MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 1283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017073	T	9	9	29728	29736	0 %	100 %	0 %	0 %	383755783
502	NC_017073	AAG	2	6	29752	29757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755783
503	NC_017073	CATCA	2	10	29851	29860	40 %	20 %	0 %	40 %	383755783
504	NC_017073	TCC	2	6	29886	29891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755783
505	NC_017073	CATAG	2	10	29938	29947	40 %	20 %	20 %	20 %	383755783
506	NC_017073	TCG	2	6	29973	29978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755783
507	NC_017073	T	6	6	30032	30037	0 %	100 %	0 %	0 %	383755783
508	NC_017073	TATC	2	8	30041	30048	25 %	50 %	0 %	25 %	383755783
509	NC_017073	TTC	2	6	30079	30084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755783
510	NC_017073	A	6	6	30114	30119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017073	TTA	2	6	30152	30157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017073	AGGA	2	8	30194	30201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017073	CGG	2	6	30255	30260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017073	TG	3	6	30310	30315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017073	A	6	6	30337	30342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017073	CAC	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017073	AT	3	6	30428	30433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017073	AAT	2	6	30454	30459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017073	AAGCC	2	10	30573	30582	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
520	NC_017073	GCG	2	6	30670	30675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755784
521	NC_017073	ACG	2	6	30728	30733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755784
522	NC_017073	CCTT	2	8	31134	31141	0 %	50 %	0 %	50 %	383755784
523	NC_017073	TGA	2	6	31147	31152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755784
524	NC_017073	CAC	2	6	31177	31182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755784
525	NC_017073	TGT	2	6	31315	31320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755784
526	NC_017073	AT	3	6	31396	31401	50 %	50 %	0 %	0 %	383755785
527	NC_017073	CTCG	2	8	31438	31445	0 %	25 %	25 %	50 %	383755785
528	NC_017073	TC	4	8	31475	31482	0 %	50 %	0 %	50 %	383755785
529	NC_017073	GTG	2	6	31560	31565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755785
530	NC_017073	CTT	2	6	31624	31629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755785
531	NC_017073	CAT	2	6	31687	31692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755785
532	NC_017073	TCG	2	6	31731	31736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755785
533	NC_017073	ATA	2	6	31799	31804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755786
534	NC_017073	ATC	2	6	31840	31845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755786
535	NC_017073	AGA	2	6	31876	31881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755786
536	NC_017073	ACC	2	6	31945	31950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755786
537	NC_017073	GAA	2	6	31997	32002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755786
538	NC_017073	GAGCCG	2	12	32162	32173	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383755786
539	NC_017073	CAC	2	6	32214	32219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755786
540	NC_017073	ATC	2	6	32233	32238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755786
541	NC_017073	ATC	2	6	32308	32313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755786
542	NC_017073	AGG	2	6	32464	32469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755787
543	NC_017073	ATG	2	6	32491	32496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755787
544	NC_017073	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	383755787
545	NC_017073	CGT	2	6	32508	32513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755787
546	NC_017073	AT	3	6	32552	32557	50 %	50 %	0 %	0 %	383755787
547	NC_017073	AT	3	6	32653	32658	50 %	50 %	0 %	0 %	383755787
548	NC_017073	CTGCA	2	10	32682	32691	20 %	20 %	20 %	40 %	383755787
549	NC_017073	CGG	2	6	32693	32698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755787
550	NC_017073	CTGCAC	2	12	32918	32929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383755787
551	NC_017073	TCA	2	6	33000	33005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755788
552	NC_017073	TCC	2	6	33078	33083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755788
553	NC_017073	AAGTC	2	10	33328	33337	40 %	20 %	20 %	20 %	383755788
554	NC_017073	AGC	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755788
555	NC_017073	TGC	2	6	33401	33406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755788
556	NC_017073	ATGT	2	8	33471	33478	25 %	50 %	25 %	0 %	383755788
557	NC_017073	CCT	2	6	33492	33497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755789
558	NC_017073	TCT	2	6	33636	33641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755789
559	NC_017073	C	6	6	33659	33664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
560	NC_017073	AGGGT	2	10	33695	33704	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017073	CTC	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_017073	CCCT	2	8	33739	33746	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
563	NC_017073	CAG	2	6	33859	33864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755790
564	NC_017073	CAT	2	6	33918	33923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755790
565	NC_017073	AAC	2	6	33926	33931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
