MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017046	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494862
1003	NC_017046	GCT	2	6	45871	45876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494862
1004	NC_017046	TAC	2	6	45941	45946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494862
1005	NC_017046	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	383494862
1006	NC_017046	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017046	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017046	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017046	A	7	7	46090	46096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017046	TCA	2	6	46105	46110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017046	TA	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017046	TAG	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017046	GAA	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017046	GA	3	6	46178	46183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017046	T	6	6	46209	46214	0 %	100 %	0 %	0 %	383494863
1016	NC_017046	AGC	2	6	46215	46220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494863
1017	NC_017046	CAT	2	6	46235	46240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494863
1018	NC_017046	TCA	2	6	46243	46248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494863
1019	NC_017046	CGC	2	6	46250	46255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494863
1020	NC_017046	CAA	2	6	46355	46360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494863
1021	NC_017046	TGT	2	6	46369	46374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494863
1022	NC_017046	GCC	2	6	46488	46493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494863
1023	NC_017046	CGG	2	6	46496	46501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494863
1024	NC_017046	GAT	2	6	46502	46507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494863
1025	NC_017046	ACT	2	6	46537	46542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494863
1026	NC_017046	GGGCT	2	10	46562	46571	0 %	20 %	60 %	20 %	383494863
1027	NC_017046	ATC	2	6	46671	46676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494863
1028	NC_017046	GAT	2	6	46677	46682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494863
1029	NC_017046	TTA	2	6	46696	46701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494863
1030	NC_017046	GGC	2	6	46748	46753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494863
1031	NC_017046	GCT	2	6	46775	46780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494863
1032	NC_017046	GCG	2	6	46789	46794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494863
1033	NC_017046	TA	3	6	46810	46815	50 %	50 %	0 %	0 %	383494863
1034	NC_017046	CGG	2	6	46840	46845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494863
1035	NC_017046	GAAA	2	8	46907	46914	75 %	0 %	25 %	0 %	383494863
1036	NC_017046	TCGC	2	8	46922	46929	0 %	25 %	25 %	50 %	383494863
1037	NC_017046	TGC	2	6	47050	47055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494863
1038	NC_017046	ATT	2	6	47064	47069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494863
1039	NC_017046	CTG	2	6	47076	47081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494863
1040	NC_017046	GCTG	2	8	47113	47120	0 %	25 %	50 %	25 %	383494863
1041	NC_017046	TG	3	6	47191	47196	0 %	50 %	50 %	0 %	383494863
1042	NC_017046	TTA	2	6	47260	47265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494863
1043	NC_017046	GTG	2	6	47310	47315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494863
1044	NC_017046	GC	4	8	47330	47337	0 %	0 %	50 %	50 %	383494863
1045	NC_017046	GA	3	6	47412	47417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017046	TAT	2	6	47452	47457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494864
1047	NC_017046	AAG	2	6	47474	47479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494864
1048	NC_017046	CGC	2	6	47516	47521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494864
1049	NC_017046	TGT	2	6	47702	47707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494864
1050	NC_017046	CAG	2	6	47748	47753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494864
1051	NC_017046	GCG	2	6	47764	47769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494864
1052	NC_017046	GTG	3	9	47770	47778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494864
1053	NC_017046	CACG	2	8	47811	47818	25 %	0 %	25 %	50 %	383494864
1054	NC_017046	CAGC	2	8	47838	47845	25 %	0 %	25 %	50 %	383494864
1055	NC_017046	GCA	2	6	47889	47894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494864
1056	NC_017046	CTGC	2	8	47975	47982	0 %	25 %	25 %	50 %	383494864
1057	NC_017046	GTT	2	6	48036	48041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494864
1058	NC_017046	TGA	2	6	48090	48095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494864
1059	NC_017046	GAA	2	6	48220	48225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494864
1060	NC_017046	GA	3	6	48244	48249	50 %	0 %	50 %	0 %	383494864
1061	NC_017046	CGG	2	6	48263	48268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494864
1062	NC_017046	ACT	2	6	48290	48295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494864
1063	NC_017046	TACC	2	8	48322	48329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017046	CAG	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494865
1065	NC_017046	GCGTA	2	10	48438	48447	20 %	20 %	40 %	20 %	383494865
1066	NC_017046	CCT	2	6	48461	48466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494865
1067	NC_017046	CATG	2	8	48543	48550	25 %	25 %	25 %	25 %	383494865
1068	NC_017046	CAG	2	6	48562	48567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494865
1069	NC_017046	TCC	2	6	48671	48676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494865
1070	NC_017046	CCA	2	6	48929	48934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494865
1071	NC_017046	CCG	2	6	48941	48946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494865
1072	NC_017046	CGT	2	6	48952	48957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494865
1073	NC_017046	CCA	2	6	48958	48963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494865
1074	NC_017046	GCA	2	6	48995	49000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494865
1075	NC_017046	GAG	2	6	49025	49030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494865
1076	NC_017046	GACCA	2	10	49043	49052	40 %	0 %	20 %	40 %	383494865
1077	NC_017046	A	6	6	49135	49140	100 %	0 %	0 %	0 %	383494865
1078	NC_017046	CCGGC	2	10	49185	49194	0 %	0 %	40 %	60 %	383494865
1079	NC_017046	GTCGTA	2	12	49210	49221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383494865
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1081	NC_017046	AAGT	2	8	49337	49344	50 %	25 %	25 %	0 %	383494865
1082	NC_017046	CCAG	2	8	49395	49402	25 %	0 %	25 %	50 %	383494865
1083	NC_017046	CG	3	6	49524	49529	0 %	0 %	50 %	50 %	383494865
1084	NC_017046	AAG	2	6	49565	49570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494865
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1086	NC_017046	CAG	2	6	49627	49632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494865
1087	NC_017046	CAT	2	6	49690	49695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494865
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1089	NC_017046	AGT	2	6	49764	49769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494865
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1093	NC_017046	TG	3	6	50142	50147	0 %	50 %	50 %	0 %	383494865
1094	NC_017046	TTGA	2	8	50176	50183	25 %	50 %	25 %	0 %	383494865
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1098	NC_017046	TTG	2	6	50395	50400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494865
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1102	NC_017046	AGT	2	6	50519	50524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494866
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1108	NC_017046	CAT	2	6	50860	50865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494866
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1118	NC_017046	T	7	7	51129	51135	0 %	100 %	0 %	0 %	383494866
1119	NC_017046	GC	3	6	51210	51215	0 %	0 %	50 %	50 %	383494866
1120	NC_017046	TAAA	2	8	51245	51252	75 %	25 %	0 %	0 %	383494866
1121	NC_017046	ATC	2	6	51262	51267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494866
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1123	NC_017046	TAA	2	6	51313	51318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017046	TCTT	2	8	51364	51371	0 %	75 %	0 %	25 %	383494867
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1242	NC_017046	AGCGC	2	10	57235	57244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1243	NC_017046	GTG	2	6	57257	57262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1248	NC_017046	AGC	3	9	57490	57498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494873
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1250	NC_017046	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	383494873
1251	NC_017046	CGC	2	6	57548	57553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494873
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1486	NC_017046	TAAT	2	8	68492	68499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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