MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 37642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017326	CGC	2	6	185367	185372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538411
4502	NC_017326	CGA	2	6	185399	185404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538411
4503	NC_017326	CG	3	6	185420	185425	0 %	0 %	50 %	50 %	384538411
4504	NC_017326	CGT	2	6	185460	185465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538411
4505	NC_017326	GCG	2	6	185466	185471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538411
4506	NC_017326	GGC	2	6	185516	185521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538411
4507	NC_017326	CCA	2	6	185531	185536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538411
4508	NC_017326	TCG	2	6	185548	185553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538411
4509	NC_017326	GCC	2	6	185610	185615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538411
4510	NC_017326	ACG	2	6	185620	185625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538411
4511	NC_017326	ACC	2	6	185662	185667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538411
4512	NC_017326	GAA	2	6	185783	185788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538412
4513	NC_017326	GAG	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538412
4514	NC_017326	CG	3	6	185819	185824	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4515	NC_017326	TCG	2	6	185827	185832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4516	NC_017326	CGGT	2	8	185839	185846	0 %	25 %	50 %	25 %	384538412
4517	NC_017326	TCA	2	6	185876	185881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538412
4518	NC_017326	CAT	2	6	185883	185888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538412
4519	NC_017326	AGG	2	6	185899	185904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538412
4520	NC_017326	CCG	2	6	185936	185941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4521	NC_017326	GCC	2	6	186009	186014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4522	NC_017326	GCC	2	6	186087	186092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4523	NC_017326	GC	3	6	186100	186105	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4524	NC_017326	TCG	2	6	186112	186117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4525	NC_017326	GCC	2	6	186160	186165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4526	NC_017326	GCCG	2	8	186225	186232	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4527	NC_017326	CCG	2	6	186254	186259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4528	NC_017326	GC	3	6	186321	186326	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4529	NC_017326	CGA	2	6	186362	186367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4530	NC_017326	AGC	2	6	186406	186411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4531	NC_017326	CGA	2	6	186437	186442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4532	NC_017326	CCT	2	6	186559	186564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538413
4533	NC_017326	CTTT	2	8	186567	186574	0 %	75 %	0 %	25 %	384538413
4534	NC_017326	CGG	2	6	186577	186582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538413
4535	NC_017326	GCCC	2	8	186658	186665	0 %	0 %	25 %	75 %	384538413
4536	NC_017326	GTC	2	6	186668	186673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4537	NC_017326	CAC	2	6	186677	186682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538413
4538	NC_017326	TCG	2	6	186684	186689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4539	NC_017326	GAC	2	6	186773	186778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4540	NC_017326	GGC	2	6	186789	186794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538413
4541	NC_017326	CGGC	2	8	186816	186823	0 %	0 %	50 %	50 %	384538413
4542	NC_017326	TCGGCG	2	12	186874	186885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538413
4543	NC_017326	CATG	2	8	186979	186986	25 %	25 %	25 %	25 %	384538413
4544	NC_017326	TTC	2	6	186995	187000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538413
4545	NC_017326	GCAT	2	8	187005	187012	25 %	25 %	25 %	25 %	384538413
4546	NC_017326	CG	3	6	187030	187035	0 %	0 %	50 %	50 %	384538413
4547	NC_017326	CTC	2	6	187103	187108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538413
4548	NC_017326	GAT	2	6	187130	187135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538413
4549	NC_017326	CGT	2	6	187145	187150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4550	NC_017326	GTG	2	6	187155	187160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538413
4551	NC_017326	GAA	2	6	187184	187189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538413
4552	NC_017326	TCG	2	6	187210	187215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4553	NC_017326	GTC	2	6	187217	187222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4554	NC_017326	CGT	2	6	187249	187254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4555	NC_017326	CCG	2	6	187287	187292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538413
4556	NC_017326	CG	3	6	187373	187378	0 %	0 %	50 %	50 %	384538413
4557	NC_017326	ATC	2	6	187383	187388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538413
4558	NC_017326	CGG	2	6	187443	187448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538414
