MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 1347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383479209
2	NC_017040	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383479210
3	NC_017040	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383479211
4	NC_017040	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383479212
5	NC_017040	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383479213
6	NC_017040	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	383479218
7	NC_017040	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	383479218
8	NC_017040	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	383479221
9	NC_017040	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	383479221
10	NC_017040	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017040	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017040	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017040	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017040	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017040	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017040	TTCTT	2	10	23965	23974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017040	CTTTT	4	20	24071	24090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017040	TATAA	2	10	26507	26516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017040	AGTGA	2	10	27254	27263	40 %	20 %	40 %	0 %	383479225
20	NC_017040	ATTTT	2	10	27953	27962	20 %	80 %	0 %	0 %	383479226
21	NC_017040	TTGAT	2	10	28142	28151	20 %	60 %	20 %	0 %	383479226
22	NC_017040	TGGTG	2	10	30227	30236	0 %	40 %	60 %	0 %	383479229
23	NC_017040	AGCAG	2	10	37475	37484	40 %	0 %	40 %	20 %	383479233
24	NC_017040	GGTCA	2	10	37839	37848	20 %	20 %	40 %	20 %	383479233
25	NC_017040	TTGGG	2	10	38235	38244	0 %	40 %	60 %	0 %	383479234
26	NC_017040	GCAGG	2	10	42315	42324	20 %	0 %	60 %	20 %	383479236
27	NC_017040	CTGCC	2	10	43279	43288	0 %	20 %	20 %	60 %	383479238
28	NC_017040	CTCAG	2	10	43672	43681	20 %	20 %	20 %	40 %	383479238
29	NC_017040	GCTTT	2	10	51029	51038	0 %	60 %	20 %	20 %	383479245
30	NC_017040	TTTTC	2	10	51227	51236	0 %	80 %	0 %	20 %	383479245
31	NC_017040	AAACC	2	10	51292	51301	60 %	0 %	0 %	40 %	383479245
32	NC_017040	ATGGT	2	10	53066	53075	20 %	40 %	40 %	0 %	383479246
33	NC_017040	ATTCA	2	10	53750	53759	40 %	40 %	0 %	20 %	383479246
34	NC_017040	ATTTT	2	10	55015	55024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017040	AAATA	2	10	56282	56291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017040	TATAT	2	10	56367	56376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	TTTTA	2	10	57521	57530	20 %	80 %	0 %	0 %	383479248
38	NC_017040	AAAGC	2	10	57714	57723	60 %	0 %	20 %	20 %	383479248
39	NC_017040	TTTGG	2	10	61708	61717	0 %	60 %	40 %	0 %	383479255
40	NC_017040	TTCAC	2	10	62064	62073	20 %	40 %	0 %	40 %	383479256
41	NC_017040	GAAAT	2	10	63145	63154	60 %	20 %	20 %	0 %	383479258
42	NC_017040	AAGGA	2	10	64225	64234	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017040	TCCAA	2	10	68845	68854	40 %	20 %	0 %	40 %	383479270
