MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 1797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	ATGTC	2	10	1873	1882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017068	ATCAG	2	10	2642	2651	40 %	20 %	20 %	20 %	383752830
3	NC_017068	TTCAG	2	10	3572	3581	20 %	40 %	20 %	20 %	383752832
4	NC_017068	GCAAG	2	10	6997	7006	40 %	0 %	40 %	20 %	383752835
5	NC_017068	TGGGC	2	10	8130	8139	0 %	20 %	60 %	20 %	383752836
6	NC_017068	GAAAC	2	10	9147	9156	60 %	0 %	20 %	20 %	383752837
7	NC_017068	CCTGC	2	10	12362	12371	0 %	20 %	20 %	60 %	383752839
8	NC_017068	TGCTC	2	10	13996	14005	0 %	40 %	20 %	40 %	383752840
9	NC_017068	TGGAA	2	10	14056	14065	40 %	20 %	40 %	0 %	383752840
10	NC_017068	GTTCA	2	10	15898	15907	20 %	40 %	20 %	20 %	383752841
11	NC_017068	GTGGC	2	10	16682	16691	0 %	20 %	60 %	20 %	383752841
12	NC_017068	ATATC	2	10	17044	17053	40 %	40 %	0 %	20 %	383752842
13	NC_017068	AATGA	2	10	18098	18107	60 %	20 %	20 %	0 %	383752842
14	NC_017068	CGTAT	2	10	19416	19425	20 %	40 %	20 %	20 %	383752843
15	NC_017068	TGTAG	2	10	21323	21332	20 %	40 %	40 %	0 %	383752845
16	NC_017068	GATCA	2	10	23621	23630	40 %	20 %	20 %	20 %	383752847
17	NC_017068	GAAAG	2	10	35155	35164	60 %	0 %	40 %	0 %	383752859
18	NC_017068	AAGGC	2	10	35333	35342	40 %	0 %	40 %	20 %	383752859
19	NC_017068	TCGGT	2	10	36177	36186	0 %	40 %	40 %	20 %	383752860
20	NC_017068	TACGG	2	10	36352	36361	20 %	20 %	40 %	20 %	383752860
21	NC_017068	CGTGG	2	10	36488	36497	0 %	20 %	60 %	20 %	383752860
22	NC_017068	CTCCA	2	10	40242	40251	20 %	20 %	0 %	60 %	383752862
23	NC_017068	GCCTT	2	10	41308	41317	0 %	40 %	20 %	40 %	383752863
24	NC_017068	ATTTT	2	10	44846	44855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017068	TGCCG	2	10	45079	45088	0 %	20 %	40 %	40 %	383752867
26	NC_017068	ATCAG	2	10	49068	49077	40 %	20 %	20 %	20 %	383752870
27	NC_017068	TTATT	2	10	54017	54026	20 %	80 %	0 %	0 %	383752877
28	NC_017068	CCAGG	2	10	58064	58073	20 %	0 %	40 %	40 %	383752882
29	NC_017068	TTTAT	2	10	60363	60372	20 %	80 %	0 %	0 %	383752884
30	NC_017068	AGAGC	2	10	60877	60886	40 %	0 %	40 %	20 %	383752884
31	NC_017068	GCAGG	2	10	61159	61168	20 %	0 %	60 %	20 %	383752884
32	NC_017068	CGGTA	2	10	61975	61984	20 %	20 %	40 %	20 %	383752884
33	NC_017068	CACGG	2	10	64532	64541	20 %	0 %	40 %	40 %	383752889
34	NC_017068	TTATA	2	10	66064	66073	40 %	60 %	0 %	0 %	383752891
35	NC_017068	AGGAA	2	10	66236	66245	60 %	0 %	40 %	0 %	383752891
36	NC_017068	AATAC	2	10	66568	66577	60 %	20 %	0 %	20 %	383752891
37	NC_017068	GGCAC	2	10	68162	68171	20 %	0 %	40 %	40 %	383752892
38	NC_017068	TATTG	2	10	72099	72108	20 %	60 %	20 %	0 %	383752894
39	NC_017068	GCTTG	2	10	72221	72230	0 %	40 %	40 %	20 %	383752894
40	NC_017068	CATAT	2	10	72465	72474	40 %	40 %	0 %	20 %	383752894
41	NC_017068	CGGCC	2	10	82849	82858	0 %	0 %	40 %	60 %	383752902
42	NC_017068	AAAAG	2	10	84485	84494	80 %	0 %	20 %	0 %	383752904
43	NC_017068	GATGA	2	10	87747	87756	40 %	20 %	40 %	0 %	383752907
44	NC_017068	AAAGA	2	10	88236	88245	80 %	0 %	20 %	0 %	383752907
45	NC_017068	GCAAA	2	10	88606	88615	60 %	0 %	20 %	20 %	383752907
