MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 66792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017038	TCA	2	6	267285	267290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321153
5002	NC_017038	CCG	2	6	267355	267360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321153
5003	NC_017038	TTC	2	6	267398	267403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321153
5004	NC_017038	ACT	2	6	267428	267433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321153
5005	NC_017038	CCG	2	6	267445	267450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321153
5006	NC_017038	GTT	2	6	267484	267489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321153
5007	NC_017038	TCA	2	6	267510	267515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321153
5008	NC_017038	CAC	2	6	267568	267573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321153
5009	NC_017038	G	7	7	267603	267609	0 %	0 %	100 %	0 %	383321153
5010	NC_017038	GGT	2	6	267650	267655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321153
5011	NC_017038	G	6	6	267662	267667	0 %	0 %	100 %	0 %	383321153
5012	NC_017038	TCC	2	6	267693	267698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383321153
5013	NC_017038	CTG	2	6	267751	267756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383321153
5014	NC_017038	GAG	2	6	267760	267765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383321153
5015	NC_017038	TTC	2	6	267818	267823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321153
5016	NC_017038	GCC	2	6	267861	267866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321153
5017	NC_017038	TTC	2	6	267875	267880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321153
5018	NC_017038	GGA	2	6	267912	267917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383321153
5019	NC_017038	TCC	2	6	267939	267944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383321153
5020	NC_017038	TTC	2	6	267956	267961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321153
5021	NC_017038	CAA	2	6	268064	268069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383321153
5022	NC_017038	GGC	2	6	268082	268087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321153
5023	NC_017038	TCA	2	6	268092	268097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321153
5024	NC_017038	GTT	2	6	268114	268119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321153
5025	NC_017038	T	6	6	268171	268176	0 %	100 %	0 %	0 %	383321153
5026	NC_017038	GCC	2	6	268197	268202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321153
5027	NC_017038	AGTTA	2	10	268491	268500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017038	CAG	2	6	268528	268533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017038	GTT	2	6	268540	268545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017038	TGAGC	2	10	268581	268590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_017038	GT	3	6	268615	268620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017038	CCG	2	6	268706	268711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_017038	GGC	2	6	268816	268821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321154
5034	NC_017038	GGA	2	6	268908	268913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383321154
5035	NC_017038	T	6	6	268926	268931	0 %	100 %	0 %	0 %	383321154
5036	NC_017038	ATC	2	6	268994	268999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321154
5037	NC_017038	TAAAA	2	10	269030	269039	80 %	20 %	0 %	0 %	383321154
5038	NC_017038	TTG	2	6	269086	269091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321154
5039	NC_017038	GGA	2	6	269102	269107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383321154
5040	NC_017038	GGC	2	6	269278	269283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321154
5041	NC_017038	AAT	2	6	269286	269291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383321154
5042	NC_017038	ATTGT	2	10	269374	269383	20 %	60 %	20 %	0 %	383321154
5043	NC_017038	CAC	2	6	269434	269439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321154
5044	NC_017038	ATG	2	6	269459	269464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383321154
5045	NC_017038	CGG	2	6	269472	269477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321154
5046	NC_017038	GGC	2	6	269500	269505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321154
5047	NC_017038	TGG	2	6	269516	269521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321154
5048	NC_017038	CCA	3	9	269604	269612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321154
5049	NC_017038	TGT	2	6	269651	269656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321154
5050	NC_017038	ACA	2	6	269711	269716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383321154
5051	NC_017038	ATAA	2	8	269726	269733	75 %	25 %	0 %	0 %	383321154
5052	NC_017038	AAT	2	6	269783	269788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383321155
