MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01

Total Repeats: 34177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017324	GCA	2	6	44650	44655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017324	CCA	2	6	44760	44765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_017324	GC	3	6	44819	44824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017324	GCT	2	6	44870	44875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1005	NC_017324	GCG	2	6	44943	44948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1006	NC_017324	AAGC	2	8	44965	44972	50 %	0 %	25 %	25 %	384531563
1007	NC_017324	CG	3	6	45047	45052	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1008	NC_017324	GC	3	6	45066	45071	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1009	NC_017324	CCG	2	6	45240	45245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1010	NC_017324	AGG	2	6	45250	45255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531563
1011	NC_017324	GGC	2	6	45302	45307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1012	NC_017324	CGA	2	6	45309	45314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1013	NC_017324	AGCCG	2	10	45318	45327	20 %	0 %	40 %	40 %	384531563
1014	NC_017324	CG	3	6	45409	45414	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1015	NC_017324	GTC	2	6	45442	45447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1016	NC_017324	GCC	2	6	45473	45478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1017	NC_017324	GCG	2	6	45525	45530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1018	NC_017324	CTG	2	6	45532	45537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1019	NC_017324	ACG	2	6	45548	45553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1020	NC_017324	TGG	2	6	45575	45580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384531563
1021	NC_017324	GCGA	2	8	45626	45633	25 %	0 %	50 %	25 %	384531563
1022	NC_017324	CG	3	6	45638	45643	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1023	NC_017324	TCC	2	6	45680	45685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384531563
1024	NC_017324	CCG	2	6	45749	45754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1025	NC_017324	TGA	3	9	45756	45764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384531563
1026	NC_017324	CG	3	6	45791	45796	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1027	NC_017324	CGC	2	6	45821	45826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1028	NC_017324	CGC	2	6	45837	45842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1029	NC_017324	CG	3	6	45877	45882	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1030	NC_017324	CCG	2	6	45966	45971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531563
1031	NC_017324	GCT	2	6	46014	46019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1032	NC_017324	GGC	2	6	46033	46038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1033	NC_017324	CCGC	2	8	46061	46068	0 %	0 %	25 %	75 %	384531563
1034	NC_017324	GC	3	6	46067	46072	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1035	NC_017324	CGA	2	6	46077	46082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531563
1036	NC_017324	CGG	2	6	46092	46097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1037	NC_017324	CCAG	2	8	46158	46165	25 %	0 %	25 %	50 %	384531563
1038	NC_017324	CG	3	6	46175	46180	0 %	0 %	50 %	50 %	384531563
1039	NC_017324	GAGC	2	8	46185	46192	25 %	0 %	50 %	25 %	384531563
1040	NC_017324	GCG	2	6	46242	46247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531563
1041	NC_017324	GCTC	2	8	46281	46288	0 %	25 %	25 %	50 %	384531563
1042	NC_017324	CT	3	6	46292	46297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_017324	T	7	7	46328	46334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017324	GAA	2	6	46368	46373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017324	TCA	2	6	46377	46382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017324	GAC	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017324	GCC	2	6	46443	46448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531564
1048	NC_017324	TGCC	2	8	46468	46475	0 %	25 %	25 %	50 %	384531564
1049	NC_017324	GCG	2	6	46476	46481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531564
1050	NC_017324	TCG	2	6	46561	46566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531564
1051	NC_017324	CCG	2	6	46572	46577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531564
1052	NC_017324	GCC	2	6	46709	46714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531564
1053	NC_017324	GGC	2	6	46715	46720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531564
1054	NC_017324	ACC	2	6	46723	46728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384531564
1055	NC_017324	TCA	2	6	46729	46734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531564
1056	NC_017324	GCT	2	6	46766	46771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531564
1057	NC_017324	TCG	2	6	46780	46785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531564
1058	NC_017324	CGA	2	6	46793	46798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531564
1059	NC_017324	ACC	2	6	46809	46814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384531564
1060	NC_017324	TCG	2	6	46835	46840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017324	ACAA	2	8	46841	46848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_017324	CAT	2	6	46938	46943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531565
1063	NC_017324	AGC	2	6	46948	46953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531565
1064	NC_017324	CAA	2	6	47001	47006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384531565
1065	NC_017324	A	6	6	47047	47052	100 %	0 %	0 %	0 %	384531565
1066	NC_017324	TGAGCG	2	12	47115	47126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384531565
1067	NC_017324	GGC	2	6	47196	47201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531565
1068	NC_017324	GAG	2	6	47215	47220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531565
1069	NC_017324	CGATCG	2	12	47240	47251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384531565
1070	NC_017324	TGA	2	6	47255	47260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384531565
1071	NC_017324	ACG	2	6	47415	47420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1072	NC_017324	CG	3	6	47532	47537	0 %	0 %	50 %	50 %	384531566
