MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017326	CGA	3	9	165534	165542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538395
4002	NC_017326	ATC	2	6	165550	165555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538395
4003	NC_017326	AAGG	2	8	165619	165626	50 %	0 %	50 %	0 %	384538395
4004	NC_017326	CGC	2	6	165677	165682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538395
4005	NC_017326	GCC	2	6	165721	165726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538395
4006	NC_017326	GTG	2	6	165757	165762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538395
4007	NC_017326	CCT	2	6	165767	165772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538395
4008	NC_017326	ATC	2	6	165835	165840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538395
4009	NC_017326	GGC	2	6	165903	165908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538395
4010	NC_017326	GCG	2	6	165911	165916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538395
4011	NC_017326	TCG	2	6	165920	165925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538395
4012	NC_017326	CGA	2	6	166028	166033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538395
4013	NC_017326	GGC	2	6	166078	166083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538395
4014	NC_017326	TTC	2	6	166090	166095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538395
4015	NC_017326	CGC	2	6	166143	166148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538395
4016	NC_017326	GAC	2	6	166161	166166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538395
4017	NC_017326	TCG	2	6	166211	166216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538395
4018	NC_017326	GGC	2	6	166218	166223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538395
4019	NC_017326	TTCC	2	8	166254	166261	0 %	50 %	0 %	50 %	384538395
4020	NC_017326	GCAT	2	8	166283	166290	25 %	25 %	25 %	25 %	384538395
4021	NC_017326	GAT	2	6	166302	166307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538395
4022	NC_017326	GGC	2	6	166318	166323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538395
4023	NC_017326	TCGA	2	8	166393	166400	25 %	25 %	25 %	25 %	384538395
4024	NC_017326	ATCT	2	8	166429	166436	25 %	50 %	0 %	25 %	384538395
4025	NC_017326	ACA	2	6	166472	166477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538395
4026	NC_017326	CGG	2	6	166535	166540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017326	CGT	2	6	166733	166738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4028	NC_017326	GAT	2	6	166763	166768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538396
4029	NC_017326	CGG	2	6	166769	166774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4030	NC_017326	GCG	2	6	166791	166796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4031	NC_017326	CCG	2	6	166886	166891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538396
4032	NC_017326	TGA	2	6	166924	166929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538396
4033	NC_017326	CAT	2	6	166949	166954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538396
4034	NC_017326	GCC	2	6	167003	167008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538396
4035	NC_017326	CCG	2	6	167023	167028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538396
4036	NC_017326	GCC	2	6	167145	167150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538396
4037	NC_017326	GCG	2	6	167160	167165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4038	NC_017326	GGC	2	6	167168	167173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4039	NC_017326	GTC	2	6	167196	167201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4040	NC_017326	TCGCCG	2	12	167215	167226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384538396
4041	NC_017326	CGG	2	6	167243	167248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4042	NC_017326	CGT	2	6	167249	167254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4043	NC_017326	CTG	2	6	167265	167270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4044	NC_017326	TAT	2	6	167283	167288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384538396
4045	NC_017326	TGG	2	6	167314	167319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538396
4046	NC_017326	CGG	2	6	167330	167335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4047	NC_017326	GCC	2	6	167361	167366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538396
4048	NC_017326	CTG	2	6	167370	167375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4049	NC_017326	GGC	2	6	167379	167384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538396
4050	NC_017326	ACG	2	6	167391	167396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538396
4051	NC_017326	TTC	3	9	167427	167435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538396
4052	NC_017326	CG	3	6	167470	167475	0 %	0 %	50 %	50 %	384538396
4053	NC_017326	GGA	2	6	167485	167490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538396
4054	NC_017326	AGC	2	6	167522	167527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538397
4055	NC_017326	TCT	2	6	167614	167619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538397
4056	NC_017326	GCT	2	6	167636	167641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538397
4057	NC_017326	GCT	2	6	167663	167668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538397
4058	NC_017326	CTCG	2	8	167675	167682	0 %	25 %	25 %	50 %	384538397
4059	NC_017326	GCG	2	6	167701	167706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538397
4060	NC_017326	GCG	2	6	167740	167745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538397
4061	NC_017326	GCC	2	6	167751	167756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538397
4062	NC_017326	CTC	2	6	167793	167798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538397
4063	NC_017326	CGC	2	6	167804	167809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538397
4064	NC_017326	CGG	2	6	167819	167824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538397
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4068	NC_017326	CGT	2	6	168041	168046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538397
4069	NC_017326	GCT	2	6	168047	168052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538397
4070	NC_017326	TCG	2	6	168079	168084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538397
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4074	NC_017326	ATGT	2	8	168180	168187	25 %	50 %	25 %	0 %	384538397
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4078	NC_017326	GCTC	2	8	168316	168323	0 %	25 %	25 %	50 %	384538397
4079	NC_017326	TTC	2	6	168357	168362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538397
