MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 37427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_017040	AG	3	6	1119874	1119879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24002	NC_017040	CT	4	8	1119894	1119901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24003	NC_017040	T	6	6	1119913	1119918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24004	NC_017040	TAAAC	2	10	1119921	1119930	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24005	NC_017040	AAT	2	6	1119942	1119947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_017040	GAA	2	6	1119968	1119973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24007	NC_017040	AAAGG	2	10	1119974	1119983	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24008	NC_017040	TAAA	2	8	1119984	1119991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24009	NC_017040	ATG	2	6	1119992	1119997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480266
24010	NC_017040	AACA	2	8	1120077	1120084	75 %	0 %	0 %	25 %	383480266
24011	NC_017040	ATT	2	6	1120088	1120093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480266
24012	NC_017040	TGG	2	6	1120129	1120134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480266
24013	NC_017040	GAA	2	6	1120187	1120192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480266
24014	NC_017040	CTA	2	6	1120206	1120211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480266
24015	NC_017040	TGA	2	6	1120234	1120239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480266
24016	NC_017040	AGA	2	6	1120330	1120335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480266
24017	NC_017040	TAA	2	6	1120339	1120344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480266
24018	NC_017040	GGTT	2	8	1120349	1120356	0 %	50 %	50 %	0 %	383480266
24019	NC_017040	GA	3	6	1120389	1120394	50 %	0 %	50 %	0 %	383480266
24020	NC_017040	A	7	7	1120422	1120428	100 %	0 %	0 %	0 %	383480266
24021	NC_017040	CAT	2	6	1120430	1120435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480266
24022	NC_017040	CTA	2	6	1120437	1120442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480266
24023	NC_017040	AGG	2	6	1120486	1120491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_017040	TCA	2	6	1120505	1120510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480267
24025	NC_017040	TCA	2	6	1120535	1120540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480267
24026	NC_017040	A	6	6	1120551	1120556	100 %	0 %	0 %	0 %	383480267
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24029	NC_017040	AAAT	2	8	1120647	1120654	75 %	25 %	0 %	0 %	383480267
24030	NC_017040	AGG	2	6	1120667	1120672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480267
24031	NC_017040	T	8	8	1120696	1120703	0 %	100 %	0 %	0 %	383480267
24032	NC_017040	ATTTC	2	10	1120777	1120786	20 %	60 %	0 %	20 %	383480267
24033	NC_017040	CAG	2	6	1120802	1120807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24034	NC_017040	T	7	7	1120850	1120856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24035	NC_017040	A	6	6	1120924	1120929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24036	NC_017040	TC	3	6	1120954	1120959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24037	NC_017040	CTA	2	6	1120990	1120995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24038	NC_017040	A	6	6	1120995	1121000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24039	NC_017040	TCT	2	6	1121028	1121033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24040	NC_017040	CT	3	6	1121075	1121080	0 %	50 %	0 %	50 %	383480268
24041	NC_017040	TTC	2	6	1121113	1121118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480268
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24044	NC_017040	AGCAA	2	10	1121309	1121318	60 %	0 %	20 %	20 %	383480268
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24053	NC_017040	CAT	2	6	1122042	1122047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480268
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24056	NC_017040	AAG	2	6	1122264	1122269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480268
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24069	NC_017040	TGAT	2	8	1122692	1122699	25 %	50 %	25 %	0 %	383480268
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24091	NC_017040	GCT	2	6	1123778	1123783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480268
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24099	NC_017040	ATGATA	2	12	1124052	1124063	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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24102	NC_017040	TTTA	2	8	1124134	1124141	25 %	75 %	0 %	0 %	383480269
24103	NC_017040	ATTTA	2	10	1124145	1124154	40 %	60 %	0 %	0 %	383480269
24104	NC_017040	TCA	2	6	1124245	1124250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480269
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24107	NC_017040	ATC	2	6	1124316	1124321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480269
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24109	NC_017040	TGG	2	6	1124476	1124481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480269
24110	NC_017040	AC	3	6	1124483	1124488	50 %	0 %	0 %	50 %	383480269
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24112	NC_017040	TCA	2	6	1124536	1124541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480269
24113	NC_017040	GCTTTA	2	12	1124566	1124577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383480269
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24117	NC_017040	TTTCA	2	10	1124706	1124715	20 %	60 %	0 %	20 %	383480269
24118	NC_017040	TTC	2	6	1124733	1124738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480269
24119	NC_017040	ATC	2	6	1124793	1124798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480269
24120	NC_017040	AAC	2	6	1124799	1124804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480269
24121	NC_017040	CTT	3	9	1124825	1124833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480269
24122	NC_017040	TTAT	2	8	1124907	1124914	25 %	75 %	0 %	0 %	383480270
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24126	NC_017040	TAG	2	6	1125119	1125124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480270
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24148	NC_017040	ATCA	2	8	1126161	1126168	50 %	25 %	0 %	25 %	383480272
24149	NC_017040	CATT	2	8	1126174	1126181	25 %	50 %	0 %	25 %	383480272
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24152	NC_017040	TCT	2	6	1126320	1126325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480272
