MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017053	CTT	2	6	160144	160149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3502	NC_017053	ATC	2	6	160195	160200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493276
3503	NC_017053	CAA	3	9	160288	160296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493276
3504	NC_017053	A	6	6	160339	160344	100 %	0 %	0 %	0 %	383493276
3505	NC_017053	GAA	2	6	160345	160350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493276
3506	NC_017053	CTT	2	6	160377	160382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3507	NC_017053	TGT	2	6	160401	160406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493276
3508	NC_017053	AAGC	2	8	160516	160523	50 %	0 %	25 %	25 %	383493276
3509	NC_017053	TTC	2	6	160525	160530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3510	NC_017053	CT	3	6	160548	160553	0 %	50 %	0 %	50 %	383493276
3511	NC_017053	TGTT	2	8	160598	160605	0 %	75 %	25 %	0 %	383493276
3512	NC_017053	TTC	2	6	160698	160703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3513	NC_017053	CTT	2	6	160762	160767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3514	NC_017053	GTG	2	6	160856	160861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493276
3515	NC_017053	AGC	2	6	160869	160874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493276
3516	NC_017053	TAT	2	6	160899	160904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493276
3517	NC_017053	GGT	2	6	160951	160956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493276
3518	NC_017053	TTC	2	6	160979	160984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3519	NC_017053	TCT	2	6	161048	161053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493276
3520	NC_017053	AAG	2	6	161096	161101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493276
3521	NC_017053	AACAA	2	10	161160	161169	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3522	NC_017053	TAA	2	6	161170	161175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017053	GGA	2	6	161185	161190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017053	A	6	6	161190	161195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017053	TCAG	2	8	161299	161306	25 %	25 %	25 %	25 %	383493277
3526	NC_017053	CTT	2	6	161307	161312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493277
3527	NC_017053	TTGG	2	8	161411	161418	0 %	50 %	50 %	0 %	383493277
3528	NC_017053	GATG	2	8	161431	161438	25 %	25 %	50 %	0 %	383493277
3529	NC_017053	AAG	2	6	161463	161468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493277
3530	NC_017053	CTCTTT	2	12	161522	161533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017053	GT	4	8	161558	161565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017053	ACA	2	6	161624	161629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493278
3533	NC_017053	TGAT	2	8	161696	161703	25 %	50 %	25 %	0 %	383493278
3534	NC_017053	TAC	2	6	161725	161730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493278
3535	NC_017053	CAT	2	6	161736	161741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493278
3536	NC_017053	TTA	2	6	161766	161771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493278
3537	NC_017053	CA	3	6	161929	161934	50 %	0 %	0 %	50 %	383493278
3538	NC_017053	TGG	2	6	161993	161998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493278
3539	NC_017053	AGA	2	6	162033	162038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493278
3540	NC_017053	CTTA	2	8	162053	162060	25 %	50 %	0 %	25 %	383493278
3541	NC_017053	ATG	2	6	162111	162116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017053	AGC	2	6	162237	162242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493279
3543	NC_017053	GTTT	2	8	162286	162293	0 %	75 %	25 %	0 %	383493279
3544	NC_017053	GTG	2	6	162413	162418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493279
3545	NC_017053	CGA	2	6	162446	162451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493279
3546	NC_017053	AGC	2	6	162465	162470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493279
3547	NC_017053	AGA	2	6	162486	162491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493279
3548	NC_017053	ACC	2	6	162590	162595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493279
3549	NC_017053	CTT	2	6	162610	162615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493279
3550	NC_017053	ATTG	2	8	162660	162667	25 %	50 %	25 %	0 %	383493279
3551	NC_017053	TGG	2	6	162693	162698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493279
3552	NC_017053	AGA	2	6	162777	162782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493279
3553	NC_017053	CTG	2	6	162785	162790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493279
3554	NC_017053	GCG	2	6	162793	162798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383493279
3555	NC_017053	TGA	2	6	162952	162957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493280
3556	NC_017053	GC	3	6	162974	162979	0 %	0 %	50 %	50 %	383493280
3557	NC_017053	GAA	2	6	162995	163000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493280
3558	NC_017053	TGA	2	6	163125	163130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493280
3559	NC_017053	GAA	2	6	163202	163207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493280
3560	NC_017053	GAA	2	6	163268	163273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493280
3561	NC_017053	TG	3	6	163535	163540	0 %	50 %	50 %	0 %	383493280
