MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	TCTGA	2	10	1040	1049	20 %	40 %	20 %	20 %	383080720
2	NC_017074	TTTCC	2	10	2465	2474	0 %	60 %	0 %	40 %	383080721
3	NC_017074	AAGGA	2	10	4018	4027	60 %	0 %	40 %	0 %	383080723
4	NC_017074	GCTGT	2	10	4297	4306	0 %	40 %	40 %	20 %	383080724
5	NC_017074	ACCTT	2	10	5770	5779	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017074	TTCTA	2	10	6744	6753	20 %	60 %	0 %	20 %	383080727
7	NC_017074	GGAAT	2	10	7067	7076	40 %	20 %	40 %	0 %	383080727
8	NC_017074	AATGA	2	10	8405	8414	60 %	20 %	20 %	0 %	383080728
9	NC_017074	TTTCT	2	10	11828	11837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017074	GACCT	2	10	14119	14128	20 %	20 %	20 %	40 %	383080738
11	NC_017074	ACAAG	2	10	14223	14232	60 %	0 %	20 %	20 %	383080738
12	NC_017074	AAGGA	2	10	14749	14758	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017074	GACTG	2	10	15664	15673	20 %	20 %	40 %	20 %	383080739
14	NC_017074	GAATT	2	10	18620	18629	40 %	40 %	20 %	0 %	383080744
15	NC_017074	ACAGC	2	10	20064	20073	40 %	0 %	20 %	40 %	383080746
16	NC_017074	AGACC	2	10	22199	22208	40 %	0 %	20 %	40 %	383080750
17	NC_017074	CTGAA	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	383080750
18	NC_017074	CACTG	2	10	23201	23210	20 %	20 %	20 %	40 %	383080750
19	NC_017074	TATGT	2	10	26785	26794	20 %	60 %	20 %	0 %	383080752
20	NC_017074	CAGTA	2	10	31398	31407	40 %	20 %	20 %	20 %	383080757
21	NC_017074	AGCGT	2	10	31671	31680	20 %	20 %	40 %	20 %	383080757
22	NC_017074	AGAAA	2	10	32347	32356	80 %	0 %	20 %	0 %	383080758
23	NC_017074	ATGAC	2	10	34422	34431	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017074	ACTGT	2	10	34654	34663	20 %	40 %	20 %	20 %	383080764
25	NC_017074	ATGAC	2	10	34926	34935	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017074	TTTTG	2	10	35073	35082	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.