MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017046	G	6	6	139956	139961	0 %	0 %	100 %	0 %	383494941
3002	NC_017046	CATC	2	8	140065	140072	25 %	25 %	0 %	50 %	383494941
3003	NC_017046	CTG	2	6	140081	140086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494941
3004	NC_017046	CCTG	2	8	140095	140102	0 %	25 %	25 %	50 %	383494941
3005	NC_017046	ATT	2	6	140111	140116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494941
3006	NC_017046	GATG	2	8	140203	140210	25 %	25 %	50 %	0 %	383494941
3007	NC_017046	AAG	2	6	140265	140270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494941
3008	NC_017046	CAA	2	6	140290	140295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494941
3009	NC_017046	GAT	2	6	140408	140413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494942
3010	NC_017046	AC	3	6	140426	140431	50 %	0 %	0 %	50 %	383494942
3011	NC_017046	CGG	2	6	140510	140515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494942
3012	NC_017046	CGAT	2	8	140566	140573	25 %	25 %	25 %	25 %	383494942
3013	NC_017046	CAT	2	6	140627	140632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494942
3014	NC_017046	GCTG	2	8	140651	140658	0 %	25 %	50 %	25 %	383494942
3015	NC_017046	TCT	2	6	140721	140726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494942
3016	NC_017046	CG	3	6	140800	140805	0 %	0 %	50 %	50 %	383494942
3017	NC_017046	GCC	2	6	140814	140819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494942
3018	NC_017046	CGG	2	6	140833	140838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494942
3019	NC_017046	GAG	2	6	140877	140882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494942
3020	NC_017046	TTG	2	6	140911	140916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494942
3021	NC_017046	GCG	3	9	140970	140978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494942
3022	NC_017046	GGA	2	6	141056	141061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494942
3023	NC_017046	GCTC	2	8	141082	141089	0 %	25 %	25 %	50 %	383494942
3024	NC_017046	GGCG	2	8	141105	141112	0 %	0 %	75 %	25 %	383494942
3025	NC_017046	ATC	2	6	141120	141125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494942
3026	NC_017046	CGG	2	6	141196	141201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494942
3027	NC_017046	A	6	6	141228	141233	100 %	0 %	0 %	0 %	383494942
3028	NC_017046	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	383494942
3029	NC_017046	AG	3	6	141332	141337	50 %	0 %	50 %	0 %	383494942
3030	NC_017046	CAG	2	6	141352	141357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017046	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3032	NC_017046	CAT	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494943
3033	NC_017046	CGG	2	6	141492	141497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494943
3034	NC_017046	GGT	2	6	141502	141507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494943
3035	NC_017046	ACG	2	6	141509	141514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494943
3036	NC_017046	GAA	2	6	141605	141610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494943
3037	NC_017046	GCA	2	6	141667	141672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494943
3038	NC_017046	AGC	2	6	141733	141738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494944
3039	NC_017046	GAA	2	6	141767	141772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494944
3040	NC_017046	TCA	2	6	141783	141788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494944
3041	NC_017046	T	7	7	141834	141840	0 %	100 %	0 %	0 %	383494944
3042	NC_017046	CG	3	6	141848	141853	0 %	0 %	50 %	50 %	383494944
3043	NC_017046	ACCG	2	8	141950	141957	25 %	0 %	25 %	50 %	383494944
3044	NC_017046	AAG	2	6	142014	142019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494944
3045	NC_017046	CGG	2	6	142030	142035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494944
3046	NC_017046	TTTA	2	8	142133	142140	25 %	75 %	0 %	0 %	383494944
3047	NC_017046	GC	3	6	142145	142150	0 %	0 %	50 %	50 %	383494944
3048	NC_017046	A	6	6	142181	142186	100 %	0 %	0 %	0 %	383494944
3049	NC_017046	CGC	2	6	142223	142228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494944
3050	NC_017046	TAC	2	6	142229	142234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494944
3051	NC_017046	GCGA	2	8	142341	142348	25 %	0 %	50 %	25 %	383494944
3052	NC_017046	TCC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494944
3053	NC_017046	TGA	2	6	142435	142440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494944
3054	NC_017046	AAC	2	6	142472	142477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494944
3055	NC_017046	TGGCGA	2	12	142545	142556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383494944
3056	NC_017046	CAA	2	6	142576	142581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494944
3057	NC_017046	TGG	2	6	142662	142667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494944
