MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 24528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017053	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017053	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493133
4	NC_017053	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
5	NC_017053	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
6	NC_017053	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493133
7	NC_017053	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
8	NC_017053	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493133
9	NC_017053	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493133
10	NC_017053	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493133
11	NC_017053	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
12	NC_017053	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493133
13	NC_017053	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493133
14	NC_017053	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
15	NC_017053	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383493133
16	NC_017053	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
17	NC_017053	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
18	NC_017053	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493133
19	NC_017053	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493133
20	NC_017053	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493133
21	NC_017053	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017053	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017053	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017053	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017053	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
26	NC_017053	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493134
27	NC_017053	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
28	NC_017053	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
29	NC_017053	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493134
30	NC_017053	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493134
31	NC_017053	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493134
32	NC_017053	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
33	NC_017053	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
34	NC_017053	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493134
35	NC_017053	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493134
36	NC_017053	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493134
37	NC_017053	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493134
38	NC_017053	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
39	NC_017053	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493134
40	NC_017053	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493134
41	NC_017053	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493134
42	NC_017053	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017053	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017053	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493135
45	NC_017053	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017053	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017053	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017053	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017053	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017053	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
51	NC_017053	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493136
52	NC_017053	TGA	3	9	3801	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
53	NC_017053	AGA	2	6	4047	4052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
54	NC_017053	GTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493136
55	NC_017053	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493136
56	NC_017053	AGT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
57	NC_017053	AGA	3	9	4224	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
58	NC_017053	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
59	NC_017053	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
60	NC_017053	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493136
61	NC_017053	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
62	NC_017053	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493136
63	NC_017053	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493136
64	NC_017053	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
65	NC_017053	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
66	NC_017053	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
67	NC_017053	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493136
68	NC_017053	CAT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493136
69	NC_017053	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017053	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493137
71	NC_017053	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493137
72	NC_017053	TTA	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493137
73	NC_017053	CTA	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493137
74	NC_017053	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493137
75	NC_017053	CTA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493137
76	NC_017053	ATG	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493137
77	NC_017053	CAG	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493137
78	NC_017053	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493137
79	NC_017053	TTA	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493137
80	NC_017053	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
81	NC_017053	ACC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493138
82	NC_017053	GAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
83	NC_017053	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
84	NC_017053	TGA	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
85	NC_017053	TTA	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
86	NC_017053	TGA	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
87	NC_017053	AAC	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
88	NC_017053	GAT	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
89	NC_017053	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
90	NC_017053	ATT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
91	NC_017053	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
92	NC_017053	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
93	NC_017053	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
94	NC_017053	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493138
95	NC_017053	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493138
96	NC_017053	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
97	NC_017053	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
98	NC_017053	ACG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493138
99	NC_017053	TAG	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
100	NC_017053	CTG	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493138
101	NC_017053	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493138
102	NC_017053	ATG	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
103	NC_017053	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
104	NC_017053	AAG	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
105	NC_017053	GAT	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
106	NC_017053	TGA	3	9	7049	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
107	NC_017053	AGA	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
108	NC_017053	TAG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
109	NC_017053	CAG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493138
110	NC_017053	GTA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
111	NC_017053	ATT	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
112	NC_017053	AAC	2	6	7462	7467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
113	NC_017053	AAT	2	6	7647	7652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493138
114	NC_017053	GGA	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493138
115	NC_017053	ATG	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
116	NC_017053	CAA	3	9	7870	7878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
117	NC_017053	GAA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
118	NC_017053	GAG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493138
119	NC_017053	GAT	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
120	NC_017053	AAT	2	6	8502	8507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493138
121	NC_017053	CTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493138
122	NC_017053	ATT	2	6	8560	8565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
123	NC_017053	AGA	2	6	8669	8674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
124	NC_017053	ATA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493138
125	NC_017053	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017053	TGC	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017053	TTA	2	6	8937	8942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493139
128	NC_017053	CGT	2	6	8945	8950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493139
129	NC_017053	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493139
130	NC_017053	GAA	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493139
131	NC_017053	GAA	4	12	9231	9242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493140
132	NC_017053	ATG	2	6	9285	9290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493140
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134	NC_017053	GAT	2	6	9438	9443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493140
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