	107283	107292	0 %	20 %	40 %	40 %	384538346
63	NC_017326	GGCGA	2	10	108205	108214	20 %	0 %	60 %	20 %	384538346
64	NC_017326	TCGCC	2	10	108471	108480	0 %	20 %	20 %	60 %	384538346
65	NC_017326	GGCCA	2	10	114456	114465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017326	AGATC	2	10	114489	114498	40 %	20 %	20 %	20 %	384538350
67	NC_017326	TCGTC	2	10	116661	116670	0 %	40 %	20 %	40 %	384538351
68	NC_017326	CGCGC	2	10	118459	118468	0 %	0 %	40 %	60 %	384538351
69	NC_017326	AGCGC	2	10	118695	118704	20 %	0 %	40 %	40 %	384538351
70	NC_017326	GCCTT	2	10	118964	118973	0 %	40 %	20 %	40 %	384538352
71	NC_017326	CCGAT	2	10	119584	119593	20 %	20 %	20 %	40 %	384538352
72	NC_017326	TCGCC	2	10	119837	119846	0 %	20 %	20 %	60 %	384538352
73	NC_017326	CAACT	2	10	122135	122144	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017326	CCGAC	2	10	125259	125268	20 %	0 %	20 %	60 %	384538355
75	NC_017326	GGCGA	2	10	125300	125309	20 %	0 %	60 %	20 %	384538355
76	NC_017326	TGCAG	2	10	126625	126634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017326	TTGCG	2	10	126683	126692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017326	TCGGC	2	10	127377	127386	0 %	20 %	40 %	40 %	384538358
79	NC_017326	GGCGA	2	10	128259	128268	20 %	0 %	60 %	20 %	384538359
80	NC_017326	GCTCG	2	10	128903	128912	0 %	20 %	40 %	40 %	384538359
81	NC_017326	CCTTG	2	10	133798	133807	0 %	40 %	20 %	40 %	384538364
82	NC_017326	GCCGC	2	10	136697	136706	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
83	NC_017326	GCCGC	2	10	137545	137554	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
84	NC_017326	ACGCG	2	10	138092	138101	20 %	0 %	40 %	40 %	384538367
85	NC_017326	TTCCT	2	10	140242	140251	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017326	GAAAG	2	10	140395	140404	60 %	0 %	40 %	0 %	384538370
87	NC_017326	GCCGG	2	10	141567	141576	0 %	0 %	60 %	40 %	384538372
88	NC_017326	GGGGA	2	10	141871	141880	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017326	TCGCC	2	10	146194	146203	0 %	20 %	20 %	60 %	384538377
90	NC_017326	AAGCG	2	10	146849	146858	40 %	0 %	40 %	20 %	384538377
91	NC_017326	AGCCG	2	10	148459	148468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017326	CATCG	2	10	148804	148813	20 %	20 %	20 %	40 %	384538379
93	NC_017326	TACGC	2	10	149827	149836	20 %	20 %	20 %	40 %	384538380
94	NC_017326	CGGCG	2	10	149881	149890	0 %	0 %	60 %	40 %	384538380
95	NC_017326	GCTCG	2	10	150106	150115	0 %	20 %	40 %	40 %	384538380
96	NC_017326	GGAAC	2	10	151157	151166	40 %	0 %	40 %	20 %	384538381
97	NC_017326	GCTCG	2	10	151795	151804	0 %	20 %	40 %	40 %	384538381
98	NC_017326	TCGCC	2	10	154131	154140	0 %	20 %	20 %	60 %	384538383
99	NC_017326	CGCGC	2	10	154735	154744	0 %	0 %	40 %	60 %	384538384
100	NC_017326	ACCGG	2	10	155278	155287	20 %	0 %	40 %	40 %	384538385
101	NC_017326	CCGCG	2	10	157965	157974	0 %	0 %	40 %	60 %	384538388
102	NC_017326	CAAAG	2	10	160340	160349	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017326	TCGGC	2	10	163655	163664	0 %	20 %	40 %	40 %	384538392
104	NC_017326	TCCGG	2	10	164523	164532	0 %	20 %	40 %	40 %	384538393
105	NC_017326	CGATG	2	10	164929	164938	20 %	20 %	40 %	20 %	384538393
106	NC_017326	TGGCA	2	10	165271	165280	20 %	20 %	40 %	20 %	384538394
107	NC_017326	ACGGC	2	10	168457	168466	20 %	0 %	40 %	40 %	384538397
108	NC_017326	CGCGT	2	10	168596	168605	0 %	20 %	40 %	40 %	384538398
109	NC_017326	CGGCG	2	10	171723	171732	0 %	0 %	60 %	40 %	384538400
110	NC_017326	TGTAT	2	10	174172	174181	20 %	60 %	20 %	0 %	384538401
