MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017274	CTT	2	6	111669	111674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432670
2502	NC_017274	T	6	6	111686	111691	0 %	100 %	0 %	0 %	384432670
2503	NC_017274	TTA	2	6	111729	111734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432670
2504	NC_017274	TGC	2	6	111797	111802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432670
2505	NC_017274	CCTT	2	8	111858	111865	0 %	50 %	0 %	50 %	384432670
2506	NC_017274	CTA	2	6	111880	111885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432670
2507	NC_017274	AGC	2	6	111911	111916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432670
2508	NC_017274	TAAG	2	8	111919	111926	50 %	25 %	25 %	0 %	384432670
2509	NC_017274	AAT	2	6	111930	111935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432670
2510	NC_017274	CAC	2	6	111949	111954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432670
2511	NC_017274	TCT	2	6	112014	112019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432670
2512	NC_017274	CAT	2	6	112130	112135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432670
2513	NC_017274	AT	4	8	112138	112145	50 %	50 %	0 %	0 %	384432670
2514	NC_017274	AAG	2	6	112151	112156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432670
2515	NC_017274	ATT	2	6	112302	112307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432670
2516	NC_017274	ATT	2	6	112353	112358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432670
2517	NC_017274	CTC	2	6	112370	112375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432670
2518	NC_017274	TAA	2	6	112388	112393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432670
2519	NC_017274	AT	3	6	112456	112461	50 %	50 %	0 %	0 %	384432670
2520	NC_017274	TAAT	2	8	112480	112487	50 %	50 %	0 %	0 %	384432670
2521	NC_017274	TCTTA	2	10	112559	112568	20 %	60 %	0 %	20 %	384432670
2522	NC_017274	CTC	2	6	112590	112595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432670
2523	NC_017274	TTC	2	6	112610	112615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432670
2524	NC_017274	GGT	2	6	112623	112628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432670
2525	NC_017274	TCT	2	6	112671	112676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432670
2526	NC_017274	AATGTA	2	12	112757	112768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384432670
2527	NC_017274	TAC	2	6	112801	112806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432670
2528	NC_017274	TCA	2	6	112824	112829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432670
2529	NC_017274	ACC	2	6	112969	112974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432671
2530	NC_017274	TC	3	6	112987	112992	0 %	50 %	0 %	50 %	384432671
2531	NC_017274	TTC	3	9	113004	113012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432671
2532	NC_017274	TTG	2	6	113022	113027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432671
2533	NC_017274	ATA	2	6	113109	113114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432671
2534	NC_017274	ATG	2	6	113213	113218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432671
2535	NC_017274	TTC	2	6	113228	113233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432671
2536	NC_017274	TATTT	2	10	113266	113275	20 %	80 %	0 %	0 %	384432671
2537	NC_017274	TTA	2	6	113412	113417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432671
2538	NC_017274	TA	3	6	113416	113421	50 %	50 %	0 %	0 %	384432671
2539	NC_017274	TAG	2	6	113440	113445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432671
2540	NC_017274	TCT	2	6	113536	113541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432671
2541	NC_017274	TAT	2	6	113566	113571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432671
2542	NC_017274	ACT	2	6	113617	113622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432672
2543	NC_017274	GGA	2	6	113647	113652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432672
2544	NC_017274	TACC	2	8	113675	113682	25 %	25 %	0 %	50 %	384432672
2545	NC_017274	ATTA	2	8	113691	113698	50 %	50 %	0 %	0 %	384432672
2546	NC_017274	ATA	2	6	113790	113795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432672
2547	NC_017274	TAA	2	6	113798	113803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432672
2548	NC_017274	AAT	2	6	113827	113832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432672
2549	NC_017274	ATT	2	6	113844	113849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432672
2550	NC_017274	TA	4	8	113859	113866	50 %	50 %	0 %	0 %	384432672
2551	NC_017274	TGCA	2	8	113949	113956	25 %	25 %	25 %	25 %	384432672
2552	NC_017274	CTA	2	6	114038	114043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432672
2553	NC_017274	CTGA	2	8	114084	114091	25 %	25 %	25 %	25 %	384432673
2554	NC_017274	AACTG	2	10	114111	114120	40 %	20 %	20 %	20 %	384432673
2555	NC_017274	AT	3	6	114155	114160	50 %	50 %	0 %	0 %	384432673
2556	NC_017274	GTATTA	2	12	114192	114203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384432673
2557	NC_017274	CTG	2	6	114242	114247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432673
