MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017274	ATA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017274	TAG	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017274	AGA	2	6	119	124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432550
4	NC_017274	A	6	6	167	172	100 %	0 %	0 %	0 %	384432550
5	NC_017274	AAT	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
6	NC_017274	TGC	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
7	NC_017274	TTA	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432550
8	NC_017274	TGA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
9	NC_017274	AGTGGA	2	12	641	652	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384432550
10	NC_017274	GAT	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
11	NC_017274	GAAA	2	8	745	752	75 %	0 %	25 %	0 %	384432550
12	NC_017274	AAT	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
13	NC_017274	TGA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432550
14	NC_017274	CAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432550
15	NC_017274	TA	3	6	846	851	50 %	50 %	0 %	0 %	384432550
16	NC_017274	CCT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432550
17	NC_017274	ATA	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
18	NC_017274	GATAG	2	10	918	927	40 %	20 %	40 %	0 %	384432550
19	NC_017274	CAGAC	2	10	956	965	40 %	0 %	20 %	40 %	384432550
20	NC_017274	ATA	2	6	975	980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
21	NC_017274	TGC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
22	NC_017274	AAT	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432550
23	NC_017274	GGT	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432550
24	NC_017274	ATGGG	2	10	1182	1191	20 %	20 %	60 %	0 %	384432550
25	NC_017274	GCT	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432550
26	NC_017274	AGA	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432550
27	NC_017274	ACT	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432550
28	NC_017274	TC	3	6	1391	1396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017274	T	6	6	1487	1492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017274	CCTT	2	8	1493	1500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017274	AG	3	6	1521	1526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017274	ATA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017274	TAC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017274	TA	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017274	A	6	6	1664	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017274	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017274	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017274	AGGT	2	8	1794	1801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017274	TTA	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432551
40	NC_017274	ACGT	2	8	1821	1828	25 %	25 %	25 %	25 %	384432551
41	NC_017274	TTC	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432551
42	NC_017274	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432551
43	NC_017274	AT	3	6	2046	2051	50 %	50 %	0 %	0 %	384432551
44	NC_017274	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017274	CAG	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017274	GGT	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
47	NC_017274	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	384432552
48	NC_017274	AG	3	6	2283	2288	50 %	0 %	50 %	0 %	384432552
49	NC_017274	AT	3	6	2290	2295	50 %	50 %	0 %	0 %	384432552
50	NC_017274	AT	3	6	2399	2404	50 %	50 %	0 %	0 %	384432552
51	NC_017274	GAG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432552
52	NC_017274	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
53	NC_017274	AG	3	6	2478	2483	50 %	0 %	50 %	0 %	384432552
54	NC_017274	TGG	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
55	NC_017274	TAT	2	6	2506	2511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432552
56	NC_017274	AACT	2	8	2527	2534	50 %	25 %	0 %	25 %	384432552
57	NC_017274	GATAA	2	10	2580	2589	60 %	20 %	20 %	0 %	384432552
58	NC_017274	TA	3	6	2618	2623	50 %	50 %	0 %	0 %	384432552
59	NC_017274	GAAGA	2	10	2648	2657	60 %	0 %	40 %	0 %	384432552
60	NC_017274	GCT	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432552
61	NC_017274	AT	3	6	2701	2706	50 %	50 %	0 %	0 %	384432552
62	NC_017274	ATC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432552
63	NC_017274	TAA	2	6	2851	2856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432552
64	NC_017274	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432552
65	NC_017274	CAGCT	2	10	2953	2962	20 %	20 %	20 %	40 %	384432552
66	NC_017274	TAT	2	6	2978	2983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432552
67	NC_017274	AGGA	2	8	2985	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	384432552
68	NC_017274	AG	3	6	3026	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	384432552
69	NC_017274	AAG	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
70	NC_017274	AGA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432552
71	NC_017274	TAA	2	6	3140	3145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432552
72	NC_017274	AGG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432552
73	NC_017274	ATATC	2	10	3184	3193	40 %	40 %	0 %	20 %	384432552
74	NC_017274	TAAT	2	8	3229	3236	50 %	50 %	0 %	0 %	384432552
75	NC_017274	TGG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432552
76	NC_017274	TAGTAT	2	12	3323	3334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384432552
77	NC_017274	TGA	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432552
78	NC_017274	AGA	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
79	NC_017274	GA	3	6	3376	3381	50 %	0 %	50 %	0 %	384432553
80	NC_017274	CTA	3	9	3477	3485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432553
81	NC_017274	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
82	NC_017274	AGG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432553
83	NC_017274	GAA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432553
84	NC_017274	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	384432553
85	NC_017274	ATT	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432553
86	NC_017274	A	6	6	3644	3649	100 %	0 %	0 %	0 %	384432553
87	NC_017274	TTA	2	6	3650	3655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432553
88	NC_017274	TAAA	2	8	3705	3712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017274	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
90	NC_017274	CTA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
91	NC_017274	TAT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432554
