MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 62925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017068	TAT	2	6	236294	236299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753030
5002	NC_017068	GAT	2	6	236338	236343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753030
5003	NC_017068	GCCG	2	8	236348	236355	0 %	0 %	50 %	50 %	383753030
5004	NC_017068	GGT	2	6	236395	236400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753030
5005	NC_017068	TGC	3	9	236406	236414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753030
5006	NC_017068	CTG	2	6	236450	236455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753030
5007	NC_017068	TCAAGG	2	12	236538	236549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383753030
5008	NC_017068	GGA	3	9	236608	236616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753030
5009	NC_017068	TGG	2	6	236649	236654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753030
5010	NC_017068	TGAT	2	8	236727	236734	25 %	50 %	25 %	0 %	383753030
5011	NC_017068	GAA	2	6	236765	236770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753030
5012	NC_017068	TTA	2	6	236809	236814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017068	TCTG	2	8	236854	236861	0 %	50 %	25 %	25 %	383753031
5014	NC_017068	GTG	2	6	236865	236870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753031
5015	NC_017068	ATTC	2	8	236918	236925	25 %	50 %	0 %	25 %	383753031
5016	NC_017068	GGC	2	6	236975	236980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753031
5017	NC_017068	CGG	2	6	237013	237018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753031
5018	NC_017068	CAC	2	6	237026	237031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383753031
5019	NC_017068	GGC	2	6	237092	237097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753031
5020	NC_017068	GCG	2	6	237129	237134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753031
5021	NC_017068	TTC	2	6	237141	237146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753031
5022	NC_017068	GA	3	6	237154	237159	50 %	0 %	50 %	0 %	383753031
5023	NC_017068	AGG	2	6	237208	237213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753031
5024	NC_017068	GCC	2	6	237240	237245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753031
5025	NC_017068	AGC	2	6	237268	237273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753031
5026	NC_017068	CATG	2	8	237308	237315	25 %	25 %	25 %	25 %	383753031
5027	NC_017068	GAT	2	6	237363	237368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753031
5028	NC_017068	CTG	2	6	237369	237374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753031
5029	NC_017068	GCGG	2	8	237383	237390	0 %	0 %	75 %	25 %	383753031
5030	NC_017068	GGC	3	9	237452	237460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753031
5031	NC_017068	GCT	2	6	237543	237548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753031
5032	NC_017068	GGA	2	6	237554	237559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753031
5033	NC_017068	CTG	3	9	237648	237656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753031
5034	NC_017068	AGG	2	6	237758	237763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753031
5035	NC_017068	CCG	2	6	237826	237831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753032
5036	NC_017068	CTG	2	6	237833	237838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5037	NC_017068	GAT	2	6	237851	237856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753032
5038	NC_017068	GA	3	6	237863	237868	50 %	0 %	50 %	0 %	383753032
5039	NC_017068	CCG	2	6	237880	237885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753032
5040	NC_017068	GCA	2	6	237902	237907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5041	NC_017068	AAG	2	6	237923	237928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753032
5042	NC_017068	TGG	2	6	237963	237968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753032
5043	NC_017068	GCC	2	6	237990	237995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753032
5044	NC_017068	ATG	2	6	237996	238001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753032
5045	NC_017068	TGC	2	6	238053	238058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5046	NC_017068	ATGAA	2	10	238152	238161	60 %	20 %	20 %	0 %	383753032
5047	NC_017068	GCG	2	6	238224	238229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5048	NC_017068	CTG	2	6	238283	238288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5049	NC_017068	TCTG	2	8	238302	238309	0 %	50 %	25 %	25 %	383753032
5050	NC_017068	GCGG	2	8	238339	238346	0 %	0 %	75 %	25 %	383753032
5051	NC_017068	GGT	2	6	238351	238356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753032
5052	NC_017068	GCTG	2	8	238374	238381	0 %	25 %	50 %	25 %	383753032
5053	NC_017068	CAT	2	6	238393	238398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753032
5054	NC_017068	CTG	2	6	238412	238417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5055	NC_017068	GATC	2	8	238456	238463	25 %	25 %	25 %	25 %	383753032
5056	NC_017068	TCA	2	6	238488	238493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753032
5057	NC_017068	CGG	2	6	238560	238565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5058	NC_017068	GTG	2	6	238583	238588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753032
5059	NC_017068	G	6	6	238666	238671	0 %	0 %	100 %	0 %	383753032
5060	NC_017068	CTG	2	6	238769	238774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5061	NC_017068	GCG	2	6	238854	238859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5062	NC_017068	ATG	2	6	238907	238912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753032
5063	NC_017068	TTA	2	6	238924	238929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753032
5064	NC_017068	CTGT	2	8	238981	238988	0 %	50 %	25 %	25 %	383753032
5065	NC_017068	CGG	2	6	239009	239014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5066	NC_017068	CGA	2	6	239083	239088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5067	NC_017068	GCA	2	6	239091	239096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5068	NC_017068	CAC	2	6	239125	239130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383753032
5069	NC_017068	CGG	2	6	239142	239147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5070	NC_017068	AGC	2	6	239190	239195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5071	NC_017068	GCG	2	6	239309	239314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
5072	NC_017068	TGG	2	6	239382	239387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753032
