MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017319	CCTGA	2	10	100266	100275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2002	NC_017319	CCA	2	6	100300	100305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2003	NC_017319	C	6	6	100321	100326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2004	NC_017319	GAC	2	6	100335	100340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_017319	CTGG	2	8	100364	100371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2006	NC_017319	T	6	6	100456	100461	0 %	100 %	0 %	0 %	384546101
2007	NC_017319	CTG	2	6	100486	100491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546101
2008	NC_017319	CAGC	2	8	100561	100568	25 %	0 %	25 %	50 %	384546101
2009	NC_017319	ACCTT	2	10	100679	100688	20 %	40 %	0 %	40 %	384546101
2010	NC_017319	GA	3	6	100722	100727	50 %	0 %	50 %	0 %	384546101
2011	NC_017319	ACA	2	6	100827	100832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546101
2012	NC_017319	CG	3	6	100836	100841	0 %	0 %	50 %	50 %	384546101
2013	NC_017319	CAC	2	6	100845	100850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546101
2014	NC_017319	AAG	2	6	100853	100858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546101
2015	NC_017319	ACA	2	6	100923	100928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546101
2016	NC_017319	GTC	2	6	101010	101015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546101
2017	NC_017319	CGAAC	2	10	101028	101037	40 %	0 %	20 %	40 %	384546101
2018	NC_017319	GCTCCT	2	12	101043	101054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384546101
2019	NC_017319	GA	4	8	101063	101070	50 %	0 %	50 %	0 %	384546101
2020	NC_017319	GAAT	2	8	101073	101080	50 %	25 %	25 %	0 %	384546101
2021	NC_017319	CAG	2	6	101220	101225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546101
2022	NC_017319	GGC	2	6	101243	101248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546101
2023	NC_017319	TTG	2	6	101464	101469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_017319	C	6	6	101546	101551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2025	NC_017319	GAG	2	6	101608	101613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_017319	ATAA	2	8	101621	101628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_017319	CAT	2	6	101668	101673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_017319	GGA	2	6	101803	101808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_017319	CTG	2	6	101818	101823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_017319	CT	3	6	101890	101895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2031	NC_017319	TATCTT	2	12	102006	102017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2032	NC_017319	TGG	2	6	102020	102025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_017319	AGA	2	6	102060	102065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_017319	GCAG	2	8	102069	102076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2035	NC_017319	AT	3	6	102179	102184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_017319	ACA	2	6	102208	102213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_017319	TGAA	2	8	102217	102224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_017319	AGC	2	6	102253	102258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_017319	TAAG	2	8	102312	102319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_017319	TGG	2	6	102322	102327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_017319	CTAT	2	8	102340	102347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_017319	TCGG	2	8	102357	102364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2043	NC_017319	A	6	6	102409	102414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_017319	GGT	2	6	102429	102434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_017319	TGCTGA	2	12	102534	102545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2046	NC_017319	TAA	2	6	102560	102565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_017319	GTT	2	6	102584	102589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_017319	GACG	2	8	102595	102602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_017319	TGA	2	6	102603	102608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_017319	GTTC	2	8	102642	102649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2051	NC_017319	TAG	2	6	102681	102686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017319	TGC	2	6	102711	102716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_017319	TCG	2	6	102723	102728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_017319	AAC	2	6	102736	102741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_017319	GTTAT	2	10	102777	102786	20 %	60 %	20 %	0 %	384546102
2056	NC_017319	AT	3	6	102821	102826	50 %	50 %	0 %	0 %	384546102
2057	NC_017319	TCA	2	6	102833	102838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546102
2058	NC_017319	GTT	2	6	102880	102885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546102
2059	NC_017319	T	6	6	102884	102889	0 %	100 %	0 %	0 %	384546102
2060	NC_017319	TGC	2	6	102941	102946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546102
2061	NC_017319	TAA	2	6	103054	103059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546102
2062	NC_017319	ATA	2	6	103093	103098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546102
2063	NC_017319	CTT	2	6	103149	103154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546102
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2065	NC_017319	T	6	6	103189	103194	0 %	100 %	0 %	0 %	384546102
2066	NC_017319	TTTA	2	8	103209	103216	25 %	75 %	0 %	0 %	384546102
2067	NC_017319	TTA	2	6	103233	103238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546102
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2069	NC_017319	ATT	2	6	103399	103404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546102
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2071	NC_017319	T	6	6	103516	103521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_017319	TGGGG	2	10	103546	103555	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_017319	G	6	6	103552	103557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_017319	TG	3	6	103610	103615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_017319	TG	3	6	103666	103671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_017319	GAT	2	6	103742	103747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2078	NC_017319	TTTAT	2	10	103785	103794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_017319	AAAT	2	8	103900	103907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2081	NC_017319	TTATAA	2	12	103948	103959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2085	NC_017319	TGG	2	6	104077	104082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_017319	T	6	6	104084	104089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_017319	A	8	8	104104	104111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_017319	AGT	2	6	104115	104120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_017319	CAT	2	6	104219	104224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2095	NC_017319	TCTTT	2	10	104570	104579	0 %	80 %	0 %	20 %	384546103
2096	NC_017319	AAAT	2	8	104604	104611	75 %	25 %	0 %	0 %	384546103
2097	NC_017319	ATG	2	6	104663	104668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546103
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2099	NC_017319	AT	3	6	104686	104691	50 %	50 %	0 %	0 %	384546103
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2103	NC_017319	AAGTT	2	10	104816	104825	40 %	40 %	20 %	0 %	384546103
2104	NC_017319	ATT	2	6	104849	104854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546103
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2108	NC_017319	ATGCT	2	10	104984	104993	20 %	40 %	20 %	20 %	384546103
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2114	NC_017319	T	6	6	105240	105245	0 %	100 %	0 %	0 %	384546103
2115	NC_017319	TTA	2	6	105308	105313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546103
2116	NC_017319	CTTT	2	8	105333	105340	0 %	75 %	0 %	25 %	384546103
2117	NC_017319	CCTT	2	8	105344	105351	0 %	50 %	0 %	50 %	384546103
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2119	NC_017319	TGTA	2	8	105448	105455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2121	NC_017319	AAT	2	6	105539	105544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_017319	A	6	6	105582	105587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_017319	TAA	2	6	105651	105656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546104
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2129	NC_017319	TA	4	8	105903	105910	50 %	50 %	0 %	0 %	384546105
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