MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017074	GCA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
502	NC_017074	AGACC	2	10	22199	22208	40 %	0 %	20 %	40 %	383080750
503	NC_017074	CTGAA	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	383080750
504	NC_017074	TAC	2	6	22357	22362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080750
505	NC_017074	GTT	3	9	22395	22403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080750
506	NC_017074	TCGC	2	8	22404	22411	0 %	25 %	25 %	50 %	383080750
507	NC_017074	GGC	2	6	22455	22460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
508	NC_017074	CGG	2	6	22585	22590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
509	NC_017074	CAGG	2	8	22626	22633	25 %	0 %	50 %	25 %	383080750
510	NC_017074	CA	3	6	22675	22680	50 %	0 %	0 %	50 %	383080750
511	NC_017074	CAA	2	6	22775	22780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080750
512	NC_017074	TGAC	2	8	22783	22790	25 %	25 %	25 %	25 %	383080750
513	NC_017074	GCG	3	9	22800	22808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
514	NC_017074	ACA	2	6	22859	22864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080750
515	NC_017074	GCT	2	6	22929	22934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
516	NC_017074	GCA	2	6	22956	22961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
517	NC_017074	GAA	2	6	22976	22981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080750
518	NC_017074	TGC	2	6	22991	22996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
519	NC_017074	AT	3	6	23027	23032	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
520	NC_017074	GCAG	2	8	23036	23043	25 %	0 %	50 %	25 %	383080750
521	NC_017074	TC	3	6	23070	23075	0 %	50 %	0 %	50 %	383080750
522	NC_017074	CAAA	2	8	23094	23101	75 %	0 %	0 %	25 %	383080750
523	NC_017074	ATT	2	6	23106	23111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080750
524	NC_017074	CTG	2	6	23145	23150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
525	NC_017074	TGGT	2	8	23152	23159	0 %	50 %	50 %	0 %	383080750
526	NC_017074	TCT	2	6	23173	23178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080750
527	NC_017074	CACTG	2	10	23201	23210	20 %	20 %	20 %	40 %	383080750
528	NC_017074	GCA	2	6	23211	23216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
529	NC_017074	ACA	2	6	23253	23258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080750
530	NC_017074	ATT	2	6	23312	23317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080750
531	NC_017074	TGC	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
532	NC_017074	TA	3	6	23380	23385	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
533	NC_017074	AAT	2	6	23451	23456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080750
534	NC_017074	CTG	2	6	23474	23479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
535	NC_017074	AGC	2	6	23493	23498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
536	NC_017074	AAC	2	6	23505	23510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080750
537	NC_017074	CTG	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
538	NC_017074	GCA	2	6	23583	23588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
539	NC_017074	TTG	2	6	23608	23613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080750
540	NC_017074	A	6	6	23628	23633	100 %	0 %	0 %	0 %	383080750
541	NC_017074	TTG	2	6	23722	23727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080750
542	NC_017074	AAG	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080750
543	NC_017074	A	6	6	23789	23794	100 %	0 %	0 %	0 %	383080750
544	NC_017074	GGC	2	6	23814	23819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
545	NC_017074	TA	3	6	23821	23826	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
546	NC_017074	TA	3	6	23883	23888	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
547	NC_017074	TCCT	2	8	23925	23932	0 %	50 %	0 %	50 %	383080750
548	NC_017074	GTC	2	6	24030	24035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
549	NC_017074	CTT	2	6	24084	24089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080750
550	NC_017074	GAA	2	6	24177	24182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080750
551	NC_017074	GCT	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
552	NC_017074	CGG	2	6	24284	24289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
553	NC_017074	GCA	2	6	24290	24295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
554	NC_017074	CGG	2	6	24344	24349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
555	NC_017074	TCG	2	6	24382	24387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
556	NC_017074	TAAA	2	8	24466	24473	75 %	25 %	0 %	0 %	383080750
557	NC_017074	ACG	2	6	24522	24527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
558	NC_017074	GCA	2	6	24644	24649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
559	NC_017074	CAA	2	6	24656	24661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080750
560	NC_017074	GTC	2	6	24699	24704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
561	NC_017074	GAA	2	6	24708	24713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080750
562	NC_017074	CAAT	2	8	24766	24773	50 %	25 %	0 %	25 %	383080750
563	NC_017074	GAG	2	6	24781	24786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080750
564	NC_017074	CCT	2	6	24799	24804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017074	AGG	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017074	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	383080751
567	NC_017074	ATAA	2	8	25017	25024	75 %	25 %	0 %	0 %	383080751
568	NC_017074	GCG	2	6	25027	25032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080751
569	NC_017074	GAAA	2	8	25061	25068	75 %	0 %	25 %	0 %	383080751
570	NC_017074	CAA	2	6	25109	25114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080751
571	NC_017074	AAG	3	9	25347	25355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080751
