MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017319	ATTT	2	8	49117	49124	25 %	75 %	0 %	0 %	384546036
1002	NC_017319	CAA	2	6	49131	49136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546036
1003	NC_017319	AAT	2	6	49232	49237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017319	TGTA	2	8	49260	49267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017319	TGT	2	6	49290	49295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017319	ATT	2	6	49351	49356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017319	TAT	2	6	49364	49369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017319	AT	4	8	49380	49387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017319	GATA	2	8	49423	49430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017319	ATG	2	6	49464	49469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017319	A	6	6	49477	49482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017319	CAA	2	6	49516	49521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546037
1013	NC_017319	TGC	2	6	49533	49538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546037
1014	NC_017319	ATG	2	6	49558	49563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546037
1015	NC_017319	TTCCAT	2	12	49588	49599	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384546037
1016	NC_017319	TCCT	2	8	49606	49613	0 %	50 %	0 %	50 %	384546037
1017	NC_017319	GTG	2	6	49631	49636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546037
1018	NC_017319	A	6	6	49834	49839	100 %	0 %	0 %	0 %	384546038
1019	NC_017319	GTGAT	2	10	49880	49889	20 %	40 %	40 %	0 %	384546038
1020	NC_017319	GCTG	2	8	49946	49953	0 %	25 %	50 %	25 %	384546038
1021	NC_017319	GGA	2	6	49976	49981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546038
1022	NC_017319	TCT	2	6	50031	50036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546038
1023	NC_017319	CTG	2	6	50041	50046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546038
1024	NC_017319	AATCTG	2	12	50161	50172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546038
1025	NC_017319	ACA	2	6	50175	50180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546038
1026	NC_017319	CAC	2	6	50455	50460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546039
1027	NC_017319	A	6	6	50579	50584	100 %	0 %	0 %	0 %	384546039
1028	NC_017319	CTG	2	6	50593	50598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017319	CAT	2	6	50689	50694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017319	GAA	2	6	50736	50741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017319	GTT	2	6	50801	50806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546040
1032	NC_017319	TGG	2	6	50851	50856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546040
1033	NC_017319	TTAC	2	8	50989	50996	25 %	50 %	0 %	25 %	384546040
1034	NC_017319	TCA	2	6	51031	51036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546040
1035	NC_017319	GTAT	2	8	51176	51183	25 %	50 %	25 %	0 %	384546040
1036	NC_017319	AC	3	6	51193	51198	50 %	0 %	0 %	50 %	384546040
1037	NC_017319	GTGG	2	8	51356	51363	0 %	25 %	75 %	0 %	384546040
1038	NC_017319	CGA	2	6	51378	51383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546040
1039	NC_017319	CTC	2	6	51406	51411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546040
1040	NC_017319	GCAGAA	2	12	51414	51425	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384546040
1041	NC_017319	TTA	2	6	51431	51436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546040
1042	NC_017319	GAT	2	6	51453	51458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546040
1043	NC_017319	GCA	2	6	51522	51527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546041
1044	NC_017319	TGAA	2	8	51554	51561	50 %	25 %	25 %	0 %	384546041
1045	NC_017319	TGG	2	6	51566	51571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546041
1046	NC_017319	AGA	2	6	51572	51577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546041
1047	NC_017319	A	6	6	51592	51597	100 %	0 %	0 %	0 %	384546041
1048	NC_017319	TTA	2	6	51651	51656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546041
1049	NC_017319	TGA	2	6	51660	51665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546041
1050	NC_017319	GGCGGA	2	12	51672	51683	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384546041
1051	NC_017319	CAG	2	6	51692	51697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546041
1052	NC_017319	GTCT	2	8	51715	51722	0 %	50 %	25 %	25 %	384546041
1053	NC_017319	TTC	2	6	51742	51747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546041
1054	NC_017319	CTG	2	6	51778	51783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546041
1055	NC_017319	CTG	2	6	51889	51894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546041
1056	NC_017319	ATAA	2	8	51917	51924	75 %	25 %	0 %	0 %	384546041
1057	NC_017319	CGT	2	6	51986	51991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546042
1058	NC_017319	AGG	2	6	51999	52004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546042
1059	NC_017319	TTCA	2	8	52043	52050	25 %	50 %	0 %	25 %	384546042
1060	NC_017319	CTG	2	6	52127	52132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546042
1061	NC_017319	GGC	2	6	52165	52170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546042
1062	NC_017319	GTA	2	6	52187	52192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546042
1063	NC_017319	GCT	2	6	52279	52284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546042
1064	NC_017319	GTG	2	6	52313	52318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546042
1065	NC_017319	GAT	2	6	52319	52324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546042
1066	NC_017319	GCA	2	6	52440	52445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546042
1067	NC_017319	TGGCGG	2	12	52464	52475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384546042
1068	NC_017319	CAG	2	6	52476	52481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546042
1069	NC_017319	AT	3	6	52501	52506	50 %	50 %	0 %	0 %	384546042