4080	NC_017326	CGG	2	6	168376	168381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538397
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4090	NC_017326	CGCC	2	8	168786	168793	0 %	0 %	25 %	75 %	384538398
4091	NC_017326	CGGG	2	8	168830	168837	0 %	0 %	75 %	25 %	384538398
4092	NC_017326	CCGG	2	8	168928	168935	0 %	0 %	50 %	50 %	384538398
4093	NC_017326	CAG	2	6	168956	168961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538398
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4099	NC_017326	ATGCCG	2	12	169242	169253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384538398
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4101	NC_017326	TGCC	2	8	169330	169337	0 %	25 %	25 %	50 %	384538399
4102	NC_017326	GC	3	6	169339	169344	0 %	0 %	50 %	50 %	384538399
4103	NC_017326	GAC	2	6	169379	169384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538399
4104	NC_017326	GCT	2	6	169385	169390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538399
4105	NC_017326	CG	3	6	169476	169481	0 %	0 %	50 %	50 %	384538399
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4107	NC_017326	TCG	2	6	169552	169557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538399
4108	NC_017326	GCCG	2	8	169567	169574	0 %	0 %	50 %	50 %	384538399
4109	NC_017326	CGG	2	6	169652	169657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538399
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4111	NC_017326	TGT	2	6	169669	169674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538399
4112	NC_017326	CCGC	2	8	169678	169685	0 %	0 %	25 %	75 %	384538399
4113	NC_017326	CGGC	2	8	169694	169701	0 %	0 %	50 %	50 %	384538399
4114	NC_017326	CGA	2	6	169718	169723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538399
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4118	NC_017326	CTC	2	6	170012	170017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_017326	CG	4	8	170061	170068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4121	NC_017326	CAG	2	6	170115	170120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538400
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4242	NC_017326	CGGC	2	8	175240	175247	0 %	0 %	50 %	50 %	384538401
4243	NC_017326	CGC	2	6	175267	175272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538401
4244	NC_017326	CGCC	2	8	175324	175331	0 %	0 %	25 %	75 %	384538401
4245	NC_017326	GC	3	6	175405	175410	0 %	0 %	50 %	50 %	384538401
4246	NC_017326	GCA	2	6	175426	175431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538401
4247	NC_017326	CGA	2	6	175462	175467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538401
4248	NC_017326	CGA	2	6	175486	175491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538401
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4251	NC_017326	GCAA	2	8	175599	175606	50 %	0 %	25 %	25 %	384538401
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4256	NC_017326	TCC	2	6	175793	175798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538402
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4267	NC_017326	C	6	6	176325	176330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4268	NC_017326	CG	3	6	176445	176450	0 %	0 %	50 %	50 %	384538403
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4273	NC_017326	CGCC	2	8	176646	176653	0 %	0 %	25 %	75 %	384538403
4274	NC_017326	GCG	2	6	176659	176664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538403
4275	NC_017326	TCG	2	6	176672	176677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538403
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4284	NC_017326	GAT	2	6	176950	176955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538403
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4289	NC_017326	CCG	2	6	177079	177084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4290	NC_017326	CG	3	6	177083	177088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4291	NC_017326	TTCA	2	8	177127	177134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4292	NC_017326	CGT	2	6	177155	177160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4309	NC_017326	GCCT	2	8	177864	177871	0 %	25 %	25 %	50 %	384538404
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4323	NC_017326	GGA	2	6	178365	178370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4324	NC_017326	A	6	6	178380	178385	100 %	0 %	0 %	0 %	384538405
4325	NC_017326	GCC	2	6	178410	178415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538405
4326	NC_017326	TCG	2	6	178471	178476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
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4335	NC_017326	GGCT	2	8	178616	178623	0 %	25 %	50 %	25 %	384538405
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4339	NC_017326	CGA	2	6	178739	178744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538405
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4341	NC_017326	CGG	2	6	178829	178834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4342	NC_017326	GAT	2	6	178871	178876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538405
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4346	NC_017326	CAA	2	6	178973	178978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538405
4347	NC_017326	CGAG	2	8	178981	178988	25 %	0 %	50 %	25 %	384538405
4348	NC_017326	ACT	2	6	179131	179136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538405
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4350	NC_017326	GTC	2	6	179181	179186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4351	NC_017326	CGA	2	6	179282	179287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4352	NC_017326	GGCT	2	8	179346	179353	0 %	25 %	50 %	25 %	384538405
4353	NC_017326	CATC	2	8	179416	179423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4354	NC_017326	TGAG	2	8	179470	179477	25 %	25 %	50 %	0 %	384538406
4355	NC_017326	CGC	2	6	179522	179527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4356	NC_017326	CGC	2	6	179765	179770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4357	NC_017326	CTGG	2	8	179780	179787	0 %	25 %	50 %	25 %	384538406
4358	NC_017326	CGC	2	6	179816	179821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4359	NC_017326	TGG	2	6	179850	179855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538406
4360	NC_017326	TCT	2	6	179887	179892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538406
4361	NC_017326	GCT	2	6	179927	179932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538406
4362	NC_017326	GGA	2	6	179993	179998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_017326	TCT	2	6	180018	180023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
