MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017046	GC	3	6	254117	254122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_017046	AC	3	6	254148	254153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_017046	AAC	2	6	254186	254191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017046	AC	4	8	254190	254197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_017046	GC	3	6	254387	254392	0 %	0 %	50 %	50 %	383495039
5506	NC_017046	CAT	2	6	254406	254411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495039
5507	NC_017046	CTGAA	2	10	254453	254462	40 %	20 %	20 %	20 %	383495039
5508	NC_017046	AAGCG	2	10	254517	254526	40 %	0 %	40 %	20 %	383495039
5509	NC_017046	GCT	2	6	254536	254541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495039
5510	NC_017046	TTC	2	6	254557	254562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495039
5511	NC_017046	GCTG	2	8	254573	254580	0 %	25 %	50 %	25 %	383495039
5512	NC_017046	AAGA	2	8	254680	254687	75 %	0 %	25 %	0 %	383495039
5513	NC_017046	AAC	2	6	254818	254823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495039
5514	NC_017046	GAA	2	6	254989	254994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495039
5515	NC_017046	TAA	2	6	255013	255018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495039
5516	NC_017046	GGC	2	6	255057	255062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017046	GTA	2	6	255170	255175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017046	ATG	2	6	255330	255335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495040
5519	NC_017046	A	6	6	255342	255347	100 %	0 %	0 %	0 %	383495040
5520	NC_017046	CTGA	2	8	255351	255358	25 %	25 %	25 %	25 %	383495040
5521	NC_017046	GCG	2	6	255417	255422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495040
5522	NC_017046	A	6	6	255423	255428	100 %	0 %	0 %	0 %	383495040
5523	NC_017046	GCT	2	6	255441	255446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5524	NC_017046	GACT	2	8	255509	255516	25 %	25 %	25 %	25 %	383495040
5525	NC_017046	CGC	2	6	255566	255571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495040
5526	NC_017046	GAA	2	6	255618	255623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495040
5527	NC_017046	TCG	2	6	255668	255673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5528	NC_017046	GC	3	6	255720	255725	0 %	0 %	50 %	50 %	383495040
5529	NC_017046	GCAA	2	8	255795	255802	50 %	0 %	25 %	25 %	383495040
5530	NC_017046	CTG	2	6	255832	255837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5531	NC_017046	GAAA	2	8	255896	255903	75 %	0 %	25 %	0 %	383495040
5532	NC_017046	GAA	2	6	255932	255937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495040
5533	NC_017046	CTG	2	6	256005	256010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5534	NC_017046	GACT	2	8	256079	256086	25 %	25 %	25 %	25 %	383495040
5535	NC_017046	GCA	2	6	256089	256094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5536	NC_017046	TGC	2	6	256100	256105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495040
5537	NC_017046	GAG	2	6	256132	256137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017046	CTT	2	6	256152	256157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017046	CT	3	6	256165	256170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_017046	GAAA	2	8	256260	256267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017046	GCG	2	6	256318	256323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495041
5542	NC_017046	TGGTG	2	10	256421	256430	0 %	40 %	60 %	0 %	383495041
5543	NC_017046	GGT	2	6	256437	256442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495041
5544	NC_017046	CGCC	2	8	256571	256578	0 %	0 %	25 %	75 %	383495041
5545	NC_017046	CTG	2	6	256641	256646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495041
5546	NC_017046	TAA	2	6	256649	256654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495041
5547	NC_017046	TCTG	2	8	256667	256674	0 %	50 %	25 %	25 %	383495041
5548	NC_017046	TTC	2	6	256692	256697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495041
5549	NC_017046	GGC	2	6	256874	256879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495041
5550	NC_017046	GC	3	6	256939	256944	0 %	0 %	50 %	50 %	383495041
5551	NC_017046	CGT	2	6	256947	256952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495041
5552	NC_017046	GTG	2	6	256953	256958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495041
5553	NC_017046	AAG	2	6	256969	256974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495041
5554	NC_017046	AAT	2	6	256990	256995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495041
5555	NC_017046	TTA	2	6	257043	257048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017046	TG	3	6	257093	257098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017046	GTCTG	2	10	257102	257111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_017046	CTG	2	6	257246	257251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495042
5559	NC_017046	AGA	2	6	257317	257322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495042
5560	NC_017046	GCC	2	6	257446	257451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495042
5561	NC_017046	GAA	2	6	257459	257464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495042
5562	NC_017046	CGT	2	6	257465	257470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495042
5563	NC_017046	CGTC	2	8	257530	257537	0 %	25 %	25 %	50 %	383495042
5564	NC_017046	CTG	2	6	257564	257569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495042
5565	NC_017046	TCG	2	6	257599	257604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495042
5566	NC_017046	GAA	2	6	257612	257617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495042
5567	NC_017046	GCG	2	6	257657	257662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495042
5568	NC_017046	AAG	2	6	257673	257678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495042
5569	NC_017046	TGAT	2	8	257696	257703	25 %	50 %	25 %	0 %	383495042