2558	NC_017274	T	6	6	114282	114287	0 %	100 %	0 %	0 %	384432673
2559	NC_017274	TAT	2	6	114313	114318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432673
2560	NC_017274	TAG	2	6	114421	114426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432673
2561	NC_017274	TAC	2	6	114437	114442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432673
2562	NC_017274	A	6	6	114445	114450	100 %	0 %	0 %	0 %	384432673
2563	NC_017274	ATT	2	6	114495	114500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432673
2564	NC_017274	TCACT	2	10	114511	114520	20 %	40 %	0 %	40 %	384432673
2565	NC_017274	TTC	2	6	114526	114531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432673
2566	NC_017274	CCAATA	2	12	114539	114550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384432674
2567	NC_017274	GGA	2	6	114576	114581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432674
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2569	NC_017274	ATC	2	6	114684	114689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432674
2570	NC_017274	CAA	2	6	114803	114808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432674
2571	NC_017274	TAC	2	6	114833	114838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432674
2572	NC_017274	TGATA	2	10	114870	114879	40 %	40 %	20 %	0 %	384432674
2573	NC_017274	TGA	3	9	114888	114896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432674
2574	NC_017274	AGA	2	6	114939	114944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432674
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2578	NC_017274	TTG	3	9	115086	115094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432674
2579	NC_017274	GTA	2	6	115105	115110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432674
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2581	NC_017274	A	6	6	115170	115175	100 %	0 %	0 %	0 %	384432674
2582	NC_017274	TGC	2	6	115188	115193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432674
2583	NC_017274	TATGCT	2	12	115200	115211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384432674
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2585	NC_017274	GTT	2	6	115244	115249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432674
2586	NC_017274	GTTTAT	2	12	115263	115274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384432674
2587	NC_017274	CTCAC	2	10	115280	115289	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2588	NC_017274	A	7	7	115305	115311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017274	T	6	6	115334	115339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017274	CTGG	2	8	115378	115385	0 %	25 %	50 %	25 %	384432675
2591	NC_017274	TA	4	8	115386	115393	50 %	50 %	0 %	0 %	384432675
2592	NC_017274	GAG	2	6	115408	115413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432675
2593	NC_017274	TATTGT	2	12	115436	115447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384432675
2594	NC_017274	CAAA	2	8	115483	115490	75 %	0 %	0 %	25 %	384432675
2595	NC_017274	CGG	2	6	115513	115518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432675
2596	NC_017274	AACA	2	8	115583	115590	75 %	0 %	0 %	25 %	384432675
2597	NC_017274	AGTA	2	8	115594	115601	50 %	25 %	25 %	0 %	384432675
2598	NC_017274	TTC	2	6	115647	115652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432675
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2600	NC_017274	TAGA	2	8	115669	115676	50 %	25 %	25 %	0 %	384432675
2601	NC_017274	CTA	2	6	115686	115691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432675
2602	NC_017274	TAA	2	6	115693	115698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432675
2603	NC_017274	ATA	2	6	115727	115732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432675
2604	NC_017274	TA	3	6	115735	115740	50 %	50 %	0 %	0 %	384432675
2605	NC_017274	GT	3	6	115741	115746	0 %	50 %	50 %	0 %	384432675
2606	NC_017274	ATA	2	6	115781	115786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432675
2607	NC_017274	CTG	2	6	115811	115816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432675
2608	NC_017274	TAA	2	6	115883	115888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432675
2609	NC_017274	TA	4	8	115897	115904	50 %	50 %	0 %	0 %	384432675
2610	NC_017274	GTA	2	6	115950	115955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432675
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2612	NC_017274	TTTA	2	8	116099	116106	25 %	75 %	0 %	0 %	384432675
2613	NC_017274	AAT	2	6	116133	116138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432675
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2616	NC_017274	TCCTT	2	10	116222	116231	0 %	60 %	0 %	40 %	384432675
2617	NC_017274	T	6	6	116237	116242	0 %	100 %	0 %	0 %	384432675
2618	NC_017274	T	6	6	116284	116289	0 %	100 %	0 %	0 %	384432675
2619	NC_017274	TC	4	8	116331	116338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_017274	T	6	6	116375	116380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_017274	ATA	2	6	116444	116449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432676
2622	NC_017274	ATATT	2	10	116454	116463	40 %	60 %	0 %	0 %	384432676
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