MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 1354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017069	GCG	2	6	26550	26555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
502	NC_017069	GAG	2	6	26670	26675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755693
503	NC_017069	TTA	2	6	26753	26758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755693
504	NC_017069	ATCC	2	8	26766	26773	25 %	25 %	0 %	50 %	383755693
505	NC_017069	TGA	2	6	26783	26788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755693
506	NC_017069	ACA	2	6	26854	26859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755693
507	NC_017069	TCA	2	6	26879	26884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755693
508	NC_017069	TTA	2	6	26920	26925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755693
509	NC_017069	TCA	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755693
510	NC_017069	GTAAT	2	10	27037	27046	40 %	40 %	20 %	0 %	383755693
511	NC_017069	ACA	2	6	27151	27156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755693
512	NC_017069	GCG	2	6	27171	27176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
513	NC_017069	GGC	2	6	27192	27197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
514	NC_017069	GGC	2	6	27281	27286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
515	NC_017069	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	383755693
516	NC_017069	TA	3	6	27543	27548	50 %	50 %	0 %	0 %	383755693
517	NC_017069	AT	3	6	27623	27628	50 %	50 %	0 %	0 %	383755693
518	NC_017069	TGG	2	6	27647	27652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755693
519	NC_017069	CAG	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755693
520	NC_017069	CAAG	2	8	27659	27666	50 %	0 %	25 %	25 %	383755693
521	NC_017069	TGT	2	6	27740	27745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755693
522	NC_017069	CAAGAA	2	12	27786	27797	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383755693
523	NC_017069	AGA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755693
524	NC_017069	TCAA	2	8	27834	27841	50 %	25 %	0 %	25 %	383755693
525	NC_017069	GAG	2	6	28065	28070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755693
526	NC_017069	GAA	2	6	28212	28217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755693
527	NC_017069	AGG	2	6	28393	28398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755693
528	NC_017069	AAG	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755693
529	NC_017069	GCGCA	2	10	28575	28584	20 %	0 %	40 %	40 %	383755693
530	NC_017069	GCC	2	6	28638	28643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755693
531	NC_017069	TAA	2	6	28721	28726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755693
532	NC_017069	TGG	2	6	28862	28867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755693
533	NC_017069	TC	3	6	28880	28885	0 %	50 %	0 %	50 %	383755693
534	NC_017069	GGT	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755693
535	NC_017069	CAGGGA	2	12	28945	28956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383755693
536	NC_017069	CAT	2	6	29024	29029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755693
537	NC_017069	A	6	6	29031	29036	100 %	0 %	0 %	0 %	383755693
538	NC_017069	CGG	2	6	29132	29137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
539	NC_017069	CAA	2	6	29201	29206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755693
540	NC_017069	CAA	2	6	29291	29296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755693
541	NC_017069	TGA	2	6	29356	29361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755693
542	NC_017069	GGA	2	6	29434	29439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755694
543	NC_017069	A	7	7	29557	29563	100 %	0 %	0 %	0 %	383755694
544	NC_017069	GGCTC	2	10	29693	29702	0 %	20 %	40 %	40 %	383755694
545	NC_017069	TCG	2	6	29736	29741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755694
546	NC_017069	TTC	2	6	29848	29853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755694
547	NC_017069	AGC	2	6	29876	29881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755694
548	NC_017069	ACA	2	6	29910	29915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755694
549	NC_017069	CTGT	2	8	29930	29937	0 %	50 %	25 %	25 %	383755694
550	NC_017069	GAA	2	6	29953	29958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755694
551	NC_017069	A	6	6	30028	30033	100 %	0 %	0 %	0 %	383755694
552	NC_017069	TTG	2	6	30093	30098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755694
553	NC_017069	T	7	7	30168	30174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017069	T	6	6	30186	30191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017069	AT	3	6	30254	30259	50 %	50 %	0 %	0 %	383755695
556	NC_017069	TG	3	6	30306	30311	0 %	50 %	50 %	0 %	383755695
557	NC_017069	TGGC	2	8	30341	30348	0 %	25 %	50 %	25 %	383755695
558	NC_017069	TTA	2	6	30420	30425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755695
559	NC_017069	A	6	6	30448	30453	100 %	0 %	0 %	0 %	383755695
560	NC_017069	GT	3	6	30485	30490	0 %	50 %	50 %	0 %	383755695
561	NC_017069	AAG	2	6	30571	30576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755695
562	NC_017069	T	6	6	30695	30700	0 %	100 %	0 %	0 %	383755696
563	NC_017069	TA	3	6	30708	30713	50 %	50 %	0 %	0 %	383755696
564	NC_017069	TCA	2	6	30714	30719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755696
565	NC_017069	AGC	3	9	30745	30753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755696
566	NC_017069	AT	3	6	30784	30789	50 %	50 %	0 %	0 %	383755696
