MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017274	AGA	2	6	44099	44104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432601
1002	NC_017274	TTG	2	6	44111	44116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432601
1003	NC_017274	ATT	2	6	44146	44151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432601
1004	NC_017274	CCA	2	6	44152	44157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432601
1005	NC_017274	AGA	2	6	44175	44180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432601
1006	NC_017274	TTA	2	6	44252	44257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432601
1007	NC_017274	GGT	2	6	44278	44283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432601
1008	NC_017274	ATA	2	6	44287	44292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432601
1009	NC_017274	AAG	2	6	44307	44312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432601
1010	NC_017274	ATA	2	6	44440	44445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432601
1011	NC_017274	ATT	2	6	44538	44543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432601
1012	NC_017274	A	7	7	44596	44602	100 %	0 %	0 %	0 %	384432601
1013	NC_017274	CAG	2	6	44696	44701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432601
1014	NC_017274	ATG	2	6	44708	44713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432601
1015	NC_017274	AGAT	2	8	44753	44760	50 %	25 %	25 %	0 %	384432601
1016	NC_017274	ACAA	2	8	44761	44768	75 %	0 %	0 %	25 %	384432601
1017	NC_017274	GTAA	2	8	44797	44804	50 %	25 %	25 %	0 %	384432601
1018	NC_017274	AGA	2	6	44825	44830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432601
1019	NC_017274	ATTA	2	8	44847	44854	50 %	50 %	0 %	0 %	384432601
1020	NC_017274	GGTTT	2	10	44864	44873	0 %	60 %	40 %	0 %	384432601
1021	NC_017274	GAT	2	6	44910	44915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432601
1022	NC_017274	AAAT	2	8	44997	45004	75 %	25 %	0 %	0 %	384432602
1023	NC_017274	GAA	2	6	45119	45124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432602
1024	NC_017274	GATC	2	8	45202	45209	25 %	25 %	25 %	25 %	384432602
1025	NC_017274	TCA	2	6	45238	45243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432602
1026	NC_017274	AAG	2	6	45349	45354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432602
1027	NC_017274	ATATT	2	10	45385	45394	40 %	60 %	0 %	0 %	384432602
1028	NC_017274	TGG	2	6	45403	45408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432602
1029	NC_017274	AGCT	2	8	45435	45442	25 %	25 %	25 %	25 %	384432602
1030	NC_017274	GAT	2	6	45494	45499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432602
1031	NC_017274	TAA	2	6	45541	45546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432602
1032	NC_017274	AGAA	2	8	45576	45583	75 %	0 %	25 %	0 %	384432602
1033	NC_017274	A	7	7	45601	45607	100 %	0 %	0 %	0 %	384432602
1034	NC_017274	ATA	2	6	45612	45617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432602
1035	NC_017274	TTG	2	6	45641	45646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432603
1036	NC_017274	TAA	2	6	45650	45655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432603
1037	NC_017274	TTA	2	6	45693	45698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432603
1038	NC_017274	ATC	2	6	45755	45760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432603
1039	NC_017274	TTA	2	6	45778	45783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432603
1040	NC_017274	CAG	2	6	45811	45816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432603
1041	NC_017274	TTA	2	6	45817	45822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432603
1042	NC_017274	T	6	6	45914	45919	0 %	100 %	0 %	0 %	384432603
1043	NC_017274	T	6	6	46081	46086	0 %	100 %	0 %	0 %	384432603
1044	NC_017274	CTT	2	6	46117	46122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432603
1045	NC_017274	ATT	2	6	46221	46226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432603
1046	NC_017274	TCA	2	6	46231	46236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432603
1047	NC_017274	GTT	2	6	46241	46246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432603
1048	NC_017274	TTA	2	6	46259	46264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017274	ATC	2	6	46279	46284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017274	ATT	2	6	46310	46315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
1051	NC_017274	AACA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	0 %	25 %	384432604
1052	NC_017274	ACT	2	6	46358	46363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432604
1053	NC_017274	ATA	2	6	46446	46451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432604
1054	NC_017274	TAT	2	6	46484	46489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
