MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 66792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017038	TAA	2	6	26513	26518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320930
502	NC_017038	ATTA	2	8	26547	26554	50 %	50 %	0 %	0 %	383320930
503	NC_017038	CAG	2	6	26609	26614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320930
504	NC_017038	AT	3	6	26629	26634	50 %	50 %	0 %	0 %	383320930
505	NC_017038	GTC	2	6	26658	26663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320930
506	NC_017038	ACC	2	6	26790	26795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320930
507	NC_017038	T	6	6	26874	26879	0 %	100 %	0 %	0 %	383320930
508	NC_017038	ATTA	2	8	26889	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	383320930
509	NC_017038	AGA	2	6	26928	26933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320930
510	NC_017038	TGT	2	6	26956	26961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320930
511	NC_017038	ATTG	2	8	27041	27048	25 %	50 %	25 %	0 %	383320930
512	NC_017038	GTA	2	6	27088	27093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320930
513	NC_017038	TTG	2	6	27147	27152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320930
514	NC_017038	CTT	2	6	27164	27169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320930
515	NC_017038	AAC	2	6	27174	27179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320930
516	NC_017038	CTG	2	6	27260	27265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320930
517	NC_017038	CTT	3	9	27266	27274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320930
518	NC_017038	CAA	2	6	27284	27289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320930
519	NC_017038	TCT	2	6	27298	27303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320930
520	NC_017038	GAT	2	6	27355	27360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320930
521	NC_017038	GCG	2	6	27373	27378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320930
522	NC_017038	CGG	2	6	27434	27439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320930
523	NC_017038	GAT	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320930
524	NC_017038	TAA	2	6	27545	27550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320930
525	NC_017038	AATT	2	8	27588	27595	50 %	50 %	0 %	0 %	383320930
526	NC_017038	CTT	2	6	27635	27640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320930
527	NC_017038	ATTC	2	8	27698	27705	25 %	50 %	0 %	25 %	383320930
528	NC_017038	TCT	2	6	27718	27723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320930
529	NC_017038	TTTTTC	2	12	27726	27737	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383320930
530	NC_017038	GCGA	2	8	27808	27815	25 %	0 %	50 %	25 %	383320930
531	NC_017038	T	6	6	27839	27844	0 %	100 %	0 %	0 %	383320930
532	NC_017038	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017038	AT	3	6	27875	27880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017038	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_017038	T	6	6	27921	27926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017038	TCT	2	6	27960	27965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017038	TAC	2	6	27985	27990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320931
538	NC_017038	TTA	2	6	28114	28119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320931
539	NC_017038	TAA	2	6	28125	28130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320931
540	NC_017038	AAGG	2	8	28252	28259	50 %	0 %	50 %	0 %	383320931
541	NC_017038	T	7	7	28320	28326	0 %	100 %	0 %	0 %	383320931
542	NC_017038	T	8	8	28338	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	383320931
543	NC_017038	TAG	2	6	28352	28357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320931
544	NC_017038	AAT	2	6	28384	28389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320931
545	NC_017038	TAAA	2	8	28407	28414	75 %	25 %	0 %	0 %	383320931
546	NC_017038	GT	3	6	28478	28483	0 %	50 %	50 %	0 %	383320931
547	NC_017038	TTAA	2	8	28537	28544	50 %	50 %	0 %	0 %	383320931
548	NC_017038	AAC	2	6	28574	28579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320931
549	NC_017038	AAT	2	6	28583	28588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320931
550	NC_017038	ACTA	2	8	28605	28612	50 %	25 %	0 %	25 %	383320931
551	NC_017038	CTA	2	6	28733	28738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320931
552	NC_017038	TTC	2	6	28780	28785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320931
553	NC_017038	AAT	2	6	28830	28835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320931
554	NC_017038	TAT	2	6	28905	28910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320931
555	NC_017038	TCA	2	6	28942	28947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320931
556	NC_017038	CAA	2	6	28952	28957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320931
557	NC_017038	AGT	2	6	28968	28973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320931
558	NC_017038	GTG	2	6	28996	29001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320931
559	NC_017038	ATC	2	6	29094	29099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320932
560	NC_017038	AGT	2	6	29267	29272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320932
561	NC_017038	AAT	2	6	29313	29318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320932
562	NC_017038	TTTA	2	8	29332	29339	25 %	75 %	0 %	0 %	383320932
563	NC_017038	GTTA	2	8	29365	29372	25 %	50 %	25 %	0 %	383320932
564	NC_017038	TTG	2	6	29383	29388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320932
