MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	TC	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	383760554
2	NC_017076	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	383760554
3	NC_017076	AG	3	6	1500	1505	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
4	NC_017076	GA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
5	NC_017076	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
6	NC_017076	TA	3	6	2586	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017076	AT	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017076	AC	3	6	2731	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
9	NC_017076	AG	3	6	2790	2795	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
10	NC_017076	CA	3	6	2826	2831	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
11	NC_017076	AC	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
12	NC_017076	CT	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	383760560
13	NC_017076	CA	3	6	6814	6819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017076	GA	3	6	7676	7681	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
15	NC_017076	AG	3	6	7740	7745	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
16	NC_017076	TC	3	6	8349	8354	0 %	50 %	0 %	50 %	383760562
17	NC_017076	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	383760562
18	NC_017076	TA	3	6	10373	10378	50 %	50 %	0 %	0 %	383760564
19	NC_017076	AT	3	6	10497	10502	50 %	50 %	0 %	0 %	383760565
20	NC_017076	CA	3	6	11763	11768	50 %	0 %	0 %	50 %	383760566
21	NC_017076	TC	3	6	13779	13784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017076	AT	3	6	16373	16378	50 %	50 %	0 %	0 %	383760572
23	NC_017076	GC	3	6	17520	17525	0 %	0 %	50 %	50 %	383760574
24	NC_017076	AT	3	6	17662	17667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017076	GA	3	6	18081	18086	50 %	0 %	50 %	0 %	383760575
26	NC_017076	CT	3	6	18353	18358	0 %	50 %	0 %	50 %	383760575
27	NC_017076	TC	3	6	18422	18427	0 %	50 %	0 %	50 %	383760575
28	NC_017076	AT	4	8	18969	18976	50 %	50 %	0 %	0 %	383760576
29	NC_017076	TG	3	6	19044	19049	0 %	50 %	50 %	0 %	383760576
30	NC_017076	TA	3	6	19827	19832	50 %	50 %	0 %	0 %	383760576
31	NC_017076	CA	3	6	20489	20494	50 %	0 %	0 %	50 %	383760577
32	NC_017076	TA	3	6	20954	20959	50 %	50 %	0 %	0 %	383760577
33	NC_017076	GA	4	8	20993	21000	50 %	0 %	50 %	0 %	383760577
34	NC_017076	TC	3	6	21780	21785	0 %	50 %	0 %	50 %	383760578
35	NC_017076	TC	3	6	22825	22830	0 %	50 %	0 %	50 %	383760578
36	NC_017076	AC	3	6	22875	22880	50 %	0 %	0 %	50 %	383760578
37	NC_017076	CT	3	6	23093	23098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017076	AT	3	6	23218	23223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017076	AT	3	6	23785	23790	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
40	NC_017076	AT	3	6	24101	24106	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
41	NC_017076	TA	4	8	24402	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
42	NC_017076	AT	3	6	24892	24897	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
43	NC_017076	CG	3	6	25595	25600	0 %	0 %	50 %	50 %	383760581
44	NC_017076	GA	3	6	26517	26522	50 %	0 %	50 %	0 %	383760582
45	NC_017076	CT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017076	AT	3	6	29730	29735	50 %	50 %	0 %	0 %	383760587
47	NC_017076	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	383760588
48	NC_017076	TA	3	6	31136	31141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017076	TA	3	6	31160	31165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017076	TG	3	6	32052	32057	0 %	50 %	50 %	0 %	383760589
51	NC_017076	TA	3	6	34376	34381	50 %	50 %	0 %	0 %	383760592
52	NC_017076	AT	3	6	34427	34432	50 %	50 %	0 %	0 %	383760592
53	NC_017076	GA	3	6	35040	35045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017076	GT	3	6	36288	36293	0 %	50 %	50 %	0 %	383760597
55	NC_017076	GT	3	6	37336	37341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017076	TG	3	6	38038	38043	0 %	50 %	50 %	0 %	383760600
