MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017073	CT	3	6	319	324	0 %	50 %	0 %	50 %	383755758
2	NC_017073	AT	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	383755758
3	NC_017073	TA	3	6	1221	1226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017073	GT	3	6	3224	3229	0 %	50 %	50 %	0 %	383755761
5	NC_017073	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	383755761
6	NC_017073	CA	3	6	4722	4727	50 %	0 %	0 %	50 %	383755761
7	NC_017073	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017073	CT	3	6	5577	5582	0 %	50 %	0 %	50 %	383755764
9	NC_017073	AT	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	383755766
10	NC_017073	AG	3	6	11781	11786	50 %	0 %	50 %	0 %	383755772
11	NC_017073	TC	3	6	13028	13033	0 %	50 %	0 %	50 %	383755772
12	NC_017073	TC	3	6	14444	14449	0 %	50 %	0 %	50 %	383755773
13	NC_017073	TC	3	6	15871	15876	0 %	50 %	0 %	50 %	383755773
14	NC_017073	AT	3	6	18633	18638	50 %	50 %	0 %	0 %	383755774
15	NC_017073	CT	3	6	18681	18686	0 %	50 %	0 %	50 %	383755774
16	NC_017073	TC	4	8	19431	19438	0 %	50 %	0 %	50 %	383755776
17	NC_017073	TC	3	6	19669	19674	0 %	50 %	0 %	50 %	383755776
18	NC_017073	AT	4	8	21336	21343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017073	AT	3	6	21627	21632	50 %	50 %	0 %	0 %	383755779
20	NC_017073	CT	3	6	25383	25388	0 %	50 %	0 %	50 %	383755780
21	NC_017073	TC	3	6	26724	26729	0 %	50 %	0 %	50 %	383755780
22	NC_017073	CT	3	6	27781	27786	0 %	50 %	0 %	50 %	383755780
23	NC_017073	CT	3	6	27818	27823	0 %	50 %	0 %	50 %	383755780
24	NC_017073	CT	3	6	28815	28820	0 %	50 %	0 %	50 %	383755780
25	NC_017073	TA	3	6	28955	28960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017073	CT	3	6	29421	29426	0 %	50 %	0 %	50 %	383755781
27	NC_017073	TG	3	6	30310	30315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017073	AT	3	6	30428	30433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017073	AT	3	6	31396	31401	50 %	50 %	0 %	0 %	383755785
30	NC_017073	TC	4	8	31475	31482	0 %	50 %	0 %	50 %	383755785
31	NC_017073	AT	3	6	32552	32557	50 %	50 %	0 %	0 %	383755787
32	NC_017073	AT	3	6	32653	32658	50 %	50 %	0 %	0 %	383755787
33	NC_017073	CG	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	383755790
34	NC_017073	CA	3	6	35555	35560	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
35	NC_017073	TG	3	6	35820	35825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017073	AG	3	6	35848	35853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017073	AT	3	6	36126	36131	50 %	50 %	0 %	0 %	383755792
38	NC_017073	TC	3	6	36466	36471	0 %	50 %	0 %	50 %	383755792
39	NC_017073	AC	3	6	38540	38545	50 %	0 %	0 %	50 %	383755793
40	NC_017073	CA	3	6	40471	40476	50 %	0 %	0 %	50 %	383755796
41	NC_017073	TA	3	6	41454	41459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017073	AT	3	6	41534	41539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017073	AT	3	6	41574	41579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017073	AT	3	6	41758	41763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017073	TA	3	6	41898	41903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017073	CT	3	6	41960	41965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017073	CA	3	6	42381	42386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017073	TA	3	6	42425	42430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017073	CA	3	6	42824	42829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017073	GA	3	6	43034	43039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017073	TA	3	6	44731	44736	50 %	50 %	0 %	0 %	383755802
