MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017053	TGA	2	6	231077	231082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493345
5002	NC_017053	ATTG	2	8	231273	231280	25 %	50 %	25 %	0 %	383493345
5003	NC_017053	GAT	2	6	231283	231288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493345
5004	NC_017053	G	6	6	231301	231306	0 %	0 %	100 %	0 %	383493345
5005	NC_017053	ACA	2	6	231449	231454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493345
5006	NC_017053	TGT	3	9	231456	231464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493345
5007	NC_017053	GA	4	8	231499	231506	50 %	0 %	50 %	0 %	383493345
5008	NC_017053	CAA	2	6	231562	231567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493346
5009	NC_017053	GAT	2	6	231615	231620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493346
5010	NC_017053	ACG	2	6	231655	231660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5011	NC_017053	AGGCAA	2	12	231691	231702	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383493346
5012	NC_017053	A	6	6	231718	231723	100 %	0 %	0 %	0 %	383493346
5013	NC_017053	CAA	2	6	231732	231737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493346
5014	NC_017053	ACT	2	6	231777	231782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493346
5015	NC_017053	AGC	2	6	231805	231810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5016	NC_017053	AGT	2	6	231870	231875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493346
5017	NC_017053	GAG	2	6	231876	231881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493346
5018	NC_017053	AG	3	6	231912	231917	50 %	0 %	50 %	0 %	383493346
5019	NC_017053	CAG	2	6	232006	232011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5020	NC_017053	ACT	2	6	232014	232019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493346
5021	NC_017053	AGC	2	6	232112	232117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5022	NC_017053	ATA	2	6	232132	232137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493346
5023	NC_017053	GCT	2	6	232239	232244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5024	NC_017053	GTC	2	6	232270	232275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493346
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5029	NC_017053	ATT	2	6	232434	232439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493346
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5032	NC_017053	AAG	2	6	232580	232585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493346
5033	NC_017053	ACC	2	6	232598	232603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493346
5034	NC_017053	CAG	2	6	232615	232620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
5035	NC_017053	CAT	2	6	232684	232689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493346
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5037	NC_017053	ATG	2	6	232789	232794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493346
5038	NC_017053	TGAA	2	8	233005	233012	50 %	25 %	25 %	0 %	383493346
5039	NC_017053	TAA	2	6	233060	233065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493346
5040	NC_017053	TCA	2	6	233186	233191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493346
5041	NC_017053	AAGT	2	8	233221	233228	50 %	25 %	25 %	0 %	383493346
5042	NC_017053	AGCA	2	8	233246	233253	50 %	0 %	25 %	25 %	383493346
5043	NC_017053	AGC	2	6	233333	233338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493346
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5045	NC_017053	AGCTA	2	10	233384	233393	40 %	20 %	20 %	20 %	383493346
5046	NC_017053	CAGA	2	8	233418	233425	50 %	0 %	25 %	25 %	383493346
5047	NC_017053	TGG	2	6	233464	233469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493346
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5049	NC_017053	ATA	2	6	233548	233553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493346
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5053	NC_017053	AGAT	2	8	233794	233801	50 %	25 %	25 %	0 %	383493346
5054	NC_017053	ACT	2	6	233802	233807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493346
5055	NC_017053	GAAAC	2	10	233832	233841	60 %	0 %	20 %	20 %	383493346
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5057	NC_017053	TTG	2	6	233902	233907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493346
5058	NC_017053	TCT	2	6	234003	234008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493346
5059	NC_017053	TGA	2	6	234035	234040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493346
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5061	NC_017053	TAT	2	6	234193	234198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017053	TC	3	6	234224	234229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017053	TTG	2	6	234256	234261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017053	A	7	7	234314	234320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017053	ACA	2	6	234418	234423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493347
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5067	NC_017053	A	6	6	234501	234506	100 %	0 %	0 %	0 %	383493347
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5081	NC_017053	ACA	2	6	235155	235160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493348
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5087	NC_017053	TAT	2	6	235618	235623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017053	CAA	2	6	235630	235635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017053	A	7	7	235705	235711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_017053	TAC	2	6	235817	235822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493349
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5093	NC_017053	TGGA	2	8	235877	235884	25 %	25 %	50 %	0 %	383493349
5094	NC_017053	GCAAGA	2	12	235885	235896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383493349
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5096	NC_017053	CAT	2	6	235957	235962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493349
5097	NC_017053	AC	3	6	235965	235970	50 %	0 %	0 %	50 %	383493349
5098	NC_017053	TC	3	6	236006	236011	0 %	50 %	0 %	50 %	383493349
5099	NC_017053	CAA	2	6	236125	236130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493349
5100	NC_017053	CCAAT	2	10	236204	236213	40 %	20 %	0 %	40 %	383493349
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5105	NC_017053	TGA	3	9	236397	236405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493349
5106	NC_017053	GAA	2	6	236420	236425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493349
5107	NC_017053	ACG	2	6	236433	236438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493349
5108	NC_017053	ATTG	2	8	236440	236447	25 %	50 %	25 %	0 %	383493349
5109	NC_017053	CAA	2	6	236463	236468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493349
5110	NC_017053	TTC	2	6	236480	236485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493349
5111	NC_017053	GAA	3	9	236612	236620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493349
5112	NC_017053	TGA	2	6	236632	236637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493349
5113	NC_017053	TGAC	2	8	236670	236677	25 %	25 %	25 %	25 %	383493349
5114	NC_017053	TTC	2	6	236699	236704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493349
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5116	NC_017053	TGA	2	6	236890	236895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493349
5117	NC_017053	CAAGA	2	10	236978	236987	60 %	0 %	20 %	20 %	383493349
5118	NC_017053	GAA	2	6	237014	237019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493349
5119	NC_017053	AAAC	2	8	237039	237046	75 %	0 %	0 %	25 %	383493349
5120	NC_017053	TTG	2	6	237102	237107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493349
5121	NC_017053	CTC	2	6	237150	237155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383493349
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5123	NC_017053	TGG	2	6	237220	237225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493349
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5226	NC_017053	GA	3	6	241411	241416	50 %	0 %	50 %	0 %	383493352
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5228	NC_017053	GTA	2	6	241580	241585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493352
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5230	NC_017053	T	6	6	241736	241741	0 %	100 %	0 %	0 %	383493352
5231	NC_017053	GCT	2	6	241842	241847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493352
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5233	NC_017053	AT	3	6	242009	242014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_017053	AAT	2	6	242052	242057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_017053	A	7	7	242146	242152	100 %	0 %	0 %	0 %	383493353
5236	NC_017053	TGA	2	6	242156	242161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493353
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5239	NC_017053	CAC	2	6	242521	242526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493353
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5241	NC_017053	A	6	6	242767	242772	100 %	0 %	0 %	0 %	383493353
5242	NC_017053	ATT	2	6	242775	242780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493353
5243	NC_017053	GAA	2	6	242785	242790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493353
5244	NC_017053	GCT	2	6	242871	242876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493353
5245	NC_017053	AGGT	2	8	242903	242910	25 %	25 %	50 %	0 %	383493353
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5495	NC_017053	ACTTAT	2	12	255785	255796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383493364
5496	NC_017053	GAA	2	6	255836	255841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493364
5497	NC_017053	CAG	2	6	255855	255860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493364
5498	NC_017053	GTT	2	6	255917	255922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493364
5499	NC_017053	A	6	6	255934	255939	100 %	0 %	0 %	0 %	383493364
5500	NC_017053	AAG	2	6	255975	255980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493364

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