MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 2282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017275	GTCAC	2	10	202	211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017275	GATAA	2	10	1085	1094	60 %	20 %	20 %	0 %	385772022
3	NC_017275	AGAGG	2	10	1155	1164	40 %	0 %	60 %	0 %	385772022
4	NC_017275	TCCTT	2	10	3690	3699	0 %	60 %	0 %	40 %	385772026
5	NC_017275	CGTTA	2	10	3933	3942	20 %	40 %	20 %	20 %	385772026
6	NC_017275	CTGTG	2	10	4364	4373	0 %	40 %	40 %	20 %	385772027
7	NC_017275	GTAAT	2	10	4510	4519	40 %	40 %	20 %	0 %	385772027
8	NC_017275	GTTTT	2	10	4584	4593	0 %	80 %	20 %	0 %	385772027
9	NC_017275	CTAAA	2	10	4927	4936	60 %	20 %	0 %	20 %	385772028
10	NC_017275	CTTAT	2	10	5133	5142	20 %	60 %	0 %	20 %	385772028
11	NC_017275	TTAAA	2	10	5728	5737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017275	ATGTT	2	10	5959	5968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017275	TGTGA	2	10	5993	6002	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017275	TTTTC	2	10	6614	6623	0 %	80 %	0 %	20 %	385772029
15	NC_017275	TAATT	2	10	6701	6710	40 %	60 %	0 %	0 %	385772029
16	NC_017275	TCTTA	2	10	7009	7018	20 %	60 %	0 %	20 %	385772030
17	NC_017275	ATATA	2	10	8064	8073	60 %	40 %	0 %	0 %	385772032
18	NC_017275	GAAAT	2	10	9650	9659	60 %	20 %	20 %	0 %	385772033
19	NC_017275	TTATA	2	10	10005	10014	40 %	60 %	0 %	0 %	385772034
20	NC_017275	TCTTT	2	10	12982	12991	0 %	80 %	0 %	20 %	385772036
21	NC_017275	TACAC	2	10	13493	13502	40 %	20 %	0 %	40 %	385772036
22	NC_017275	CCATG	2	10	17062	17071	20 %	20 %	20 %	40 %	385772039
23	NC_017275	TTTCC	2	10	17166	17175	0 %	60 %	0 %	40 %	385772039
24	NC_017275	TAATT	2	10	17385	17394	40 %	60 %	0 %	0 %	385772039
25	NC_017275	TGGCT	2	10	21023	21032	0 %	40 %	40 %	20 %	385772042
26	NC_017275	AAGAG	2	10	24001	24010	60 %	0 %	40 %	0 %	385772046
27	NC_017275	CTATG	2	10	25109	25118	20 %	40 %	20 %	20 %	385772048
28	NC_017275	GAAGA	2	10	26411	26420	60 %	0 %	40 %	0 %	385772049
29	NC_017275	TATTT	2	10	26767	26776	20 %	80 %	0 %	0 %	385772049
30	NC_017275	AAAAT	2	10	26999	27008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017275	CTTTT	2	10	27487	27496	0 %	80 %	0 %	20 %	385772050
32	NC_017275	AGTTA	2	10	28210	28219	40 %	40 %	20 %	0 %	385772051
33	NC_017275	TATCA	2	10	29924	29933	40 %	40 %	0 %	20 %	385772053
34	NC_017275	TTTCC	2	10	30772	30781	0 %	60 %	0 %	40 %	385772053
35	NC_017275	ATATG	2	10	31792	31801	40 %	40 %	20 %	0 %	385772054
36	NC_017275	TGTGG	2	10	32101	32110	0 %	40 %	60 %	0 %	385772055
37	NC_017275	CTTCT	2	10	33426	33435	0 %	60 %	0 %	40 %	385772056
38	NC_017275	GAAGG	2	10	34898	34907	40 %	0 %	60 %	0 %	385772058
39	NC_017275	ATTTT	2	10	36013	36022	20 %	80 %	0 %	0 %	385772060
40	NC_017275	CATAC	2	10	37109	37118	40 %	20 %	0 %	40 %	385772063
41	NC_017275	ATTAG	2	10	38247	38256	40 %	40 %	20 %	0 %	385772065
42	NC_017275	CTTTT	2	10	38274	38283	0 %	80 %	0 %	20 %	385772065
43	NC_017275	TGGTG	2	10	38881	38890	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017275	TTTTA	2	10	39066	39075	20 %	80 %	0 %	0 %	385772066
45	NC_017275	ATTAT	2	10	39243	39252	40 %	60 %	0 %	0 %	385772066
46	NC_017275	TACCT	2	10	41034	41043	20 %	40 %	0 %	40 %	385772068
