MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 66795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017052	ACCC	2	8	186285	186292	25 %	0 %	0 %	75 %	383490136
3502	NC_017052	CTT	2	6	186308	186313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490136
3503	NC_017052	CGC	2	6	186353	186358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490136
3504	NC_017052	CAT	2	6	186464	186469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490136
3505	NC_017052	CGC	2	6	186503	186508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490136
3506	NC_017052	AAT	2	6	186516	186521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490136
3507	NC_017052	AGG	2	6	186558	186563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017052	TAG	2	6	186574	186579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017052	ACT	2	6	186664	186669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490137
3510	NC_017052	T	6	6	186669	186674	0 %	100 %	0 %	0 %	383490137
3511	NC_017052	GTG	2	6	186679	186684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3512	NC_017052	G	6	6	186705	186710	0 %	0 %	100 %	0 %	383490137
3513	NC_017052	CCAG	2	8	186725	186732	25 %	0 %	25 %	50 %	383490137
3514	NC_017052	TCC	2	6	186893	186898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490137
3515	NC_017052	CCA	2	6	187092	187097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3516	NC_017052	CAC	2	6	187120	187125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3517	NC_017052	TCT	2	6	187178	187183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3518	NC_017052	TCC	2	6	187309	187314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490137
3519	NC_017052	ATT	2	6	187396	187401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490137
3520	NC_017052	CGA	2	6	187413	187418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490137
3521	NC_017052	AATA	2	8	187486	187493	75 %	25 %	0 %	0 %	383490137
3522	NC_017052	TGG	2	6	187509	187514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3523	NC_017052	CAA	2	6	187573	187578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490137
3524	NC_017052	GTT	2	6	187611	187616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490137
3525	NC_017052	AGCT	2	8	187644	187651	25 %	25 %	25 %	25 %	383490137
3526	NC_017052	CTT	2	6	187764	187769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3527	NC_017052	CTT	2	6	187809	187814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3528	NC_017052	GGCT	2	8	187815	187822	0 %	25 %	50 %	25 %	383490137
3529	NC_017052	AAAG	2	8	187918	187925	75 %	0 %	25 %	0 %	383490137
3530	NC_017052	CCA	3	9	187962	187970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3531	NC_017052	ACT	2	6	188047	188052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490137
3532	NC_017052	TAG	2	6	188080	188085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490137
3533	NC_017052	TAA	2	6	188103	188108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490137
3534	NC_017052	GGAT	2	8	188228	188235	25 %	25 %	50 %	0 %	383490137
3535	NC_017052	GAA	2	6	188273	188278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3536	NC_017052	AAG	2	6	188313	188318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3537	NC_017052	CGC	2	6	188330	188335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490137
3538	NC_017052	GTT	2	6	188356	188361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490137
3539	NC_017052	GGT	3	9	188380	188388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3540	NC_017052	GGC	2	6	188602	188607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490137
3541	NC_017052	CCA	2	6	188728	188733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3542	NC_017052	C	6	6	188768	188773	0 %	0 %	0 %	100 %	383490137
3543	NC_017052	GAA	2	6	188774	188779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3544	NC_017052	G	6	6	188801	188806	0 %	0 %	100 %	0 %	383490137
3545	NC_017052	CAG	2	6	188839	188844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490137
3546	NC_017052	TTG	2	6	188969	188974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017052	ATG	2	6	189049	189054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017052	TTGT	2	8	189098	189105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017052	CAA	2	6	189146	189151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490138
3550	NC_017052	G	6	6	189175	189180	0 %	0 %	100 %	0 %	383490138
3551	NC_017052	GCC	2	6	189292	189297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490138
3552	NC_017052	TG	3	6	189320	189325	0 %	50 %	50 %	0 %	383490138
3553	NC_017052	C	7	7	189345	189351	0 %	0 %	0 %	100 %	383490138
3554	NC_017052	GTT	2	6	189355	189360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490138
3555	NC_017052	TCGG	2	8	189562	189569	0 %	25 %	50 %	25 %	383490138
3556	NC_017052	ATT	2	6	189578	189583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490138
3557	NC_017052	G	6	6	189644	189649	0 %	0 %	100 %	0 %	383490138
3558	NC_017052	CGGA	2	8	189739	189746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_017052	ACA	2	6	189769	189774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_017052	GCCAA	2	10	189792	189801	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3561	NC_017052	GCG	2	6	189873	189878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017052	GTG	2	6	189911	189916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017052	TCC	2	6	189965	189970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_017052	T	6	6	189989	189994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017052	TGA	2	6	190019	190024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490139
3566	NC_017052	GGA	2	6	190146	190151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490139
