MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017053	CGT	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017053	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017053	C	6	6	21807	21812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_017053	GA	3	6	21855	21860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017053	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017053	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_017053	CAG	2	6	22072	22077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017053	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
509	NC_017053	AC	3	6	22148	22153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_017053	AGT	2	6	22329	22334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017053	T	6	6	22339	22344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017053	CGT	2	6	22669	22674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017053	GAG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017053	T	6	6	22777	22782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017053	CTC	2	6	22848	22853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017053	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017053	TAT	2	6	23020	23025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017053	ATT	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017053	GGA	2	6	23138	23143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017053	GCGT	2	8	23197	23204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017053	TCC	2	6	23221	23226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017053	TCG	2	6	23261	23266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017053	GTT	2	6	23325	23330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017053	CGG	2	6	23378	23383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017053	TGT	2	6	23455	23460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017053	GGT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017053	GGT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017053	AT	4	8	23594	23601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017053	TAAA	2	8	23748	23755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017053	AGA	2	6	23762	23767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017053	T	7	7	23779	23785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017053	ATT	2	6	23827	23832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017053	ACT	2	6	23860	23865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017053	GTT	2	6	23905	23910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017053	AGT	2	6	23934	23939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017053	TTCTT	2	10	23966	23975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
537	NC_017053	AAT	2	6	24035	24040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017053	CTTTT	3	15	24072	24086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_017053	GTTA	2	8	24093	24100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017053	TAT	2	6	24130	24135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017053	TGA	2	6	24136	24141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017053	TAG	2	6	24324	24329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017053	TAA	2	6	24352	24357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017053	GAT	2	6	24397	24402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017053	ATT	2	6	24493	24498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017053	CTA	2	6	24609	24614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017053	A	7	7	24724	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017053	TAA	2	6	24753	24758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017053	A	6	6	24769	24774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017053	ATA	2	6	24817	24822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017053	ATA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017053	TTA	2	6	24865	24870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017053	ATTC	2	8	24893	24900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_017053	AAG	2	6	24902	24907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017053	TTA	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017053	ATA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017053	AATT	2	8	25012	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017053	AT	3	6	25046	25051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017053	GCT	2	6	25059	25064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017053	TTA	2	6	25103	25108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017053	T	10	10	25143	25152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017053	AGT	2	6	25183	25188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017053	T	7	7	25188	25194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017053	A	7	7	25201	25207	100 %	0 %	0 %	0 %	383493148
565	NC_017053	CAG	2	6	25217	25222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493148
566	NC_017053	GTG	2	6	25232	25237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493148
567	NC_017053	AGC	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493148
568	NC_017053	GGA	2	6	25269	25274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493148
569	NC_017053	TAT	2	6	25305	25310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493148
570	NC_017053	AAGT	2	8	25370	25377	50 %	25 %	25 %	0 %	383493148
571	NC_017053	TTG	2	6	25478	25483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493148
572	NC_017053	A	6	6	25500	25505	100 %	0 %	0 %	0 %	383493148
573	NC_017053	TGT	2	6	25584	25589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493148
574	NC_017053	TAG	2	6	25598	25603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493148
575	NC_017053	AAC	2	6	25643	25648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493148
576	NC_017053	GAA	2	6	25672	25677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493148
577	NC_017053	AAGC	2	8	25678	25685	50 %	0 %	25 %	25 %	383493148
578	NC_017053	GAA	2	6	25735	25740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493148
579	NC_017053	CAA	2	6	25762	25767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493148
580	NC_017053	CTGCAA	2	12	25781	25792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383493148
581	NC_017053	AAG	2	6	25850	25855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493148
582	NC_017053	GCT	3	9	25867	25875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493148
583	NC_017053	GCT	2	6	25897	25902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493148
584	NC_017053	CAA	2	6	25930	25935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493148
585	NC_017053	GCA	2	6	25936	25941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493148
586	NC_017053	AGC	2	6	25950	25955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493148
587	NC_017053	CAC	2	6	25976	25981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493148
588	NC_017053	AGT	2	6	26002	26007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493148
589	NC_017053	CAT	2	6	26054	26059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493148
590	NC_017053	TTC	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493148
591	NC_017053	AAT	2	6	26131	26136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493148
592	NC_017053	TGG	2	6	26145	26150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493148
593	NC_017053	AGC	2	6	26172	26177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493148
594	NC_017053	TGG	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493148
595	NC_017053	ACC	2	6	26330	26335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493148
596	NC_017053	ATTT	2	8	26364	26371	25 %	75 %	0 %	0 %	383493148
597	NC_017053	ATT	2	6	26386	26391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017053	GTT	2	6	26404	26409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017053	AG	3	6	26476	26481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017053	TATAA	2	10	26503	26512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017053	GGA	2	6	26625	26630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017053	A	6	6	26630	26635	100 %	0 %	0 %	0 %	383493149
603	NC_017053	GAA	2	6	26773	26778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493149
604	NC_017053	TCA	2	6	26790	26795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493149
605	NC_017053	A	6	6	26888	26893	100 %	0 %	0 %	0 %	383493149
606	NC_017053	TAC	2	6	26911	26916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493149
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608	NC_017053	TGC	2	6	27030	27035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493149
609	NC_017053	TGT	2	6	27132	27137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493149
610	NC_017053	GTT	2	6	27139	27144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493149
611	NC_017053	TGG	2	6	27156	27161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493149
612	NC_017053	TCC	2	6	27191	27196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383493149
613	NC_017053	CGT	2	6	27223	27228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493149
614	NC_017053	AGTGA	2	10	27250	27259	40 %	20 %	40 %	0 %	383493149
615	NC_017053	TTGA	2	8	27298	27305	25 %	50 %	25 %	0 %	383493149
616	NC_017053	TGAT	2	8	27311	27318	25 %	50 %	25 %	0 %	383493149
617	NC_017053	GCA	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493149
618	NC_017053	TTCT	2	8	27401	27408	0 %	75 %	0 %	25 %	383493149
619	NC_017053	ATA	2	6	27422	27427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493149
620	NC_017053	ATT	2	6	27541	27546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493149
621	NC_017053	ATA	2	6	27615	27620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017053	ATTA	2	8	27666	27673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017053	TAA	2	6	27713	27718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017053	AAC	2	6	27726	27731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017053	ACG	2	6	27770	27775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017053	GAT	2	6	27837	27842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493150
627	NC_017053	ATTTT	2	10	27949	27958	20 %	80 %	0 %	0 %	383493150
628	NC_017053	TGT	2	6	27986	27991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493150
629	NC_017053	TAA	2	6	28025	28030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493150
630	NC_017053	TGC	2	6	28079	28084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493150
631	NC_017053	A	7	7	28128	28134	100 %	0 %	0 %	0 %	383493150
632	NC_017053	TTGAT	2	10	28138	28147	20 %	60 %	20 %	0 %	383493150
633	NC_017053	ATT	2	6	28309	28314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493150
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