MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 1838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017076	CAG	2	6	51304	51309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760617
1002	NC_017076	TGC	2	6	51345	51350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760617
1003	NC_017076	GA	3	6	51362	51367	50 %	0 %	50 %	0 %	383760617
1004	NC_017076	T	6	6	51428	51433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017076	TAT	2	6	51439	51444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017076	A	7	7	51491	51497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017076	AGT	2	6	51543	51548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017076	TAT	2	6	51555	51560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760618
1009	NC_017076	CAG	2	6	51579	51584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1010	NC_017076	CTG	2	6	51599	51604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1011	NC_017076	CAG	3	9	51607	51615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1012	NC_017076	GTG	2	6	51757	51762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760618
1013	NC_017076	CCA	2	6	51776	51781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760618
1014	NC_017076	CAG	2	6	51858	51863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1015	NC_017076	ATC	2	6	51889	51894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760618
1016	NC_017076	TGG	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760618
1017	NC_017076	CTT	2	6	51935	51940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760618
1018	NC_017076	TCA	2	6	52028	52033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760618
1019	NC_017076	CAGC	2	8	52061	52068	25 %	0 %	25 %	50 %	383760618
1020	NC_017076	TCCTTG	2	12	52108	52119	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383760618
1021	NC_017076	CCA	2	6	52156	52161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760618
1022	NC_017076	AGT	2	6	52188	52193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760618
1023	NC_017076	GCA	2	6	52211	52216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1024	NC_017076	CCA	2	6	52235	52240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760618
1025	NC_017076	CAG	2	6	52251	52256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1026	NC_017076	CAG	2	6	52326	52331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1027	NC_017076	GAT	2	6	52332	52337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760618
1028	NC_017076	TCT	2	6	52352	52357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760618
1029	NC_017076	CAT	2	6	52413	52418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760618
1030	NC_017076	CAG	2	6	52422	52427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760618
1031	NC_017076	CCG	2	6	52444	52449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760618
1032	NC_017076	TTCT	2	8	52524	52531	0 %	75 %	0 %	25 %	383760618
1033	NC_017076	CCT	2	6	52548	52553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017076	TTG	2	6	52700	52705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760619
1035	NC_017076	GTT	2	6	52858	52863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760619
1036	NC_017076	CTT	2	6	52938	52943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760619
1037	NC_017076	TCA	2	6	53096	53101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760619
1038	NC_017076	TAG	2	6	53104	53109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760619
1039	NC_017076	CAA	2	6	53280	53285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760619
1040	NC_017076	CTC	2	6	53317	53322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760619
1041	NC_017076	GCG	2	6	53327	53332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760619
1042	NC_017076	CGG	2	6	53439	53444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760619
1043	NC_017076	GCC	2	6	53455	53460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760619
1044	NC_017076	TCA	2	6	53563	53568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760620
1045	NC_017076	TTC	2	6	53571	53576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760620
1046	NC_017076	GAT	2	6	53597	53602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760620
1047	NC_017076	T	6	6	53714	53719	0 %	100 %	0 %	0 %	383760620
1048	NC_017076	GCC	2	6	53823	53828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760620
1049	NC_017076	GAT	2	6	53901	53906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760620
1050	NC_017076	TCT	2	6	53914	53919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760620
1051	NC_017076	TTC	2	6	53946	53951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760620
1052	NC_017076	CTGC	2	8	54008	54015	0 %	25 %	25 %	50 %	383760620
1053	NC_017076	CAT	2	6	54045	54050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760620
1054	NC_017076	GAT	2	6	54088	54093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017076	TAATA	2	10	54103	54112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017076	AG	3	6	54114	54119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017076	CAGA	2	8	54139	54146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_017076	CA	3	6	54281	54286	50 %	0 %	0 %	50 %	383760621