3567	NC_017052	CTGG	2	8	190161	190168	0 %	25 %	50 %	25 %	383490139
3568	NC_017052	GGAG	2	8	190188	190195	25 %	0 %	75 %	0 %	383490139
3569	NC_017052	TGG	2	6	190199	190204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490139
3570	NC_017052	ATT	2	6	190222	190227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490139
3571	NC_017052	GTT	2	6	190295	190300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490139
3572	NC_017052	ACC	2	6	190336	190341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490139
3573	NC_017052	AGA	2	6	190359	190364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490139
3574	NC_017052	ATC	2	6	190471	190476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490139
3575	NC_017052	A	7	7	190501	190507	100 %	0 %	0 %	0 %	383490139
3576	NC_017052	C	6	6	190584	190589	0 %	0 %	0 %	100 %	383490139
3577	NC_017052	TGG	2	6	190693	190698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490139
3578	NC_017052	ACA	2	6	190862	190867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490140
3579	NC_017052	TCC	2	6	190933	190938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490140
3580	NC_017052	TAA	2	6	190961	190966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490140
3581	NC_017052	CT	3	6	191017	191022	0 %	50 %	0 %	50 %	383490140
3582	NC_017052	GCA	2	6	191261	191266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490140
3583	NC_017052	GTA	2	6	191268	191273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490140
3584	NC_017052	GCGG	2	8	191292	191299	0 %	0 %	75 %	25 %	383490140
3585	NC_017052	TGG	2	6	191363	191368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490140
3586	NC_017052	A	6	6	191415	191420	100 %	0 %	0 %	0 %	383490140
3587	NC_017052	CTT	2	6	191453	191458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490140
3588	NC_017052	TTC	2	6	191484	191489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490140
3589	NC_017052	GAA	2	6	191500	191505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490140
3590	NC_017052	CAGG	2	8	191547	191554	25 %	0 %	50 %	25 %	383490140
3591	NC_017052	TGGAGT	2	12	191561	191572	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383490140
3592	NC_017052	CTG	2	6	191679	191684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490140
3593	NC_017052	T	6	6	191817	191822	0 %	100 %	0 %	0 %	383490140
3594	NC_017052	TGG	2	6	191859	191864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490140
3595	NC_017052	C	6	6	191945	191950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3596	NC_017052	CCG	2	6	192128	192133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490141
3597	NC_017052	TGT	2	6	192278	192283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490141
3598	NC_017052	TGATG	2	10	192324	192333	20 %	40 %	40 %	0 %	383490141
3599	NC_017052	AAG	2	6	192383	192388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490141
3600	NC_017052	A	7	7	192453	192459	100 %	0 %	0 %	0 %	383490141
3601	NC_017052	AGA	2	6	192486	192491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490141
3602	NC_017052	TAC	2	6	192493	192498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490141
3603	NC_017052	T	6	6	192657	192662	0 %	100 %	0 %	0 %	383490141
3604	NC_017052	ACA	2	6	192664	192669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490141
3605	NC_017052	TTA	2	6	192727	192732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490141
3606	NC_017052	CTAAA	2	10	192832	192841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3607	NC_017052	GCAA	2	8	192860	192867	50 %	0 %	25 %	25 %	383490142
3608	NC_017052	ATT	2	6	192900	192905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490142
3609	NC_017052	GGC	2	6	192918	192923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490142
3610	NC_017052	GCT	2	6	192930	192935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490142
3611	NC_017052	CAT	2	6	192968	192973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490142
3612	NC_017052	GGC	2	6	192990	192995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490142
3613	NC_017052	TG	3	6	192999	193004	0 %	50 %	50 %	0 %	383490142
3614	NC_017052	CTC	2	6	193032	193037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490142
3615	NC_017052	GCC	2	6	193038	193043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490142
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3617	NC_017052	CTGAC	2	10	193171	193180	20 %	20 %	20 %	40 %	383490142
3618	NC_017052	C	6	6	193329	193334	0 %	0 %	0 %	100 %	383490142
3619	NC_017052	TGA	2	6	193370	193375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490142
3620	NC_017052	CAT	2	6	193412	193417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490142
3621	NC_017052	CCA	2	6	193594	193599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490142
3622	NC_017052	CAAAA	2	10	193643	193652	80 %	0 %	0 %	20 %	383490142
3623	NC_017052	CCA	2	6	193711	193716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490142
3624	NC_017052	ATG	2	6	193851	193856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490142
3625	NC_017052	GTG	2	6	193884	193889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490142
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3995	NC_017052	CCA	2	6	213828	213833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490158
3996	NC_017052	CGC	2	6	213976	213981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490158
3997	NC_017052	CAT	2	6	213987	213992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490158
3998	NC_017052	TCC	3	9	214040	214048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490158
3999	NC_017052	CAAA	2	8	214077	214084	75 %	0 %	0 %	25 %	383490158
4000	NC_017052	CAA	2	6	214132	214137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490158

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