5073	NC_017068	TGC	2	6	239391	239396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5074	NC_017068	CTG	2	6	239405	239410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753032
5075	NC_017068	GCG	2	6	239434	239439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753032
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5078	NC_017068	AGGA	2	8	239603	239610	50 %	0 %	50 %	0 %	383753032
5079	NC_017068	ATC	2	6	239724	239729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753033
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5081	NC_017068	CTG	2	6	239739	239744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753033
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5088	NC_017068	GATC	2	8	240254	240261	25 %	25 %	25 %	25 %	383753033
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5090	NC_017068	CAG	2	6	240416	240421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753033
5091	NC_017068	AAT	2	6	240483	240488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383753033
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5097	NC_017068	ACCG	2	8	240693	240700	25 %	0 %	25 %	50 %	383753033
5098	NC_017068	TCA	2	6	240718	240723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753033
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5103	NC_017068	CAG	2	6	240864	240869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753033
5104	NC_017068	TG	4	8	240907	240914	0 %	50 %	50 %	0 %	383753033
5105	NC_017068	CTG	2	6	240918	240923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753033
5106	NC_017068	TGG	2	6	240934	240939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753033
5107	NC_017068	GCG	2	6	240962	240967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753033
5108	NC_017068	GGA	2	6	241022	241027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753033
5109	NC_017068	A	6	6	241032	241037	100 %	0 %	0 %	0 %	383753033
5110	NC_017068	GAA	2	6	241098	241103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753033
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5116	NC_017068	ACC	2	6	241401	241406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383753033
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5118	NC_017068	GAG	2	6	241528	241533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753033
5119	NC_017068	CTG	2	6	241562	241567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753034
5120	NC_017068	TGC	2	6	241572	241577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753034
5121	NC_017068	CCG	2	6	241637	241642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753034
5122	NC_017068	CAT	2	6	241712	241717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753034
5123	NC_017068	GGC	2	6	241801	241806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753034
5124	NC_017068	AGG	2	6	241812	241817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753034
5125	NC_017068	GCG	2	6	241900	241905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753034
5126	NC_017068	CTG	2	6	241907	241912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753034
5127	NC_017068	TGA	3	9	241915	241923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753034
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5129	NC_017068	AAG	2	6	241965	241970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753034
5130	NC_017068	TGC	2	6	242025	242030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753034
5131	NC_017068	GCCT	2	8	242066	242073	0 %	25 %	25 %	50 %	383753034
5132	NC_017068	GTG	2	6	242153	242158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753034
5133	NC_017068	AGA	2	6	242235	242240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753034
5134	NC_017068	GCC	2	6	242243	242248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753034
5135	NC_017068	CTG	2	6	242309	242314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753034
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5137	NC_017068	GCG	2	6	242501	242506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753034
5138	NC_017068	GGC	2	6	242543	242548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753034
5139	NC_017068	GA	3	6	242592	242597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_017068	GGC	2	6	242630	242635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753035
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5142	NC_017068	GGCG	2	8	242721	242728	0 %	0 %	75 %	25 %	383753035
5143	NC_017068	TGCAG	2	10	242735	242744	20 %	20 %	40 %	20 %	383753035
5144	NC_017068	A	6	6	242764	242769	100 %	0 %	0 %	0 %	383753035
5145	NC_017068	CGG	2	6	242786	242791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753035
5146	NC_017068	CGG	2	6	242960	242965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753035
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5148	NC_017068	CAT	2	6	243047	243052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753035
5149	NC_017068	CGG	3	9	243056	243064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753035
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5165	NC_017068	GGGC	2	8	243836	243843	0 %	0 %	75 %	25 %	383753035
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5168	NC_017068	GCC	2	6	243971	243976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753035
5169	NC_017068	GCTG	2	8	243980	243987	0 %	25 %	50 %	25 %	383753035
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5175	NC_017068	ATTT	2	8	244353	244360	25 %	75 %	0 %	0 %	383753036
5176	NC_017068	TTG	2	6	244371	244376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383753036
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5182	NC_017068	GATGTA	2	12	244688	244699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753036
5183	NC_017068	CTT	2	6	244702	244707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753036
5184	NC_017068	GCC	2	6	244742	244747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753036
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5188	NC_017068	CGT	2	6	245027	245032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753036
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5199	NC_017068	CGCAG	2	10	245497	245506	20 %	0 %	40 %	40 %	383753036
5200	NC_017068	GCC	2	6	245508	245513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753036
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5203	NC_017068	TGA	2	6	245572	245577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753036
