MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 4427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017040	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017040	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	383479208
4	NC_017040	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	383479208
5	NC_017040	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	383479208
6	NC_017040	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	383479208
7	NC_017040	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	383479209
8	NC_017040	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	383479209
9	NC_017040	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	383479209
10	NC_017040	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	383479209
11	NC_017040	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	383479209
12	NC_017040	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017040	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017040	TCAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	0 %	25 %	383479211
15	NC_017040	CAAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	383479211
16	NC_017040	TTTA	2	8	5183	5190	25 %	75 %	0 %	0 %	383479212
17	NC_017040	TTGA	2	8	6390	6397	25 %	50 %	25 %	0 %	383479213
18	NC_017040	ACGA	2	8	6463	6470	50 %	0 %	25 %	25 %	383479213
19	NC_017040	CCTT	2	8	6503	6510	0 %	50 %	0 %	50 %	383479213
20	NC_017040	AGTG	2	8	6512	6519	25 %	25 %	50 %	0 %	383479213
21	NC_017040	GATT	2	8	7441	7448	25 %	50 %	25 %	0 %	383479213
22	NC_017040	TGAT	2	8	7450	7457	25 %	50 %	25 %	0 %	383479213
23	NC_017040	ACCA	2	8	7607	7614	50 %	0 %	0 %	50 %	383479213
24	NC_017040	AAAG	2	8	7739	7746	75 %	0 %	25 %	0 %	383479213
25	NC_017040	TTGA	2	8	7830	7837	25 %	50 %	25 %	0 %	383479213
26	NC_017040	TCGG	2	8	8175	8182	0 %	25 %	50 %	25 %	383479213
27	NC_017040	AGCA	2	8	8223	8230	50 %	0 %	25 %	25 %	383479213
28	NC_017040	AATC	2	8	8267	8274	50 %	25 %	0 %	25 %	383479213
29	NC_017040	TCAA	2	8	8357	8364	50 %	25 %	0 %	25 %	383479213
30	NC_017040	GAAC	2	8	8785	8792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017040	AAAT	2	8	9058	9065	75 %	25 %	0 %	0 %	383479214
32	NC_017040	AAGA	2	8	9204	9211	75 %	0 %	25 %	0 %	383479215
33	NC_017040	GGAT	2	8	9267	9274	25 %	25 %	50 %	0 %	383479215
34	NC_017040	TATT	2	8	9295	9302	25 %	75 %	0 %	0 %	383479215
35	NC_017040	TCAA	2	8	9790	9797	50 %	25 %	0 %	25 %	383479217
36	NC_017040	CAAA	2	8	10154	10161	75 %	0 %	0 %	25 %	383479217
37	NC_017040	ATTT	2	8	10870	10877	25 %	75 %	0 %	0 %	383479217
38	NC_017040	AAAT	2	8	10891	10898	75 %	25 %	0 %	0 %	383479217
39	NC_017040	CAAA	2	8	11124	11131	75 %	0 %	0 %	25 %	383479218
40	NC_017040	TTCA	2	8	11560	11567	25 %	50 %	0 %	25 %	383479218
41	NC_017040	AGTT	2	8	11867	11874	25 %	50 %	25 %	0 %	383479218
42	NC_017040	TTTA	2	8	11979	11986	25 %	75 %	0 %	0 %	383479218
43	NC_017040	TTTA	2	8	12066	12073	25 %	75 %	0 %	0 %	383479218
44	NC_017040	GAAG	2	8	12512	12519	50 %	0 %	50 %	0 %	383479219
45	NC_017040	TGTT	2	8	12670	12677	0 %	75 %	25 %	0 %	383479219
46	NC_017040	ATTA	2	8	12940	12947	50 %	50 %	0 %	0 %	383479220
47	NC_017040	GAAA	2	8	13135	13142	75 %	0 %	25 %	0 %	383479220
