MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017053	TGGAT	2	10	207858	207867	20 %	40 %	40 %	0 %	383493321
4502	NC_017053	AGGC	2	8	207936	207943	25 %	0 %	50 %	25 %	383493321
4503	NC_017053	TAG	2	6	207969	207974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493321
4504	NC_017053	ATT	2	6	208010	208015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493321
4505	NC_017053	TGAC	2	8	208020	208027	25 %	25 %	25 %	25 %	383493321
4506	NC_017053	CTTTT	2	10	208028	208037	0 %	80 %	0 %	20 %	383493321
4507	NC_017053	AAG	2	6	208068	208073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493321
4508	NC_017053	ATTT	2	8	208280	208287	25 %	75 %	0 %	0 %	383493321
4509	NC_017053	TTC	2	6	208410	208415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_017053	T	6	6	208420	208425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017053	GTAAA	2	10	208451	208460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017053	A	6	6	208458	208463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017053	AG	3	6	208502	208507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017053	GTG	2	6	208508	208513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017053	T	7	7	208604	208610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017053	ATA	2	6	208667	208672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017053	ATA	2	6	208702	208707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017053	A	7	7	208722	208728	100 %	0 %	0 %	0 %	383493322
4519	NC_017053	AT	3	6	208742	208747	50 %	50 %	0 %	0 %	383493322
4520	NC_017053	TAT	3	9	208753	208761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493322
4521	NC_017053	ATT	2	6	208764	208769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493322
4522	NC_017053	TAT	2	6	208773	208778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493322
4523	NC_017053	T	6	6	208795	208800	0 %	100 %	0 %	0 %	383493322
4524	NC_017053	AAC	2	6	208834	208839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493322
4525	NC_017053	TAT	2	6	208909	208914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493322
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4529	NC_017053	TGG	2	6	208993	208998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493322
4530	NC_017053	T	7	7	209041	209047	0 %	100 %	0 %	0 %	383493322
4531	NC_017053	CTTG	2	8	209084	209091	0 %	50 %	25 %	25 %	383493322
4532	NC_017053	CTG	2	6	209097	209102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493322
4533	NC_017053	TAT	2	6	209120	209125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493322
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4538	NC_017053	TCT	2	6	209348	209353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493322
4539	NC_017053	GAGAA	2	10	209399	209408	60 %	0 %	40 %	0 %	383493322
4540	NC_017053	CAA	2	6	209409	209414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493322
4541	NC_017053	ACT	2	6	209590	209595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493322
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4545	NC_017053	T	6	6	209776	209781	0 %	100 %	0 %	0 %	383493322
4546	NC_017053	TGTT	2	8	209863	209870	0 %	75 %	25 %	0 %	383493322
4547	NC_017053	A	8	8	209886	209893	100 %	0 %	0 %	0 %	383493322
4548	NC_017053	GAA	2	6	209916	209921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493322
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4550	NC_017053	TTAT	2	8	209993	210000	25 %	75 %	0 %	0 %	383493322
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4553	NC_017053	TA	3	6	210079	210084	50 %	50 %	0 %	0 %	383493323
4554	NC_017053	TTA	2	6	210114	210119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493323
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4556	NC_017053	T	6	6	210245	210250	0 %	100 %	0 %	0 %	383493323
4557	NC_017053	ATT	2	6	210251	210256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493323
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4563	NC_017053	AAGAT	2	10	210510	210519	60 %	20 %	20 %	0 %	383493323
4564	NC_017053	TAC	2	6	210560	210565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493323
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4566	NC_017053	TATT	3	12	210639	210650	25 %	75 %	0 %	0 %	383493323
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4573	NC_017053	ATT	2	6	211180	211185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493323
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4589	NC_017053	GTTT	2	8	211868	211875	0 %	75 %	25 %	0 %	383493324
4590	NC_017053	CAGA	2	8	211883	211890	50 %	0 %	25 %	25 %	383493324
4591	NC_017053	ATCT	2	8	211911	211918	25 %	50 %	0 %	25 %	383493324
4592	NC_017053	T	7	7	211944	211950	0 %	100 %	0 %	0 %	383493324
4593	NC_017053	GTT	2	6	211985	211990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493324
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4595	NC_017053	AAATG	2	10	212058	212067	60 %	20 %	20 %	0 %	383493324
4596	NC_017053	AG	3	6	212104	212109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017053	ATG	2	6	212148	212153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017053	TAA	2	6	212178	212183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017053	TAAA	2	8	212190	212197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017053	CAAT	2	8	212225	212232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_017053	TCAA	2	8	212240	212247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_017053	TC	5	10	212258	212267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_017053	ATG	2	6	212291	212296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017053	TTTG	2	8	212329	212336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017053	T	6	6	212388	212393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017053	GTT	2	6	212449	212454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017053	AGA	2	6	212480	212485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017053	TAC	2	6	212490	212495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_017053	T	6	6	212586	212591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017053	TAA	2	6	212611	212616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017053	GAA	2	6	212640	212645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493325
4612	NC_017053	A	7	7	212779	212785	100 %	0 %	0 %	0 %	383493325
4613	NC_017053	CAA	2	6	212923	212928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493325
4614	NC_017053	CAT	2	6	212935	212940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493325
4615	NC_017053	GAA	2	6	212983	212988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493325
4616	NC_017053	TAT	2	6	213024	213029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493326
4617	NC_017053	GTG	2	6	213045	213050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493326
4618	NC_017053	ATC	2	6	213064	213069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493326
4619	NC_017053	ATT	2	6	213149	213154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493326
4620	NC_017053	TCATGC	2	12	213177	213188	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383493326
4621	NC_017053	CAAAT	2	10	213203	213212	60 %	20 %	0 %	20 %	383493326
4622	NC_017053	AGA	2	6	213219	213224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493326
4623	NC_017053	AC	3	6	213279	213284	50 %	0 %	0 %	50 %	383493326
4624	NC_017053	GAA	2	6	213305	213310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493326
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4752	NC_017053	AGG	2	6	218501	218506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383493331
4753	NC_017053	TGG	2	6	218659	218664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493332
4754	NC_017053	CTA	2	6	218675	218680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493332
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4756	NC_017053	TGC	2	6	218853	218858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493332
4757	NC_017053	GTT	2	6	218878	218883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493332
4758	NC_017053	GGC	2	6	218934	218939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383493332
4759	NC_017053	GATG	2	8	219037	219044	25 %	25 %	50 %	0 %	383493332
4760	NC_017053	ATT	2	6	219140	219145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493332
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4762	NC_017053	CTA	2	6	219224	219229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493332
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4764	NC_017053	TAAA	2	8	219348	219355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4765	NC_017053	ATAG	2	8	219402	219409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4766	NC_017053	TTTG	2	8	219464	219471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4767	NC_017053	A	6	6	219511	219516	100 %	0 %	0 %	0 %	383493333
4768	NC_017053	CT	4	8	219531	219538	0 %	50 %	0 %	50 %	383493333
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4772	NC_017053	TAC	2	6	219708	219713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493333
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4776	NC_017053	GCTA	2	8	220068	220075	25 %	25 %	25 %	25 %	383493333
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4784	NC_017053	TATT	2	8	220505	220512	25 %	75 %	0 %	0 %	383493334
4785	NC_017053	ATT	2	6	220540	220545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493334
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5000	NC_017053	TAT	2	6	231036	231041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493345

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