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5210	NC_017068	ATT	2	6	245928	245933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5211	NC_017068	T	6	6	245932	245937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_017068	TTTA	2	8	246017	246024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5213	NC_017068	ATG	2	6	246058	246063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5214	NC_017068	TA	3	6	246070	246075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5215	NC_017068	AT	3	6	246107	246112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5216	NC_017068	GAT	2	6	246259	246264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753037
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5219	NC_017068	AGC	2	6	246392	246397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753038
5220	NC_017068	CGGC	2	8	246403	246410	0 %	0 %	50 %	50 %	383753038
5221	NC_017068	TTC	2	6	246417	246422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753038
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5223	NC_017068	GCTG	2	8	246555	246562	0 %	25 %	50 %	25 %	383753038
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5227	NC_017068	GATG	2	8	246851	246858	25 %	25 %	50 %	0 %	383753038
5228	NC_017068	CGC	2	6	246918	246923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753038
5229	NC_017068	ATG	2	6	247039	247044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753038
5230	NC_017068	GGA	2	6	247079	247084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753038
5231	NC_017068	CGC	2	6	247092	247097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753038
5232	NC_017068	GATC	2	8	247109	247116	25 %	25 %	25 %	25 %	383753038
5233	NC_017068	ATC	2	6	247131	247136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753038
5234	NC_017068	CGG	2	6	247187	247192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753038
5235	NC_017068	CGTG	2	8	247217	247224	0 %	25 %	50 %	25 %	383753038
5236	NC_017068	CTG	2	6	247263	247268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753038
5237	NC_017068	TGCC	2	8	247388	247395	0 %	25 %	25 %	50 %	383753038
5238	NC_017068	AGG	2	6	247474	247479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753038
5239	NC_017068	GTT	2	6	247653	247658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383753039
5240	NC_017068	GCCC	2	8	247745	247752	0 %	0 %	25 %	75 %	383753039
5241	NC_017068	TGG	2	6	247764	247769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753039
5242	NC_017068	TGGTGA	2	12	247777	247788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383753039
5243	NC_017068	CGG	2	6	247801	247806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753039
5244	NC_017068	GCC	2	6	247827	247832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753039
5245	NC_017068	GGT	2	6	247849	247854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753039
5246	NC_017068	AAT	3	9	247862	247870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383753039
5247	NC_017068	AT	3	6	247869	247874	50 %	50 %	0 %	0 %	383753039
5248	NC_017068	G	6	6	247885	247890	0 %	0 %	100 %	0 %	383753039
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5262	NC_017068	AGC	2	6	248415	248420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753040
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5270	NC_017068	GAG	2	6	249085	249090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_017068	GCA	2	6	249160	249165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753041
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5314	NC_017068	TACAAG	2	12	251461	251472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383753042
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5317	NC_017068	GGC	2	6	251745	251750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5326	NC_017068	CTGG	3	12	252259	252270	0 %	25 %	50 %	25 %	383753043
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5331	NC_017068	A	6	6	252479	252484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5332	NC_017068	T	6	6	252501	252506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5333	NC_017068	TAT	2	6	252514	252519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5334	NC_017068	ATCAGG	2	12	252544	252555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383753044
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5350	NC_017068	ACAGGA	2	12	253211	253222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383753044
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5352	NC_017068	CCT	2	6	253327	253332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5353	NC_017068	T	6	6	253370	253375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_017068	TCA	2	6	253418	253423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5355	NC_017068	AGG	2	6	253427	253432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_017068	AGA	2	6	253437	253442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_017068	TTG	2	6	253466	253471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_017068	TAA	2	6	253472	253477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_017068	ATG	2	6	253615	253620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753045
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5363	NC_017068	CTG	2	6	253896	253901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753045
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5486	NC_017068	ACC	2	6	259931	259936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383753050
5487	NC_017068	TGCC	2	8	259937	259944	0 %	25 %	25 %	50 %	383753050
5488	NC_017068	GCGG	2	8	260035	260042	0 %	0 %	75 %	25 %	383753050
5489	NC_017068	AAG	2	6	260054	260059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753050
5490	NC_017068	GTG	2	6	260069	260074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753050
5491	NC_017068	CTA	2	6	260101	260106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753050
5492	NC_017068	CGG	2	6	260131	260136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753050
5493	NC_017068	GCG	2	6	260145	260150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753050
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5496	NC_017068	GCA	2	6	260358	260363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753050
5497	NC_017068	AGGA	2	8	260446	260453	50 %	0 %	50 %	0 %	383753050
5498	NC_017068	GA	3	6	260452	260457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_017068	GAA	2	6	260490	260495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753051
5500	NC_017068	CCTGT	2	10	260528	260537	0 %	40 %	20 %	40 %	383753051

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