3562	NC_017053	T	6	6	163591	163596	0 %	100 %	0 %	0 %	383493280
3563	NC_017053	GGA	2	6	163630	163635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493280
3564	NC_017053	GCT	2	6	163643	163648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493280
3565	NC_017053	AAG	2	6	163653	163658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493280
3566	NC_017053	ATA	2	6	163702	163707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493280
3567	NC_017053	TCA	2	6	163834	163839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493281
3568	NC_017053	GTT	2	6	163884	163889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493281
3569	NC_017053	CTT	2	6	163930	163935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493281
3570	NC_017053	CACT	2	8	163997	164004	25 %	25 %	0 %	50 %	383493281
3571	NC_017053	GTTG	2	8	164016	164023	0 %	50 %	50 %	0 %	383493281
3572	NC_017053	CAGG	2	8	164028	164035	25 %	0 %	50 %	25 %	383493281
3573	NC_017053	ACT	2	6	164071	164076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493281
3574	NC_017053	TC	3	6	164103	164108	0 %	50 %	0 %	50 %	383493281
3575	NC_017053	AGA	2	6	164162	164167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493281
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3577	NC_017053	AATC	2	8	164318	164325	50 %	25 %	0 %	25 %	383493281
3578	NC_017053	ATT	2	6	164365	164370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493281
3579	NC_017053	TTA	2	6	164393	164398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493281
3580	NC_017053	TTA	2	6	164426	164431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017053	ATT	2	6	164478	164483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493282
3582	NC_017053	TGT	2	6	164558	164563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493282
3583	NC_017053	GGTGTT	2	12	164588	164599	0 %	50 %	50 %	0 %	383493282
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3585	NC_017053	GGAT	2	8	164705	164712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017053	AG	3	6	164717	164722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017053	ATG	2	6	164736	164741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
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3589	NC_017053	TTA	2	6	164849	164854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493283
3590	NC_017053	GCT	2	6	164949	164954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493283
3591	NC_017053	TTA	3	9	164961	164969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493283
3592	NC_017053	GAA	2	6	164970	164975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493283
3593	NC_017053	TGA	2	6	165005	165010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3594	NC_017053	ATG	2	6	165085	165090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3595	NC_017053	CTGA	2	8	165117	165124	25 %	25 %	25 %	25 %	383493283
3596	NC_017053	GAA	2	6	165132	165137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493283
3597	NC_017053	ACAA	2	8	165145	165152	75 %	0 %	0 %	25 %	383493283
3598	NC_017053	ATT	2	6	165190	165195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493283
3599	NC_017053	AT	3	6	165280	165285	50 %	50 %	0 %	0 %	383493283
3600	NC_017053	ATTTG	2	10	165508	165517	20 %	60 %	20 %	0 %	383493283
3601	NC_017053	AG	3	6	165555	165560	50 %	0 %	50 %	0 %	383493283
3602	NC_017053	GAT	2	6	165588	165593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3603	NC_017053	GATGTT	2	12	165614	165625	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383493283
3604	NC_017053	AGATCA	2	12	165638	165649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383493283
3605	NC_017053	ATG	2	6	165670	165675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3606	NC_017053	GAC	2	6	165767	165772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493283
3607	NC_017053	T	7	7	165811	165817	0 %	100 %	0 %	0 %	383493283
3608	NC_017053	GAA	2	6	165855	165860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493283
3609	NC_017053	GAT	2	6	165927	165932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3610	NC_017053	AAT	2	6	165975	165980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493283
3611	NC_017053	GAT	2	6	166017	166022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3612	NC_017053	TTG	2	6	166147	166152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493283
3613	NC_017053	CTA	2	6	166153	166158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493283
3614	NC_017053	GAT	2	6	166215	166220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493283
3615	NC_017053	ATC	2	6	166221	166226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493283
3616	NC_017053	TGAG	2	8	166258	166265	25 %	25 %	50 %	0 %	383493283
3617	NC_017053	TGT	2	6	166307	166312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493283
3618	NC_017053	TCAT	2	8	166360	166367	25 %	50 %	0 %	25 %	383493283
3619	NC_017053	GCT	2	6	166373	166378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493283
3620	NC_017053	GTC	2	6	166394	166399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017053	AGTC	2	8	166524	166531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_017053	TG	3	6	166550	166555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_017053	GGA	2	6	166622	166627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4000	NC_017053	TGG	2	6	184636	184641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493300

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