MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017274	TGG	2	6	21062	21067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432571
502	NC_017274	CTA	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432571
503	NC_017274	GAG	2	6	21136	21141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432571
504	NC_017274	TGG	2	6	21191	21196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432571
505	NC_017274	TGG	2	6	21212	21217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432571
506	NC_017274	AG	3	6	21243	21248	50 %	0 %	50 %	0 %	384432571
507	NC_017274	ACT	2	6	21272	21277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432571
508	NC_017274	TTACT	2	10	21305	21314	20 %	60 %	0 %	20 %	384432571
509	NC_017274	TAT	2	6	21315	21320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432571
510	NC_017274	GAA	2	6	21530	21535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432571
511	NC_017274	ATGAT	2	10	21619	21628	40 %	40 %	20 %	0 %	384432571
512	NC_017274	AGA	2	6	21631	21636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432571
513	NC_017274	AACTA	2	10	21650	21659	60 %	20 %	0 %	20 %	384432571
514	NC_017274	GAT	2	6	21699	21704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
515	NC_017274	TGT	2	6	21745	21750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432571
516	NC_017274	GAG	2	6	21780	21785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432571
517	NC_017274	TAG	2	6	21821	21826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
518	NC_017274	AGA	2	6	21857	21862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432571
519	NC_017274	TGC	2	6	21866	21871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432571
520	NC_017274	GAA	2	6	21912	21917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432571
521	NC_017274	TAT	2	6	21921	21926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432571
522	NC_017274	TAA	2	6	21971	21976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432571
523	NC_017274	TAT	2	6	22042	22047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432571
524	NC_017274	TGA	2	6	22049	22054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
525	NC_017274	TGA	2	6	22064	22069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
526	NC_017274	TGT	2	6	22172	22177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432571
527	NC_017274	GGT	2	6	22178	22183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432571
528	NC_017274	TGA	2	6	22184	22189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
529	NC_017274	GGAT	2	8	22193	22200	25 %	25 %	50 %	0 %	384432571
530	NC_017274	TTAC	2	8	22227	22234	25 %	50 %	0 %	25 %	384432571
531	NC_017274	TAT	2	6	22236	22241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432571
532	NC_017274	GAT	2	6	22266	22271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432571
533	NC_017274	TAA	2	6	22297	22302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432571
534	NC_017274	TG	3	6	22343	22348	0 %	50 %	50 %	0 %	384432571
535	NC_017274	T	6	6	22424	22429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017274	ATA	2	6	22447	22452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432572
537	NC_017274	TAT	2	6	22463	22468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432572
538	NC_017274	TAAG	2	8	22582	22589	50 %	25 %	25 %	0 %	384432572
539	NC_017274	GTT	2	6	22692	22697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432572
540	NC_017274	GGA	2	6	22704	22709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432572
541	NC_017274	AGA	2	6	22745	22750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432572
542	NC_017274	ATC	2	6	22838	22843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432572
543	NC_017274	AGG	2	6	22912	22917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432572
544	NC_017274	ATT	2	6	22937	22942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432572
545	NC_017274	ACT	2	6	22977	22982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432572
546	NC_017274	GAAA	2	8	23004	23011	75 %	0 %	25 %	0 %	384432572
547	NC_017274	GAA	2	6	23015	23020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432572
548	NC_017274	TGA	2	6	23036	23041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432572
549	NC_017274	CTC	2	6	23047	23052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432572
550	NC_017274	TTA	2	6	23071	23076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432572
551	NC_017274	TGG	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432572
552	NC_017274	AATA	2	8	23208	23215	75 %	25 %	0 %	0 %	384432573
553	NC_017274	GGAT	2	8	23246	23253	25 %	25 %	50 %	0 %	384432573
554	NC_017274	T	6	6	23383	23388	0 %	100 %	0 %	0 %	384432573
555	NC_017274	TAA	2	6	23479	23484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432573
556	NC_017274	TAC	2	6	23508	23513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432573
557	NC_017274	ATAGT	2	10	23572	23581	40 %	40 %	20 %	0 %	384432573
558	NC_017274	AAG	2	6	23655	23660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432573
559	NC_017274	TCT	2	6	23711	23716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432573
560	NC_017274	AT	3	6	23719	23724	50 %	50 %	0 %	0 %	384432573
561	NC_017274	CCT	2	6	23764	23769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432573
