MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017078	CAT	3	9	196788	196796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760893
4002	NC_017078	GCC	2	6	196815	196820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760893
4003	NC_017078	TCT	2	6	196823	196828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760893
4004	NC_017078	TCA	2	6	196847	196852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760893
4005	NC_017078	GCA	2	6	196905	196910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760893
4006	NC_017078	TGC	2	6	197024	197029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760893
4007	NC_017078	TCAA	2	8	197054	197061	50 %	25 %	0 %	25 %	383760893
4008	NC_017078	GAT	2	6	197131	197136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760893
4009	NC_017078	A	7	7	197139	197145	100 %	0 %	0 %	0 %	383760893
4010	NC_017078	CTTT	2	8	197325	197332	0 %	75 %	0 %	25 %	383760894
4011	NC_017078	GCC	2	6	197416	197421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760894
4012	NC_017078	CTT	2	6	197426	197431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760894
4013	NC_017078	CAA	2	6	197518	197523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760894
4014	NC_017078	CAG	2	6	197637	197642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760894
4015	NC_017078	GCCA	2	8	197731	197738	25 %	0 %	25 %	50 %	383760894
4016	NC_017078	AATCA	2	10	197808	197817	60 %	20 %	0 %	20 %	383760894
4017	NC_017078	TTC	2	6	197902	197907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760894
4018	NC_017078	CT	3	6	197922	197927	0 %	50 %	0 %	50 %	383760894
4019	NC_017078	TTC	2	6	198040	198045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760895
4020	NC_017078	ATG	2	6	198091	198096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760895
4021	NC_017078	CAT	2	6	198245	198250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760896
4022	NC_017078	TTC	2	6	198277	198282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760896
4023	NC_017078	CA	3	6	198359	198364	50 %	0 %	0 %	50 %	383760896
4024	NC_017078	GCCA	2	8	198380	198387	25 %	0 %	25 %	50 %	383760896
4025	NC_017078	CTT	2	6	198407	198412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760896
4026	NC_017078	T	6	6	198498	198503	0 %	100 %	0 %	0 %	383760896
4027	NC_017078	C	6	6	198514	198519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4028	NC_017078	CTTCC	2	10	198539	198548	0 %	40 %	0 %	60 %	383760897
4029	NC_017078	ACC	2	6	198726	198731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760897
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4031	NC_017078	TC	3	6	198788	198793	0 %	50 %	0 %	50 %	383760897
4032	NC_017078	CA	3	6	198818	198823	50 %	0 %	0 %	50 %	383760897
4033	NC_017078	CGC	2	6	198887	198892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760897
4034	NC_017078	TTC	2	6	198946	198951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017078	TTC	2	6	198975	198980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760898
4036	NC_017078	TTC	2	6	199055	199060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760898
4037	NC_017078	TAT	2	6	199164	199169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760899
4038	NC_017078	CAG	2	6	199227	199232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760899
4039	NC_017078	GCCCT	2	10	199255	199264	0 %	20 %	20 %	60 %	383760899
4040	NC_017078	CCG	2	6	199296	199301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760899
4041	NC_017078	CAT	3	9	199305	199313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760899
4042	NC_017078	CAT	2	6	199350	199355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760899
4043	NC_017078	GTCT	2	8	199454	199461	0 %	50 %	25 %	25 %	383760899
4044	NC_017078	AAT	2	6	199465	199470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760899
4045	NC_017078	CAA	2	6	199554	199559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760900
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4047	NC_017078	TCC	3	9	199603	199611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760900
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4051	NC_017078	CTT	2	6	199790	199795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760900
4052	NC_017078	CAC	2	6	199806	199811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760900
4053	NC_017078	GGCA	2	8	199814	199821	25 %	0 %	50 %	25 %	383760900
4054	NC_017078	CAA	2	6	199829	199834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760900
4055	NC_017078	CTA	2	6	199864	199869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017078	ATT	2	6	199895	199900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017078	AATA	2	8	199940	199947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017078	A	6	6	199975	199980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017078	CTG	2	6	200012	200017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017078	ATTTT	2	10	200035	200044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017078	ATT	2	6	200102	200107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017078	AGG	2	6	200161	200166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017078	AGA	2	6	200180	200185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760901
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4067	NC_017078	CCAT	2	8	200406	200413	25 %	25 %	0 %	50 %	383760901
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4071	NC_017078	GTT	2	6	200538	200543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760901
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4094	NC_017078	CGG	2	6	201663	201668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760902
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4102	NC_017078	TCA	2	6	201905	201910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760903