5053	NC_017038	AGG	2	6	269925	269930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383321155
5054	NC_017038	GCC	2	6	269981	269986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321155
5055	NC_017038	CAG	2	6	270025	270030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321155
5056	NC_017038	TTC	2	6	270103	270108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321155
5057	NC_017038	GGC	2	6	270133	270138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321155
5058	NC_017038	C	6	6	270151	270156	0 %	0 %	0 %	100 %	383321155
5059	NC_017038	CGG	2	6	270165	270170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321155
5060	NC_017038	CAG	2	6	270319	270324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321155
5061	NC_017038	CGGC	2	8	270336	270343	0 %	0 %	50 %	50 %	383321155
5062	NC_017038	TGG	2	6	270497	270502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321156
5063	NC_017038	TGGC	2	8	270621	270628	0 %	25 %	50 %	25 %	383321156
5064	NC_017038	A	8	8	270641	270648	100 %	0 %	0 %	0 %	383321156
5065	NC_017038	TGG	2	6	270670	270675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321156
5066	NC_017038	CTA	2	6	270733	270738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321156
5067	NC_017038	GGT	2	6	270776	270781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321156
5068	NC_017038	GTA	2	6	270862	270867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383321156
5069	NC_017038	GGC	2	6	270887	270892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321156
5070	NC_017038	CGC	3	9	270908	270916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321156
5071	NC_017038	TCA	2	6	270924	270929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321156
5072	NC_017038	AAT	2	6	270932	270937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383321156
5073	NC_017038	GTG	2	6	270951	270956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321156
5074	NC_017038	GCA	2	6	271096	271101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321156
5075	NC_017038	TGT	2	6	271110	271115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321156
5076	NC_017038	CCG	2	6	271129	271134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321156
5077	NC_017038	CCT	2	6	271164	271169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383321156
5078	NC_017038	CCA	2	6	271204	271209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321156
5079	NC_017038	GCC	3	9	271218	271226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321156
5080	NC_017038	A	6	6	271256	271261	100 %	0 %	0 %	0 %	383321156
5081	NC_017038	GGC	2	6	271362	271367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321156
5082	NC_017038	T	6	6	271506	271511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017038	TACT	2	8	271589	271596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_017038	CGA	2	6	271627	271632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321157
5085	NC_017038	AC	3	6	271637	271642	50 %	0 %	0 %	50 %	383321157
5086	NC_017038	GCAGTG	2	12	271745	271756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383321157
5087	NC_017038	ATA	2	6	271784	271789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383321157
5088	NC_017038	TCT	2	6	271800	271805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321157
5089	NC_017038	TGT	2	6	271821	271826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383321157
5090	NC_017038	AGTT	2	8	271847	271854	25 %	50 %	25 %	0 %	383321157
5091	NC_017038	GAA	2	6	271871	271876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383321157
5092	NC_017038	GT	3	6	271913	271918	0 %	50 %	50 %	0 %	383321157
5093	NC_017038	T	6	6	271918	271923	0 %	100 %	0 %	0 %	383321157
5094	NC_017038	ATT	2	6	271951	271956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383321157
5095	NC_017038	TTTGCC	2	12	272044	272055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383321157
5096	NC_017038	A	6	6	272091	272096	100 %	0 %	0 %	0 %	383321157
5097	NC_017038	CCA	2	6	272198	272203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321157
5098	NC_017038	ACTTT	2	10	272266	272275	20 %	60 %	0 %	20 %	383321157
5099	NC_017038	ATT	2	6	272284	272289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383321157
5100	NC_017038	TGG	2	6	272323	272328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321157
5101	NC_017038	ATT	2	6	272347	272352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383321157
5102	NC_017038	TTAA	2	8	272368	272375	50 %	50 %	0 %	0 %	383321157
5103	NC_017038	TCG	2	6	272394	272399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383321157
5104	NC_017038	TCA	2	6	272400	272405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321157
5105	NC_017038	T	6	6	272406	272411	0 %	100 %	0 %	0 %	383321157
5106	NC_017038	T	6	6	272445	272450	0 %	100 %	0 %	0 %	383321157
5107	NC_017038	GGTTT	2	10	272451	272460	0 %	60 %	40 %	0 %	383321157