1073	NC_017324	GGC	2	6	47543	47548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531566
1074	NC_017324	GTG	2	6	47559	47564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384531566
1075	NC_017324	CCG	2	6	47596	47601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531566
1076	NC_017324	GAGG	2	8	47643	47650	25 %	0 %	75 %	0 %	384531566
1077	NC_017324	CGC	2	6	47663	47668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531566
1078	NC_017324	CCG	2	6	47687	47692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531566
1079	NC_017324	CAT	2	6	47696	47701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531566
1080	NC_017324	AGG	2	6	47735	47740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531566
1081	NC_017324	ACG	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1082	NC_017324	CTCGC	2	10	47832	47841	0 %	20 %	20 %	60 %	384531566
1083	NC_017324	CGT	2	6	47852	47857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1084	NC_017324	CTT	2	6	47870	47875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384531566
1085	NC_017324	CCGG	2	8	47897	47904	0 %	0 %	50 %	50 %	384531566
1086	NC_017324	TCG	2	6	47947	47952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1087	NC_017324	CGA	2	6	47987	47992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1088	NC_017324	CGC	2	6	47999	48004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531566
1089	NC_017324	GTC	2	6	48045	48050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531566
1090	NC_017324	TCCCC	2	10	48059	48068	0 %	20 %	0 %	80 %	384531566
1091	NC_017324	GGA	2	6	48134	48139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531566
1092	NC_017324	CGG	2	6	48151	48156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531566
1093	NC_017324	CTA	2	6	48170	48175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531566
1094	NC_017324	GAT	2	6	48283	48288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017324	TCG	2	6	48313	48318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017324	GCC	2	6	48331	48336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017324	A	7	7	48343	48349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017324	CGC	2	6	48548	48553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_017324	TG	3	6	48628	48633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017324	CGCC	2	8	48642	48649	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1101	NC_017324	AGC	2	6	48849	48854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017324	CGGGCC	2	12	48911	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_017324	CGGCG	2	10	48972	48981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_017324	TCCCC	2	10	49025	49034	0 %	20 %	0 %	80 %	384531567
1105	NC_017324	CGG	2	6	49039	49044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531567
1106	NC_017324	TGC	2	6	49073	49078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531567
1107	NC_017324	AGG	2	6	49151	49156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531567
1108	NC_017324	TCGGC	2	10	49179	49188	0 %	20 %	40 %	40 %	384531567
1109	NC_017324	CGC	2	6	49195	49200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531567
1110	NC_017324	TCC	2	6	49211	49216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384531567
1111	NC_017324	CGC	2	6	49291	49296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531567
1112	NC_017324	GCT	2	6	49392	49397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531567
1113	NC_017324	TCG	2	6	49430	49435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531567
1114	NC_017324	CGT	2	6	49492	49497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531567
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1116	NC_017324	GAT	2	6	49519	49524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384531567
1117	NC_017324	ACG	2	6	49606	49611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531567
1118	NC_017324	GAA	2	6	49721	49726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017324	CGG	3	9	49816	49824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017324	CCA	2	6	49974	49979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384531568
1121	NC_017324	CG	3	6	50070	50075	0 %	0 %	50 %	50 %	384531568
1122	NC_017324	GCC	2	6	50114	50119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_017324	GGCT	2	8	50196	50203	0 %	25 %	50 %	25 %	384531569
1124	NC_017324	GCC	2	6	50209	50214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531569
1125	NC_017324	GCT	2	6	50221	50226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1126	NC_017324	CTC	2	6	50245	50250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384531569
1127	NC_017324	GCAG	2	8	50262	50269	25 %	0 %	50 %	25 %	384531569
1128	NC_017324	TCACCA	2	12	50279	50290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384531569
1129	NC_017324	CAG	2	6	50359	50364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1130	NC_017324	GGT	2	6	50385	50390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384531569
1131	NC_017324	CAT	2	6	50397	50402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531569
1132	NC_017324	CCG	2	6	50450	50455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531569
1133	NC_017324	TCA	2	6	50477	50482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531569
1134	NC_017324	CAA	2	6	50586	50591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384531569
1135	NC_017324	GGT	2	6	50595	50600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384531569
1136	NC_017324	CGT	2	6	50601	50606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1137	NC_017324	CGG	3	9	50607	50615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531569
1138	NC_017324	GTC	2	6	50671	50676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1139	NC_017324	CGA	2	6	50766	50771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531569
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1141	NC_017324	CACG	2	8	50856	50863	25 %	0 %	25 %	50 %	384531569
1142	NC_017324	TCG	2	6	50870	50875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1143	NC_017324	CGA	2	6	50960	50965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531569
1144	NC_017324	GCTG	2	8	50985	50992	0 %	25 %	50 %	25 %	384531569