1070	NC_017319	GGC	2	6	52585	52590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017319	TCA	2	6	52861	52866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546043
1072	NC_017319	TC	3	6	52900	52905	0 %	50 %	0 %	50 %	384546043
1073	NC_017319	CAG	2	6	52940	52945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1074	NC_017319	GTC	2	6	52988	52993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1075	NC_017319	GGT	2	6	53161	53166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546043
1076	NC_017319	ATG	2	6	53258	53263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546043
1077	NC_017319	CCAC	2	8	53328	53335	25 %	0 %	0 %	75 %	384546043
1078	NC_017319	T	6	6	53343	53348	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1079	NC_017319	GCT	2	6	53363	53368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1080	NC_017319	TAAA	2	8	53404	53411	75 %	25 %	0 %	0 %	384546043
1081	NC_017319	CATT	2	8	53500	53507	25 %	50 %	0 %	25 %	384546043
1082	NC_017319	AAGG	2	8	53585	53592	50 %	0 %	50 %	0 %	384546043
1083	NC_017319	CAT	2	6	53683	53688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546043
1084	NC_017319	T	6	6	53692	53697	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1085	NC_017319	CTG	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1086	NC_017319	TCA	2	6	53763	53768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546043
1087	NC_017319	CTGG	2	8	53808	53815	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
1088	NC_017319	TAT	2	6	53842	53847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546043
1089	NC_017319	TGT	2	6	53893	53898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546043
1090	NC_017319	TAT	2	6	53920	53925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546043
1091	NC_017319	GCATCA	2	12	54147	54158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546043
1092	NC_017319	TGT	2	6	54269	54274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546043
1093	NC_017319	GCT	2	6	54419	54424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1094	NC_017319	ACC	2	6	54500	54505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546043
1095	NC_017319	TC	3	6	54512	54517	0 %	50 %	0 %	50 %	384546043
1096	NC_017319	GAT	2	6	54531	54536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546043
1097	NC_017319	TGG	2	6	54688	54693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546043
1098	NC_017319	CTGG	2	8	54794	54801	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
1099	NC_017319	AAG	2	6	54802	54807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546043
1100	NC_017319	TCG	2	6	54808	54813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1101	NC_017319	CTT	2	6	54860	54865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546043
1102	NC_017319	GGCT	2	8	54981	54988	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
1103	NC_017319	T	6	6	55000	55005	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1104	NC_017319	TTA	2	6	55029	55034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546043
1105	NC_017319	CTG	2	6	55062	55067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1106	NC_017319	GAA	2	6	55082	55087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546043
1107	NC_017319	ATA	2	6	55139	55144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546043
1108	NC_017319	CTC	2	6	55159	55164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546043
1109	NC_017319	C	6	6	55166	55171	0 %	0 %	0 %	100 %	384546043
1110	NC_017319	T	6	6	55247	55252	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1111	NC_017319	ATG	2	6	55269	55274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546043
1112	NC_017319	GCC	2	6	55287	55292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546043
1113	NC_017319	ATT	2	6	55313	55318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546043
1114	NC_017319	TCC	2	6	55337	55342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546043
1115	NC_017319	GAC	2	6	55405	55410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1116	NC_017319	CTG	2	6	55463	55468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
1117	NC_017319	C	6	6	55626	55631	0 %	0 %	0 %	100 %	384546043
1118	NC_017319	ATT	2	6	55730	55735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546043
1119	NC_017319	AGG	2	6	55746	55751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546043
1120	NC_017319	T	6	6	55752	55757	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1121	NC_017319	CTTT	2	8	55777	55784	0 %	75 %	0 %	25 %	384546043
1122	NC_017319	CAT	2	6	55840	55845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546043
1123	NC_017319	GTG	2	6	55932	55937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546043
1124	NC_017319	TAGT	2	8	55956	55963	25 %	50 %	25 %	0 %	384546043
1125	NC_017319	T	8	8	55994	56001	0 %	100 %	0 %	0 %	384546043
1126	NC_017319	G	6	6	56023	56028	0 %	0 %	100 %	0 %	384546043
1127	NC_017319	ATC	2	6	56106	56111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546043
1128	NC_017319	GTT	2	6	56117	56122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546043
1129	NC_017319	GC	3	6	56134	56139	0 %	0 %	50 %	50 %	384546043
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1143	NC_017319	TTA	2	6	56953	56958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_017319	T	7	7	56999	57005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_017319	G	6	6	57028	57033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1168	NC_017319	CGGC	2	8	58157	58164	0 %	0 %	50 %	50 %	384546045
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1239	NC_017319	TTA	2	6	62019	62024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1241	NC_017319	ATAA	2	8	62069	62076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_017319	AACT	2	8	62082	62089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1243	NC_017319	ATA	2	6	62220	62225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546053
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1254	NC_017319	CAT	2	6	62625	62630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546053
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