1055	NC_017274	ATA	2	6	46501	46506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432604
1056	NC_017274	TTA	2	6	46583	46588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
1057	NC_017274	GAG	2	6	46614	46619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432604
1058	NC_017274	A	6	6	46632	46637	100 %	0 %	0 %	0 %	384432604
1059	NC_017274	ATT	2	6	46649	46654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
1060	NC_017274	AAG	2	6	46656	46661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432604
1061	NC_017274	GA	3	6	46704	46709	50 %	0 %	50 %	0 %	384432604
1062	NC_017274	GAT	2	6	46752	46757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432604
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1064	NC_017274	TAAG	2	8	46921	46928	50 %	25 %	25 %	0 %	384432604
1065	NC_017274	ATAA	2	8	46941	46948	75 %	25 %	0 %	0 %	384432604
1066	NC_017274	CTC	2	6	46978	46983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432604
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1069	NC_017274	ATT	2	6	47114	47119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
1070	NC_017274	TTA	2	6	47179	47184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432604
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1072	NC_017274	TCT	2	6	47210	47215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432604
1073	NC_017274	TGC	2	6	47219	47224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432604
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1076	NC_017274	TCA	2	6	47258	47263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432604
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1078	NC_017274	T	7	7	47393	47399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017274	TCT	2	6	47413	47418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017274	AAT	2	6	47476	47481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432605
1081	NC_017274	GAA	2	6	47615	47620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432605
1082	NC_017274	A	6	6	47720	47725	100 %	0 %	0 %	0 %	384432605
1083	NC_017274	AG	3	6	47757	47762	50 %	0 %	50 %	0 %	384432606
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1091	NC_017274	TCT	2	6	48161	48166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
1092	NC_017274	CTC	2	6	48183	48188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432606
1093	NC_017274	CTC	2	6	48201	48206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432606
1094	NC_017274	TTCGTA	2	12	48240	48251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384432606
1095	NC_017274	CTCTT	2	10	48252	48261	0 %	60 %	0 %	40 %	384432606
1096	NC_017274	TTCT	2	8	48262	48269	0 %	75 %	0 %	25 %	384432606
1097	NC_017274	CTC	2	6	48273	48278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432606
1098	NC_017274	ATC	2	6	48303	48308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432606
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1100	NC_017274	TCTCT	2	10	48364	48373	0 %	60 %	0 %	40 %	384432606
1101	NC_017274	TC	3	6	48375	48380	0 %	50 %	0 %	50 %	384432606
1102	NC_017274	CCTAT	2	10	48409	48418	20 %	40 %	0 %	40 %	384432606
1103	NC_017274	TCT	2	6	48499	48504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
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1107	NC_017274	ATG	2	6	48648	48653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432606
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1109	NC_017274	ATTT	2	8	48750	48757	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1110	NC_017274	TCTT	2	8	48868	48875	0 %	75 %	0 %	25 %	384432606
1111	NC_017274	ATTT	2	8	48900	48907	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1112	NC_017274	TAGT	2	8	48917	48924	25 %	50 %	25 %	0 %	384432606
1113	NC_017274	TGTA	2	8	48932	48939	25 %	50 %	25 %	0 %	384432606
1114	NC_017274	CTA	2	6	48947	48952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432606
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1116	NC_017274	CTTTCC	2	12	48964	48975	0 %	50 %	0 %	50 %	384432606
1117	NC_017274	TTA	2	6	49036	49041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
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1119	NC_017274	T	6	6	49104	49109	0 %	100 %	0 %	0 %	384432606
1120	NC_017274	ATTT	2	8	49122	49129	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1121	NC_017274	TGT	2	6	49134	49139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432606
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1123	NC_017274	TAG	2	6	49215	49220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432606
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1126	NC_017274	TATAG	2	10	49292	49301	40 %	40 %	20 %	0 %	384432606
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