48	NC_017040	TCAA	2	8	13333	13340	50 %	25 %	0 %	25 %	383479220
49	NC_017040	GTTC	2	8	13607	13614	0 %	50 %	25 %	25 %	383479220
50	NC_017040	ATGG	2	8	13754	13761	25 %	25 %	50 %	0 %	383479220
51	NC_017040	GTTG	2	8	14017	14024	0 %	50 %	50 %	0 %	383479220
52	NC_017040	AAAG	2	8	14101	14108	75 %	0 %	25 %	0 %	383479220
53	NC_017040	TGAT	2	8	14529	14536	25 %	50 %	25 %	0 %	383479220
54	NC_017040	ATTG	2	8	14614	14621	25 %	50 %	25 %	0 %	383479220
55	NC_017040	ACTA	2	8	15060	15067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017040	TTTA	2	8	15677	15684	25 %	75 %	0 %	0 %	383479221
57	NC_017040	GTAT	2	8	16059	16066	25 %	50 %	25 %	0 %	383479221
58	NC_017040	ATAA	2	8	16495	16502	75 %	25 %	0 %	0 %	383479221
59	NC_017040	TACT	2	8	16578	16585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017040	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017040	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017040	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017040	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017040	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017040	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017040	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017040	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017040	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017040	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017040	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017040	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017040	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017040	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017040	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017040	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017040	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017040	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017040	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017040	GTTA	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017040	ATTC	2	8	24897	24904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017040	AATT	2	8	25016	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017040	AAGT	2	8	25374	25381	50 %	25 %	25 %	0 %	383479224
83	NC_017040	AAGC	2	8	25682	25689	50 %	0 %	25 %	25 %	383479224
84	NC_017040	ATTT	2	8	26368	26375	25 %	75 %	0 %	0 %	383479224
85	NC_017040	TTGA	2	8	27302	27309	25 %	50 %	25 %	0 %	383479225
86	NC_017040	TGAT	2	8	27315	27322	25 %	50 %	25 %	0 %	383479225
87	NC_017040	TTCT	2	8	27405	27412	0 %	75 %	0 %	25 %	383479225
88	NC_017040	ATTA	2	8	27670	27677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017040	CATT	2	8	28499	28506	25 %	50 %	0 %	25 %	383479226
90	NC_017040	GTTT	2	8	28967	28974	0 %	75 %	25 %	0 %	383479227
91	NC_017040	TAAT	2	8	29390	29397	50 %	50 %	0 %	0 %	383479227
92	NC_017040	GTAC	2	8	29575	29582	25 %	25 %	25 %	25 %	383479227
93	NC_017040	AACA	2	8	29724	29731	75 %	0 %	0 %	25 %	383479228
94	NC_017040	TTAG	2	8	29884	29891	25 %	50 %	25 %	0 %	383479228
95	NC_017040	AGAA	2	8	30017	30024	75 %	0 %	25 %	0 %	383479229
96	NC_017040	TTAT	2	8	30052	30059	25 %	75 %	0 %	0 %	383479229
97	NC_017040	GGTT	2	8	30525	30532	0 %	50 %	50 %	0 %	383479229
