MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017326	CCG	2	6	41221	41226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538285
1002	NC_017326	CGA	3	9	41259	41267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1003	NC_017326	TCC	2	6	41296	41301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538285
1004	NC_017326	TCG	2	6	41321	41326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1005	NC_017326	TCG	2	6	41336	41341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1006	NC_017326	CGC	2	6	41364	41369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538285
1007	NC_017326	TTC	2	6	41407	41412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538285
1008	NC_017326	CGC	2	6	41554	41559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538285
1009	NC_017326	CTC	2	6	41584	41589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538285
1010	NC_017326	TCA	3	9	41633	41641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538285
1011	NC_017326	GCC	2	6	41646	41651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538285
1012	NC_017326	CAT	2	6	41679	41684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538285
1013	NC_017326	GGC	2	6	41688	41693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538285
1014	NC_017326	CGT	2	6	41700	41705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1015	NC_017326	TCGA	2	8	41719	41726	25 %	25 %	25 %	25 %	384538285
1016	NC_017326	GGCG	2	8	41769	41776	0 %	0 %	75 %	25 %	384538285
1017	NC_017326	CGGCC	2	10	41805	41814	0 %	0 %	40 %	60 %	384538285
1018	NC_017326	GGA	2	6	41820	41825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538285
1019	NC_017326	GCT	2	6	41865	41870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1020	NC_017326	TCG	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1021	NC_017326	GCG	2	6	41888	41893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538285
1022	NC_017326	TGA	2	6	41942	41947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538285
1023	NC_017326	CGC	2	6	41975	41980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538285
1024	NC_017326	CGT	2	6	42009	42014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1025	NC_017326	GTC	2	6	42046	42051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1026	NC_017326	TGC	2	6	42074	42079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538285
1027	NC_017326	GGC	2	6	42093	42098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538285
1028	NC_017326	CGG	2	6	42117	42122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538285
1029	NC_017326	CG	3	6	42185	42190	0 %	0 %	50 %	50 %	384538285
1030	NC_017326	GAA	2	6	42202	42207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538285
1031	NC_017326	ACGG	2	8	42241	42248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_017326	CTC	2	6	42252	42257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_017326	CGG	2	6	42310	42315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538286
1034	NC_017326	GGA	2	6	42329	42334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538286
1035	NC_017326	CCCG	2	8	42395	42402	0 %	0 %	25 %	75 %	384538286
1036	NC_017326	GAAAA	2	10	42413	42422	80 %	0 %	20 %	0 %	384538286
1037	NC_017326	AGG	2	6	42450	42455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538286
1038	NC_017326	ACC	2	6	42457	42462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538286
1039	NC_017326	CGG	2	6	42469	42474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538286
1040	NC_017326	GAGG	2	8	42497	42504	25 %	0 %	75 %	0 %	384538286
1041	NC_017326	TTC	2	6	42531	42536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538286
1042	NC_017326	CTC	2	6	42539	42544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538286
1043	NC_017326	GCC	2	6	42686	42691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538286
1044	NC_017326	CG	3	6	42715	42720	0 %	0 %	50 %	50 %	384538286
1045	NC_017326	GCC	2	6	42727	42732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538286
1046	NC_017326	TCCGG	2	10	42768	42777	0 %	20 %	40 %	40 %	384538286
1047	NC_017326	CGGCAA	2	12	42841	42852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538286
1048	NC_017326	CAT	2	6	42884	42889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538286
1049	NC_017326	GCCG	2	8	42917	42924	0 %	0 %	50 %	50 %	384538286
1050	NC_017326	CCA	2	6	42976	42981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538286
1051	NC_017326	GCC	2	6	42983	42988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538286
1052	NC_017326	GCC	3	9	43005	43013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538286
1053	NC_017326	GAT	2	6	43028	43033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538286
1054	NC_017326	ATT	2	6	43043	43048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384538286
1055	NC_017326	TCA	2	6	43067	43072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017326	G	6	6	43075	43080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017326	GGC	2	6	43117	43122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017326	AC	3	6	43138	43143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_017326	GGC	2	6	43229	43234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017326	TCAA	2	8	43257	43264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017326	GCC	2	6	43285	43290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538287
1062	NC_017326	CCG	2	6	43310	43315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538287
1063	NC_017326	CGA	2	6	43382	43387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538287
1064	NC_017326	GCTT	2	8	43389	43396	0 %	50 %	25 %	25 %	384538287
1065	NC_017326	GCG	2	6	43397	43402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538287
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1068	NC_017326	GCC	2	6	43486	43491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538287
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1072	NC_017326	GGA	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538287
1073	NC_017326	GCG	2	6	43766	43771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538287
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1075	NC_017326	GGCG	2	8	43853	43860	0 %	0 %	75 %	25 %	384538287
1076	NC_017326	GGC	3	9	43866	43874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538287
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1078	NC_017326	CGC	2	6	43919	43924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538287
