MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017070	CAG	2	6	25116	25121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080700
502	NC_017070	A	6	6	25184	25189	100 %	0 %	0 %	0 %	383080700
503	NC_017070	TAG	2	6	25275	25280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017070	TGT	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017070	T	6	6	25296	25301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017070	C	7	7	25324	25330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
507	NC_017070	ATT	2	6	25375	25380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017070	GGT	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017070	TGT	2	6	25413	25418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080701
510	NC_017070	TAA	2	6	25428	25433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080701
511	NC_017070	TGC	2	6	25500	25505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080701
512	NC_017070	TTG	2	6	25524	25529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080701
513	NC_017070	CCG	2	6	25543	25548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080701
514	NC_017070	TA	3	6	25561	25566	50 %	50 %	0 %	0 %	383080701
515	NC_017070	ACC	2	6	25706	25711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080701
516	NC_017070	AGT	2	6	25732	25737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080701
517	NC_017070	CAA	2	6	25741	25746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080701
518	NC_017070	CAG	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080701
519	NC_017070	CTG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080701
520	NC_017070	ACT	2	6	25971	25976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080701
521	NC_017070	AGC	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017070	GAAAAG	2	12	26109	26120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017070	GAG	2	6	26146	26151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017070	AGAT	2	8	26187	26194	50 %	25 %	25 %	0 %	383080702
525	NC_017070	GAT	2	6	26346	26351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080702
526	NC_017070	AATA	2	8	26444	26451	75 %	25 %	0 %	0 %	383080702
527	NC_017070	CAT	2	6	26522	26527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017070	AT	3	6	26526	26531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017070	TTA	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017070	AGG	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017070	CAA	3	9	26578	26586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080703
532	NC_017070	CTG	2	6	26748	26753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080703
533	NC_017070	TAC	2	6	26804	26809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080703
534	NC_017070	GGA	2	6	26822	26827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080703
535	NC_017070	A	6	6	26880	26885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017070	ATTA	2	8	26943	26950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017070	AT	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017070	GACC	2	8	26999	27006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017070	ATA	2	6	27057	27062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080704
540	NC_017070	CAA	2	6	27217	27222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080704
541	NC_017070	CAT	2	6	27243	27248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
542	NC_017070	GTG	2	6	27251	27256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080704
543	NC_017070	TCA	2	6	27350	27355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
544	NC_017070	AC	3	6	27456	27461	50 %	0 %	0 %	50 %	383080704
545	NC_017070	CTG	2	6	27555	27560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080704
546	NC_017070	GCA	2	6	27573	27578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080704
547	NC_017070	TA	3	6	27627	27632	50 %	50 %	0 %	0 %	383080704
548	NC_017070	TCA	2	6	27641	27646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
549	NC_017070	CAG	2	6	27655	27660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080704
550	NC_017070	CCCT	2	8	27806	27813	0 %	25 %	0 %	75 %	383080704
551	NC_017070	A	6	6	27921	27926	100 %	0 %	0 %	0 %	383080704
552	NC_017070	TCA	2	6	28035	28040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
553	NC_017070	TTACC	2	10	28113	28122	20 %	40 %	0 %	40 %	383080704
554	NC_017070	ACT	2	6	28156	28161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
555	NC_017070	GTAT	2	8	28266	28273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017070	TAA	2	6	28288	28293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017070	AAT	2	6	28377	28382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080705
558	NC_017070	AGC	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080705
559	NC_017070	AG	3	6	28489	28494	50 %	0 %	50 %	0 %	383080705
560	NC_017070	AAT	2	6	28535	28540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080705
561	NC_017070	A	6	6	28556	28561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017070	TTG	2	6	28578	28583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017070	T	6	6	28613	28618	0 %	100 %	0 %	0 %	383080706
564	NC_017070	AT	4	8	28629	28636	50 %	50 %	0 %	0 %	383080706
565	NC_017070	T	6	6	28756	28761	0 %	100 %	0 %	0 %	383080706
566	NC_017070	TAT	2	6	28765	28770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080706
567	NC_017070	TCT	2	6	28824	28829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080706
568	NC_017070	ATTCA	2	10	28831	28840	40 %	40 %	0 %	20 %	383080706
569	NC_017070	CTACC	2	10	28884	28893	20 %	20 %	0 %	60 %	383080706
570	NC_017070	CTG	2	6	28959	28964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080706
571	NC_017070	TAA	2	6	29084	29089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017070	AT	3	6	29102	29107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017070	ATT	4	12	29113	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017070	TAA	3	9	29126	29134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017070	TA	3	6	29202	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017070	TAT	2	6	29224	29229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017070	ATTT	2	8	29255	29262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017070	AT	3	6	29270	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017070	ATT	2	6	29480	29485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080707
580	NC_017070	AGGC	2	8	29499	29506	25 %	0 %	50 %	25 %	383080707
581	NC_017070	TGCTT	2	10	29576	29585	0 %	60 %	20 %	20 %	383080707
582	NC_017070	AT	3	6	29595	29600	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
583	NC_017070	TA	3	6	29603	29608	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
584	NC_017070	ATT	2	6	29632	29637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080707
585	NC_017070	TA	3	6	29802	29807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017070	TAAT	2	8	29809	29816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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