MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 8439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017052	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017052	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017052	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017052	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	383489966
5	NC_017052	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	383489966
6	NC_017052	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017052	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	383489968
8	NC_017052	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	383489968
9	NC_017052	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017052	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	383489969
11	NC_017052	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	383489969
12	NC_017052	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017052	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017052	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	383489971
15	NC_017052	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017052	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	383489972
17	NC_017052	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	383489972
18	NC_017052	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	383489972
19	NC_017052	ATTT	2	8	10221	10228	25 %	75 %	0 %	0 %	383489972
20	NC_017052	AATT	2	8	10775	10782	50 %	50 %	0 %	0 %	383489973
21	NC_017052	AATT	2	8	10919	10926	50 %	50 %	0 %	0 %	383489973
22	NC_017052	AATT	2	8	11147	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	383489973
23	NC_017052	GGAA	2	8	11417	11424	50 %	0 %	50 %	0 %	383489973
24	NC_017052	ACTG	2	8	12427	12434	25 %	25 %	25 %	25 %	383489973
25	NC_017052	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017052	TCAA	2	8	14045	14052	50 %	25 %	0 %	25 %	383489975
27	NC_017052	TTGG	2	8	14076	14083	0 %	50 %	50 %	0 %	383489975
28	NC_017052	GGTT	2	8	14142	14149	0 %	50 %	50 %	0 %	383489975
29	NC_017052	TTTC	2	8	14404	14411	0 %	75 %	0 %	25 %	383489975
30	NC_017052	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017052	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017052	TTAC	2	8	14716	14723	25 %	50 %	0 %	25 %	383489976
33	NC_017052	TATT	2	8	14741	14748	25 %	75 %	0 %	0 %	383489976
34	NC_017052	TCCC	2	8	14777	14784	0 %	25 %	0 %	75 %	383489976
35	NC_017052	TCCT	2	8	15024	15031	0 %	50 %	0 %	50 %	383489976
36	NC_017052	TCAA	2	8	16832	16839	50 %	25 %	0 %	25 %	383489978
37	NC_017052	ATTT	2	8	17346	17353	25 %	75 %	0 %	0 %	383489978
38	NC_017052	GCAG	2	8	17381	17388	25 %	0 %	50 %	25 %	383489978
39	NC_017052	TTCA	2	8	17757	17764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017052	TGGG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017052	CAAA	2	8	18536	18543	75 %	0 %	0 %	25 %	383489979
42	NC_017052	GTCA	2	8	19251	19258	25 %	25 %	25 %	25 %	383489979
43	NC_017052	TCAA	2	8	19672	19679	50 %	25 %	0 %	25 %	383489979
44	NC_017052	TCTT	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017052	TTTG	2	8	20568	20575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017052	CCAA	2	8	21424	21431	50 %	0 %	0 %	50 %	383489980