565	NC_017038	TAAA	2	8	29479	29486	75 %	25 %	0 %	0 %	383320932
566	NC_017038	GCT	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320932
567	NC_017038	GGA	2	6	29636	29641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383320932
568	NC_017038	AGT	2	6	29767	29772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320932
569	NC_017038	TTG	2	6	29778	29783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320932
570	NC_017038	CTT	2	6	29814	29819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320932
571	NC_017038	GTA	2	6	29875	29880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320932
572	NC_017038	T	8	8	29885	29892	0 %	100 %	0 %	0 %	383320932
573	NC_017038	CTG	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017038	TCA	3	9	29944	29952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017038	CTA	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320933
576	NC_017038	CGA	2	6	30104	30109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320933
577	NC_017038	A	6	6	30111	30116	100 %	0 %	0 %	0 %	383320933
578	NC_017038	GCA	2	6	30119	30124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320933
579	NC_017038	TAT	2	6	30306	30311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320933
580	NC_017038	ATA	2	6	30432	30437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320933
581	NC_017038	GAGG	2	8	30583	30590	25 %	0 %	75 %	0 %	383320933
582	NC_017038	AAG	2	6	30597	30602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320933
583	NC_017038	GGT	2	6	30613	30618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320933
584	NC_017038	GATA	2	8	30654	30661	50 %	25 %	25 %	0 %	383320933
585	NC_017038	TTC	2	6	30703	30708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320933
586	NC_017038	CCA	2	6	30768	30773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320933
587	NC_017038	AAAT	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	383320933
588	NC_017038	ATC	2	6	30838	30843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320933
589	NC_017038	TCCAA	2	10	30962	30971	40 %	20 %	0 %	40 %	383320933
590	NC_017038	A	6	6	31031	31036	100 %	0 %	0 %	0 %	383320933
591	NC_017038	TCC	2	6	31048	31053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320933
592	NC_017038	ATA	2	6	31057	31062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320933
593	NC_017038	A	6	6	31096	31101	100 %	0 %	0 %	0 %	383320933
594	NC_017038	GCATG	2	10	31146	31155	20 %	20 %	40 %	20 %	383320933
595	NC_017038	TCGAT	2	10	31249	31258	20 %	40 %	20 %	20 %	383320933
596	NC_017038	AGG	2	6	31475	31480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383320933
597	NC_017038	T	6	6	31564	31569	0 %	100 %	0 %	0 %	383320933
598	NC_017038	TTGA	2	8	31580	31587	25 %	50 %	25 %	0 %	383320933
599	NC_017038	CGG	2	6	31773	31778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320933
600	NC_017038	TAGC	2	8	31928	31935	25 %	25 %	25 %	25 %	383320933
601	NC_017038	CTT	2	6	31947	31952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320933
602	NC_017038	GGA	2	6	32005	32010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383320933
603	NC_017038	TAAGC	2	10	32017	32026	40 %	20 %	20 %	20 %	383320933
604	NC_017038	ATT	2	6	32068	32073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320933
605	NC_017038	TGT	2	6	32103	32108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320933
606	NC_017038	CGC	2	6	32131	32136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320933
607	NC_017038	TCC	2	6	32170	32175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320933
608	NC_017038	AAT	2	6	32206	32211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320933
609	NC_017038	TTG	2	6	32261	32266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320933
610	NC_017038	TTTGG	2	10	32347	32356	0 %	60 %	40 %	0 %	383320933
611	NC_017038	ATT	2	6	32365	32370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320933
612	NC_017038	CTA	2	6	32397	32402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320933
613	NC_017038	CTC	2	6	32460	32465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017038	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017038	T	7	7	32519	32525	0 %	100 %	0 %	0 %	383320934
616	NC_017038	GGC	2	6	32539	32544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320934
617	NC_017038	CCAT	2	8	32579	32586	25 %	25 %	0 %	50 %	383320934
618	NC_017038	ACC	2	6	32633	32638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320934
619	NC_017038	TTAGCC	2	12	32657	32668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383320934
620	NC_017038	TTTG	2	8	32675	32682	0 %	75 %	25 %	0 %	383320934
621	NC_017038	AAAT	2	8	32745	32752	75 %	25 %	0 %	0 %	383320934
622	NC_017038	GCTT	2	8	32763	32770	0 %	50 %	25 %	25 %	383320934
623	NC_017038	GAT	2	6	32836	32841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320934
624	NC_017038	A	6	6	32859	32864	100 %	0 %	0 %	0 %	383320934
625	NC_017038	ATC	2	6	32873	32878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320934
626	NC_017038	TCC	2	6	32937	32942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320934
627	NC_017038	GGAAC	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	383320935
628	NC_017038	TGGCAA	2	12	33052	33063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383320935
629	NC_017038	C	6	6	33104	33109	0 %	0 %	0 %	100 %	383320935
630	NC_017038	GGC	2	6	33128	33133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320935
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