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1081	NC_017326	CGA	2	6	44057	44062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538287
1082	NC_017326	CAGC	2	8	44084	44091	25 %	0 %	25 %	50 %	384538287
1083	NC_017326	GCC	2	6	44106	44111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538287
1084	NC_017326	CG	4	8	44147	44154	0 %	0 %	50 %	50 %	384538287
1085	NC_017326	CAG	2	6	44163	44168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538287
1086	NC_017326	TGC	2	6	44185	44190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538287
1087	NC_017326	CGGT	2	8	44251	44258	0 %	25 %	50 %	25 %	384538287
1088	NC_017326	CGGCG	2	10	44289	44298	0 %	0 %	60 %	40 %	384538287
1089	NC_017326	TGTCA	2	10	44340	44349	20 %	40 %	20 %	20 %	384538287
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1091	NC_017326	GAT	2	6	44404	44409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017326	ATC	2	6	44429	44434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017326	TCG	2	6	44465	44470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538288
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1095	NC_017326	GCC	2	6	44526	44531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538288
1096	NC_017326	GC	3	6	44586	44591	0 %	0 %	50 %	50 %	384538288
1097	NC_017326	CCG	2	6	44595	44600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538288
1098	NC_017326	CGGG	2	8	44614	44621	0 %	0 %	75 %	25 %	384538288
1099	NC_017326	GCT	2	6	44628	44633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538288
1100	NC_017326	GCG	2	6	44643	44648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538288
1101	NC_017326	GGC	2	6	44667	44672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538288
1102	NC_017326	CGCGG	2	10	44686	44695	0 %	0 %	60 %	40 %	384538288
1103	NC_017326	CCG	2	6	44705	44710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538288
1104	NC_017326	GCT	2	6	44751	44756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538288
1105	NC_017326	TGG	2	6	44765	44770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538288
1106	NC_017326	GAT	2	6	44793	44798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538288
1107	NC_017326	CGA	2	6	44822	44827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538288
1108	NC_017326	CGAT	2	8	44858	44865	25 %	25 %	25 %	25 %	384538288
1109	NC_017326	CCG	2	6	44881	44886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538288
1110	NC_017326	ATC	2	6	44911	44916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538288
1111	NC_017326	CGA	2	6	44925	44930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538288
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1114	NC_017326	CGC	2	6	45018	45023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538288
1115	NC_017326	CCTT	2	8	45031	45038	0 %	50 %	0 %	50 %	384538288
1116	NC_017326	ACG	2	6	45077	45082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538288
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1118	NC_017326	TC	3	6	45124	45129	0 %	50 %	0 %	50 %	384538288
1119	NC_017326	TTCGC	2	10	45194	45203	0 %	40 %	20 %	40 %	384538288
1120	NC_017326	GCG	2	6	45252	45257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538288
1121	NC_017326	CCGC	2	8	45258	45265	0 %	0 %	25 %	75 %	384538288
1122	NC_017326	TCG	2	6	45275	45280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538288
1123	NC_017326	ACG	2	6	45358	45363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538288
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1125	NC_017326	GCC	2	6	45406	45411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538289
1126	NC_017326	CGA	2	6	45472	45477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538289
1127	NC_017326	CGC	2	6	45505	45510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538289
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1230	NC_017326	CGG	2	6	49677	49682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1231	NC_017326	CTC	2	6	49705	49710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1232	NC_017326	CCAG	2	8	49734	49741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1233	NC_017326	CTC	2	6	49764	49769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1234	NC_017326	GCT	2	6	49786	49791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1235	NC_017326	CGTGC	2	10	49859	49868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1236	NC_017326	CGT	2	6	49891	49896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1237	NC_017326	GCC	2	6	49913	49918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538292
1238	NC_017326	CGA	2	6	49944	49949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538292
1239	NC_017326	GC	4	8	50027	50034	0 %	0 %	50 %	50 %	384538292
1240	NC_017326	TCG	2	6	50064	50069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538292
1241	NC_017326	CGGT	2	8	50155	50162	0 %	25 %	50 %	25 %	384538292
1242	NC_017326	TGA	2	6	50181	50186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538292
1243	NC_017326	GCC	2	6	50252	50257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538292
1244	NC_017326	CGG	2	6	50259	50264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538292
1245	NC_017326	TCT	2	6	50295	50300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538292
1246	NC_017326	GAT	2	6	50335	50340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538292
1247	NC_017326	CGT	2	6	50349	50354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538292
1248	NC_017326	GCTT	2	8	50399	50406	0 %	50 %	25 %	25 %	384538292
1249	NC_017326	CT	3	6	50410	50415	0 %	50 %	0 %	50 %	384538292
1250	NC_017326	CGA	2	6	50427	50432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538292
1251	NC_017326	CCA	2	6	50433	50438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538292
1252	NC_017326	AGC	2	6	50456	50461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538292
1253	NC_017326	GGCG	2	8	50472	50479	0 %	0 %	75 %	25 %	384538292
1254	NC_017326	GAT	2	6	50554	50559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_017326	TGA	2	6	50585	50590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_017326	AAT	2	6	50617	50622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_017326	GGT	2	6	50671	50676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538293
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1362	NC_017326	GATA	2	8	55285	55292	50 %	25 %	25 %	0 %	384538296
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1500	NC_017326	GC	3	6	61122	61127	0 %	0 %	50 %	50 %	384538303

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