MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 66795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017052	GGT	2	6	158996	159001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490109
3002	NC_017052	GTG	2	6	159102	159107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490109
3003	NC_017052	TGT	2	6	159131	159136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490109
3004	NC_017052	AAT	2	6	159290	159295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490109
3005	NC_017052	AGT	2	6	159299	159304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490109
3006	NC_017052	CCG	2	6	159305	159310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490109
3007	NC_017052	GGC	2	6	159353	159358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490109
3008	NC_017052	GGC	2	6	159489	159494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490109
3009	NC_017052	CTG	2	6	159509	159514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490109
3010	NC_017052	TTA	2	6	159526	159531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490109
3011	NC_017052	CGC	2	6	159567	159572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490109
3012	NC_017052	AACC	2	8	159579	159586	50 %	0 %	0 %	50 %	383490109
3013	NC_017052	AGGAG	2	10	159588	159597	40 %	0 %	60 %	0 %	383490109
3014	NC_017052	TGGG	2	8	159601	159608	0 %	25 %	75 %	0 %	383490109
3015	NC_017052	A	6	6	159664	159669	100 %	0 %	0 %	0 %	383490109
3016	NC_017052	TAA	2	6	159686	159691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490109
3017	NC_017052	GTG	2	6	159740	159745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017052	ACT	2	6	159787	159792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_017052	A	6	6	159794	159799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017052	T	7	7	159811	159817	0 %	100 %	0 %	0 %	383490110
3021	NC_017052	GTG	2	6	159855	159860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490110
3022	NC_017052	CCA	2	6	159873	159878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490110
3023	NC_017052	A	7	7	159909	159915	100 %	0 %	0 %	0 %	383490110
3024	NC_017052	AGGAGT	2	12	159929	159940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383490110
3025	NC_017052	AAC	2	6	159967	159972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017052	ACC	2	6	160014	160019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490111
3027	NC_017052	CAT	2	6	160201	160206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017052	T	6	6	160220	160225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017052	TGTC	2	8	160350	160357	0 %	50 %	25 %	25 %	383490112
3030	NC_017052	GTT	2	6	160366	160371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490112
3031	NC_017052	ATT	2	6	160384	160389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490112
3032	NC_017052	T	6	6	160501	160506	0 %	100 %	0 %	0 %	383490112
3033	NC_017052	GCC	2	6	160574	160579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490112
3034	NC_017052	TGA	2	6	160626	160631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490112
3035	NC_017052	TTA	2	6	160651	160656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490112
3036	NC_017052	CGG	2	6	160669	160674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490112
3037	NC_017052	CAA	2	6	160756	160761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490112
3038	NC_017052	CGC	2	6	160782	160787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490112
3039	NC_017052	AGAA	2	8	160812	160819	75 %	0 %	25 %	0 %	383490112
3040	NC_017052	CAG	2	6	160823	160828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490112
3041	NC_017052	ATT	2	6	160850	160855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490112
3042	NC_017052	TAC	2	6	160874	160879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490112
3043	NC_017052	C	6	6	160963	160968	0 %	0 %	0 %	100 %	383490112
3044	NC_017052	TGCC	2	8	160995	161002	0 %	25 %	25 %	50 %	383490112
3045	NC_017052	AAC	2	6	161013	161018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490112
3046	NC_017052	CTT	2	6	161108	161113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490113
3047	NC_017052	GT	3	6	161182	161187	0 %	50 %	50 %	0 %	383490113
3048	NC_017052	CAG	2	6	161250	161255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490113
3049	NC_017052	GTC	2	6	161304	161309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490113
3050	NC_017052	ACC	2	6	161425	161430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490113
3051	NC_017052	GGT	2	6	161472	161477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490113
3052	NC_017052	C	6	6	161527	161532	0 %	0 %	0 %	100 %	383490113
3053	NC_017052	T	6	6	161616	161621	0 %	100 %	0 %	0 %	383490113
3054	NC_017052	CAG	2	6	161714	161719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017052	GCT	2	6	161720	161725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017052	CAA	2	6	161738	161743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017052	ACT	2	6	161755	161760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490114
3058	NC_017052	CGG	2	6	161811	161816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490114
3059	NC_017052	TCC	2	6	161877	161882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490114
3060	NC_017052	ATC	2	6	161903	161908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490114
3061	NC_017052	GTC	2	6	161930	161935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490114
3062	NC_017052	TGGCTT	2	12	161968	161979	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383490114
3063	NC_017052	CCA	2	6	162031	162036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490114
3064	NC_017052	AGG	2	6	162054	162059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490114
3065	NC_017052	CGG	2	6	162085	162090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490114
3066	NC_017052	CTCC	2	8	162136	162143	0 %	25 %	0 %	75 %	383490114
3067	NC_017052	TGT	2	6	162234	162239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490114
3068	NC_017052	ACCA	2	8	162278	162285	50 %	0 %	0 %	50 %	383490114
3069	NC_017052	TGG	2	6	162382	162387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490114
3070	NC_017052	TAA	2	6	162421	162426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490114
3071	NC_017052	GTC	2	6	162494	162499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490114
3072	NC_017052	GTT	2	6	162517	162522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490114
3073	NC_017052	TTTCCA	2	12	162523	162534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383490114