562	NC_017274	AAGG	2	8	23771	23778	50 %	0 %	50 %	0 %	384432573
563	NC_017274	GT	3	6	23833	23838	0 %	50 %	50 %	0 %	384432574
564	NC_017274	ATT	2	6	23877	23882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432574
565	NC_017274	ATG	2	6	23955	23960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432574
566	NC_017274	AAC	2	6	24071	24076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432574
567	NC_017274	ATT	2	6	24180	24185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432574
568	NC_017274	GTA	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432574
569	NC_017274	AAG	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432574
570	NC_017274	T	6	6	24325	24330	0 %	100 %	0 %	0 %	384432574
571	NC_017274	GA	3	6	24388	24393	50 %	0 %	50 %	0 %	384432574
572	NC_017274	AT	3	6	24415	24420	50 %	50 %	0 %	0 %	384432574
573	NC_017274	CAAA	2	8	24439	24446	75 %	0 %	0 %	25 %	384432574
574	NC_017274	AGT	2	6	24465	24470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432575
575	NC_017274	TAA	2	6	24511	24516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432575
576	NC_017274	CTTAT	2	10	24560	24569	20 %	60 %	0 %	20 %	384432575
577	NC_017274	TC	3	6	24581	24586	0 %	50 %	0 %	50 %	384432575
578	NC_017274	AGT	2	6	24594	24599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432575
579	NC_017274	ATT	2	6	24653	24658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432575
580	NC_017274	T	6	6	24670	24675	0 %	100 %	0 %	0 %	384432575
581	NC_017274	TAT	2	6	24711	24716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432575
582	NC_017274	CT	3	6	24718	24723	0 %	50 %	0 %	50 %	384432575
583	NC_017274	CTT	2	6	24741	24746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432575
584	NC_017274	ATA	2	6	24767	24772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432575
585	NC_017274	TC	3	6	24789	24794	0 %	50 %	0 %	50 %	384432575
586	NC_017274	TCCT	2	8	24814	24821	0 %	50 %	0 %	50 %	384432575
587	NC_017274	ATCT	2	8	24859	24866	25 %	50 %	0 %	25 %	384432575
588	NC_017274	ATT	2	6	24923	24928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432575
589	NC_017274	TGG	2	6	24943	24948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432575
590	NC_017274	TAT	2	6	24985	24990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432575
591	NC_017274	TCGG	2	8	25108	25115	0 %	25 %	50 %	25 %	384432575
592	NC_017274	AAG	2	6	25118	25123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432575
593	NC_017274	TAG	2	6	25150	25155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432575
594	NC_017274	TAA	2	6	25271	25276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432576
595	NC_017274	ATA	2	6	25345	25350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432576
596	NC_017274	CT	3	6	25402	25407	0 %	50 %	0 %	50 %	384432576
597	NC_017274	A	6	6	25476	25481	100 %	0 %	0 %	0 %	384432576
598	NC_017274	AATTT	2	10	25630	25639	40 %	60 %	0 %	0 %	384432576
599	NC_017274	ACT	2	6	25663	25668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432576
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601	NC_017274	TGA	2	6	25851	25856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432576
602	NC_017274	AAGAG	2	10	25879	25888	60 %	0 %	40 %	0 %	384432576
603	NC_017274	ATT	2	6	25972	25977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432576
604	NC_017274	TA	3	6	26092	26097	50 %	50 %	0 %	0 %	384432576
605	NC_017274	GA	3	6	26220	26225	50 %	0 %	50 %	0 %	384432576
606	NC_017274	AT	3	6	26247	26252	50 %	50 %	0 %	0 %	384432576
607	NC_017274	TGA	2	6	26317	26322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017274	GAT	2	6	26341	26346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017274	TAGA	2	8	26361	26368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017274	ATA	2	6	26389	26394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017274	AT	3	6	26397	26402	50 %	50 %	0 %	0 %	384432577
612	NC_017274	ACT	2	6	26407	26412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432577
613	NC_017274	AGA	2	6	26472	26477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432577
614	NC_017274	AT	3	6	26560	26565	50 %	50 %	0 %	0 %	384432577
615	NC_017274	GAT	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432577
616	NC_017274	AT	3	6	26588	26593	50 %	50 %	0 %	0 %	384432577
617	NC_017274	TTCC	2	8	26604	26611	0 %	50 %	0 %	50 %	384432577
618	NC_017274	AAG	2	6	26636	26641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432577
619	NC_017274	AC	3	6	26648	26653	50 %	0 %	0 %	50 %	384432577
620	NC_017274	ATA	2	6	26693	26698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432577
621	NC_017274	ATT	2	6	26726	26731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432577
622	NC_017274	GAT	2	6	26794	26799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432577
623	NC_017274	ATT	2	6	26809	26814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432577
624	NC_017274	A	7	7	26904	26910	100 %	0 %	0 %	0 %	384432577
625	NC_017274	TA	3	6	26947	26952	50 %	50 %	0 %	0 %	384432577
626	NC_017274	TGT	2	6	27063	27068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432578
627	NC_017274	AAT	2	6	27135	27140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432578
628	NC_017274	GGT	2	6	27148	27153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432578
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