MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017325	ATG	2	6	420636	420641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017325	TAG	2	6	420683	420688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017325	GCGG	2	8	420704	420711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10004	NC_017325	CA	3	6	420719	420724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_017325	CCG	2	6	420902	420907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534854
10006	NC_017325	GCC	2	6	420973	420978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534854
10007	NC_017325	CGA	2	6	421006	421011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534854
10008	NC_017325	AGC	2	6	421014	421019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534854
10009	NC_017325	CCG	2	6	421035	421040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534854
10010	NC_017325	CGG	2	6	421134	421139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534854
10011	NC_017325	TGC	2	6	421238	421243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534855
10012	NC_017325	CAG	2	6	421254	421259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534855
10013	NC_017325	CCG	2	6	421297	421302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534855
10014	NC_017325	GCG	3	9	421336	421344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534855
10015	NC_017325	GGCCA	2	10	421359	421368	20 %	0 %	40 %	40 %	384534855
10016	NC_017325	CG	3	6	421369	421374	0 %	0 %	50 %	50 %	384534855
10017	NC_017325	TCG	2	6	421421	421426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534856
10018	NC_017325	GGC	2	6	421428	421433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534856
10019	NC_017325	CCA	2	6	421435	421440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534856
10020	NC_017325	GGC	2	6	421717	421722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534857
10021	NC_017325	CGG	2	6	421726	421731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534857
10022	NC_017325	GCC	2	6	421746	421751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534857
10023	NC_017325	TGT	3	9	421759	421767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534857
10024	NC_017325	CGT	2	6	421805	421810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534857
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10026	NC_017325	GCG	2	6	421871	421876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534857
10027	NC_017325	CG	4	8	421875	421882	0 %	0 %	50 %	50 %	384534857
10028	NC_017325	CGT	2	6	421901	421906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534857
10029	NC_017325	CGA	2	6	421922	421927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534857
10030	NC_017325	CGG	2	6	421970	421975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534857
10031	NC_017325	GAG	2	6	422007	422012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534857
10032	NC_017325	TCG	2	6	422125	422130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534857
10033	NC_017325	CGC	2	6	422134	422139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534857
10034	NC_017325	CAGC	2	8	422177	422184	25 %	0 %	25 %	50 %	384534857
10035	NC_017325	TTC	2	6	422187	422192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534857
10036	NC_017325	TCA	2	6	422216	422221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534857
10037	NC_017325	TTC	2	6	422222	422227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534857
10038	NC_017325	GTC	2	6	422242	422247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_017325	CGAC	2	8	422273	422280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_017325	CGGC	2	8	422378	422385	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10041	NC_017325	TCT	2	6	422388	422393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534858
10042	NC_017325	CGA	2	6	422421	422426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534858
10043	NC_017325	TGC	2	6	422505	422510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534858
10044	NC_017325	AGGC	2	8	422527	422534	25 %	0 %	50 %	25 %	384534858
10045	NC_017325	GC	6	12	422539	422550	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10046	NC_017325	TCG	2	6	422555	422560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534858
10047	NC_017325	GCG	2	6	422620	422625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534858
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10049	NC_017325	GCC	2	6	422708	422713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534858
10050	NC_017325	CG	3	6	422728	422733	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10051	NC_017325	C	6	6	422763	422768	0 %	0 %	0 %	100 %	384534858
10052	NC_017325	GGC	2	6	422778	422783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534858
10053	NC_017325	CG	3	6	422835	422840	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10054	NC_017325	TCGC	2	8	422845	422852	0 %	25 %	25 %	50 %	384534858
10055	NC_017325	CGCGC	2	10	422863	422872	0 %	0 %	40 %	60 %	384534858
10056	NC_017325	CG	3	6	422940	422945	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10057	NC_017325	GCG	2	6	422957	422962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534858
10058	NC_017325	TC	3	6	422971	422976	0 %	50 %	0 %	50 %	384534858
10059	NC_017325	GCT	2	6	422997	423002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534858
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10061	NC_017325	GTG	2	6	423019	423024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534858
10062	NC_017325	TGCC	2	8	423027	423034	0 %	25 %	25 %	50 %	384534858
10063	NC_017325	TCGC	2	8	423067	423074	0 %	25 %	25 %	50 %	384534858
10064	NC_017325	GC	4	8	423154	423161	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10065	NC_017325	CG	4	8	423193	423200	0 %	0 %	50 %	50 %	384534858
10066	NC_017325	CGA	2	6	423260	423265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534858
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10074	NC_017325	CCCG	2	8	423504	423511	0 %	0 %	25 %	75 %	384534858
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10081	NC_017325	CCA	2	6	423951	423956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534859
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10088	NC_017325	GTC	2	6	424355	424360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_017325	GAG	2	6	424380	424385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10104	NC_017325	TCT	2	6	425082	425087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_017325	GGA	2	6	425136	425141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017325	GCA	2	6	425187	425192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534862
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10109	NC_017325	ACGAA	2	10	425248	425257	60 %	0 %	20 %	20 %	384534862
10110	NC_017325	AG	3	6	425265	425270	50 %	0 %	50 %	0 %	384534862
10111	NC_017325	GCG	2	6	425297	425302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534862
10112	NC_017325	GCAAG	2	10	425424	425433	40 %	0 %	40 %	20 %	384534862
10113	NC_017325	TGC	2	6	425458	425463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534862
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10118	NC_017325	GC	3	6	425714	425719	0 %	0 %	50 %	50 %	384534862
10119	NC_017325	TGC	2	6	425731	425736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534862