566	NC_017073	TAA	2	6	34011	34016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755790
567	NC_017073	CAGG	2	8	34077	34084	25 %	0 %	50 %	25 %	383755790
568	NC_017073	GTA	2	6	34244	34249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755790
569	NC_017073	CAA	2	6	34371	34376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
570	NC_017073	TTC	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755790
571	NC_017073	GAA	2	6	34444	34449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755790
572	NC_017073	CG	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	383755790
573	NC_017073	CAA	2	6	34716	34721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
574	NC_017073	TCACA	2	10	34831	34840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
575	NC_017073	A	6	6	34850	34855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017073	TCA	2	6	34964	34969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755791
577	NC_017073	CCA	2	6	34974	34979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755791
578	NC_017073	TCGCCC	2	12	35081	35092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383755791
579	NC_017073	GCT	2	6	35102	35107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
580	NC_017073	CGT	2	6	35124	35129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
581	NC_017073	GCT	2	6	35259	35264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
582	NC_017073	TTTGCT	2	12	35345	35356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383755791
583	NC_017073	CACAAC	2	12	35415	35426	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
584	NC_017073	ATAA	2	8	35443	35450	75 %	25 %	0 %	0 %	383755791
585	NC_017073	CA	3	6	35555	35560	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
586	NC_017073	TCC	2	6	35645	35650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755791
587	NC_017073	ACC	2	6	35749	35754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755791
588	NC_017073	TG	3	6	35820	35825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017073	AG	3	6	35848	35853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017073	TAG	2	6	35902	35907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755792
591	NC_017073	CCA	2	6	35937	35942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
592	NC_017073	GTA	2	6	36065	36070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755792
593	NC_017073	CCA	2	6	36076	36081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
594	NC_017073	AT	3	6	36126	36131	50 %	50 %	0 %	0 %	383755792
595	NC_017073	GTT	2	6	36176	36181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755792
596	NC_017073	TCC	2	6	36189	36194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755792
597	NC_017073	ATC	2	6	36195	36200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
598	NC_017073	GACCA	2	10	36275	36284	40 %	0 %	20 %	40 %	383755792
599	NC_017073	TTC	2	6	36444	36449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755792
600	NC_017073	TC	3	6	36466	36471	0 %	50 %	0 %	50 %	383755792
601	NC_017073	GTT	2	6	36472	36477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755792
602	NC_017073	TGG	2	6	36526	36531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755792
603	NC_017073	CAT	2	6	36587	36592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
604	NC_017073	CTG	3	9	36683	36691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755792
605	NC_017073	ACC	2	6	36732	36737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
606	NC_017073	TCG	2	6	36745	36750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755792
607	NC_017073	CAT	2	6	36835	36840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
608	NC_017073	GAAC	2	8	36857	36864	50 %	0 %	25 %	25 %	383755792
609	NC_017073	TTTC	2	8	36926	36933	0 %	75 %	0 %	25 %	383755792
610	NC_017073	CCA	2	6	36939	36944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
611	NC_017073	TTA	2	6	37077	37082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755792
612	NC_017073	TTGC	2	8	37140	37147	0 %	50 %	25 %	25 %	383755792
613	NC_017073	T	6	6	37155	37160	0 %	100 %	0 %	0 %	383755792
614	NC_017073	A	7	7	37195	37201	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
615	NC_017073	TATTCA	2	12	37236	37247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383755793
616	NC_017073	TCC	2	6	37255	37260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755793
617	NC_017073	TGC	2	6	37269	37274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755793
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619	NC_017073	TCT	2	6	37386	37391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
620	NC_017073	CTGC	2	8	37506	37513	0 %	25 %	25 %	50 %	383755793
621	NC_017073	GAA	2	6	37535	37540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755793
622	NC_017073	A	7	7	37539	37545	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
623	NC_017073	ATA	2	6	37591	37596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755793
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625	NC_017073	ATA	2	6	37703	37708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755793
626	NC_017073	ACC	2	6	37732	37737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755793
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628	NC_017073	TTC	2	6	37960	37965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
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630	NC_017073	AGG	2	6	38103	38108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755793
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