47	NC_017275	AAGGA	2	10	41069	41078	60 %	0 %	40 %	0 %	385772068
48	NC_017275	ATTTG	2	10	42243	42252	20 %	60 %	20 %	0 %	385772070
49	NC_017275	AAGAT	2	10	44861	44870	60 %	20 %	20 %	0 %	385772074
50	NC_017275	TGAAT	2	10	44883	44892	40 %	40 %	20 %	0 %	385772074
51	NC_017275	TCTTT	2	10	46668	46677	0 %	80 %	0 %	20 %	385772076
52	NC_017275	TTTCT	2	10	46915	46924	0 %	80 %	0 %	20 %	385772076
53	NC_017275	TATAG	2	10	47702	47711	40 %	40 %	20 %	0 %	385772076
54	NC_017275	AAAGT	2	10	49685	49694	60 %	20 %	20 %	0 %	385772079
55	NC_017275	GATAA	2	10	51665	51674	60 %	20 %	20 %	0 %	385772081
56	NC_017275	TCTTT	2	10	53294	53303	0 %	80 %	0 %	20 %	385772083
57	NC_017275	ATTTA	2	10	54612	54621	40 %	60 %	0 %	0 %	385772083
58	NC_017275	TTTCT	2	10	54664	54673	0 %	80 %	0 %	20 %	385772083
59	NC_017275	TACCT	2	10	57094	57103	20 %	40 %	0 %	40 %	385772085
60	NC_017275	CTGTA	2	10	57353	57362	20 %	40 %	20 %	20 %	385772085
61	NC_017275	ATTTA	2	10	57607	57616	40 %	60 %	0 %	0 %	385772085
62	NC_017275	CATTT	2	10	58269	58278	20 %	60 %	0 %	20 %	385772086
63	NC_017275	TAAAT	2	10	60152	60161	60 %	40 %	0 %	0 %	385772087
64	NC_017275	TAATT	2	10	60866	60875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017275	CAACA	2	10	60969	60978	60 %	0 %	0 %	40 %	385772089
66	NC_017275	AGCTA	2	10	62753	62762	40 %	20 %	20 %	20 %	385772090
67	NC_017275	ATCCC	2	10	64814	64823	20 %	20 %	0 %	60 %	385772092
68	NC_017275	TTAAT	2	10	65194	65203	40 %	60 %	0 %	0 %	385772092
69	NC_017275	AAGCC	2	10	66450	66459	40 %	0 %	20 %	40 %	385772094
70	NC_017275	GTTTT	2	10	71903	71912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017275	AGGAT	2	10	72485	72494	40 %	20 %	40 %	0 %	385772105
72	NC_017275	ATTGA	2	10	73184	73193	40 %	40 %	20 %	0 %	385772106
73	NC_017275	GGAAT	2	10	74945	74954	40 %	20 %	40 %	0 %	385772108
74	NC_017275	ACTTT	2	10	76446	76455	20 %	60 %	0 %	20 %	385772110
75	NC_017275	CTTAT	2	10	77919	77928	20 %	60 %	0 %	20 %	385772112
76	NC_017275	TCTTT	2	10	78463	78472	0 %	80 %	0 %	20 %	385772112
77	NC_017275	ATGTG	2	10	78903	78912	20 %	40 %	40 %	0 %	385772112
78	NC_017275	TTGAG	2	10	78942	78951	20 %	40 %	40 %	0 %	385772112
79	NC_017275	CTCTT	2	10	79851	79860	0 %	60 %	0 %	40 %	385772113
80	NC_017275	TCAGC	2	10	80552	80561	20 %	20 %	20 %	40 %	385772114
81	NC_017275	ATATG	2	10	82033	82042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017275	ATTTT	2	10	84181	84190	20 %	80 %	0 %	0 %	385772117
83	NC_017275	AGATT	2	10	88862	88871	40 %	40 %	20 %	0 %	385772122
84	NC_017275	TAGCA	2	10	89267	89276	40 %	20 %	20 %	20 %	385772123
85	NC_017275	ATATT	2	10	89758	89767	40 %	60 %	0 %	0 %	385772123
86	NC_017275	TTTAA	2	10	91784	91793	40 %	60 %	0 %	0 %	385772124
87	NC_017275	CTAAT	2	10	92485	92494	40 %	40 %	0 %	20 %	385772125
88	NC_017275	AATTA	2	10	92780	92789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017275	CTTTA	2	10	92816	92825	20 %	60 %	0 %	20 %	385772126
90	NC_017275	TTAAG	2	10	94223	94232	40 %	40 %	20 %	0 %	385772128
91	NC_017275	ACGAT	2	10	94367	94376	40 %	20 %	20 %	20 %	385772128
92	NC_017275	AACGT	2	10	94417	94426	40 %	20 %	20 %	20 %	385772128
93	NC_017275	AGTCT	2	10	95943	95952	20 %	40 %	20 %	20 %	385772130
94	NC_017275	AGTTA	2	10	96750	96759	40 %	40 %	20 %	0 %	385772131