111	NC_017326	GGGTC	2	10	174508	174517	0 %	20 %	60 %	20 %	384538401
112	NC_017326	TTGCG	2	10	174622	174631	0 %	40 %	40 %	20 %	384538401
113	NC_017326	GCCGG	2	10	175809	175818	0 %	0 %	60 %	40 %	384538402
114	NC_017326	GTGCG	2	10	176991	177000	0 %	20 %	60 %	20 %	384538403
115	NC_017326	TGATT	2	10	177040	177049	20 %	60 %	20 %	0 %	384538403
116	NC_017326	TCCTG	2	10	180191	180200	0 %	40 %	20 %	40 %	384538407
117	NC_017326	GCCCG	2	10	181032	181041	0 %	0 %	40 %	60 %	384538407
118	NC_017326	CGGCT	2	10	190242	190251	0 %	20 %	40 %	40 %	384538417
119	NC_017326	CCGGT	2	10	193652	193661	0 %	20 %	40 %	40 %	384538419
120	NC_017326	GGCGC	2	10	194096	194105	0 %	0 %	60 %	40 %	384538419
121	NC_017326	CGATC	2	10	197848	197857	20 %	20 %	20 %	40 %	384538421
122	NC_017326	GCCCA	2	10	198709	198718	20 %	0 %	20 %	60 %	384538422
123	NC_017326	AAGGG	2	10	200100	200109	40 %	0 %	60 %	0 %	384538423
124	NC_017326	GCCCG	2	10	201028	201037	0 %	0 %	40 %	60 %	384538424
125	NC_017326	GCGCG	2	10	202137	202146	0 %	0 %	60 %	40 %	384538426
126	NC_017326	GCGAC	2	10	202878	202887	20 %	0 %	40 %	40 %	384538426
127	NC_017326	GGGCA	2	10	208621	208630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017326	CAGCC	2	10	209258	209267	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017326	ACCTC	2	10	214178	214187	20 %	20 %	0 %	60 %	384538439
130	NC_017326	CGGCG	2	10	214994	215003	0 %	0 %	60 %	40 %	384538440
131	NC_017326	GCGAT	2	10	215056	215065	20 %	20 %	40 %	20 %	384538440
132	NC_017326	ATCCG	2	10	215092	215101	20 %	20 %	20 %	40 %	384538440
133	NC_017326	CGGCG	2	10	215700	215709	0 %	0 %	60 %	40 %	384538440
134	NC_017326	CTGCC	2	10	215899	215908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017326	GGCAG	2	10	216060	216069	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017326	TCTTG	2	10	217034	217043	0 %	60 %	20 %	20 %	384538441
137	NC_017326	GGGGC	2	10	221412	221421	0 %	0 %	80 %	20 %	384538445
138	NC_017326	CAGAA	2	10	221915	221924	60 %	0 %	20 %	20 %	384538445
139	NC_017326	TGCGC	2	10	222271	222280	0 %	20 %	40 %	40 %	384538446
140	NC_017326	AGCGC	2	10	223922	223931	20 %	0 %	40 %	40 %	384538448
141	NC_017326	GATCA	2	10	230419	230428	40 %	20 %	20 %	20 %	384538454
142	NC_017326	TTGAA	2	10	230594	230603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017326	AGGGA	2	10	230901	230910	40 %	0 %	60 %	0 %	384538455
144	NC_017326	CGGCG	2	10	231346	231355	0 %	0 %	60 %	40 %	384538456
145	NC_017326	GATGT	2	10	232278	232287	20 %	40 %	40 %	0 %	384538456
146	NC_017326	CAGTG	2	10	233301	233310	20 %	20 %	40 %	20 %	384538457
147	NC_017326	GGCCG	2	10	234147	234156	0 %	0 %	60 %	40 %	384538458
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149	NC_017326	TGCGA	2	10	235807	235816	20 %	20 %	40 %	20 %	384538459
150	NC_017326	GTCGC	2	10	236002	236011	0 %	20 %	40 %	40 %	384538459
151	NC_017326	GAGCG	2	10	240334	240343	20 %	0 %	60 %	20 %	384538464
152	NC_017326	GCATG	2	10	241553	241562	20 %	20 %	40 %	20 %	384538465
153	NC_017326	GGCCG	2	10	242710	242719	0 %	0 %	60 %	40 %	384538465
154	NC_017326	GCGCC	2	10	245781	245790	0 %	0 %	40 %	60 %	384538468
155	NC_017326	CCGGC	2	10	246474	246483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_017326	GCGAC	2	10	249535	249544	20 %	0 %	40 %	40 %	384538474
157	NC_017326	GCCCG	2	10	249804	249813	0 %	0 %	40 %	60 %	384538474
158	NC_017326	GGAGA	2	10	249853	249862	40 %	0 %	60 %	0 %	384538475
159	NC_017326	TCGCC	2	10	252511	252520	0 %	20 %	20 %	60 %	384538477