1145	NC_017324	GGC	2	6	51054	51059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531569
1146	NC_017324	CAAGC	2	10	51340	51349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1147	NC_017324	ATCA	2	8	51367	51374	50 %	25 %	0 %	25 %	384531570
1148	NC_017324	CG	3	6	51423	51428	0 %	0 %	50 %	50 %	384531570
1149	NC_017324	CGGC	2	8	51621	51628	0 %	0 %	50 %	50 %	384531570
1150	NC_017324	GAC	2	6	51691	51696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531570
1151	NC_017324	CTTC	2	8	51709	51716	0 %	50 %	0 %	50 %	384531570
1152	NC_017324	CGAA	2	8	51758	51765	50 %	0 %	25 %	25 %	384531570
1153	NC_017324	CGT	2	6	51831	51836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531570
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1156	NC_017324	GTC	2	6	51901	51906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531570
1157	NC_017324	CGC	2	6	51921	51926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531570
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1159	NC_017324	GTC	2	6	52048	52053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531570
1160	NC_017324	CAT	2	6	52074	52079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531570
1161	NC_017324	TCG	2	6	52094	52099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531570
1162	NC_017324	CCCG	2	8	52115	52122	0 %	0 %	25 %	75 %	384531570
1163	NC_017324	GC	3	6	52141	52146	0 %	0 %	50 %	50 %	384531570
1164	NC_017324	TCCGGC	2	12	52168	52179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384531570
1165	NC_017324	CGC	2	6	52181	52186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531570
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1167	NC_017324	CAA	2	6	52317	52322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1168	NC_017324	CGA	2	6	52363	52368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531571
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1173	NC_017324	GGC	2	6	52682	52687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531571
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1190	NC_017324	CTC	2	6	53355	53360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1191	NC_017324	GAC	2	6	53433	53438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1192	NC_017324	GC	3	6	53587	53592	0 %	0 %	50 %	50 %	384531573
1193	NC_017324	GGC	3	9	53635	53643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384531573
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1202	NC_017324	CCA	2	6	53889	53894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384531573
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1218	NC_017324	GAT	2	6	54762	54767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1219	NC_017324	CG	3	6	54785	54790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1220	NC_017324	CTC	2	6	54820	54825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1221	NC_017324	CGG	2	6	55037	55042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1222	NC_017324	AGA	2	6	55044	55049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1223	NC_017324	ATG	2	6	55072	55077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1224	NC_017324	GCT	2	6	55204	55209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1225	NC_017324	CT	3	6	55208	55213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1226	NC_017324	CCA	2	6	55224	55229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1227	NC_017324	CCG	2	6	55271	55276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1228	NC_017324	CCT	2	6	55305	55310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1229	NC_017324	TTG	2	6	55342	55347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1230	NC_017324	GTC	2	6	55376	55381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1231	NC_017324	GATG	2	8	55479	55486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_017324	GGC	2	6	55598	55603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1233	NC_017324	GCA	2	6	55630	55635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1234	NC_017324	CAGTT	2	10	55675	55684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1235	NC_017324	TCG	2	6	55692	55697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1236	NC_017324	GGA	2	6	55713	55718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1237	NC_017324	TG	3	6	55719	55724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_017324	TGT	2	6	55777	55782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384531574
1239	NC_017324	CAAG	2	8	55809	55816	50 %	0 %	25 %	25 %	384531574
1240	NC_017324	CTA	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384531574
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1242	NC_017324	AGG	2	6	55924	55929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384531574
1243	NC_017324	CTT	2	6	55992	55997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384531574
1244	NC_017324	G	6	6	56018	56023	0 %	0 %	100 %	0 %	384531574
1245	NC_017324	GTCTGC	2	12	56027	56038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531574
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1248	NC_017324	GCGTC	2	10	56155	56164	0 %	20 %	40 %	40 %	384531574
1249	NC_017324	GCC	2	6	56258	56263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384531574
1250	NC_017324	CA	3	6	56271	56276	50 %	0 %	0 %	50 %	384531574
1251	NC_017324	AAG	2	6	56305	56310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384531574
1252	NC_017324	ACG	2	6	56332	56337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384531574
1253	NC_017324	CGAG	2	8	56338	56345	25 %	0 %	50 %	25 %	384531574
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1255	NC_017324	TGC	2	6	56498	56503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384531574
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1382	NC_017324	GATG	2	8	63320	63327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1383	NC_017324	TCA	2	6	63401	63406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_017324	GTC	2	6	63432	63437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1385	NC_017324	TC	3	6	63537	63542	0 %	50 %	0 %	50 %	384531581
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1499	NC_017324	ACTG	2	8	69314	69321	25 %	25 %	25 %	25 %	384531585
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