92	NC_017274	TAA	2	6	3839	3844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
93	NC_017274	TAG	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432554
94	NC_017274	TA	3	6	3859	3864	50 %	50 %	0 %	0 %	384432554
95	NC_017274	TAGG	2	8	3902	3909	25 %	25 %	50 %	0 %	384432554
96	NC_017274	AG	3	6	3916	3921	50 %	0 %	50 %	0 %	384432554
97	NC_017274	ATA	2	6	3946	3951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
98	NC_017274	ATC	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
99	NC_017274	CTTT	2	8	4000	4007	0 %	75 %	0 %	25 %	384432554
100	NC_017274	T	6	6	4005	4010	0 %	100 %	0 %	0 %	384432554
101	NC_017274	AGC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432554
102	NC_017274	AT	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	384432554
103	NC_017274	ATT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432554
104	NC_017274	TTC	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432554
105	NC_017274	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
106	NC_017274	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432554
107	NC_017274	TGC	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432554
108	NC_017274	TGC	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432554
109	NC_017274	TA	4	8	4403	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	384432554
110	NC_017274	ATA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
111	NC_017274	AAT	2	6	4467	4472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432554
112	NC_017274	AT	3	6	4471	4476	50 %	50 %	0 %	0 %	384432554
113	NC_017274	AAG	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017274	GGAT	2	8	4662	4669	25 %	25 %	50 %	0 %	384432555
115	NC_017274	AGA	2	6	4687	4692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432555
116	NC_017274	AAG	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432555
117	NC_017274	CAC	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432555
118	NC_017274	TG	4	8	4787	4794	0 %	50 %	50 %	0 %	384432555
119	NC_017274	TAT	2	6	4797	4802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432555
120	NC_017274	GTA	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432555
121	NC_017274	AAC	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432555
122	NC_017274	ATG	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432555
123	NC_017274	AGG	2	6	4838	4843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432555
124	NC_017274	AT	3	6	4910	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	384432555
125	NC_017274	ATA	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017274	TTTTGT	2	12	4941	4952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017274	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432556
128	NC_017274	AGAA	2	8	4987	4994	75 %	0 %	25 %	0 %	384432556
129	NC_017274	CCA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432556
130	NC_017274	AAG	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432556
131	NC_017274	TCCT	2	8	5175	5182	0 %	50 %	0 %	50 %	384432556
132	NC_017274	TTA	2	6	5201	5206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432556
133	NC_017274	GGGT	2	8	5221	5228	0 %	25 %	75 %	0 %	384432556
134	NC_017274	ACTA	2	8	5253	5260	50 %	25 %	0 %	25 %	384432556
135	NC_017274	TAT	3	9	5286	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432556
136	NC_017274	T	6	6	5294	5299	0 %	100 %	0 %	0 %	384432556
137	NC_017274	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	384432556
138	NC_017274	GTA	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432556
139	NC_017274	ATA	3	9	5394	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432556
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141	NC_017274	TTC	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432557
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175	NC_017274	TAA	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017274	CTATA	2	10	7361	7370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_017274	TAACG	2	10	7840	7849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_017274	GTA	2	6	10804	10809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017274	AG	3	6	11362	11367	50 %	0 %	50 %	0 %	384432563
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404	NC_017274	TCC	2	6	17018	17023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432567
405	NC_017274	AGA	2	6	17058	17063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432567
406	NC_017274	TAT	2	6	17225	17230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432567
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420	NC_017274	TAT	2	6	17811	17816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432567
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427	NC_017274	TTA	2	6	18132	18137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017274	TC	3	6	18256	18261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
429	NC_017274	TAA	2	6	18295	18300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_017274	G	6	6	18341	18346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_017274	TAT	2	6	18609	18614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017274	GTT	2	6	18660	18665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432568
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443	NC_017274	TCGC	2	8	18879	18886	0 %	25 %	25 %	50 %	384432568
444	NC_017274	TAA	2	6	18946	18951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432568
445	NC_017274	CTAA	2	8	19074	19081	50 %	25 %	0 %	25 %	384432568
446	NC_017274	ATA	2	6	19082	19087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432568
447	NC_017274	T	6	6	19103	19108	0 %	100 %	0 %	0 %	384432568
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452	NC_017274	AT	3	6	19326	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	384432568
453	NC_017274	TG	3	6	19332	19337	0 %	50 %	50 %	0 %	384432568
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464	NC_017274	AT	3	6	19690	19695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017274	TAT	2	6	19718	19723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_017274	AT	3	6	20413	20418	50 %	50 %	0 %	0 %	384432570
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497	NC_017274	GA	3	6	20924	20929	50 %	0 %	50 %	0 %	384432571
498	NC_017274	TAT	2	6	20947	20952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432571
499	NC_017274	TGG	2	6	20990	20995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432571
500	NC_017274	GAT	2	6	21018	21023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571

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