47	NC_017052	CAGC	2	8	21485	21492	25 %	0 %	25 %	50 %	383489980
48	NC_017052	TAGG	2	8	21960	21967	25 %	25 %	50 %	0 %	383489981
49	NC_017052	TTGG	2	8	22191	22198	0 %	50 %	50 %	0 %	383489981
50	NC_017052	TTTC	2	8	22509	22516	0 %	75 %	0 %	25 %	383489981
51	NC_017052	TGGT	2	8	22538	22545	0 %	50 %	50 %	0 %	383489981
52	NC_017052	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	383489981
53	NC_017052	ATTT	2	8	23120	23127	25 %	75 %	0 %	0 %	383489981
54	NC_017052	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	383489982
55	NC_017052	ATTG	2	8	24231	24238	25 %	50 %	25 %	0 %	383489983
56	NC_017052	AAAG	2	8	24387	24394	75 %	0 %	25 %	0 %	383489983
57	NC_017052	AGGT	2	8	24691	24698	25 %	25 %	50 %	0 %	383489983
58	NC_017052	GATC	2	8	25056	25063	25 %	25 %	25 %	25 %	383489983
59	NC_017052	ACTG	2	8	25335	25342	25 %	25 %	25 %	25 %	383489984
60	NC_017052	TGTT	2	8	25989	25996	0 %	75 %	25 %	0 %	383489984
61	NC_017052	AGAA	2	8	26336	26343	75 %	0 %	25 %	0 %	383489984
62	NC_017052	ATTA	2	8	26547	26554	50 %	50 %	0 %	0 %	383489984
63	NC_017052	ATTA	2	8	26889	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	383489984
64	NC_017052	ATTG	2	8	27041	27048	25 %	50 %	25 %	0 %	383489984
65	NC_017052	AATT	2	8	27588	27595	50 %	50 %	0 %	0 %	383489984
66	NC_017052	ATTC	2	8	27698	27705	25 %	50 %	0 %	25 %	383489984
67	NC_017052	GCGA	2	8	27808	27815	25 %	0 %	50 %	25 %	383489984
68	NC_017052	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017052	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017052	AAGG	2	8	28252	28259	50 %	0 %	50 %	0 %	383489985
71	NC_017052	TAAA	2	8	28407	28414	75 %	25 %	0 %	0 %	383489985
72	NC_017052	TTAA	2	8	28537	28544	50 %	50 %	0 %	0 %	383489985
73	NC_017052	ACTA	2	8	28605	28612	50 %	25 %	0 %	25 %	383489985
74	NC_017052	TTTA	2	8	29332	29339	25 %	75 %	0 %	0 %	383489986
75	NC_017052	GTTA	2	8	29365	29372	25 %	50 %	25 %	0 %	383489986
76	NC_017052	TAAA	2	8	29479	29486	75 %	25 %	0 %	0 %	383489986
77	NC_017052	GAGG	2	8	30583	30590	25 %	0 %	75 %	0 %	383489987
78	NC_017052	GATA	2	8	30654	30661	50 %	25 %	25 %	0 %	383489987
79	NC_017052	AAAT	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	383489987
80	NC_017052	TTGA	2	8	31580	31587	25 %	50 %	25 %	0 %	383489987
81	NC_017052	TAGC	2	8	31928	31935	25 %	25 %	25 %	25 %	383489987
82	NC_017052	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017052	CCAT	2	8	32579	32586	25 %	25 %	0 %	50 %	383489988
84	NC_017052	TTTG	2	8	32675	32682	0 %	75 %	25 %	0 %	383489988
85	NC_017052	AAAT	2	8	32745	32752	75 %	25 %	0 %	0 %	383489988
86	NC_017052	GCTT	2	8	32763	32770	0 %	50 %	25 %	25 %	383489988
87	NC_017052	CCCT	2	8	34372	34379	0 %	25 %	0 %	75 %	383489990
88	NC_017052	AACC	2	8	34607	34614	50 %	0 %	0 %	50 %	383489990
89	NC_017052	AGAA	2	8	35266	35273	75 %	0 %	25 %	0 %	383489990
90	NC_017052	ATTT	2	8	35532	35539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017052	TTTA	2	8	35995	36002	25 %	75 %	0 %	0 %	383489991
92	NC_017052	GGAC	2	8	36312	36319	25 %	0 %	50 %	25 %	383489991
93	NC_017052	ATTT	2	8	36408	36415	25 %	75 %	0 %	0 %	383489991
94	NC_017052	GATT	2	8	38120	38127	25 %	50 %	25 %	0 %	383489992