4559	NC_017326	CCT	2	6	187449	187454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538414
4560	NC_017326	GCG	2	6	187481	187486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538414
4561	NC_017326	CGA	2	6	187563	187568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4562	NC_017326	CGA	2	6	187629	187634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4563	NC_017326	TCG	2	6	187640	187645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4564	NC_017326	TCG	2	6	187649	187654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4565	NC_017326	CGACAT	2	12	187678	187689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384538414
4566	NC_017326	GCTC	2	8	187698	187705	0 %	25 %	25 %	50 %	384538414
4567	NC_017326	GCG	2	6	187740	187745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538414
4568	NC_017326	TCGACC	2	12	187844	187855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384538414
4569	NC_017326	CGA	2	6	187875	187880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4570	NC_017326	GTGC	2	8	187885	187892	0 %	25 %	50 %	25 %	384538414
4571	NC_017326	CAG	2	6	187927	187932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4572	NC_017326	TCG	2	6	187940	187945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4573	NC_017326	CG	3	6	187974	187979	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4574	NC_017326	CG	3	6	188001	188006	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4575	NC_017326	CGCC	2	8	188013	188020	0 %	0 %	25 %	75 %	384538414
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4580	NC_017326	GC	3	6	188306	188311	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4581	NC_017326	CG	3	6	188340	188345	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4582	NC_017326	GCT	2	6	188424	188429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4583	NC_017326	CGA	2	6	188430	188435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
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4585	NC_017326	CGG	2	6	188477	188482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538414
4586	NC_017326	CAG	2	6	188488	188493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4587	NC_017326	GGC	2	6	188512	188517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538414
4588	NC_017326	TACA	2	8	188536	188543	50 %	25 %	0 %	25 %	384538414
4589	NC_017326	TGG	2	6	188566	188571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538415
4590	NC_017326	GGCA	2	8	188577	188584	25 %	0 %	50 %	25 %	384538415
4591	NC_017326	CG	3	6	188596	188601	0 %	0 %	50 %	50 %	384538415
4592	NC_017326	CG	3	6	188623	188628	0 %	0 %	50 %	50 %	384538415
4593	NC_017326	GGC	2	6	188645	188650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538415
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4597	NC_017326	CGCCGG	2	12	188884	188895	0 %	0 %	50 %	50 %	384538415
4598	NC_017326	CGG	2	6	189014	189019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538415
4599	NC_017326	GCA	2	6	189024	189029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538415
4600	NC_017326	GCCG	2	8	189037	189044	0 %	0 %	50 %	50 %	384538415
4601	NC_017326	CGGG	2	8	189053	189060	0 %	0 %	75 %	25 %	384538415
4602	NC_017326	TCA	2	6	189148	189153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538415
4603	NC_017326	GAA	2	6	189175	189180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538416
4604	NC_017326	GGC	2	6	189310	189315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538416
4605	NC_017326	AGC	2	6	189344	189349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538416
4606	NC_017326	CGC	4	12	189426	189437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538416
4607	NC_017326	GTC	2	6	189502	189507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538416
4608	NC_017326	CAT	2	6	189616	189621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_017326	GGC	2	6	189718	189723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_017326	GAA	2	6	189724	189729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017326	GAA	2	6	189737	189742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017326	GAT	2	6	189743	189748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538417
4613	NC_017326	TCG	2	6	189757	189762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538417
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4617	NC_017326	GC	3	6	189910	189915	0 %	0 %	50 %	50 %	384538417
4618	NC_017326	GAA	2	6	189930	189935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538417
4619	NC_017326	GC	3	6	189944	189949	0 %	0 %	50 %	50 %	384538417
4620	NC_017326	GAT	2	6	189968	189973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538417
4621	NC_017326	GCG	2	6	190007	190012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538417
4622	NC_017326	GCC	2	6	190036	190041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538417
4623	NC_017326	GA	3	6	190046	190051	50 %	0 %	50 %	0 %	384538417
4624	NC_017326	GCG	2	6	190093	190098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538417
4625	NC_017326	CAG	2	6	190157	190162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538417
4626	NC_017326	GGC	2	6	190171	190176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538417