46	NC_017068	GGCCG	2	10	92023	92032	0 %	0 %	60 %	40 %	383752910
47	NC_017068	GGGAA	2	10	92540	92549	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017068	GGCCG	2	10	96331	96340	0 %	0 %	60 %	40 %	383752913
49	NC_017068	GGCAG	2	10	96606	96615	20 %	0 %	60 %	20 %	383752913
50	NC_017068	TGTCT	2	10	97739	97748	0 %	60 %	20 %	20 %	383752914
51	NC_017068	AGCTC	2	10	100117	100126	20 %	20 %	20 %	40 %	383752917
52	NC_017068	ATGCT	2	10	104597	104606	20 %	40 %	20 %	20 %	383752921
53	NC_017068	GGCCA	2	10	105443	105452	20 %	0 %	40 %	40 %	383752921
54	NC_017068	CGCCA	2	10	106252	106261	20 %	0 %	20 %	60 %	383752921
55	NC_017068	GAGCC	2	10	109685	109694	20 %	0 %	40 %	40 %	383752924
56	NC_017068	GGGCA	2	10	110278	110287	20 %	0 %	60 %	20 %	383752924
57	NC_017068	GCCAT	2	10	111059	111068	20 %	20 %	20 %	40 %	383752924
58	NC_017068	GAGCA	2	10	111346	111355	40 %	0 %	40 %	20 %	383752924
59	NC_017068	CATTC	2	10	117986	117995	20 %	40 %	0 %	40 %	383752929
60	NC_017068	GCAGT	2	10	118668	118677	20 %	20 %	40 %	20 %	383752929
61	NC_017068	TGTGC	2	10	121441	121450	0 %	40 %	40 %	20 %	383752932
62	NC_017068	TTTAT	2	10	124969	124978	20 %	80 %	0 %	0 %	383752937
63	NC_017068	TATCG	2	10	128939	128948	20 %	40 %	20 %	20 %	383752941
64	NC_017068	AAGAA	2	10	129641	129650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017068	TAAAA	2	10	130179	130188	80 %	20 %	0 %	0 %	383752942
66	NC_017068	CAGGC	2	10	132020	132029	20 %	0 %	40 %	40 %	383752943
67	NC_017068	TACTA	2	10	132146	132155	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017068	ATGCG	2	10	132161	132170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017068	CGCTT	2	10	132334	132343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017068	TAATA	2	10	133356	133365	60 %	40 %	0 %	0 %	383752945
71	NC_017068	CTGAT	2	10	133474	133483	20 %	40 %	20 %	20 %	383752945
72	NC_017068	GATAA	2	10	133487	133496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017068	TCGTG	2	10	134795	134804	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017068	GGGAG	2	10	136192	136201	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017068	TAGTT	2	10	139456	139465	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017068	CAGGC	2	10	142619	142628	20 %	0 %	40 %	40 %	383752948
77	NC_017068	CTGAA	2	10	142641	142650	40 %	20 %	20 %	20 %	383752948
78	NC_017068	GCTGG	2	10	142726	142735	0 %	20 %	60 %	20 %	383752948
79	NC_017068	ACGGA	2	10	142844	142853	40 %	0 %	40 %	20 %	383752948
80	NC_017068	GGCGG	2	10	143114	143123	0 %	0 %	80 %	20 %	383752948
81	NC_017068	TAGAA	2	10	146317	146326	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017068	GAAGA	2	10	150277	150286	60 %	0 %	40 %	0 %	383752954
83	NC_017068	AGCTC	2	10	151190	151199	20 %	20 %	20 %	40 %	383752955
84	NC_017068	GTTTT	2	10	151614	151623	0 %	80 %	20 %	0 %	383752955
85	NC_017068	GTATC	2	10	154370	154379	20 %	40 %	20 %	20 %	383752957
86	NC_017068	AAGGT	2	10	154696	154705	40 %	20 %	40 %	0 %	383752957
87	NC_017068	CCGGC	2	10	156457	156466	0 %	0 %	40 %	60 %	383752959