5570	NC_017046	GTG	2	6	257749	257754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495043
5571	NC_017046	AGA	2	6	257770	257775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495043
5572	NC_017046	GCG	2	6	257794	257799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495043
5573	NC_017046	GCA	2	6	257882	257887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5574	NC_017046	GTG	2	6	257896	257901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495043
5575	NC_017046	TGG	2	6	257936	257941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495043
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5578	NC_017046	CAG	2	6	258046	258051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5579	NC_017046	CAG	2	6	258082	258087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5580	NC_017046	GGC	2	6	258102	258107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495043
5581	NC_017046	TGA	2	6	258111	258116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495043
5582	NC_017046	GGC	2	6	258132	258137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495043
5583	NC_017046	GGC	2	6	258171	258176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495043
5584	NC_017046	CTG	2	6	258199	258204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5585	NC_017046	GCGG	2	8	258230	258237	0 %	0 %	75 %	25 %	383495043
5586	NC_017046	GCA	2	6	258260	258265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5587	NC_017046	TGG	2	6	258396	258401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495043
5588	NC_017046	GTC	2	6	258458	258463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5589	NC_017046	CCA	2	6	258506	258511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495043
5590	NC_017046	TGA	2	6	258512	258517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495043
5591	NC_017046	ATCC	2	8	258586	258593	25 %	25 %	0 %	50 %	383495043
5592	NC_017046	TCAT	2	8	258602	258609	25 %	50 %	0 %	25 %	383495043
5593	NC_017046	ATGGC	2	10	258688	258697	20 %	20 %	40 %	20 %	383495043
5594	NC_017046	GC	3	6	258716	258721	0 %	0 %	50 %	50 %	383495043
5595	NC_017046	GC	3	6	258746	258751	0 %	0 %	50 %	50 %	383495043
5596	NC_017046	GC	3	6	258761	258766	0 %	0 %	50 %	50 %	383495043
5597	NC_017046	GGC	2	6	258825	258830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495043
5598	NC_017046	ACG	2	6	258832	258837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495043
5599	NC_017046	GGAT	2	8	258935	258942	25 %	25 %	50 %	0 %	383495043
5600	NC_017046	CG	3	6	258990	258995	0 %	0 %	50 %	50 %	383495043
5601	NC_017046	AGA	2	6	259051	259056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017046	T	6	6	259123	259128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017046	T	6	6	259158	259163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017046	CG	3	6	259252	259257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_017046	A	6	6	259336	259341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017046	TGT	2	6	259349	259354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017046	AAT	2	6	259410	259415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017046	ATGG	2	8	259417	259424	25 %	25 %	50 %	0 %	383495044
5609	NC_017046	GTCC	2	8	259488	259495	0 %	25 %	25 %	50 %	383495044
5610	NC_017046	TGC	2	6	259512	259517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495044
5611	NC_017046	TAG	2	6	259554	259559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495044
5612	NC_017046	ACCG	2	8	259571	259578	25 %	0 %	25 %	50 %	383495044
5613	NC_017046	TG	3	6	259611	259616	0 %	50 %	50 %	0 %	383495044
5614	NC_017046	TAT	2	6	259668	259673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495044
5615	NC_017046	ATA	2	6	259742	259747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495044
5616	NC_017046	CGG	2	6	259779	259784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495044
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5618	NC_017046	TGA	2	6	259860	259865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495044
5619	NC_017046	AG	3	6	259866	259871	50 %	0 %	50 %	0 %	383495044
5620	NC_017046	ACTTT	2	10	259983	259992	20 %	60 %	0 %	20 %	383495044
5621	NC_017046	CGT	2	6	260065	260070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495044
5622	NC_017046	CGG	2	6	260073	260078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495044
5623	NC_017046	TGA	2	6	260091	260096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495044
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5625	NC_017046	GCC	2	6	260187	260192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495045
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5876	NC_017046	CCGC	2	8	272737	272744	0 %	0 %	25 %	75 %	383495054
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5988	NC_017046	GC	3	6	278952	278957	0 %	0 %	50 %	50 %	383495060
5989	NC_017046	GCA	2	6	279008	279013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495060
5990	NC_017046	CTG	2	6	279039	279044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495060
5991	NC_017046	CCGG	2	8	279066	279073	0 %	0 %	50 %	50 %	383495060
5992	NC_017046	CTT	2	6	279117	279122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495060
5993	NC_017046	GA	3	6	279134	279139	50 %	0 %	50 %	0 %	383495060
5994	NC_017046	T	6	6	279230	279235	0 %	100 %	0 %	0 %	383495060
5995	NC_017046	GC	4	8	279242	279249	0 %	0 %	50 %	50 %	383495060
5996	NC_017046	CAG	2	6	279261	279266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495060
5997	NC_017046	GCG	2	6	279285	279290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495060
5998	NC_017046	GCT	2	6	279329	279334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495060
5999	NC_017046	ACTG	2	8	279360	279367	25 %	25 %	25 %	25 %	383495060
6000	NC_017046	CGG	2	6	279373	279378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495060

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