4364	NC_017326	CTG	2	6	180064	180069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4365	NC_017326	TCG	2	6	180074	180079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4366	NC_017326	TCG	2	6	180098	180103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4367	NC_017326	TGC	2	6	180107	180112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4368	NC_017326	GT	3	6	180134	180139	0 %	50 %	50 %	0 %	384538407
4369	NC_017326	GCT	2	6	180141	180146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4370	NC_017326	ATC	2	6	180184	180189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538407
4371	NC_017326	TCCTG	2	10	180191	180200	0 %	40 %	20 %	40 %	384538407
4372	NC_017326	GC	3	6	180212	180217	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
4373	NC_017326	CGG	2	6	180222	180227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538407
4374	NC_017326	CTC	2	6	180267	180272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538407
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4377	NC_017326	CGT	2	6	180375	180380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4380	NC_017326	GAT	2	6	180519	180524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538407
4381	NC_017326	CTG	2	6	180661	180666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4382	NC_017326	ACG	2	6	180667	180672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4383	NC_017326	TC	3	6	180714	180719	0 %	50 %	0 %	50 %	384538407
4384	NC_017326	CGA	2	6	180776	180781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4389	NC_017326	CG	3	6	180896	180901	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
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4392	NC_017326	CTG	2	6	180949	180954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4394	NC_017326	TGA	2	6	180998	181003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538407
4395	NC_017326	TGA	2	6	181013	181018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538407
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4397	NC_017326	GTC	2	6	181105	181110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4403	NC_017326	TCT	2	6	181394	181399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
4404	NC_017326	GCT	2	6	181443	181448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4406	NC_017326	TCT	3	9	181460	181468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
4407	NC_017326	GCGCAA	2	12	181485	181496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4409	NC_017326	CGG	2	6	181532	181537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538407
4410	NC_017326	GAG	2	6	181584	181589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_017326	GAT	2	6	181643	181648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538408
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4413	NC_017326	GCG	2	6	181710	181715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538408
4414	NC_017326	CGG	2	6	181792	181797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538408
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4440	NC_017326	CGA	2	6	183060	183065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538409
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4442	NC_017326	CGG	2	6	183123	183128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4443	NC_017326	TGC	2	6	183144	183149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
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4452	NC_017326	GCG	2	6	183422	183427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4453	NC_017326	GCT	2	6	183455	183460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4454	NC_017326	CTGG	2	8	183474	183481	0 %	25 %	50 %	25 %	384538409
4455	NC_017326	GC	4	8	183504	183511	0 %	0 %	50 %	50 %	384538409
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4459	NC_017326	AGG	2	6	183680	183685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538409
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4463	NC_017326	TGC	2	6	183822	183827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
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4465	NC_017326	CG	4	8	183991	183998	0 %	0 %	50 %	50 %	384538409
4466	NC_017326	CCG	3	9	184061	184069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538409
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4469	NC_017326	CGCTGG	2	12	184214	184225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538409
4470	NC_017326	GCG	2	6	184261	184266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4471	NC_017326	GCG	3	9	184280	184288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4472	NC_017326	GCG	2	6	184416	184421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4473	NC_017326	CTC	2	6	184444	184449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538410
4474	NC_017326	ATCCCA	2	12	184498	184509	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384538410
4475	NC_017326	CGA	2	6	184584	184589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4476	NC_017326	GAC	2	6	184615	184620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4477	NC_017326	GGCGCC	2	12	184621	184632	0 %	0 %	50 %	50 %	384538410
4478	NC_017326	CGT	2	6	184695	184700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4479	NC_017326	GCC	3	9	184722	184730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538410
4480	NC_017326	ATG	2	6	184792	184797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538410
4481	NC_017326	CGCC	2	8	184804	184811	0 %	0 %	25 %	75 %	384538410
4482	NC_017326	TGGT	2	8	184820	184827	0 %	50 %	50 %	0 %	384538410
4483	NC_017326	ATG	2	6	184901	184906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538410
4484	NC_017326	TCG	2	6	184931	184936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4485	NC_017326	ACG	2	6	184985	184990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4486	NC_017326	GGAT	2	8	185000	185007	25 %	25 %	50 %	0 %	384538410
4487	NC_017326	GCG	2	6	185038	185043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538411
4488	NC_017326	GAT	2	6	185073	185078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538411
4489	NC_017326	CCT	2	6	185102	185107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538411
4490	NC_017326	GCCG	2	8	185136	185143	0 %	0 %	50 %	50 %	384538411
4491	NC_017326	CTT	2	6	185145	185150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538411
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4493	NC_017326	TTC	2	6	185182	185187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538411
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