44	NC_017040	GTTTC	2	10	71494	71503	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017040	TCGTG	2	10	74755	74764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017040	GTTAA	2	10	75649	75658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017040	GGGAG	2	10	76168	76177	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017040	AGGGA	2	10	78379	78388	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017040	GCTTA	2	10	78745	78754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017040	ATTAT	2	10	79035	79044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017040	TATAT	2	10	79118	79127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017040	CTTGG	2	10	83054	83063	0 %	40 %	40 %	20 %	383479282
53	NC_017040	TCTTA	2	10	83472	83481	20 %	60 %	0 %	20 %	383479282
54	NC_017040	CACTC	2	10	85017	85026	20 %	20 %	0 %	60 %	383479284
55	NC_017040	GATTG	2	10	87278	87287	20 %	40 %	40 %	0 %	383479285
56	NC_017040	TTGAT	2	10	97424	97433	20 %	60 %	20 %	0 %	383479290
57	NC_017040	AAATC	2	10	97592	97601	60 %	20 %	0 %	20 %	383479290
58	NC_017040	TGAAG	2	10	102908	102917	40 %	20 %	40 %	0 %	383479299
59	NC_017040	TAGTT	2	10	104620	104629	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017040	TTTAG	2	10	104767	104776	20 %	60 %	20 %	0 %	383479302
61	NC_017040	GTGTT	2	10	109171	109180	0 %	60 %	40 %	0 %	383479308
62	NC_017040	TTAAG	2	10	109371	109380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017040	TAGGT	2	10	109994	110003	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017040	TAAAT	2	10	110127	110136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017040	AAATC	2	10	111002	111011	60 %	20 %	0 %	20 %	383479309
66	NC_017040	GAGAG	2	10	111164	111173	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017040	GAAAA	2	10	117421	117430	80 %	0 %	20 %	0 %	383479314
68	NC_017040	GGGAA	2	10	121572	121581	40 %	0 %	60 %	0 %	383479318
69	NC_017040	GACCT	2	10	123027	123036	20 %	20 %	20 %	40 %	383479318
70	NC_017040	TCAGG	2	10	124332	124341	20 %	20 %	40 %	20 %	383479318
71	NC_017040	TTTTA	2	10	126214	126223	20 %	80 %	0 %	0 %	383479321
72	NC_017040	GCTTT	3	15	126790	126804	0 %	60 %	20 %	20 %	383479321
73	NC_017040	GTCAT	2	10	127109	127118	20 %	40 %	20 %	20 %	383479321
74	NC_017040	TAGTG	2	10	128052	128061	20 %	40 %	40 %	0 %	383479322
75	NC_017040	GTTAA	2	10	128455	128464	40 %	40 %	20 %	0 %	383479322
76	NC_017040	AATAA	2	10	128484	128493	80 %	20 %	0 %	0 %	383479322
77	NC_017040	TTGAT	2	10	129571	129580	20 %	60 %	20 %	0 %	383479323
78	NC_017040	TACCT	2	10	130974	130983	20 %	40 %	0 %	40 %	383479325
79	NC_017040	AATCA	2	10	131754	131763	60 %	20 %	0 %	20 %	383479326
80	NC_017040	TCATG	2	10	132361	132370	20 %	40 %	20 %	20 %	383479327
81	NC_017040	AACAA	2	10	133507	133516	80 %	0 %	0 %	20 %	383479328
82	NC_017040	TTGGC	2	10	133592	133601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017040	CAAAA	2	10	134725	134734	80 %	0 %	0 %	20 %	383479330
84	NC_017040	GTCTT	2	10	134936	134945	0 %	60 %	20 %	20 %	383479330
85	NC_017040	TTTTA	2	10	135798	135807	20 %	80 %	0 %	0 %	383479330
86	NC_017040	AAAGC	2	10	136987	136996	60 %	0 %	20 %	20 %	383479332
87	NC_017040	AGTTC	2	10	137237	137246	20 %	40 %	20 %	20 %	383479332
88	NC_017040	GCTGA	2	10	137257	137266	20 %	20 %	40 %	20 %	383479332
89	NC_017040	ATCGC	2	10	140632	140641	20 %	20 %	20 %	40 %	383479335
90	NC_017040	TTGGG	2	10	142035	142044	0 %	40 %	60 %	0 %	383479336
91	NC_017040	GAAAA	2	10	147345	147354	80 %	0 %	20 %	0 %	383479341
92	NC_017040	GGATT	2	10	147462	147471	20 %	40 %	40 %	0 %	383479341
93	NC_017040	TTTTG	2	10	147982	147991	0 %	80 %	20 %	0 %	383479341
94	NC_017040	TCATG	2	10	149488	149497	20 %	40 %	20 %	20 %	383479343
95	NC_017040	GTATC	2	10	150749	150758	20 %	40 %	20 %	20 %	383479344
96	NC_017040	GTCGC	2	10	151188	151197	0 %	20 %	40 %	40 %	383479345