572	NC_017074	TCCT	2	8	25365	25372	0 %	50 %	0 %	50 %	383080751
573	NC_017074	ACTG	2	8	25433	25440	25 %	25 %	25 %	25 %	383080751
574	NC_017074	AGG	2	6	25454	25459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080751
575	NC_017074	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	383080751
576	NC_017074	GGC	2	6	25515	25520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080751
577	NC_017074	ACC	2	6	25933	25938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080752
578	NC_017074	CATG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	25 %	25 %	383080752
579	NC_017074	CGT	2	6	26156	26161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080752
580	NC_017074	AGA	2	6	26180	26185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080752
581	NC_017074	ACG	2	6	26197	26202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
582	NC_017074	GCCA	2	8	26220	26227	25 %	0 %	25 %	50 %	383080752
583	NC_017074	A	6	6	26303	26308	100 %	0 %	0 %	0 %	383080752
584	NC_017074	AAG	2	6	26322	26327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080752
585	NC_017074	CAG	2	6	26340	26345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
586	NC_017074	GAC	2	6	26358	26363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
587	NC_017074	CAG	2	6	26376	26381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
588	NC_017074	GCA	2	6	26388	26393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
589	NC_017074	AGG	2	6	26476	26481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080752
590	NC_017074	GCT	2	6	26586	26591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080752
591	NC_017074	AAC	2	6	26640	26645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080752
592	NC_017074	GGCA	2	8	26681	26688	25 %	0 %	50 %	25 %	383080752
593	NC_017074	A	6	6	26763	26768	100 %	0 %	0 %	0 %	383080752
594	NC_017074	TATGT	2	10	26785	26794	20 %	60 %	20 %	0 %	383080752
595	NC_017074	GAC	3	9	26880	26888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
596	NC_017074	TGT	2	6	26891	26896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080752
597	NC_017074	CAG	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080752
598	NC_017074	TAT	2	6	27055	27060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017074	AT	4	8	27059	27066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017074	AGG	2	6	27086	27091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017074	TCC	2	6	27196	27201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080753
602	NC_017074	TA	3	6	27249	27254	50 %	50 %	0 %	0 %	383080753
603	NC_017074	CTG	2	6	27266	27271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080753
604	NC_017074	GGC	2	6	27329	27334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080753
605	NC_017074	GGT	2	6	27335	27340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080753
606	NC_017074	ACG	2	6	27401	27406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080753
607	NC_017074	GGC	2	6	27458	27463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080753
608	NC_017074	TAT	2	6	27475	27480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080753
609	NC_017074	AGG	2	6	27506	27511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080753
610	NC_017074	TTG	2	6	27533	27538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080754
611	NC_017074	ATAG	2	8	27559	27566	50 %	25 %	25 %	0 %	383080754
612	NC_017074	CTG	2	6	27586	27591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080754
613	NC_017074	GCC	2	6	27644	27649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080754
614	NC_017074	AT	3	6	27688	27693	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
615	NC_017074	AGA	2	6	27777	27782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080754
616	NC_017074	AT	3	6	27783	27788	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
617	NC_017074	CA	3	6	27792	27797	50 %	0 %	0 %	50 %	383080754
618	NC_017074	CTG	3	9	27815	27823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080754
619	NC_017074	AT	3	6	27864	27869	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
620	NC_017074	AGG	2	6	27962	27967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080754
621	NC_017074	CTA	2	6	28056	28061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080755
622	NC_017074	CTT	2	6	28095	28100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080755
623	NC_017074	GCAG	2	8	28228	28235	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
624	NC_017074	GGCA	2	8	28257	28264	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
625	NC_017074	AAAACG	2	12	28464	28475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383080755
626	NC_017074	CTG	2	6	28596	28601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080755
627	NC_017074	GTC	2	6	28619	28624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080755
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629	NC_017074	ATT	2	6	28658	28663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080755
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757	NC_017074	TAT	2	6	35002	35007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
758	NC_017074	AT	3	6	35006	35011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
759	NC_017074	TCC	2	6	35033	35038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
760	NC_017074	TTAT	2	8	35039	35046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
761	NC_017074	ACC	2	6	35052	35057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
762	NC_017074	GGT	2	6	35067	35072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
763	NC_017074	TTTTG	2	10	35073	35082	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
764	NC_017074	GTT	2	6	35107	35112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
765	NC_017074	CTA	2	6	35122	35127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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