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10121	NC_017325	GCCA	2	8	425791	425798	25 %	0 %	25 %	50 %	384534862
10122	NC_017325	GTC	2	6	425861	425866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534862
10123	NC_017325	AGCG	2	8	425931	425938	25 %	0 %	50 %	25 %	384534862
10124	NC_017325	CTGC	2	8	426014	426021	0 %	25 %	25 %	50 %	384534862
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10128	NC_017325	CGATCG	2	12	426165	426176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384534862
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10133	NC_017325	CCCT	2	8	426373	426380	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10134	NC_017325	GC	3	6	426389	426394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10135	NC_017325	AGC	2	6	426477	426482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534863
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10245	NC_017325	CGA	3	9	431195	431203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534866
10246	NC_017325	CGC	2	6	431243	431248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534866
10247	NC_017325	GCC	2	6	431253	431258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534866
10248	NC_017325	CCG	3	9	431324	431332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534866
10249	NC_017325	GCT	2	6	431381	431386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534866
10250	NC_017325	ATG	2	6	431394	431399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534866
10251	NC_017325	TCA	2	6	431438	431443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534866
10252	NC_017325	GGCG	2	8	431465	431472	0 %	0 %	75 %	25 %	384534866
10253	NC_017325	CGG	2	6	431524	431529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534867
10254	NC_017325	AAG	2	6	431564	431569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534867
10255	NC_017325	CGC	2	6	431591	431596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534867
10256	NC_017325	GCG	2	6	431663	431668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534867
10257	NC_017325	CGA	2	6	431686	431691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534867
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10260	NC_017325	GATCC	2	10	431831	431840	20 %	20 %	20 %	40 %	384534867
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10264	NC_017325	GGC	2	6	432004	432009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534867
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10273	NC_017325	TGC	2	6	432250	432255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534868
10274	NC_017325	CGG	2	6	432289	432294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534868
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10279	NC_017325	CG	3	6	432474	432479	0 %	0 %	50 %	50 %	384534868
10280	NC_017325	CGG	3	9	432512	432520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534868
10281	NC_017325	GC	3	6	432532	432537	0 %	0 %	50 %	50 %	384534868
10282	NC_017325	CAA	2	6	432596	432601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534868
10283	NC_017325	CGG	2	6	432607	432612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534868
10284	NC_017325	GCTT	2	8	432643	432650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10285	NC_017325	C	6	6	432671	432676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10286	NC_017325	TGC	2	6	432683	432688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10292	NC_017325	CTG	2	6	432941	432946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534869
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10353	NC_017325	CGG	2	6	435387	435392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10354	NC_017325	GC	3	6	435549	435554	0 %	0 %	50 %	50 %	384534871
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10361	NC_017325	GAA	2	6	435801	435806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534871
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10364	NC_017325	TGA	2	6	435895	435900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534871
10365	NC_017325	CGG	2	6	435938	435943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534871
10366	NC_017325	GGGC	2	8	435947	435954	0 %	0 %	75 %	25 %	384534871
10367	NC_017325	TCG	2	6	435970	435975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534871
10368	NC_017325	CGCTT	2	10	435999	436008	0 %	40 %	20 %	40 %	384534871
10369	NC_017325	AGA	2	6	436021	436026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534871
10370	NC_017325	TGA	2	6	436036	436041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534871
10371	NC_017325	TCA	2	6	436054	436059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534871
10372	NC_017325	CAG	2	6	436080	436085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534871
10373	NC_017325	CTC	2	6	436125	436130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534871
10374	NC_017325	CGC	2	6	436205	436210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534871
10375	NC_017325	CGC	4	12	436235	436246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534871
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10386	NC_017325	TGA	2	6	436651	436656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534871
10387	NC_017325	GCT	2	6	436664	436669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534871
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10390	NC_017325	CGG	2	6	436886	436891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534871
10391	NC_017325	GC	3	6	436895	436900	0 %	0 %	50 %	50 %	384534871
10392	NC_017325	CGG	2	6	436916	436921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534871
10393	NC_017325	GC	3	6	436946	436951	0 %	0 %	50 %	50 %	384534871
10394	NC_017325	TTCG	2	8	436956	436963	0 %	50 %	25 %	25 %	384534871
10395	NC_017325	TGACG	2	10	437000	437009	20 %	20 %	40 %	20 %	384534871
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10402	NC_017325	TGC	2	6	437329	437334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534872
10403	NC_017325	TCG	2	6	437479	437484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534872
10404	NC_017325	CGC	2	6	437555	437560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10405	NC_017325	CTG	2	6	437585	437590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10406	NC_017325	TCA	2	6	437653	437658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534873
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10443	NC_017325	GGCT	2	8	439378	439385	0 %	25 %	50 %	25 %	384534874
10444	NC_017325	GCC	2	6	439402	439407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534874
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10447	NC_017325	AGG	2	6	439633	439638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10448	NC_017325	TGA	2	6	439643	439648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534875
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10453	NC_017325	CGT	2	6	439800	439805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534875
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10477	NC_017325	ATC	2	6	441007	441012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534875
10478	NC_017325	TCAT	2	8	441023	441030	25 %	50 %	0 %	25 %	384534875
10479	NC_017325	CGG	2	6	441116	441121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534875
10480	NC_017325	GGA	2	6	441192	441197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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