MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 66795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017052	TA	3	6	53024	53029	50 %	50 %	0 %	0 %	383490005
1002	NC_017052	TCC	2	6	53052	53057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490005
1003	NC_017052	TA	3	6	53064	53069	50 %	50 %	0 %	0 %	383490005
1004	NC_017052	CTA	2	6	53072	53077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490005
1005	NC_017052	TC	3	6	53155	53160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_017052	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017052	TTG	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017052	GGT	2	6	53339	53344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017052	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_017052	AAT	2	6	53396	53401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017052	GCTA	2	8	53452	53459	25 %	25 %	25 %	25 %	383490006
1012	NC_017052	ATG	2	6	53556	53561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490006
1013	NC_017052	AAT	2	6	53569	53574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490006
1014	NC_017052	CTA	2	6	53580	53585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490006
1015	NC_017052	GAT	2	6	53599	53604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490006
1016	NC_017052	AAGG	2	8	53606	53613	50 %	0 %	50 %	0 %	383490006
1017	NC_017052	GAT	2	6	53673	53678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490006
1018	NC_017052	AAT	2	6	53699	53704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490006
1019	NC_017052	GGTG	2	8	53755	53762	0 %	25 %	75 %	0 %	383490006
1020	NC_017052	AT	3	6	53796	53801	50 %	50 %	0 %	0 %	383490006
1021	NC_017052	CTT	2	6	53833	53838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490006
1022	NC_017052	TAA	2	6	53890	53895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490006
1023	NC_017052	T	6	6	53996	54001	0 %	100 %	0 %	0 %	383490006
1024	NC_017052	AACT	2	8	54007	54014	50 %	25 %	0 %	25 %	383490006
1025	NC_017052	TTTGG	2	10	54038	54047	0 %	60 %	40 %	0 %	383490006
1026	NC_017052	TGC	2	6	54072	54077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490006
1027	NC_017052	TAC	2	6	54097	54102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490006
1028	NC_017052	GGA	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017052	AG	3	6	54173	54178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017052	CCA	2	6	54224	54229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017052	A	6	6	54307	54312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017052	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017052	ATT	2	6	54342	54347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017052	A	6	6	54354	54359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017052	TAC	2	6	54367	54372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017052	GGA	2	6	54411	54416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017052	TGA	2	6	54544	54549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490007
1038	NC_017052	GCG	2	6	54633	54638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490007
1039	NC_017052	GAA	2	6	54685	54690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490007
1040	NC_017052	TG	3	6	54721	54726	0 %	50 %	50 %	0 %	383490007
1041	NC_017052	AATT	2	8	54741	54748	50 %	50 %	0 %	0 %	383490007
1042	NC_017052	T	6	6	54786	54791	0 %	100 %	0 %	0 %	383490007
1043	NC_017052	GCG	2	6	54858	54863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490007
1044	NC_017052	CCA	2	6	54985	54990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490007
1045	NC_017052	TTA	2	6	55064	55069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490007
1046	NC_017052	GGC	2	6	55102	55107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490007
1047	NC_017052	TCA	2	6	55179	55184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490007
1048	NC_017052	TG	3	6	55226	55231	0 %	50 %	50 %	0 %	383490007
1049	NC_017052	CAA	2	6	55261	55266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490007
1050	NC_017052	ATT	2	6	55316	55321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490007
1051	NC_017052	GT	3	6	55475	55480	0 %	50 %	50 %	0 %	383490007
1052	NC_017052	AAC	2	6	55554	55559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490007
1053	NC_017052	GCC	2	6	55598	55603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490007
1054	NC_017052	CAA	2	6	55619	55624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490007
1055	NC_017052	AGTTT	2	10	55651	55660	20 %	60 %	20 %	0 %	383490007
1056	NC_017052	TGG	2	6	55694	55699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490008
1057	NC_017052	CTA	2	6	55752	55757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490008
1058	NC_017052	T	6	6	55758	55763	0 %	100 %	0 %	0 %	383490008
1059	NC_017052	CAC	2	6	55828	55833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490008
1060	NC_017052	GTT	2	6	55947	55952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490008
1061	NC_017052	GCG	2	6	55961	55966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490008
1062	NC_017052	CCA	2	6	56000	56005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490008
1063	NC_017052	CCA	2	6	56016	56021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490008
1064	NC_017052	TGG	2	6	56190	56195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490008
1065	NC_017052	CAC	2	6	56257	56262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490008
1066	NC_017052	CAG	2	6	56358	56363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490008
1067	NC_017052	AAT	2	6	56383	56388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490008
1068	NC_017052	CTT	2	6	56460	56465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490008
1069	NC_017052	TAA	2	6	56527	56532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490008
1070	NC_017052	CTAA	2	8	56552	56559	50 %	25 %	0 %	25 %	383490009
1071	NC_017052	C	6	6	56605	56610	0 %	0 %	0 %	100 %	383490009
1072	NC_017052	TTG	2	6	56646	56651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490009
1073	NC_017052	TAA	2	6	56668	56673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490009
1074	NC_017052	GCCT	2	8	56715	56722	0 %	25 %	25 %	50 %	383490009
1075	NC_017052	GCTT	2	8	56743	56750	0 %	50 %	25 %	25 %	383490009
1076	NC_017052	TGT	2	6	56767	56772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490009
1077	NC_017052	CAT	2	6	56819	56824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490009
1078	NC_017052	CTA	2	6	56912	56917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490009
1079	NC_017052	CTT	2	6	56954	56959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490009
