MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017046	AGA	2	6	186247	186252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494981
4002	NC_017046	CCG	2	6	186329	186334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4003	NC_017046	A	6	6	186342	186347	100 %	0 %	0 %	0 %	383494981
4004	NC_017046	TCACCG	2	12	186348	186359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383494981
4005	NC_017046	CGA	2	6	186388	186393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4006	NC_017046	TC	4	8	186394	186401	0 %	50 %	0 %	50 %	383494981
4007	NC_017046	CAAA	2	8	186511	186518	75 %	0 %	0 %	25 %	383494981
4008	NC_017046	A	6	6	186533	186538	100 %	0 %	0 %	0 %	383494981
4009	NC_017046	GTG	2	6	186566	186571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494981
4010	NC_017046	TTC	2	6	186580	186585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494981
4011	NC_017046	GCG	3	9	186654	186662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4012	NC_017046	CGG	2	6	186673	186678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4013	NC_017046	TCT	2	6	186693	186698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494981
4014	NC_017046	GC	3	6	186720	186725	0 %	0 %	50 %	50 %	383494981
4015	NC_017046	GTGC	2	8	186866	186873	0 %	25 %	50 %	25 %	383494981
4016	NC_017046	GGT	2	6	186875	186880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494981
4017	NC_017046	ACC	2	6	186911	186916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
4018	NC_017046	AGC	2	6	186983	186988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4019	NC_017046	GGTC	2	8	187015	187022	0 %	25 %	50 %	25 %	383494981
4020	NC_017046	TCCG	2	8	187044	187051	0 %	25 %	25 %	50 %	383494981
4021	NC_017046	TAC	2	6	187096	187101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494981
4022	NC_017046	CGA	2	6	187117	187122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4023	NC_017046	CCG	2	6	187152	187157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4024	NC_017046	CAC	2	6	187213	187218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
4025	NC_017046	CAC	2	6	187220	187225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
4026	NC_017046	TC	3	6	187260	187265	0 %	50 %	0 %	50 %	383494981
4027	NC_017046	TGC	3	9	187308	187316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4028	NC_017046	CGG	2	6	187333	187338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4029	NC_017046	CGG	2	6	187377	187382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4030	NC_017046	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	383494981
4031	NC_017046	GCC	2	6	187403	187408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4032	NC_017046	CTG	2	6	187535	187540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4033	NC_017046	GAA	2	6	187549	187554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494981
4034	NC_017046	TCT	2	6	187569	187574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494981
4035	NC_017046	CCG	2	6	187647	187652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4036	NC_017046	TTG	2	6	187698	187703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494981
4037	NC_017046	CTG	2	6	187727	187732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4038	NC_017046	GAT	2	6	187738	187743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494981
4039	NC_017046	CCG	2	6	187762	187767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4040	NC_017046	CGT	2	6	187778	187783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4041	NC_017046	TGGC	2	8	187802	187809	0 %	25 %	50 %	25 %	383494981
4042	NC_017046	GCT	2	6	187819	187824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4043	NC_017046	CGG	2	6	187851	187856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4044	NC_017046	GAC	2	6	187916	187921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4045	NC_017046	CTG	2	6	187928	187933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4046	NC_017046	CGA	2	6	187957	187962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4047	NC_017046	GCT	2	6	188017	188022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4048	NC_017046	GCC	2	6	188065	188070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4049	NC_017046	CGC	2	6	188083	188088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
4050	NC_017046	GAA	2	6	188099	188104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494981
4051	NC_017046	TAC	2	6	188108	188113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494981
4052	NC_017046	GGT	2	6	188203	188208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494981
4053	NC_017046	GGC	2	6	188281	188286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4054	NC_017046	GCG	2	6	188291	188296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4055	NC_017046	CGG	2	6	188358	188363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
4056	NC_017046	TATTTT	2	12	188531	188542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383494982
4057	NC_017046	CTT	2	6	188545	188550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494982
4058	NC_017046	CT	3	6	188567	188572	0 %	50 %	0 %	50 %	383494982
4059	NC_017046	TA	3	6	188577	188582	50 %	50 %	0 %	0 %	383494982
4060	NC_017046	GTAT	2	8	188655	188662	25 %	50 %	25 %	0 %	383494982
4061	NC_017046	TGG	2	6	188673	188678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494982
4062	NC_017046	TAT	2	6	188765	188770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494982