97	NC_017040	AAGCT	2	10	153041	153050	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017040	CATAA	2	10	153096	153105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017040	CTTTT	2	10	154290	154299	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017040	CTTGT	2	10	156611	156620	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017040	GCCTA	2	10	157327	157336	20 %	20 %	20 %	40 %	383479350
102	NC_017040	GCAAC	2	10	157544	157553	40 %	0 %	20 %	40 %	383479350
103	NC_017040	AAGGT	2	10	159226	159235	40 %	20 %	40 %	0 %	383479350
104	NC_017040	CGTCA	2	10	159423	159432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017040	AACAA	2	10	161162	161171	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017040	ATTTG	2	10	165510	165519	20 %	60 %	20 %	0 %	383479358
107	NC_017040	CAAGA	2	10	167432	167441	60 %	0 %	20 %	20 %	383479359
108	NC_017040	TTTGG	2	10	168601	168610	0 %	60 %	40 %	0 %	383479360
109	NC_017040	TGGAT	2	10	169550	169559	20 %	40 %	40 %	0 %	383479361
110	NC_017040	ACCTA	2	10	170622	170631	40 %	20 %	0 %	40 %	383479361
111	NC_017040	ATTTT	2	10	175486	175495	20 %	80 %	0 %	0 %	383479365
112	NC_017040	AAAAG	2	10	175650	175659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017040	TCTAT	2	10	176474	176483	20 %	60 %	0 %	20 %	383479366
114	NC_017040	GTTTG	2	10	177014	177023	0 %	60 %	40 %	0 %	383479366
115	NC_017040	TGAAA	2	10	177189	177198	60 %	20 %	20 %	0 %	383479367
116	NC_017040	TTGAT	2	10	177437	177446	20 %	60 %	20 %	0 %	383479367
117	NC_017040	CCAAA	2	10	179785	179794	60 %	0 %	0 %	40 %	383479369
118	NC_017040	TCCCA	2	10	179987	179996	20 %	20 %	0 %	60 %	383479369
119	NC_017040	GCCAA	2	10	180834	180843	40 %	0 %	20 %	40 %	383479370
120	NC_017040	GGAAA	2	10	183784	183793	60 %	0 %	40 %	0 %	383479373
121	NC_017040	TAATC	2	10	186609	186618	40 %	40 %	0 %	20 %	383479377
122	NC_017040	TCTAA	2	10	189892	189901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017040	TTTAC	2	10	190741	190750	20 %	60 %	0 %	20 %	383479381
124	NC_017040	CAAAC	2	10	193261	193270	60 %	0 %	0 %	40 %	383479383
125	NC_017040	AGATA	2	10	193375	193384	60 %	20 %	20 %	0 %	383479383
126	NC_017040	ATATA	2	10	194164	194173	60 %	40 %	0 %	0 %	383479383
127	NC_017040	TTAAA	2	10	194675	194684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017040	TTTTG	2	10	198051	198060	0 %	80 %	20 %	0 %	383479387
129	NC_017040	ATCGC	2	10	199369	199378	20 %	20 %	20 %	40 %	383479389
130	NC_017040	TTTTA	2	10	200537	200546	20 %	80 %	0 %	0 %	383479390
131	NC_017040	CTAAT	2	10	200775	200784	40 %	40 %	0 %	20 %	383479390
132	NC_017040	GAATG	2	10	201298	201307	40 %	20 %	40 %	0 %	383479390
133	NC_017040	GACAG	2	10	203726	203735	40 %	0 %	40 %	20 %	383479392
134	NC_017040	TGTCT	2	10	203792	203801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017040	TAAGA	2	10	205310	205319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017040	CCTTC	2	10	205725	205734	0 %	40 %	0 %	60 %	383479394
137	NC_017040	TAAGA	2	10	205770	205779	60 %	20 %	20 %	0 %	383479394
138	NC_017040	TGGAT	2	10	207859	207868	20 %	40 %	40 %	0 %	383479396
139	NC_017040	CTTTT	2	10	208029	208038	0 %	80 %	0 %	20 %	383479396
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261	NC_017040	TGAAA	2	10	357728	357737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017040	AGAAA	2	10	358499	358508	80 %	0 %	20 %	0 %	383479538
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