88	NC_017068	TGCAA	2	10	156850	156859	40 %	20 %	20 %	20 %	383752959
89	NC_017068	ATAAA	2	10	156981	156990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017068	CTGTT	2	10	157790	157799	0 %	60 %	20 %	20 %	383752960
91	NC_017068	CTGGA	2	10	158571	158580	20 %	20 %	40 %	20 %	383752960
92	NC_017068	CGGGG	2	10	159917	159926	0 %	0 %	80 %	20 %	383752961
93	NC_017068	ACGGA	2	10	160880	160889	40 %	0 %	40 %	20 %	383752962
94	NC_017068	AAAGG	2	10	161629	161638	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017068	CCGGG	2	10	166923	166932	0 %	0 %	60 %	40 %	383752967
96	NC_017068	TGCGG	2	10	171413	171422	0 %	20 %	60 %	20 %	383752971
97	NC_017068	CGGCC	2	10	174297	174306	0 %	0 %	40 %	60 %	383752974
98	NC_017068	ATGGC	2	10	174821	174830	20 %	20 %	40 %	20 %	383752974
99	NC_017068	GCAGA	2	10	175129	175138	40 %	0 %	40 %	20 %	383752974
100	NC_017068	AAATA	2	10	175581	175590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017068	TAAAT	2	10	175649	175658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017068	AAATA	2	10	175681	175690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017068	AGTTC	2	10	176696	176705	20 %	40 %	20 %	20 %	383752976
104	NC_017068	CTGGC	2	10	177957	177966	0 %	20 %	40 %	40 %	383752977
105	NC_017068	TATTG	2	10	180702	180711	20 %	60 %	20 %	0 %	383752979
106	NC_017068	GCTTG	2	10	180824	180833	0 %	40 %	40 %	20 %	383752979
107	NC_017068	CATAT	2	10	181068	181077	40 %	40 %	0 %	20 %	383752979
108	NC_017068	CGGGA	2	10	184495	184504	20 %	0 %	60 %	20 %	383752983
109	NC_017068	TGAGG	2	10	185157	185166	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017068	GATCT	2	10	185305	185314	20 %	40 %	20 %	20 %	383752984
111	NC_017068	TATCG	2	10	185757	185766	20 %	40 %	20 %	20 %	383752984
112	NC_017068	TTCTG	2	10	187369	187378	0 %	60 %	20 %	20 %	383752986
113	NC_017068	ATCCA	2	10	187593	187602	40 %	20 %	0 %	40 %	383752987
114	NC_017068	TGGGC	2	10	189354	189363	0 %	20 %	60 %	20 %	383752989
115	NC_017068	GCAGT	2	10	190289	190298	20 %	20 %	40 %	20 %	383752989
116	NC_017068	CCGGA	2	10	191038	191047	20 %	0 %	40 %	40 %	383752990
117	NC_017068	GGTTT	2	10	195162	195171	0 %	60 %	40 %	0 %	383752994
118	NC_017068	ATCAC	2	10	198218	198227	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017068	ATGCC	2	10	199351	199360	20 %	20 %	20 %	40 %	383752996
120	NC_017068	CCCTG	2	10	199525	199534	0 %	20 %	20 %	60 %	383752996
121	NC_017068	CAAGC	2	10	199852	199861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017068	GGTGC	2	10	200082	200091	0 %	20 %	60 %	20 %	383752997
123	NC_017068	ATGCA	2	10	202265	202274	40 %	20 %	20 %	20 %	383752999
124	NC_017068	ATAAA	2	10	205831	205840	80 %	20 %	0 %	0 %	383753001
125	NC_017068	CAGCG	2	10	209926	209935	20 %	0 %	40 %	40 %	383753006
126	NC_017068	TTGAT	2	10	210818	210827	20 %	60 %	20 %	0 %	383753009
127	NC_017068	GGCCC	2	10	212413	212422	0 %	0 %	40 %	60 %	383753009
128	NC_017068	TGCGG	2	10	214049	214058	0 %	20 %	60 %	20 %	383753011
129	NC_017068	CGCTG	2	10	214887	214896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017068	TGGAA	2	10	216816	216825	40 %	20 %	40 %	0 %	383753014