4063	NC_017046	TCA	2	6	188850	188855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494982
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4065	NC_017046	GGTT	2	8	189006	189013	0 %	50 %	50 %	0 %	383494982
4066	NC_017046	ATG	2	6	189048	189053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494982
4067	NC_017046	TGC	2	6	189059	189064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494982
4068	NC_017046	T	6	6	189088	189093	0 %	100 %	0 %	0 %	383494982
4069	NC_017046	ATT	2	6	189095	189100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494982
4070	NC_017046	CAT	2	6	189109	189114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494982
4071	NC_017046	TAT	2	6	189140	189145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494982
4072	NC_017046	TTG	2	6	189188	189193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494982
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4074	NC_017046	T	6	6	189245	189250	0 %	100 %	0 %	0 %	383494982
4075	NC_017046	TGTT	2	8	189279	189286	0 %	75 %	25 %	0 %	383494982
4076	NC_017046	AAG	2	6	189311	189316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494982
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4078	NC_017046	TAA	2	6	189377	189382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017046	TAC	2	6	189413	189418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017046	TCT	2	6	189477	189482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017046	T	7	7	189517	189523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017046	GGT	2	6	189663	189668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494983
4083	NC_017046	CG	3	6	189732	189737	0 %	0 %	50 %	50 %	383494983
4084	NC_017046	TGGA	2	8	189793	189800	25 %	25 %	50 %	0 %	383494983
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4088	NC_017046	AG	3	6	189882	189887	50 %	0 %	50 %	0 %	383494983
4089	NC_017046	GGA	2	6	189906	189911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494983
4090	NC_017046	GTC	2	6	189922	189927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494983
4091	NC_017046	CT	3	6	189963	189968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_017046	T	6	6	190059	190064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017046	T	6	6	190077	190082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017046	TTA	2	6	190088	190093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017046	TTGA	2	8	190135	190142	25 %	50 %	25 %	0 %	383494984
4096	NC_017046	CAA	2	6	190171	190176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494984
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4098	NC_017046	CGG	2	6	190227	190232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494984
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4101	NC_017046	CTG	2	6	190357	190362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494984
4102	NC_017046	GCG	2	6	190508	190513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494984
4103	NC_017046	TGC	2	6	190557	190562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494984
4104	NC_017046	ATG	2	6	190622	190627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494984
4105	NC_017046	CTTT	2	8	190631	190638	0 %	75 %	0 %	25 %	383494984
4106	NC_017046	GAT	2	6	190641	190646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494984
4107	NC_017046	TGG	2	6	190691	190696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494984
4108	NC_017046	T	6	6	190758	190763	0 %	100 %	0 %	0 %	383494984
4109	NC_017046	GGC	2	6	190771	190776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494984
4110	NC_017046	GCT	2	6	190779	190784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494984
4111	NC_017046	CTTT	2	8	190790	190797	0 %	75 %	0 %	25 %	383494984
4112	NC_017046	GGGC	2	8	190811	190818	0 %	0 %	75 %	25 %	383494984
4113	NC_017046	CGTT	2	8	190880	190887	0 %	50 %	25 %	25 %	383494984
4114	NC_017046	GCG	2	6	190945	190950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494984
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4117	NC_017046	GCT	2	6	191029	191034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494984
4118	NC_017046	CCGCT	2	10	191036	191045	0 %	20 %	20 %	60 %	383494984
4119	NC_017046	GCC	2	6	191050	191055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494984
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4121	NC_017046	CCT	2	6	191093	191098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494984
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4123	NC_017046	CTT	2	6	191126	191131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494984
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4334	NC_017046	AAGT	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4491	NC_017046	ATG	2	6	209425	209430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495001
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4493	NC_017046	CGGCG	2	10	209490	209499	0 %	0 %	60 %	40 %	383495001
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4495	NC_017046	GGA	2	6	209577	209582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495001
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4497	NC_017046	CAG	3	9	209674	209682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495001
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4500	NC_017046	T	6	6	209766	209771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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