98	NC_017040	TTGA	2	8	30552	30559	25 %	50 %	25 %	0 %	383479229
99	NC_017040	GGAA	2	8	30752	30759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017040	AATC	2	8	31477	31484	50 %	25 %	0 %	25 %	383479230
101	NC_017040	TACT	2	8	31523	31530	25 %	50 %	0 %	25 %	383479230
102	NC_017040	TGGT	2	8	32137	32144	0 %	50 %	50 %	0 %	383479230
103	NC_017040	GCAC	2	8	32745	32752	25 %	0 %	25 %	50 %	383479230
104	NC_017040	ACAG	2	8	33719	33726	50 %	0 %	25 %	25 %	383479230
105	NC_017040	TTGG	2	8	34256	34263	0 %	50 %	50 %	0 %	383479230
106	NC_017040	AGAA	2	8	34647	34654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017040	ACTT	2	8	34831	34838	25 %	50 %	0 %	25 %	383479231
108	NC_017040	AATC	2	8	34951	34958	50 %	25 %	0 %	25 %	383479231
109	NC_017040	TGAT	2	8	35816	35823	25 %	50 %	25 %	0 %	383479231
110	NC_017040	TTGA	2	8	36049	36056	25 %	50 %	25 %	0 %	383479231
111	NC_017040	TGCT	2	8	36446	36453	0 %	50 %	25 %	25 %	383479232
112	NC_017040	TAGT	2	8	37287	37294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017040	AGTT	2	8	37490	37497	25 %	50 %	25 %	0 %	383479233
114	NC_017040	GATT	2	8	37640	37647	25 %	50 %	25 %	0 %	383479233
115	NC_017040	GTCT	2	8	37650	37657	0 %	50 %	25 %	25 %	383479233
116	NC_017040	CCTG	2	8	37736	37743	0 %	25 %	25 %	50 %	383479233
117	NC_017040	AAAG	2	8	38041	38048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017040	GCTA	2	8	39176	39183	25 %	25 %	25 %	25 %	383479234
119	NC_017040	CCAA	2	8	39350	39357	50 %	0 %	0 %	50 %	383479234
120	NC_017040	AACC	2	8	39470	39477	50 %	0 %	0 %	50 %	383479234
121	NC_017040	AAAC	2	8	39656	39663	75 %	0 %	0 %	25 %	383479234
122	NC_017040	ACTT	2	8	40395	40402	25 %	50 %	0 %	25 %	383479235
123	NC_017040	ATTA	2	8	40891	40898	50 %	50 %	0 %	0 %	383479235
124	NC_017040	TAAT	2	8	41071	41078	50 %	50 %	0 %	0 %	383479236
125	NC_017040	AGAA	2	8	42466	42473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017040	CAAT	2	8	44317	44324	50 %	25 %	0 %	25 %	383479239
127	NC_017040	ATTA	2	8	44708	44715	50 %	50 %	0 %	0 %	383479239
128	NC_017040	AAGC	2	8	44728	44735	50 %	0 %	25 %	25 %	383479239
129	NC_017040	AGCA	2	8	44983	44990	50 %	0 %	25 %	25 %	383479239
130	NC_017040	ATAA	2	8	45057	45064	75 %	25 %	0 %	0 %	383479239
131	NC_017040	CAAA	2	8	45092	45099	75 %	0 %	0 %	25 %	383479239
132	NC_017040	ATTG	2	8	45162	45169	25 %	50 %	25 %	0 %	383479239
133	NC_017040	AAAT	2	8	45729	45736	75 %	25 %	0 %	0 %	383479240
134	NC_017040	TTGG	2	8	45744	45751	0 %	50 %	50 %	0 %	383479240
135	NC_017040	CAAG	2	8	45996	46003	50 %	0 %	25 %	25 %	383479240
136	NC_017040	TTGA	2	8	46633	46640	25 %	50 %	25 %	0 %	383479240
137	NC_017040	ATTG	2	8	46758	46765	25 %	50 %	25 %	0 %	383479240
138	NC_017040	TAAG	2	8	47241	47248	50 %	25 %	25 %	0 %	383479241
139	NC_017040	TGAG	2	8	47496	47503	25 %	25 %	50 %	0 %	383479241
140	NC_017040	ACTT	2	8	47523	47530	25 %	50 %	0 %	25 %	383479241
141	NC_017040	ATGG	2	8	47627	47634	25 %	25 %	50 %	0 %	383479241
142	NC_017040	CAAA	2	8	47884	47891	75 %	0 %	0 %	25 %	383479241
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144	NC_017040	ATTG	2	8	48697	48704	25 %	50 %	25 %	0 %	383479242
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