131	NC_017068	CCAGG	2	10	216849	216858	20 %	0 %	40 %	40 %	383753014
132	NC_017068	TACGG	2	10	219369	219378	20 %	20 %	40 %	20 %	383753016
133	NC_017068	GCCGT	2	10	219379	219388	0 %	20 %	40 %	40 %	383753016
134	NC_017068	CGTTA	2	10	220045	220054	20 %	40 %	20 %	20 %	383753017
135	NC_017068	TGCCG	2	10	220191	220200	0 %	20 %	40 %	40 %	383753017
136	NC_017068	GACGA	2	10	223526	223535	40 %	0 %	40 %	20 %	383753019
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148	NC_017068	TCTAT	2	10	233594	233603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017068	GAAAC	2	10	235526	235535	60 %	0 %	20 %	20 %	383753030
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238	NC_017068	TTTGG	2	10	375454	375463	0 %	60 %	40 %	0 %	383753159
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250	NC_017068	TGTCT	2	10	396444	396453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
251	NC_017068	TGTGC	2	10	398155	398164	0 %	40 %	40 %	20 %	383753181
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259	NC_017068	GAATT	2	10	411066	411075	40 %	40 %	20 %	0 %	383753196
260	NC_017068	ATTTG	2	10	412351	412360	20 %	60 %	20 %	0 %	383753196
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263	NC_017068	ATGGC	2	10	414970	414979	20 %	20 %	40 %	20 %	383753199
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265	NC_017068	CGAAA	2	10	419910	419919	60 %	0 %	20 %	20 %	383753201
266	NC_017068	GCAGC	2	10	421256	421265	20 %	0 %	40 %	40 %	383753202
267	NC_017068	GCTGT	2	10	422050	422059	0 %	40 %	40 %	20 %	383753202
268	NC_017068	AATAA	2	10	422366	422375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017068	TCTCT	2	10	422454	422463	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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271	NC_017068	CAGGA	2	10	423443	423452	40 %	0 %	40 %	20 %	383753205
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281	NC_017068	CTATA	2	10	434696	434705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017068	AATGC	2	10	435042	435051	40 %	20 %	20 %	20 %	383753215
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289	NC_017068	CTTTG	2	10	442570	442579	0 %	60 %	20 %	20 %	383753222
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381	NC_017068	ATAGT	2	10	592964	592973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
382	NC_017068	ATACT	2	10	592994	593003	40 %	40 %	0 %	20 %	383753350
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389	NC_017068	CTGGT	2	10	616056	616065	0 %	40 %	40 %	20 %	383753373
390	NC_017068	AATCC	2	10	619691	619700	40 %	20 %	0 %	40 %	383753377
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393	NC_017068	GCCGG	2	10	628735	628744	0 %	0 %	60 %	40 %	383753386
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395	NC_017068	TGCCA	2	10	630110	630119	20 %	20 %	20 %	40 %	383753388
396	NC_017068	TATAG	2	10	631662	631671	40 %	40 %	20 %	0 %	383753389
397	NC_017068	AGATT	2	10	635521	635530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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