MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 37427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017040	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017040	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017040	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017040	C	6	6	21806	21811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_017040	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017040	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017040	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
508	NC_017040	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017040	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
510	NC_017040	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017040	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017040	T	6	6	22338	22343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017040	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017040	GAG	2	6	22682	22687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017040	T	6	6	22776	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017040	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017040	CGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_017040	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017040	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017040	GGA	2	6	23137	23142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017040	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017040	TCC	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_017040	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017040	GTT	2	6	23324	23329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017040	CGG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017040	TGT	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017040	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017040	GGT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017040	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017040	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017040	AGA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017040	T	7	7	23778	23784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017040	ATT	2	6	23826	23831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017040	ACT	2	6	23859	23864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017040	GTT	2	6	23904	23909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017040	AGT	2	6	23933	23938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017040	TTCTT	2	10	23965	23974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
538	NC_017040	AAT	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017040	CTTTT	4	20	24071	24090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
540	NC_017040	GTTA	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017040	TAT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017040	TGA	2	6	24140	24145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017040	TAG	2	6	24328	24333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017040	TAA	2	6	24356	24361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017040	GAT	2	6	24401	24406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017040	ATT	2	6	24497	24502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017040	CTA	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017040	A	7	7	24728	24734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017040	TAA	2	6	24757	24762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017040	A	6	6	24773	24778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017040	ATA	2	6	24821	24826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017040	ATA	2	6	24846	24851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017040	TTA	2	6	24869	24874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017040	ATTC	2	8	24897	24904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_017040	AAG	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017040	TTA	2	6	24959	24964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017040	ATA	2	6	24969	24974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017040	AATT	2	8	25016	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017040	AT	3	6	25050	25055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017040	GCT	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017040	TTA	2	6	25107	25112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017040	T	10	10	25147	25156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017040	AGT	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017040	T	7	7	25192	25198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017040	A	7	7	25205	25211	100 %	0 %	0 %	0 %	383479224
566	NC_017040	CAG	2	6	25221	25226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479224
567	NC_017040	GTG	2	6	25236	25241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479224
568	NC_017040	AGC	2	6	25252	25257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479224
569	NC_017040	GGA	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383479224
570	NC_017040	TAT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479224
571	NC_017040	AAGT	2	8	25374	25381	50 %	25 %	25 %	0 %	383479224
572	NC_017040	TTG	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479224
573	NC_017040	A	6	6	25504	25509	100 %	0 %	0 %	0 %	383479224
574	NC_017040	TGT	2	6	25588	25593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479224
575	NC_017040	TAG	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479224
576	NC_017040	AAC	2	6	25647	25652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479224
577	NC_017040	GAA	2	6	25676	25681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479224
578	NC_017040	AAGC	2	8	25682	25689	50 %	0 %	25 %	25 %	383479224
579	NC_017040	GAA	2	6	25739	25744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479224
580	NC_017040	CAA	2	6	25766	25771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479224
581	NC_017040	CTGCAA	2	12	25785	25796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383479224
582	NC_017040	AAG	2	6	25854	25859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479224
583	NC_017040	GCT	3	9	25871	25879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479224
584	NC_017040	GCT	2	6	25901	25906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479224
585	NC_017040	CAA	2	6	25934	25939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479224
586	NC_017040	GCA	2	6	25940	25945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479224
587	NC_017040	AGC	2	6	25954	25959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479224
588	NC_017040	CAC	2	6	25980	25985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383479224
589	NC_017040	AGT	2	6	26006	26011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479224
590	NC_017040	CAT	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479224
591	NC_017040	TTC	2	6	26068	26073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479224
592	NC_017040	AAT	2	6	26135	26140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479224
593	NC_017040	TGG	2	6	26149	26154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479224
594	NC_017040	AGC	2	6	26176	26181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479224
595	NC_017040	TGG	2	6	26236	26241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479224
596	NC_017040	ACC	2	6	26334	26339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383479224
597	NC_017040	ATTT	2	8	26368	26375	25 %	75 %	0 %	0 %	383479224
598	NC_017040	ATT	2	6	26390	26395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017040	GTT	2	6	26408	26413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017040	AG	3	6	26480	26485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017040	TATAA	2	10	26507	26516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017040	GGA	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017040	A	6	6	26634	26639	100 %	0 %	0 %	0 %	383479225
604	NC_017040	GAA	2	6	26777	26782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479225
605	NC_017040	TCA	2	6	26794	26799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479225
606	NC_017040	A	6	6	26892	26897	100 %	0 %	0 %	0 %	383479225
607	NC_017040	TAC	2	6	26915	26920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479225
608	NC_017040	TTA	2	6	27014	27019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479225
609	NC_017040	TGC	2	6	27034	27039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479225
610	NC_017040	TGT	2	6	27136	27141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479225
611	NC_017040	GTT	2	6	27143	27148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479225
612	NC_017040	TGG	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479225
613	NC_017040	TCC	2	6	27195	27200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383479225
614	NC_017040	CGT	2	6	27227	27232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479225
615	NC_017040	AGTGA	2	10	27254	27263	40 %	20 %	40 %	0 %	383479225
616	NC_017040	TTGA	2	8	27302	27309	25 %	50 %	25 %	0 %	383479225
617	NC_017040	TGAT	2	8	27315	27322	25 %	50 %	25 %	0 %	383479225
618	NC_017040	GCA	2	6	27344	27349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479225
619	NC_017040	TTCT	2	8	27405	27412	0 %	75 %	0 %	25 %	383479225
620	NC_017040	ATA	2	6	27426	27431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479225
621	NC_017040	ATT	2	6	27545	27550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479225
622	NC_017040	ATA	2	6	27619	27624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017040	ATTA	2	8	27670	27677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017040	TAA	2	6	27717	27722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017040	AAC	2	6	27730	27735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017040	ACG	2	6	27774	27779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017040	GAT	2	6	27841	27846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479226
628	NC_017040	ATTTT	2	10	27953	27962	20 %	80 %	0 %	0 %	383479226
629	NC_017040	TGT	2	6	27990	27995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479226
630	NC_017040	TAA	2	6	28029	28034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479226
631	NC_017040	TGC	2	6	28083	28088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479226
632	NC_017040	A	7	7	28132	28138	100 %	0 %	0 %	0 %	383479226
633	NC_017040	TTGAT	2	10	28142	28151	20 %	60 %	20 %	0 %	383479226
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635	NC_017040	TTG	2	6	28363	28368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479226
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