MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	AT	3	6	954	959	50 %	50 %	0 %	0 %	383760689
2	NC_017078	TA	4	8	2814	2821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017078	TA	6	12	2945	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	383760691
4	NC_017078	AT	3	6	5978	5983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017078	TA	3	6	6733	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	383760693
6	NC_017078	AT	3	6	9105	9110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017078	AG	3	6	9113	9118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017078	GC	3	6	10872	10877	0 %	0 %	50 %	50 %	383760697
9	NC_017078	TA	3	6	12223	12228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017078	AT	3	6	14592	14597	50 %	50 %	0 %	0 %	383760700
11	NC_017078	AT	3	6	15924	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017078	TC	3	6	15932	15937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017078	TG	3	6	18410	18415	0 %	50 %	50 %	0 %	383760704
14	NC_017078	GC	3	6	19123	19128	0 %	0 %	50 %	50 %	383760705
15	NC_017078	GA	3	6	19350	19355	50 %	0 %	50 %	0 %	383760705
16	NC_017078	AG	3	6	22428	22433	50 %	0 %	50 %	0 %	383760708
17	NC_017078	AT	3	6	24186	24191	50 %	50 %	0 %	0 %	383760710
18	NC_017078	TG	3	6	25235	25240	0 %	50 %	50 %	0 %	383760711
19	NC_017078	AG	3	6	26580	26585	50 %	0 %	50 %	0 %	383760714
20	NC_017078	AG	3	6	26900	26905	50 %	0 %	50 %	0 %	383760715
21	NC_017078	TG	3	6	27437	27442	0 %	50 %	50 %	0 %	383760716
22	NC_017078	AT	3	6	28466	28471	50 %	50 %	0 %	0 %	383760718
23	NC_017078	AT	3	6	29935	29940	50 %	50 %	0 %	0 %	383760720
24	NC_017078	GA	3	6	30550	30555	50 %	0 %	50 %	0 %	383760720
25	NC_017078	AT	3	6	31482	31487	50 %	50 %	0 %	0 %	383760722
26	NC_017078	AT	3	6	34064	34069	50 %	50 %	0 %	0 %	383760725
27	NC_017078	GA	3	6	34145	34150	50 %	0 %	50 %	0 %	383760725
28	NC_017078	GA	3	6	36279	36284	50 %	0 %	50 %	0 %	383760730
29	NC_017078	GT	3	6	37437	37442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017078	CA	3	6	38021	38026	50 %	0 %	0 %	50 %	383760732
31	NC_017078	GC	3	6	38699	38704	0 %	0 %	50 %	50 %	383760732
32	NC_017078	TA	3	6	41484	41489	50 %	50 %	0 %	0 %	383760733
33	NC_017078	GA	3	6	42966	42971	50 %	0 %	50 %	0 %	383760733
34	NC_017078	AT	3	6	43179	43184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017078	AT	4	8	43262	43269	50 %	50 %	0 %	0 %	383760734
36	NC_017078	GT	3	6	44119	44124	0 %	50 %	50 %	0 %	383760735
37	NC_017078	TA	3	6	44701	44706	50 %	50 %	0 %	0 %	383760736
38	NC_017078	AT	3	6	45568	45573	50 %	50 %	0 %	0 %	383760736
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41	NC_017078	TG	3	6	53612	53617	0 %	50 %	50 %	0 %	383760747
42	NC_017078	TA	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	383760748
43	NC_017078	GA	3	6	55481	55486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017078	AG	3	6	55787	55792	50 %	0 %	50 %	0 %	383760751
45	NC_017078	AT	3	6	57552	57557	50 %	50 %	0 %	0 %	383760754
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50	NC_017078	GC	3	6	61716	61721	0 %	0 %	50 %	50 %	383760760
51	NC_017078	CT	3	6	62178	62183	0 %	50 %	0 %	50 %	383760760
52	NC_017078	GA	3	6	63683	63688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017078	CG	3	6	64575	64580	0 %	0 %	50 %	50 %	383760762
54	NC_017078	GA	3	6	64982	64987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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56	NC_017078	TG	3	6	65261	65266	0 %	50 %	50 %	0 %	383760763
57	NC_017078	GA	3	6	65569	65574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017078	CG	3	6	66335	66340	0 %	0 %	50 %	50 %	383760765
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67	NC_017078	AT	3	6	76515	76520	50 %	50 %	0 %	0 %	383760777
68	NC_017078	TA	3	6	77525	77530	50 %	50 %	0 %	0 %	383760778
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70	NC_017078	TG	3	6	80812	80817	0 %	50 %	50 %	0 %	383760784
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74	NC_017078	GC	3	6	87261	87266	0 %	0 %	50 %	50 %	383760792
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76	NC_017078	TA	3	6	88166	88171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017078	TA	3	6	88178	88183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_017078	TA	3	6	88887	88892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017078	TA	3	6	88899	88904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017078	TA	4	8	89984	89991	50 %	50 %	0 %	0 %	383760795
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83	NC_017078	TG	3	6	93372	93377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017078	TA	3	6	93942	93947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_017078	TG	3	6	125474	125479	0 %	50 %	50 %	0 %	383760816
111	NC_017078	TG	3	6	126692	126697	0 %	50 %	50 %	0 %	383760816
112	NC_017078	AG	3	6	133575	133580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017078	GA	3	6	133592	133597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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120	NC_017078	GA	3	6	140904	140909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.