567	NC_017069	TGA	2	6	30874	30879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755696
568	NC_017069	CTT	2	6	30893	30898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755696
569	NC_017069	ATT	2	6	30932	30937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755696
570	NC_017069	GGA	2	6	30961	30966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755696
571	NC_017069	AAAC	2	8	30969	30976	75 %	0 %	0 %	25 %	383755696
572	NC_017069	TGA	2	6	31003	31008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755696
573	NC_017069	GTT	2	6	31043	31048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755696
574	NC_017069	AGC	2	6	31146	31151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755696
575	NC_017069	GCACG	2	10	31219	31228	20 %	0 %	40 %	40 %	383755696
576	NC_017069	TTC	2	6	31312	31317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755696
577	NC_017069	CAAAAC	2	12	31348	31359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755696
578	NC_017069	ATG	2	6	31382	31387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755696
579	NC_017069	GGT	2	6	31435	31440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755696
580	NC_017069	GA	3	6	31441	31446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017069	A	6	6	31461	31466	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
582	NC_017069	AGA	2	6	31491	31496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755697
583	NC_017069	GTT	2	6	31542	31547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755697
584	NC_017069	GCA	2	6	31594	31599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755697
585	NC_017069	TTGG	2	8	31654	31661	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
586	NC_017069	TTGG	2	8	31681	31688	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
587	NC_017069	GAT	2	6	31698	31703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755697
588	NC_017069	AG	3	6	31764	31769	50 %	0 %	50 %	0 %	383755697
589	NC_017069	GTATG	2	10	31800	31809	20 %	40 %	40 %	0 %	383755697
590	NC_017069	TG	4	8	31914	31921	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
591	NC_017069	TTAT	2	8	32057	32064	25 %	75 %	0 %	0 %	383755697
592	NC_017069	AAGA	2	8	32074	32081	75 %	0 %	25 %	0 %	383755697
593	NC_017069	GCAA	2	8	32112	32119	50 %	0 %	25 %	25 %	383755697
594	NC_017069	CTC	2	6	32222	32227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755697
595	NC_017069	A	6	6	32273	32278	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
596	NC_017069	ATCAC	2	10	32393	32402	40 %	20 %	0 %	40 %	383755697
597	NC_017069	GCT	2	6	32456	32461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755697
598	NC_017069	GGC	2	6	32500	32505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755697
599	NC_017069	GAG	2	6	32548	32553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755697
600	NC_017069	CGG	2	6	32556	32561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755697
601	NC_017069	GACAT	2	10	32584	32593	40 %	20 %	20 %	20 %	383755697
602	NC_017069	AAC	2	6	32676	32681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755697
603	NC_017069	TAA	2	6	32691	32696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755697
604	NC_017069	TG	3	6	32707	32712	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
605	NC_017069	TGACAT	2	12	32766	32777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383755697
606	NC_017069	TTG	2	6	32879	32884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755697
607	NC_017069	TGG	2	6	32975	32980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755697
608	NC_017069	CGA	2	6	33009	33014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755697
609	NC_017069	AT	3	6	33425	33430	50 %	50 %	0 %	0 %	383755697
610	NC_017069	CGG	3	9	33444	33452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755697
611	NC_017069	CGA	2	6	33492	33497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755697
612	NC_017069	A	7	7	33558	33564	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
613	NC_017069	GTT	2	6	33592	33597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755697
614	NC_017069	TAT	2	6	33643	33648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755697
615	NC_017069	AAC	2	6	33655	33660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755697
616	NC_017069	TGC	2	6	33699	33704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755697
617	NC_017069	CCA	2	6	33809	33814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755697
618	NC_017069	GA	3	6	33879	33884	50 %	0 %	50 %	0 %	383755697
619	NC_017069	ACGA	2	8	33925	33932	50 %	0 %	25 %	25 %	383755697
620	NC_017069	TTA	2	6	33975	33980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755697
621	NC_017069	CTG	2	6	34034	34039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755697
622	NC_017069	CAG	2	6	34065	34070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755697
623	NC_017069	TTC	2	6	34216	34221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755697
624	NC_017069	A	6	6	34233	34238	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
625	NC_017069	CGT	2	6	34262	34267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755697
626	NC_017069	GTCT	2	8	34320	34327	0 %	50 %	25 %	25 %	383755697
627	NC_017069	GAA	2	6	34665	34670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755697
628	NC_017069	CTA	2	6	34691	34696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755697
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630	NC_017069	A	6	6	34786	34791	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
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