1080	NC_017052	T	7	7	57194	57200	0 %	100 %	0 %	0 %	383490009
1081	NC_017052	GAA	2	6	57213	57218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490009
1082	NC_017052	GTT	3	9	57234	57242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017052	ATA	2	6	57259	57264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017052	AGT	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490010
1085	NC_017052	ATC	2	6	57445	57450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490010
1086	NC_017052	AAAAC	2	10	57512	57521	80 %	0 %	0 %	20 %	383490010
1087	NC_017052	CAC	2	6	57598	57603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490010
1088	NC_017052	CAC	2	6	57667	57672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490010
1089	NC_017052	AAT	2	6	57673	57678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490010
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1091	NC_017052	CTC	2	6	57709	57714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490010
1092	NC_017052	TGT	2	6	57758	57763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490010
1093	NC_017052	GTA	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490010
1094	NC_017052	TCCA	2	8	57883	57890	25 %	25 %	0 %	50 %	383490010
1095	NC_017052	T	6	6	57916	57921	0 %	100 %	0 %	0 %	383490010
1096	NC_017052	ATC	2	6	57922	57927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490010
1097	NC_017052	GCTT	2	8	57956	57963	0 %	50 %	25 %	25 %	383490010
1098	NC_017052	T	6	6	57965	57970	0 %	100 %	0 %	0 %	383490010
1099	NC_017052	CCG	2	6	58064	58069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490010
1100	NC_017052	TGG	2	6	58142	58147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490010
1101	NC_017052	G	6	6	58146	58151	0 %	0 %	100 %	0 %	383490010
1102	NC_017052	C	6	6	58184	58189	0 %	0 %	0 %	100 %	383490010
1103	NC_017052	ATA	2	6	58246	58251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490010
1104	NC_017052	ATT	2	6	58258	58263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490010
1105	NC_017052	CCATG	2	10	58347	58356	20 %	20 %	20 %	40 %	383490010
1106	NC_017052	ACA	3	9	58374	58382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490010
1107	NC_017052	GCC	2	6	58460	58465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490010
1108	NC_017052	GTC	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490010
1109	NC_017052	ATA	2	6	58507	58512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490010
1110	NC_017052	AGA	2	6	58537	58542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490010
1111	NC_017052	TGAA	2	8	58550	58557	50 %	25 %	25 %	0 %	383490010
1112	NC_017052	A	6	6	58587	58592	100 %	0 %	0 %	0 %	383490010
1113	NC_017052	AGA	2	6	58599	58604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490010
1114	NC_017052	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_017052	GGA	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017052	T	7	7	59015	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017052	TGA	2	6	59049	59054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490011
1118	NC_017052	CCA	2	6	59074	59079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490011
1119	NC_017052	GGC	2	6	59129	59134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490011
1120	NC_017052	CGG	2	6	59209	59214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490011
1121	NC_017052	GGTCA	2	10	59261	59270	20 %	20 %	40 %	20 %	383490011
1122	NC_017052	CTG	2	6	59324	59329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490011
1123	NC_017052	CGA	2	6	59356	59361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490011
1124	NC_017052	ATT	2	6	59375	59380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490011
1125	NC_017052	TTC	2	6	59420	59425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490011
1126	NC_017052	CGA	2	6	59434	59439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490011
1127	NC_017052	TGA	2	6	59475	59480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490011
1128	NC_017052	TTC	2	6	59519	59524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490011
1129	NC_017052	GGC	2	6	59534	59539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490011
1130	NC_017052	TGG	2	6	59548	59553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490011
1131	NC_017052	GCG	2	6	59585	59590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490011
1132	NC_017052	TGG	2	6	59632	59637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490011
1133	NC_017052	GTAT	2	8	59658	59665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017052	A	8	8	59675	59682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017052	ATAC	2	8	59700	59707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1143	NC_017052	GGGA	2	8	60117	60124	25 %	0 %	75 %	0 %	383490012
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1148	NC_017052	GGT	2	6	60484	60489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1171	NC_017052	ATTT	2	8	61649	61656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_017052	ATT	2	6	61684	61689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1175	NC_017052	ATTA	2	8	61760	61767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1233	NC_017052	ATTT	2	8	64365	64372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_017052	CAAA	2	8	64396	64403	75 %	0 %	0 %	25 %	383490016
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1238	NC_017052	AATC	2	8	64517	64524	50 %	25 %	0 %	25 %	383490016
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1243	NC_017052	ATC	2	6	64793	64798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490016
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1246	NC_017052	ATTAA	2	10	64957	64966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_017052	ATT	2	6	65001	65006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490017
1248	NC_017052	TGA	2	6	65012	65017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490017
1249	NC_017052	CGAAAC	2	12	65058	65069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383490017
1250	NC_017052	AACT	2	8	65084	65091	50 %	25 %	0 %	25 %	383490017
1251	NC_017052	A	6	6	65261	65266	100 %	0 %	0 %	0 %	383490017
1252	NC_017052	GTG	2	6	65402	65407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490017
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1254	NC_017052	ACA	2	6	65463	65468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490017
1255	NC_017052	TTC	2	6	65558	65563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490017
1256	NC_017052	CAA	2	6	65567	65572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490017
1257	NC_017052	TAA	2	6	65660	65665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490017
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