5108	NC_017038	TTCC	2	8	272475	272482	0 %	50 %	0 %	50 %	383321157
5109	NC_017038	CTT	2	6	272538	272543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383321157
5110	NC_017038	CTTT	2	8	272561	272568	0 %	75 %	0 %	25 %	383321157
5111	NC_017038	T	7	7	272571	272577	0 %	100 %	0 %	0 %	383321157
5112	NC_017038	CCAAGG	2	12	272595	272606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321157
5113	NC_017038	CGG	2	6	272660	272665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321157
5114	NC_017038	TAT	2	6	272697	272702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383321157
5115	NC_017038	AAGAA	2	10	272705	272714	80 %	0 %	20 %	0 %	383321157
5116	NC_017038	CAA	2	6	272722	272727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383321157
5117	NC_017038	A	6	6	272745	272750	100 %	0 %	0 %	0 %	383321157
5118	NC_017038	GCT	3	9	272788	272796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383321157
5119	NC_017038	TAA	2	6	272829	272834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383321157
5120	NC_017038	CGT	2	6	272872	272877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383321157
5121	NC_017038	CAA	2	6	272887	272892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383321157
5122	NC_017038	GAA	2	6	272899	272904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383321157
5123	NC_017038	TGA	2	6	272942	272947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383321157
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5132	NC_017038	TCCT	2	8	273438	273445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_017038	G	6	6	273474	273479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_017038	GGT	2	6	280013	280018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321163
5248	NC_017038	GGC	2	6	280040	280045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321163
5249	NC_017038	TGG	2	6	280087	280092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321163
5250	NC_017038	ATT	2	6	280170	280175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383321164
5251	NC_017038	CGT	2	6	280179	280184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383321164
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5255	NC_017038	GATT	2	8	280397	280404	25 %	50 %	25 %	0 %	383321164
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5262	NC_017038	CAGG	2	8	280824	280831	25 %	0 %	50 %	25 %	383321164
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5264	NC_017038	CGGG	2	8	280862	280869	0 %	0 %	75 %	25 %	383321164
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5299	NC_017038	TC	3	6	282871	282876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5324	NC_017038	GCG	2	6	284368	284373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383321168
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5334	NC_017038	CCA	2	6	284935	284940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383321169
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5340	NC_017038	CAA	2	6	285237	285242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383321170
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5351	NC_017038	AG	3	6	285802	285807	50 %	0 %	50 %	0 %	383321170
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5355	NC_017038	GGA	2	6	286130	286135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_017038	TATT	2	8	286147	286154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_017038	TTA	2	6	286156	286161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_017038	GAT	2	6	286193	286198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383321171
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5360	NC_017038	TTTTG	2	10	286295	286304	0 %	80 %	20 %	0 %	383321171
5361	NC_017038	T	6	6	286315	286320	0 %	100 %	0 %	0 %	383321171
5362	NC_017038	ACTA	2	8	286323	286330	50 %	25 %	0 %	25 %	383321171
5363	NC_017038	CAG	2	6	286337	286342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383321171
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5369	NC_017038	CCG	3	9	286678	286686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321171
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5493	NC_017038	ACCC	2	8	293309	293316	25 %	0 %	0 %	75 %	383321176
5494	NC_017038	CCG	2	6	293319	293324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383321176
5495	NC_017038	TCA	2	6	293331	293336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321176
5496	NC_017038	GTG	2	6	293358	293363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383321176
5497	NC_017038	A	7	7	293447	293453	100 %	0 %	0 %	0 %	383321176
5498	NC_017038	CAAAT	2	10	293492	293501	60 %	20 %	0 %	20 %	383321177
5499	NC_017038	AC	3	6	293517	293522	50 %	0 %	0 %	50 %	383321177
5500	NC_017038	ATC	2	6	293551	293556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383321177

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