95	NC_017052	TTGG	2	8	38160	38167	0 %	50 %	50 %	0 %	383489992
96	NC_017052	TAGC	2	8	38810	38817	25 %	25 %	25 %	25 %	383489993
97	NC_017052	TGAA	2	8	38972	38979	50 %	25 %	25 %	0 %	383489993
98	NC_017052	ATTT	2	8	39029	39036	25 %	75 %	0 %	0 %	383489993
99	NC_017052	CAAC	2	8	39283	39290	50 %	0 %	0 %	50 %	383489993
100	NC_017052	CCTT	2	8	39361	39368	0 %	50 %	0 %	50 %	383489993
101	NC_017052	TGAA	2	8	39395	39402	50 %	25 %	25 %	0 %	383489993
102	NC_017052	GGTT	2	8	39451	39458	0 %	50 %	50 %	0 %	383489993
103	NC_017052	ACCA	2	8	40104	40111	50 %	0 %	0 %	50 %	383489994
104	NC_017052	GCAG	2	8	40806	40813	25 %	0 %	50 %	25 %	383489994
105	NC_017052	AGTA	2	8	41862	41869	50 %	25 %	25 %	0 %	383489994
106	NC_017052	GCTC	2	8	44042	44049	0 %	25 %	25 %	50 %	383489996
107	NC_017052	AGGC	2	8	44400	44407	25 %	0 %	50 %	25 %	383489996
108	NC_017052	TTTG	2	8	44593	44600	0 %	75 %	25 %	0 %	383489997
109	NC_017052	ACCT	2	8	44727	44734	25 %	25 %	0 %	50 %	383489997
110	NC_017052	CAAT	2	8	44752	44759	50 %	25 %	0 %	25 %	383489997
111	NC_017052	CTAT	2	8	44955	44962	25 %	50 %	0 %	25 %	383489998
112	NC_017052	TTGG	2	8	45004	45011	0 %	50 %	50 %	0 %	383489998
113	NC_017052	TATT	2	8	45027	45034	25 %	75 %	0 %	0 %	383489998
114	NC_017052	GGTA	2	8	46174	46181	25 %	25 %	50 %	0 %	383489998
115	NC_017052	TCGT	2	8	46521	46528	0 %	50 %	25 %	25 %	383489998
116	NC_017052	CTTG	2	8	46650	46657	0 %	50 %	25 %	25 %	383489998
117	NC_017052	TAAT	2	8	46852	46859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017052	ATAA	2	8	46981	46988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017052	TATT	2	8	47627	47634	25 %	75 %	0 %	0 %	383489999
120	NC_017052	AGCA	2	8	48085	48092	50 %	0 %	25 %	25 %	383490000
121	NC_017052	TTCG	2	8	49414	49421	0 %	50 %	25 %	25 %	383490002
122	NC_017052	CAAC	2	8	49437	49444	50 %	0 %	0 %	50 %	383490002
123	NC_017052	CTTT	2	8	50098	50105	0 %	75 %	0 %	25 %	383490003
124	NC_017052	TTTC	2	8	50744	50751	0 %	75 %	0 %	25 %	383490004
125	NC_017052	TCAG	2	8	50838	50845	25 %	25 %	25 %	25 %	383490004
126	NC_017052	GCCC	2	8	50855	50862	0 %	0 %	25 %	75 %	383490004
127	NC_017052	TGGA	2	8	50889	50896	25 %	25 %	50 %	0 %	383490004
128	NC_017052	TTCC	2	8	51618	51625	0 %	50 %	0 %	50 %	383490004
129	NC_017052	TGGT	2	8	52124	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017052	GAGG	2	8	52482	52489	25 %	0 %	75 %	0 %	383490005
131	NC_017052	TTTC	2	8	52783	52790	0 %	75 %	0 %	25 %	383490005
132	NC_017052	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017052	GCTA	2	8	53452	53459	25 %	25 %	25 %	25 %	383490006
134	NC_017052	AAGG	2	8	53606	53613	50 %	0 %	50 %	0 %	383490006
135	NC_017052	GGTG	2	8	53755	53762	0 %	25 %	75 %	0 %	383490006
136	NC_017052	AACT	2	8	54007	54014	50 %	25 %	0 %	25 %	383490006
137	NC_017052	AATT	2	8	54741	54748	50 %	50 %	0 %	0 %	383490007
138	NC_017052	CTAA	2	8	56552	56559	50 %	25 %	0 %	25 %	383490009
139	NC_017052	GCCT	2	8	56715	56722	0 %	25 %	25 %	50 %	383490009
140	NC_017052	GCTT	2	8	56743	56750	0 %	50 %	25 %	25 %	383490009
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142	NC_017052	GCTT	2	8	57956	57963	0 %	50 %	25 %	25 %	383490010
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