95	NC_017275	TCCAT	2	10	96983	96992	20 %	40 %	0 %	40 %	385772131
96	NC_017275	CTATC	2	10	97358	97367	20 %	40 %	0 %	40 %	385772132
97	NC_017275	TTTAG	2	10	97780	97789	20 %	60 %	20 %	0 %	385772132
98	NC_017275	TTTCT	2	10	97939	97948	0 %	80 %	0 %	20 %	385772132
99	NC_017275	CCAAT	2	10	99420	99429	40 %	20 %	0 %	40 %	385772134
100	NC_017275	TAAGT	2	10	99656	99665	40 %	40 %	20 %	0 %	385772134
101	NC_017275	TGAAA	2	10	100812	100821	60 %	20 %	20 %	0 %	385772137
102	NC_017275	CAACT	2	10	101884	101893	40 %	20 %	0 %	40 %	385772138
103	NC_017275	TTATC	2	10	102669	102678	20 %	60 %	0 %	20 %	385772139
104	NC_017275	AAATA	2	10	104818	104827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017275	ATATC	2	10	105173	105182	40 %	40 %	0 %	20 %	385772142
106	NC_017275	TAAGA	2	10	106569	106578	60 %	20 %	20 %	0 %	385772143
107	NC_017275	TTATC	2	10	106599	106608	20 %	60 %	0 %	20 %	385772143
108	NC_017275	TGATA	2	10	109904	109913	40 %	40 %	20 %	0 %	385772147
109	NC_017275	CTTTT	2	10	111260	111269	0 %	80 %	0 %	20 %	385772148
110	NC_017275	ATATT	2	10	111481	111490	40 %	60 %	0 %	0 %	385772149
111	NC_017275	TTTCC	2	10	112288	112297	0 %	60 %	0 %	40 %	385772150
112	NC_017275	GCTTT	2	10	113115	113124	0 %	60 %	20 %	20 %	385772150
113	NC_017275	CTATG	2	10	113362	113371	20 %	40 %	20 %	20 %	385772150
114	NC_017275	ATTTT	2	10	113974	113983	20 %	80 %	0 %	0 %	385772152
115	NC_017275	AGTGC	2	10	114427	114436	20 %	20 %	40 %	20 %	385772152
116	NC_017275	ACATT	2	10	114846	114855	40 %	40 %	0 %	20 %	385772153
117	NC_017275	TACAT	2	10	115005	115014	40 %	40 %	0 %	20 %	385772153
118	NC_017275	CATGC	2	10	115934	115943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017275	CACTA	2	10	116739	116748	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017275	GAGAT	2	10	118437	118446	40 %	20 %	40 %	0 %	385772157
121	NC_017275	CTTCA	2	10	118979	118988	20 %	40 %	0 %	40 %	385772158
122	NC_017275	TTTCC	2	10	119464	119473	0 %	60 %	0 %	40 %	385772158
123	NC_017275	AAATT	2	10	121086	121095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017275	GATTA	2	10	121544	121553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017275	GTAGT	2	10	121947	121956	20 %	40 %	40 %	0 %	385772161
126	NC_017275	TGGGT	2	10	122136	122145	0 %	40 %	60 %	0 %	385772161
127	NC_017275	TAGAA	2	10	123263	123272	60 %	20 %	20 %	0 %	385772162
128	NC_017275	AATTT	2	10	123516	123525	40 %	60 %	0 %	0 %	385772162
129	NC_017275	AAAGA	2	10	124963	124972	80 %	0 %	20 %	0 %	385772164
130	NC_017275	TATCT	2	10	128093	128102	20 %	60 %	0 %	20 %	385772168
131	NC_017275	AGTAA	2	10	129797	129806	60 %	20 %	20 %	0 %	385772170
132	NC_017275	AAGCG	2	10	130132	130141	40 %	0 %	40 %	20 %	385772171
133	NC_017275	ATTTC	2	10	131864	131873	20 %	60 %	0 %	20 %	385772174
134	NC_017275	GAAAA	2	10	134485	134494	80 %	0 %	20 %	0 %	385772176
135	NC_017275	AAGGT	2	10	134872	134881	40 %	20 %	40 %	0 %	385772176
136	NC_017275	AAATA	2	10	135132	135141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017275	CTTAA	2	10	139093	139102	40 %	40 %	0 %	20 %	385772181
138	NC_017275	GAGTC	2	10	143172	143181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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