1059	NC_017076	TGG	2	6	54342	54347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760621
1060	NC_017076	CCG	2	6	54504	54509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760621
1061	NC_017076	GAT	2	6	54566	54571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760621
1062	NC_017076	CAT	2	6	54580	54585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760621
1063	NC_017076	GAAG	2	8	54649	54656	50 %	0 %	50 %	0 %	383760621
1064	NC_017076	TGG	3	9	54714	54722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760621
1065	NC_017076	TGG	2	6	54750	54755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760621
1066	NC_017076	CGA	2	6	54788	54793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760621
1067	NC_017076	CGG	2	6	54799	54804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760621
1068	NC_017076	AAGGA	2	10	54827	54836	60 %	0 %	40 %	0 %	383760621
1069	NC_017076	AGC	2	6	54966	54971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017076	TGG	2	6	55112	55117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760622
1071	NC_017076	TGG	2	6	55127	55132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760622
1072	NC_017076	AGC	2	6	55138	55143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760622
1073	NC_017076	GCAG	2	8	55163	55170	25 %	0 %	50 %	25 %	383760622
1074	NC_017076	AGGC	2	8	55200	55207	25 %	0 %	50 %	25 %	383760622
1075	NC_017076	G	6	6	55226	55231	0 %	0 %	100 %	0 %	383760622
1076	NC_017076	TGG	2	6	55241	55246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760622
1077	NC_017076	CCG	2	6	55253	55258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760622
1078	NC_017076	GCT	2	6	55277	55282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760622
1079	NC_017076	TGGCTG	2	12	55415	55426	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383760622
1080	NC_017076	A	6	6	55442	55447	100 %	0 %	0 %	0 %	383760622
1081	NC_017076	GCA	2	6	55448	55453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760622
1082	NC_017076	CAG	2	6	55467	55472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760622
1083	NC_017076	GGC	2	6	55517	55522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760622
1084	NC_017076	GCAG	2	8	55550	55557	25 %	0 %	50 %	25 %	383760622
1085	NC_017076	CAG	2	6	55563	55568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760622
1086	NC_017076	CAGC	2	8	55573	55580	25 %	0 %	25 %	50 %	383760622
1087	NC_017076	GAA	2	6	55626	55631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017076	AGC	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017076	A	6	6	55718	55723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017076	ATAC	2	8	55754	55761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_017076	ATT	2	6	55822	55827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760623
1092	NC_017076	CAT	2	6	55850	55855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760623
1093	NC_017076	GTAA	2	8	55893	55900	50 %	25 %	25 %	0 %	383760623
1094	NC_017076	AGT	2	6	56027	56032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760623
1095	NC_017076	TCA	2	6	56038	56043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760623
1096	NC_017076	T	6	6	56187	56192	0 %	100 %	0 %	0 %	383760624
1097	NC_017076	GAC	2	6	56196	56201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760624
1098	NC_017076	GACG	2	8	56297	56304	25 %	0 %	50 %	25 %	383760624
1099	NC_017076	TGG	2	6	56315	56320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760624
1100	NC_017076	AGT	2	6	56333	56338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760624
1101	NC_017076	TTG	2	6	56432	56437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760624
1102	NC_017076	GCAC	2	8	56486	56493	25 %	0 %	25 %	50 %	383760624
1103	NC_017076	CTT	2	6	56573	56578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760624
1104	NC_017076	CCA	2	6	56585	56590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760624
1105	NC_017076	CCA	2	6	56605	56610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760624
1106	NC_017076	CTTC	2	8	56749	56756	0 %	50 %	0 %	50 %	383760624
1107	NC_017076	CTC	2	6	56811	56816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760624
1108	NC_017076	TTC	2	6	56865	56870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760624
1109	NC_017076	TTC	2	6	56878	56883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760624
1110	NC_017076	TTC	2	6	57006	57011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760624
1111	NC_017076	CAAT	2	8	57021	57028	50 %	25 %	0 %	25 %	383760624
1112	NC_017076	CAA	2	6	57097	57102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017076	GAG	2	6	57128	57133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017076	A	6	6	57146	57151	100 %	0 %	0 %	0 %	383760625
1115	NC_017076	ATG	2	6	57155	57160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760625
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1119	NC_017076	TGA	2	6	57373	57378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760626
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1121	NC_017076	CGG	3	9	57474	57482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760626
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