MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017046	CGG	2	6	22994	22999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494842
502	NC_017046	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	383494842
503	NC_017046	TAT	2	6	23025	23030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494842
504	NC_017046	ATA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494842
505	NC_017046	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017046	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_017046	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017046	A	7	7	23338	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	383494843
509	NC_017046	TGA	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494843
510	NC_017046	ACG	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494843
511	NC_017046	ATA	2	6	23369	23374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494843
512	NC_017046	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	383494843
513	NC_017046	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	383494843
514	NC_017046	CAG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494843
515	NC_017046	TTG	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494843
516	NC_017046	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	383494843
517	NC_017046	GTT	2	6	23548	23553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494843
518	NC_017046	ATG	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494843
519	NC_017046	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	383494843
520	NC_017046	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	383494843
521	NC_017046	ACG	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494843
522	NC_017046	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494843
523	NC_017046	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	383494843
524	NC_017046	GCT	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494843
525	NC_017046	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	383494843
526	NC_017046	A	7	7	23967	23973	100 %	0 %	0 %	0 %	383494843
527	NC_017046	GGC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494843
528	NC_017046	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017046	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017046	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017046	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017046	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017046	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017046	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017046	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017046	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017046	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017046	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017046	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017046	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017046	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494844
542	NC_017046	TAC	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494844
543	NC_017046	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	383494844
544	NC_017046	CGC	2	6	24594	24599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494844
545	NC_017046	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	383494844
546	NC_017046	TGG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494844
547	NC_017046	AGA	2	6	24696	24701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494844
548	NC_017046	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	383494844
549	NC_017046	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494844
550	NC_017046	CGA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494844
551	NC_017046	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494844
552	NC_017046	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017046	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	383494845
554	NC_017046	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	383494845
555	NC_017046	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494845
556	NC_017046	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494845
557	NC_017046	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494845
558	NC_017046	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494845
559	NC_017046	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494845
560	NC_017046	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494845
561	NC_017046	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	383494845
562	NC_017046	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494845
563	NC_017046	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	383494845
564	NC_017046	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	383494845
565	NC_017046	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	383494845
566	NC_017046	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494845
567	NC_017046	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	383494845
568	NC_017046	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	383494845
569	NC_017046	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	383494845
570	NC_017046	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494845
571	NC_017046	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	383494845
572	NC_017046	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494845
573	NC_017046	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494845
574	NC_017046	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494845
575	NC_017046	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	383494846
576	NC_017046	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
577	NC_017046	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
578	NC_017046	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	383494846
579	NC_017046	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	383494846
580	NC_017046	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
581	NC_017046	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494846
582	NC_017046	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
583	NC_017046	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
584	NC_017046	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
585	NC_017046	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494846
586	NC_017046	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
587	NC_017046	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
588	NC_017046	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
589	NC_017046	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494846
590	NC_017046	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	383494846
591	NC_017046	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
592	NC_017046	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494846
593	NC_017046	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494846
594	NC_017046	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494846
595	NC_017046	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
596	NC_017046	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494846
597	NC_017046	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
598	NC_017046	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
599	NC_017046	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
600	NC_017046	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	383494846
601	NC_017046	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
602	NC_017046	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494846
603	NC_017046	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
604	NC_017046	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494846
605	NC_017046	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494846
606	NC_017046	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494846
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608	NC_017046	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494846
609	NC_017046	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
610	NC_017046	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
611	NC_017046	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494846
612	NC_017046	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494846
613	NC_017046	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
614	NC_017046	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494846
615	NC_017046	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494846
616	NC_017046	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
617	NC_017046	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494846
618	NC_017046	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494846
619	NC_017046	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494846
620	NC_017046	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
621	NC_017046	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	383494846
622	NC_017046	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494846
623	NC_017046	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494846
624	NC_017046	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
625	NC_017046	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494846
626	NC_017046	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
627	NC_017046	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	383494846
628	NC_017046	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	383494846
629	NC_017046	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383494846
630	NC_017046	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494846
631	NC_017046	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	383494846
632	NC_017046	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494846
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639	NC_017046	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	383494847
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889	NC_017046	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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