3058	NC_017046	TGA	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494944
3059	NC_017046	GC	3	6	142760	142765	0 %	0 %	50 %	50 %	383494944
3060	NC_017046	TAG	2	6	142854	142859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494944
3061	NC_017046	TACT	2	8	142861	142868	25 %	50 %	0 %	25 %	383494944
3062	NC_017046	GGT	2	6	142944	142949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494944
3063	NC_017046	AG	3	6	142957	142962	50 %	0 %	50 %	0 %	383494944
3064	NC_017046	GTG	2	6	143126	143131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494944
3065	NC_017046	ATG	2	6	143135	143140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494944
3066	NC_017046	GCG	4	12	143160	143171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494944
3067	NC_017046	A	6	6	143222	143227	100 %	0 %	0 %	0 %	383494944
3068	NC_017046	CAA	2	6	143251	143256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494944
3069	NC_017046	TGG	2	6	143310	143315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494944
3070	NC_017046	TCA	2	6	143319	143324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494944
3071	NC_017046	TAC	2	6	143345	143350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494944
3072	NC_017046	GGC	2	6	143351	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494944
3073	NC_017046	CAT	2	6	143383	143388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494944
3074	NC_017046	GCG	2	6	143391	143396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494944
3075	NC_017046	A	7	7	143442	143448	100 %	0 %	0 %	0 %	383494944
3076	NC_017046	TAAT	2	8	143457	143464	50 %	50 %	0 %	0 %	383494944
3077	NC_017046	CTT	2	6	143505	143510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017046	GTGG	2	8	143516	143523	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017046	CG	3	6	143534	143539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_017046	GA	3	6	143548	143553	50 %	0 %	50 %	0 %	383494945
3081	NC_017046	GCG	2	6	143577	143582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494945
3082	NC_017046	GTG	2	6	143601	143606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494945
3083	NC_017046	TCA	2	6	143609	143614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494945
3084	NC_017046	AT	3	6	143630	143635	50 %	50 %	0 %	0 %	383494945
3085	NC_017046	ATT	2	6	143667	143672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494945
3086	NC_017046	GCGA	2	8	143691	143698	25 %	0 %	50 %	25 %	383494945
3087	NC_017046	GTC	2	6	143730	143735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3088	NC_017046	CAGC	2	8	143741	143748	25 %	0 %	25 %	50 %	383494945
3089	NC_017046	TGG	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494945
3090	NC_017046	ACC	4	12	143841	143852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494945
3091	NC_017046	ACT	2	6	143855	143860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494945
3092	NC_017046	TCT	2	6	144033	144038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494945
3093	NC_017046	GCA	2	6	144050	144055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3094	NC_017046	GGC	2	6	144062	144067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494945
3095	NC_017046	GCC	2	6	144078	144083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494945
3096	NC_017046	GGC	2	6	144146	144151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494945
3097	NC_017046	CCAC	2	8	144169	144176	25 %	0 %	0 %	75 %	383494945
3098	NC_017046	CAT	2	6	144177	144182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494945
3099	NC_017046	GAT	2	6	144204	144209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494945
3100	NC_017046	CGC	2	6	144219	144224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494945
3101	NC_017046	TGGC	2	8	144225	144232	0 %	25 %	50 %	25 %	383494945
3102	NC_017046	CGA	2	6	144337	144342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3103	NC_017046	CTG	2	6	144417	144422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3104	NC_017046	CCG	2	6	144475	144480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494945
3105	NC_017046	CG	3	6	144479	144484	0 %	0 %	50 %	50 %	383494945
3106	NC_017046	GGT	3	9	144539	144547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494945
3107	NC_017046	GGC	2	6	144590	144595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494945
3108	NC_017046	GAA	2	6	144687	144692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494945
3109	NC_017046	TCG	2	6	144703	144708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3110	NC_017046	TGAC	2	8	144712	144719	25 %	25 %	25 %	25 %	383494945
3111	NC_017046	GAG	2	6	144735	144740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494945
3112	NC_017046	CG	3	6	144742	144747	0 %	0 %	50 %	50 %	383494945
3113	NC_017046	CGT	2	6	144857	144862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494945
3114	NC_017046	ATT	2	6	144919	144924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494945