57	NC_017076	AT	3	6	38690	38695	50 %	50 %	0 %	0 %	383760601
58	NC_017076	CA	3	6	39862	39867	50 %	0 %	0 %	50 %	383760602
59	NC_017076	GA	3	6	40156	40161	50 %	0 %	50 %	0 %	383760602
60	NC_017076	TA	3	6	41571	41576	50 %	50 %	0 %	0 %	383760603
61	NC_017076	TG	3	6	41905	41910	0 %	50 %	50 %	0 %	383760604
62	NC_017076	AT	3	6	42017	42022	50 %	50 %	0 %	0 %	383760605
63	NC_017076	CT	3	6	43016	43021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017076	AT	3	6	43718	43723	50 %	50 %	0 %	0 %	383760608
65	NC_017076	AT	3	6	44112	44117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017076	GA	3	6	44848	44853	50 %	0 %	50 %	0 %	383760610
67	NC_017076	AT	3	6	44923	44928	50 %	50 %	0 %	0 %	383760610
68	NC_017076	GT	3	6	45174	45179	0 %	50 %	50 %	0 %	383760610
69	NC_017076	TA	3	6	45185	45190	50 %	50 %	0 %	0 %	383760610
70	NC_017076	AG	3	6	45879	45884	50 %	0 %	50 %	0 %	383760611
71	NC_017076	GA	3	6	46267	46272	50 %	0 %	50 %	0 %	383760611
72	NC_017076	AT	3	6	48108	48113	50 %	50 %	0 %	0 %	383760613
73	NC_017076	TG	3	6	50699	50704	0 %	50 %	50 %	0 %	383760616
74	NC_017076	GA	3	6	51067	51072	50 %	0 %	50 %	0 %	383760617
75	NC_017076	GA	3	6	51362	51367	50 %	0 %	50 %	0 %	383760617
76	NC_017076	AG	3	6	54114	54119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017076	CA	3	6	54281	54286	50 %	0 %	0 %	50 %	383760621
78	NC_017076	AG	3	6	57997	58002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017076	GT	3	6	59941	59946	0 %	50 %	50 %	0 %	383760630
80	NC_017076	TA	3	6	60805	60810	50 %	50 %	0 %	0 %	383760632
81	NC_017076	AT	3	6	60992	60997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017076	CT	3	6	61937	61942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017076	CT	3	6	62218	62223	0 %	50 %	0 %	50 %	383760634
84	NC_017076	TA	3	6	63152	63157	50 %	50 %	0 %	0 %	383760636
85	NC_017076	AT	3	6	65409	65414	50 %	50 %	0 %	0 %	383760639
86	NC_017076	GA	3	6	66042	66047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017076	TC	3	6	66072	66077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017076	AT	3	6	66701	66706	50 %	50 %	0 %	0 %	383760642
89	NC_017076	CT	3	6	68116	68121	0 %	50 %	0 %	50 %	383760645
90	NC_017076	AT	3	6	69263	69268	50 %	50 %	0 %	0 %	383760646
91	NC_017076	AT	5	10	69959	69968	50 %	50 %	0 %	0 %	383760647
92	NC_017076	AG	3	6	70097	70102	50 %	0 %	50 %	0 %	383760647
93	NC_017076	AT	3	6	71162	71167	50 %	50 %	0 %	0 %	383760648
94	NC_017076	TA	4	8	71450	71457	50 %	50 %	0 %	0 %	383760649
95	NC_017076	TG	3	6	71614	71619	0 %	50 %	50 %	0 %	383760649
96	NC_017076	TG	3	6	72728	72733	0 %	50 %	50 %	0 %	383760650
97	NC_017076	TA	3	6	75184	75189	50 %	50 %	0 %	0 %	383760654
98	NC_017076	AT	3	6	75867	75872	50 %	50 %	0 %	0 %	383760655
99	NC_017076	CA	3	6	77313	77318	50 %	0 %	0 %	50 %	383760657
100	NC_017076	TA	3	6	78411	78416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017076	TC	3	6	78420	78425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017076	TA	3	6	80152	80157	50 %	50 %	0 %	0 %	383760660
103	NC_017076	TC	3	6	80180	80185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017076	GT	3	6	80544	80549	0 %	50 %	50 %	0 %	383760662
105	NC_017076	TG	3	6	80963	80968	0 %	50 %	50 %	0 %	383760662
106	NC_017076	AT	3	6	84625	84630	50 %	50 %	0 %	0 %	383760665
107	NC_017076	TA	3	6	86872	86877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017076	AT	3	6	87650	87655	50 %	50 %	0 %	0 %	383760667
109	NC_017076	TC	3	6	89796	89801	0 %	50 %	0 %	50 %	383760668
110	NC_017076	TC	3	6	92460	92465	0 %	50 %	0 %	50 %	383760669
111	NC_017076	AT	3	6	93423	93428	50 %	50 %	0 %	0 %	383760670
112	NC_017076	CT	3	6	93579	93584	0 %	50 %	0 %	50 %	383760670
113	NC_017076	AT	3	6	94133	94138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017076	TA	3	6	94192	94197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017076	TA	3	6	94307	94312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017076	TA	3	6	94316	94321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.