4627	NC_017326	CGG	2	6	190186	190191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538417
4628	NC_017326	CTA	2	6	190196	190201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538417
4629	NC_017326	CGGCT	2	10	190242	190251	0 %	20 %	40 %	40 %	384538417
4630	NC_017326	CGA	2	6	190283	190288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538417
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4650	NC_017326	CGG	2	6	191077	191082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538418
4651	NC_017326	GC	3	6	191105	191110	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4652	NC_017326	GCTT	2	8	191133	191140	0 %	50 %	25 %	25 %	384538418
4653	NC_017326	TCT	2	6	191143	191148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538418
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4662	NC_017326	CGA	2	6	191464	191469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538418
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4665	NC_017326	TCG	2	6	191556	191561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538418
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4670	NC_017326	GC	3	6	191757	191762	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
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4684	NC_017326	CG	3	6	192271	192276	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4685	NC_017326	GGT	2	6	192277	192282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538418
4686	NC_017326	CTG	2	6	192332	192337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538418
4687	NC_017326	CGG	2	6	192340	192345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538418
4688	NC_017326	GCC	2	6	192418	192423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538418
4689	NC_017326	TGG	2	6	192433	192438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538418
4690	NC_017326	CG	3	6	192439	192444	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4691	NC_017326	GTC	2	6	192503	192508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538418
4692	NC_017326	TGG	2	6	192655	192660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4693	NC_017326	GAG	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4694	NC_017326	TCC	2	6	192846	192851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4721	NC_017326	GCCG	2	8	193795	193802	0 %	0 %	50 %	50 %	384538419
4722	NC_017326	GGA	2	6	193810	193815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538419
4723	NC_017326	GCCG	2	8	193904	193911	0 %	0 %	50 %	50 %	384538419
4724	NC_017326	ATC	2	6	193920	193925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538419
4725	NC_017326	CGGC	2	8	194013	194020	0 %	0 %	50 %	50 %	384538419
4726	NC_017326	GCCG	2	8	194042	194049	0 %	0 %	50 %	50 %	384538419
4727	NC_017326	GGCGC	2	10	194096	194105	0 %	0 %	60 %	40 %	384538419
4728	NC_017326	TCT	2	6	194107	194112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538419
4729	NC_017326	AGGGCG	2	12	194122	194133	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384538419
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4732	NC_017326	GTC	2	6	194273	194278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538419
4733	NC_017326	CGA	2	6	194306	194311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538419
4734	NC_017326	GCC	4	12	194363	194374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538419
4735	NC_017326	ATC	2	6	194388	194393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538419
4736	NC_017326	GCG	2	6	194412	194417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538419
4737	NC_017326	GC	3	6	194420	194425	0 %	0 %	50 %	50 %	384538419
4738	NC_017326	CGG	2	6	194485	194490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538419
4739	NC_017326	CTT	2	6	194495	194500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538419
4740	NC_017326	CGG	2	6	194540	194545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538419
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4859	NC_017326	CG	3	6	199331	199336	0 %	0 %	50 %	50 %	384538423
4860	NC_017326	GAT	2	6	199359	199364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538423
4861	NC_017326	CG	3	6	199366	199371	0 %	0 %	50 %	50 %	384538423
4862	NC_017326	GCG	2	6	199378	199383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538423
4863	NC_017326	GGGCGA	2	12	199431	199442	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384538423
4864	NC_017326	CGG	2	6	199458	199463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538423
4865	NC_017326	GAT	2	6	199473	199478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538423
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4870	NC_017326	GCG	3	9	199780	199788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538423
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4987	NC_017326	TTGC	2	8	204354	204361	0 %	50 %	25 %	25 %	384538427
4988	NC_017326	CGA	2	6	204371	204376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538427
4989	NC_017326	CGC	2	6	204478	204483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538427
4990	NC_017326	GC	3	6	204489	204494	0 %	0 %	50 %	50 %	384538427
4991	NC_017326	GAC	2	6	204509	204514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538427
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