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4108	NC_017078	A	6	6	202237	202242	100 %	0 %	0 %	0 %	383760903
4109	NC_017078	CACG	2	8	202275	202282	25 %	0 %	25 %	50 %	383760903
4110	NC_017078	GCCCCG	2	12	202394	202405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760903
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4112	NC_017078	TGG	2	6	202415	202420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760903
4113	NC_017078	ACT	2	6	202431	202436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760903
4114	NC_017078	GGC	2	6	202538	202543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017078	ATT	2	6	202577	202582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760904
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4121	NC_017078	ACATA	2	10	202799	202808	60 %	20 %	0 %	20 %	383760904
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4123	NC_017078	AGC	2	6	202851	202856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760904
4124	NC_017078	GCT	2	6	202881	202886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760904
4125	NC_017078	AAAG	2	8	202894	202901	75 %	0 %	25 %	0 %	383760904
4126	NC_017078	CTC	2	6	202949	202954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_017078	ATT	2	6	203009	203014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017078	TAA	2	6	203027	203032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017078	ATTG	2	8	203041	203048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017078	TGC	2	6	203052	203057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017078	T	6	6	203067	203072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017078	TCACT	2	10	203074	203083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4133	NC_017078	ATT	2	6	203095	203100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017078	TAA	2	6	203105	203110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017078	ATT	2	6	203139	203144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017078	ATGT	2	8	203165	203172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017078	GCA	2	6	203228	203233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_017078	TCA	2	6	203306	203311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760905
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4140	NC_017078	AAT	2	6	203378	203383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760905
4141	NC_017078	CAT	2	6	203452	203457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760905
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4143	NC_017078	CAT	2	6	203697	203702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760905
4144	NC_017078	TGA	2	6	203811	203816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760905
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4146	NC_017078	TGAA	2	8	203891	203898	50 %	25 %	25 %	0 %	383760905
4147	NC_017078	TGG	2	6	204111	204116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760905
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4151	NC_017078	AGC	2	6	204640	204645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760905
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4154	NC_017078	GAC	2	6	204740	204745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760905
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4156	NC_017078	CGC	2	6	204810	204815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760905
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4158	NC_017078	CCA	2	6	204852	204857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760905
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4162	NC_017078	TTC	2	6	204938	204943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760905
4163	NC_017078	TCTG	2	8	204983	204990	0 %	50 %	25 %	25 %	383760905
4164	NC_017078	CAT	2	6	205017	205022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760905
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4239	NC_017078	CGTC	2	8	209541	209548	0 %	25 %	25 %	50 %	383760905
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4357	NC_017078	CAT	2	6	215751	215756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760905
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4360	NC_017078	CTT	3	9	215820	215828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760905
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4482	NC_017078	GTTT	2	8	221965	221972	0 %	75 %	25 %	0 %	383760905
4483	NC_017078	TTG	2	6	221984	221989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760905
4484	NC_017078	GCTG	2	8	222004	222011	0 %	25 %	50 %	25 %	383760905
4485	NC_017078	CGG	2	6	222016	222021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760905
4486	NC_017078	ATG	2	6	222023	222028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760905
4487	NC_017078	GCC	2	6	222049	222054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760905
4488	NC_017078	GC	3	6	222134	222139	0 %	0 %	50 %	50 %	383760905
4489	NC_017078	GCC	3	9	222184	222192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760905
4490	NC_017078	GTC	2	6	222295	222300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760905
4491	NC_017078	CTG	2	6	222308	222313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760905
4492	NC_017078	GCC	2	6	222329	222334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760905
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4495	NC_017078	TTG	2	6	222461	222466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760905
4496	NC_017078	CTT	2	6	222619	222624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760905
4497	NC_017078	TGA	2	6	222672	222677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760905
4498	NC_017078	GCC	2	6	222688	222693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760905
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