52	NC_017073	GT	3	6	44767	44772	0 %	50 %	50 %	0 %	383755802
53	NC_017073	TA	3	6	44815	44820	50 %	50 %	0 %	0 %	383755802
54	NC_017073	AT	3	6	45075	45080	50 %	50 %	0 %	0 %	383755803
55	NC_017073	AT	3	6	45120	45125	50 %	50 %	0 %	0 %	383755803
56	NC_017073	AT	3	6	45273	45278	50 %	50 %	0 %	0 %	383755803
57	NC_017073	AT	3	6	46188	46193	50 %	50 %	0 %	0 %	383755805
58	NC_017073	AT	3	6	47225	47230	50 %	50 %	0 %	0 %	383755807
59	NC_017073	AC	3	6	47810	47815	50 %	0 %	0 %	50 %	383755807
60	NC_017073	AG	3	6	48518	48523	50 %	0 %	50 %	0 %	383755809
61	NC_017073	TA	3	6	48935	48940	50 %	50 %	0 %	0 %	383755810
62	NC_017073	AT	3	6	49227	49232	50 %	50 %	0 %	0 %	383755811
63	NC_017073	CG	3	6	49541	49546	0 %	0 %	50 %	50 %	383755812
64	NC_017073	TA	3	6	49939	49944	50 %	50 %	0 %	0 %	383755812
65	NC_017073	TA	3	6	50573	50578	50 %	50 %	0 %	0 %	383755814
66	NC_017073	AT	3	6	50724	50729	50 %	50 %	0 %	0 %	383755814
67	NC_017073	TG	3	6	51088	51093	0 %	50 %	50 %	0 %	383755816
68	NC_017073	AT	3	6	52890	52895	50 %	50 %	0 %	0 %	383755821
69	NC_017073	TG	3	6	53171	53176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017073	GT	3	6	53184	53189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017073	GA	3	6	53215	53220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017073	GA	3	6	53374	53379	50 %	0 %	50 %	0 %	383755822
73	NC_017073	GA	3	6	53451	53456	50 %	0 %	50 %	0 %	383755822
74	NC_017073	AT	4	8	53732	53739	50 %	50 %	0 %	0 %	383755822
75	NC_017073	AG	3	6	54257	54262	50 %	0 %	50 %	0 %	383755824
76	NC_017073	CT	3	6	54392	54397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017073	CT	3	6	56100	56105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017073	AT	3	6	57789	57794	50 %	50 %	0 %	0 %	383755833
79	NC_017073	AG	3	6	58947	58952	50 %	0 %	50 %	0 %	383755837
80	NC_017073	CG	3	6	60313	60318	0 %	0 %	50 %	50 %	383755839
81	NC_017073	AC	3	6	60375	60380	50 %	0 %	0 %	50 %	383755839
82	NC_017073	AG	3	6	60649	60654	50 %	0 %	50 %	0 %	383755839
83	NC_017073	GA	3	6	63570	63575	50 %	0 %	50 %	0 %	383755845
84	NC_017073	CA	3	6	64769	64774	50 %	0 %	0 %	50 %	383755846
85	NC_017073	TC	3	6	66295	66300	0 %	50 %	0 %	50 %	383755848
86	NC_017073	AT	3	6	68115	68120	50 %	50 %	0 %	0 %	383755848
87	NC_017073	AT	3	6	68257	68262	50 %	50 %	0 %	0 %	383755849
88	NC_017073	AT	3	6	68709	68714	50 %	50 %	0 %	0 %	383755850
89	NC_017073	TA	3	6	68727	68732	50 %	50 %	0 %	0 %	383755850
90	NC_017073	CG	3	6	69630	69635	0 %	0 %	50 %	50 %	383755854
91	NC_017073	CA	3	6	70927	70932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017073	TA	3	6	70975	70980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017073	AG	3	6	71080	71085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017073	AT	4	8	71568	71575	50 %	50 %	0 %	0 %	383755858
95	NC_017073	GA	3	6	71690	71695	50 %	0 %	50 %	0 %	383755858
96	NC_017073	CG	3	6	71744	71749	0 %	0 %	50 %	50 %	383755858
97	NC_017073	GT	3	6	72087	72092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017073	CT	3	6	72836	72841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017073	TA	3	6	72856	72861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017073	AT	3	6	73138	73143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017073	TG	3	6	73268	73273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.