3115	NC_017046	AC	3	6	145053	145058	50 %	0 %	0 %	50 %	383494946
3116	NC_017046	CTG	2	6	145157	145162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494946
3117	NC_017046	GTC	2	6	145167	145172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494946
3118	NC_017046	GCC	2	6	145235	145240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494946
3119	NC_017046	GTG	2	6	145268	145273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494946
3120	NC_017046	CCG	2	6	145317	145322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494946
3121	NC_017046	AAC	2	6	145370	145375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494946
3122	NC_017046	GCT	2	6	145396	145401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494946
3123	NC_017046	GCG	2	6	145496	145501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494946
3124	NC_017046	GGC	3	9	145516	145524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494946
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3131	NC_017046	GGC	2	6	145825	145830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494946
3132	NC_017046	GCT	2	6	145832	145837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494946
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3139	NC_017046	GCG	2	6	146166	146171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494946
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3143	NC_017046	ATGG	2	8	146430	146437	25 %	25 %	50 %	0 %	383494947
3144	NC_017046	CT	3	6	146467	146472	0 %	50 %	0 %	50 %	383494947
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3149	NC_017046	TGG	2	6	146621	146626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494947
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3152	NC_017046	TCG	2	6	146765	146770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494947
3153	NC_017046	TGG	2	6	146795	146800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494947
3154	NC_017046	CTG	2	6	146848	146853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494947
3155	NC_017046	TCG	2	6	146867	146872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494947
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3192	NC_017046	CTG	3	9	148425	148433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494948
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3220	NC_017046	TGC	2	6	149814	149819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494949
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3223	NC_017046	CGG	2	6	150003	150008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494950
3224	NC_017046	CAT	2	6	150037	150042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494950
3225	NC_017046	GCTG	2	8	150068	150075	0 %	25 %	50 %	25 %	383494950
3226	NC_017046	CCG	2	6	150080	150085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494950
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3230	NC_017046	GTC	2	6	150319	150324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494950
3231	NC_017046	TGGC	2	8	150364	150371	0 %	25 %	50 %	25 %	383494950
3232	NC_017046	GTG	2	6	150427	150432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494950
3233	NC_017046	CGTTGC	2	12	150461	150472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494950
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3238	NC_017046	GCA	2	6	150666	150671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494950
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3240	NC_017046	CGC	3	9	150765	150773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494950
3241	NC_017046	GCA	2	6	150816	150821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494950
3242	NC_017046	AGC	2	6	150872	150877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494950
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3488	NC_017046	TCT	2	6	163168	163173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3489	NC_017046	TTA	2	6	163304	163309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494962
3490	NC_017046	GC	3	6	163336	163341	0 %	0 %	50 %	50 %	383494962
3491	NC_017046	CG	3	6	163383	163388	0 %	0 %	50 %	50 %	383494962
3492	NC_017046	CAT	2	6	163392	163397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494962
3493	NC_017046	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	383494962
3494	NC_017046	ACC	2	6	163442	163447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494962
3495	NC_017046	CAG	2	6	163486	163491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3496	NC_017046	CTG	2	6	163525	163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3497	NC_017046	CTG	2	6	163549	163554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3498	NC_017046	TTC	2	6	163591	163596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494962
3499	NC_017046	A	6	6	163605	163610	100 %	0 %	0 %	0 %	383494962
3500	NC_017046	CGG	2	6	163647	163652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494962

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