MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 37683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017274	ATA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017274	TAG	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017274	AGA	2	6	119	124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432550
4	NC_017274	AAT	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
5	NC_017274	TGC	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
6	NC_017274	TTA	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432550
7	NC_017274	TGA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
8	NC_017274	GAT	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
9	NC_017274	AAT	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
10	NC_017274	TGA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
11	NC_017274	CAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432550
12	NC_017274	CCT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432550
13	NC_017274	ATA	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
14	NC_017274	ATA	2	6	975	980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
15	NC_017274	TGC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
16	NC_017274	AAT	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
17	NC_017274	GGT	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432550
18	NC_017274	GCT	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
19	NC_017274	AGA	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432550
20	NC_017274	ACT	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432550
21	NC_017274	ATA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017274	TAC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017274	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017274	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017274	TTA	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432551
26	NC_017274	TTC	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432551
27	NC_017274	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432551
28	NC_017274	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017274	CAG	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017274	GGT	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
31	NC_017274	GAG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432552
32	NC_017274	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
33	NC_017274	TGG	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
34	NC_017274	TAT	2	6	2506	2511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432552
35	NC_017274	GCT	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432552
36	NC_017274	ATC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432552
37	NC_017274	TAA	2	6	2851	2856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432552
38	NC_017274	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432552
39	NC_017274	TAT	2	6	2978	2983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432552
40	NC_017274	AAG	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
41	NC_017274	AGA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
42	NC_017274	TAA	2	6	3140	3145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432552
43	NC_017274	AGG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432552
44	NC_017274	TGG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
45	NC_017274	TGA	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432552
46	NC_017274	AGA	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
47	NC_017274	CTA	3	9	3477	3485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432553
48	NC_017274	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
49	NC_017274	AGG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432553
50	NC_017274	GAA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
51	NC_017274	ATT	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432553
52	NC_017274	TTA	2	6	3650	3655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432553
53	NC_017274	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
54	NC_017274	CTA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
55	NC_017274	TAT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432554
56	NC_017274	TAA	2	6	3839	3844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
57	NC_017274	TAG	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432554
58	NC_017274	ATA	2	6	3946	3951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
59	NC_017274	ATC	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
60	NC_017274	AGC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432554
61	NC_017274	ATT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432554
62	NC_017274	TTC	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432554
63	NC_017274	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
64	NC_017274	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
65	NC_017274	TGC	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432554
66	NC_017274	TGC	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432554
67	NC_017274	ATA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
68	NC_017274	AAT	2	6	4467	4472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
69	NC_017274	AAG	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017274	AGA	2	6	4687	4692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432555
71	NC_017274	AAG	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432555
72	NC_017274	CAC	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432555
73	NC_017274	TAT	2	6	4797	4802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432555
74	NC_017274	GTA	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432555
75	NC_017274	AAC	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432555
76	NC_017274	ATG	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432555
77	NC_017274	AGG	2	6	4838	4843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432555
78	NC_017274	ATA	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017274	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432556
80	NC_017274	CCA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432556
81	NC_017274	AAG	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432556
82	NC_017274	TTA	2	6	5201	5206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432556
83	NC_017274	TAT	3	9	5286	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432556
84	NC_017274	GTA	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432556
85	NC_017274	ATA	3	9	5394	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432556
86	NC_017274	TTC	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432557
87	NC_017274	TCC	2	6	5499	5504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432557
88	NC_017274	AAG	2	6	5864	5869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432557
89	NC_017274	AGT	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432557
90	NC_017274	TTA	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432557
91	NC_017274	TTC	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432557
92	NC_017274	GAA	2	6	6117	6122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432557
93	NC_017274	CCT	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432558
94	NC_017274	TCA	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432558
95	NC_017274	CTT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432558
96	NC_017274	CTT	2	6	6375	6380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432558
97	NC_017274	CCT	2	6	6477	6482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432558
98	NC_017274	CAT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432558
99	NC_017274	TCT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432558
100	NC_017274	CCT	2	6	6885	6890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432558
101	NC_017274	TAA	2	6	6922	6927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432558
102	NC_017274	CTT	2	6	6972	6977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432558
103	NC_017274	CAT	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017274	AAT	2	6	7213	7218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017274	AAT	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017274	TAT	2	6	7267	7272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017274	TAA	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017274	GAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017274	CGT	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017274	TAG	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017274	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017274	TAG	3	9	7918	7926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017274	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017274	TCA	2	6	7969	7974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432559
115	NC_017274	ATT	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432559
116	NC_017274	TTC	2	6	8043	8048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432559
117	NC_017274	TTC	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432559
118	NC_017274	TGT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432559
119	NC_017274	TAT	2	6	8220	8225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432559
120	NC_017274	TCT	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432559
121	NC_017274	TCC	2	6	8572	8577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432559
122	NC_017274	TCA	2	6	8581	8586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432559
123	NC_017274	CTA	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432559
124	NC_017274	TAA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432560
125	NC_017274	CTT	2	6	8821	8826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432560
126	NC_017274	TAT	2	6	8897	8902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432560
127	NC_017274	CTT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432560
128	NC_017274	TTG	2	6	8965	8970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432560
129	NC_017274	CTT	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432561
130	NC_017274	ACT	3	9	9118	9126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432561
131	NC_017274	CTA	2	6	9182	9187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432561
132	NC_017274	CTT	2	6	9197	9202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432561
133	NC_017274	ATC	2	6	9216	9221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432561
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