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161	NC_017326	CGGCA	2	10	253497	253506	20 %	0 %	40 %	40 %	384538477
162	NC_017326	GCCTT	2	10	254566	254575	0 %	40 %	20 %	40 %	384538478
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164	NC_017326	CGGCG	2	10	257156	257165	0 %	0 %	60 %	40 %	384538480
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171	NC_017326	GCGAG	2	10	263482	263491	20 %	0 %	60 %	20 %	384538486
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183	NC_017326	GCCGA	2	10	278769	278778	20 %	0 %	40 %	40 %	384538501
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191	NC_017326	GTCGA	2	10	299590	299599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017326	GCACG	2	10	300358	300367	20 %	0 %	40 %	40 %	384538524
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197	NC_017326	CGGCG	2	10	312088	312097	0 %	0 %	60 %	40 %	384538535
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199	NC_017326	TGGAA	2	10	312888	312897	40 %	20 %	40 %	0 %	384538536
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201	NC_017326	GCATC	2	10	313848	313857	20 %	20 %	20 %	40 %	384538537
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209	NC_017326	CTTCG	2	10	327448	327457	0 %	40 %	20 %	40 %	384538549
210	NC_017326	TGCAA	2	10	332563	332572	40 %	20 %	20 %	20 %	384538554
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213	NC_017326	AGTGA	2	10	337970	337979	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
214	NC_017326	CGCCT	2	10	339640	339649	0 %	20 %	20 %	60 %	384538564
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223	NC_017326	TTGCA	2	10	349419	349428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_017326	GAATG	2	10	353287	353296	40 %	20 %	40 %	0 %	384538581
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239	NC_017326	ACGAC	2	10	364779	364788	40 %	0 %	20 %	40 %	384538594
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243	NC_017326	CGGCA	2	10	366940	366949	20 %	0 %	40 %	40 %	384538595
244	NC_017326	CTTAG	2	10	367392	367401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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246	NC_017326	CCGGA	2	10	369621	369630	20 %	0 %	40 %	40 %	384538600
247	NC_017326	GCAGC	2	10	371477	371486	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_017326	CCGAG	2	10	372969	372978	20 %	0 %	40 %	40 %	384538604
249	NC_017326	GATCA	2	10	373271	373280	40 %	20 %	20 %	20 %	384538604
250	NC_017326	CGGTG	2	10	374728	374737	0 %	20 %	60 %	20 %	384538605
251	NC_017326	TGCGC	2	10	375393	375402	0 %	20 %	40 %	40 %	384538606
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254	NC_017326	GCGCG	2	10	380465	380474	0 %	0 %	60 %	40 %	384538612
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257	NC_017326	CCCAT	2	10	392453	392462	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
258	NC_017326	GGGAT	2	10	392468	392477	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017326	CAGAT	2	10	392655	392664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
260	NC_017326	GCTGC	2	10	392871	392880	0 %	20 %	40 %	40 %	384538626
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262	NC_017326	CGAGG	2	10	395271	395280	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017326	ATTCC	2	10	400476	400485	20 %	40 %	0 %	40 %	384538640
264	NC_017326	CGAAG	2	10	407271	407280	40 %	0 %	40 %	20 %	384538650
265	NC_017326	CAGGA	2	10	407326	407335	40 %	0 %	40 %	20 %	384538650
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