24153	NC_017040	CTT	2	6	1126343	1126348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480272
24154	NC_017040	CTG	2	6	1126359	1126364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480272
24155	NC_017040	ATA	2	6	1126365	1126370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480272
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24157	NC_017040	TTG	2	6	1126440	1126445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480272
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24161	NC_017040	TGC	2	6	1126530	1126535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480272
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24167	NC_017040	T	8	8	1126735	1126742	0 %	100 %	0 %	0 %	383480273
24168	NC_017040	T	6	6	1126752	1126757	0 %	100 %	0 %	0 %	383480273
24169	NC_017040	CTTT	2	8	1126794	1126801	0 %	75 %	0 %	25 %	383480273
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24175	NC_017040	CT	3	6	1126963	1126968	0 %	50 %	0 %	50 %	383480273
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24182	NC_017040	TTGATT	2	12	1127452	1127463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383480274
24183	NC_017040	TCAAAA	2	12	1127516	1127527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383480274
24184	NC_017040	CGA	2	6	1127534	1127539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480274
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24207	NC_017040	TCC	2	6	1128397	1128402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383480274
24208	NC_017040	TGA	2	6	1128457	1128462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480274
24209	NC_017040	TGC	2	6	1128487	1128492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480274
24210	NC_017040	TCA	2	6	1128518	1128523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480274
24211	NC_017040	CCG	2	6	1128554	1128559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480274
24212	NC_017040	TTA	2	6	1128633	1128638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24213	NC_017040	T	6	6	1128686	1128691	0 %	100 %	0 %	0 %	383480275
24214	NC_017040	TTG	2	6	1128738	1128743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480275
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24217	NC_017040	TTC	2	6	1128840	1128845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480275
24218	NC_017040	CAT	2	6	1128885	1128890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480275
24219	NC_017040	CCA	2	6	1129027	1129032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480275
24220	NC_017040	CCT	2	6	1129045	1129050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383480275
24221	NC_017040	AAT	2	6	1129122	1129127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480275
24222	NC_017040	ATAA	2	8	1129133	1129140	75 %	25 %	0 %	0 %	383480275
24223	NC_017040	CTAC	2	8	1129168	1129175	25 %	25 %	0 %	50 %	383480275
24224	NC_017040	AT	3	6	1129283	1129288	50 %	50 %	0 %	0 %	383480275
24225	NC_017040	CGC	2	6	1129304	1129309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480275
24226	NC_017040	AT	4	8	1129317	1129324	50 %	50 %	0 %	0 %	383480275
24227	NC_017040	TGTC	2	8	1129365	1129372	0 %	50 %	25 %	25 %	383480275
24228	NC_017040	ATG	2	6	1129456	1129461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480275
24229	NC_017040	TCTAA	2	10	1129549	1129558	40 %	40 %	0 %	20 %	383480275
24230	NC_017040	CAT	2	6	1129563	1129568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480275
24231	NC_017040	AAC	2	6	1129674	1129679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480275
24232	NC_017040	GAA	2	6	1129754	1129759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480275
24233	NC_017040	TCT	2	6	1129810	1129815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480275
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24235	NC_017040	AAAT	2	8	1129931	1129938	75 %	25 %	0 %	0 %	383480275
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24355	NC_017040	TCA	2	6	1135452	1135457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480280
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24459	NC_017040	T	6	6	1139773	1139778	0 %	100 %	0 %	0 %	383480286
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24473	NC_017040	GTC	2	6	1140503	1140508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480286
24474	NC_017040	AAAT	2	8	1140577	1140584	75 %	25 %	0 %	0 %	383480286
24475	NC_017040	T	7	7	1140711	1140717	0 %	100 %	0 %	0 %	383480286
24476	NC_017040	ATT	2	6	1140825	1140830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480287
24477	NC_017040	TCTT	2	8	1140833	1140840	0 %	75 %	0 %	25 %	383480287
24478	NC_017040	TGA	2	6	1140843	1140848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480287
24479	NC_017040	CTTTT	2	10	1140961	1140970	0 %	80 %	0 %	20 %	383480287
24480	NC_017040	GCT	2	6	1141005	1141010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480287
24481	NC_017040	CGA	2	6	1141031	1141036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480287
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24483	NC_017040	TTTC	2	8	1141057	1141064	0 %	75 %	0 %	25 %	383480287
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24485	NC_017040	CTC	2	6	1141078	1141083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383480287
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24489	NC_017040	TAT	2	6	1141407	1141412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480287
24490	NC_017040	T	6	6	1141438	1141443	0 %	100 %	0 %	0 %	383480287
24491	NC_017040	T	6	6	1141520	1141525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24492	NC_017040	T	6	6	1141579	1141584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24493	NC_017040	T	6	6	1141619	1141624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24494	NC_017040	GTAA	2	8	1141632	1141639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24495	NC_017040	GA	3	6	1141642	1141647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24496	NC_017040	TCA	2	6	1141712	1141717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24497	NC_017040	CTTAAG	2	12	1141751	1141762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24498	NC_017040	CAA	2	6	1141847	1141852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24499	NC_017040	TCA	2	6	1141857	1141862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24500	NC_017040	ATT	2	6	1141886	1141891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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