3074	NC_017052	GGC	2	6	162536	162541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490114
3075	NC_017052	CCG	2	6	162550	162555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490114
3076	NC_017052	AGGGG	2	10	162600	162609	20 %	0 %	80 %	0 %	383490114
3077	NC_017052	TGG	2	6	162643	162648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490114
3078	NC_017052	CCA	2	6	162682	162687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490114
3079	NC_017052	CGG	2	6	162793	162798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490114
3080	NC_017052	GGT	2	6	162902	162907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490114
3081	NC_017052	AAAG	2	8	163011	163018	75 %	0 %	25 %	0 %	383490114
3082	NC_017052	TGG	2	6	163024	163029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490114
3083	NC_017052	TGCT	2	8	163100	163107	0 %	50 %	25 %	25 %	383490114
3084	NC_017052	ATC	2	6	163220	163225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490114
3085	NC_017052	GAT	2	6	163343	163348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490114
3086	NC_017052	CTC	2	6	163406	163411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490114
3087	NC_017052	GTGG	2	8	163421	163428	0 %	25 %	75 %	0 %	383490114
3088	NC_017052	CGG	2	6	163555	163560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490114
3089	NC_017052	CA	3	6	163645	163650	50 %	0 %	0 %	50 %	383490114
3090	NC_017052	GAT	2	6	163675	163680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017052	C	6	6	163733	163738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3092	NC_017052	GGA	2	6	163773	163778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017052	CAT	2	6	163943	163948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017052	AAG	2	6	163959	163964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017052	C	6	6	164035	164040	0 %	0 %	0 %	100 %	383490115
3096	NC_017052	AAT	2	6	164204	164209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490115
3097	NC_017052	CTG	2	6	164218	164223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490115
3098	NC_017052	AGA	2	6	164293	164298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490115
3099	NC_017052	AGG	2	6	164402	164407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490115
3100	NC_017052	GGC	2	6	164423	164428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490115
3101	NC_017052	GTT	2	6	164431	164436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490115
3102	NC_017052	ATA	2	6	164464	164469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490115
3103	NC_017052	CTGC	2	8	164477	164484	0 %	25 %	25 %	50 %	383490115
3104	NC_017052	CG	3	6	164557	164562	0 %	0 %	50 %	50 %	383490115
3105	NC_017052	GCC	2	6	164649	164654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490115
3106	NC_017052	TCAA	2	8	164671	164678	50 %	25 %	0 %	25 %	383490115
3107	NC_017052	GTT	3	9	164993	165001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490115
3108	NC_017052	GAC	2	6	165029	165034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490115
3109	NC_017052	CGC	2	6	165167	165172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490115
3110	NC_017052	TCA	2	6	165190	165195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490115
3111	NC_017052	AAC	2	6	165226	165231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490115
3112	NC_017052	G	6	6	165290	165295	0 %	0 %	100 %	0 %	383490115
3113	NC_017052	TCA	2	6	165305	165310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490115
3114	NC_017052	TCTT	2	8	165369	165376	0 %	75 %	0 %	25 %	383490115
3115	NC_017052	CGC	2	6	165408	165413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490115
3116	NC_017052	CAA	2	6	165500	165505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490115
3117	NC_017052	GGA	2	6	165577	165582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490115
3118	NC_017052	TCAA	2	8	165583	165590	50 %	25 %	0 %	25 %	383490115
3119	NC_017052	AGT	2	6	165627	165632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490115
3120	NC_017052	ACC	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490115
3121	NC_017052	GGC	2	6	165900	165905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490116
3122	NC_017052	G	6	6	165943	165948	0 %	0 %	100 %	0 %	383490116
3123	NC_017052	AAT	2	6	166045	166050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490116
3124	NC_017052	ATAA	2	8	166117	166124	75 %	25 %	0 %	0 %	383490116
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3238	NC_017052	TAGCCC	2	12	172961	172972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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3374	NC_017052	ATT	2	6	180171	180176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490130
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3378	NC_017052	ACC	2	6	180276	180281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490130
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3381	NC_017052	A	7	7	180425	180431	100 %	0 %	0 %	0 %	383490130
3382	NC_017052	TTG	2	6	180511	180516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490130
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3387	NC_017052	T	6	6	180840	180845	0 %	100 %	0 %	0 %	383490130
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3390	NC_017052	TGG	2	6	180992	180997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490130
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3402	NC_017052	CT	3	6	181301	181306	0 %	50 %	0 %	50 %	383490131
3403	NC_017052	ATG	2	6	181362	181367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490131
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3489	NC_017052	AATT	2	8	185663	185670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_017052	ATTA	2	8	185706	185713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_017052	ATTAA	2	10	185721	185730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_017052	AAT	2	6	185755	185760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490136
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3494	NC_017052	TGG	2	6	185911	185916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490136
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3497	NC_017052	TGA	2	6	186065	186070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490136
3498	NC_017052	ATCG	2	8	186128	186135	25 %	25 %	25 %	25 %	383490136
3499	NC_017052	CCA	2	6	186152	186157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490136
3500	NC_017052	TTC	2	6	186168	186173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490136

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