MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	GTCC	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	386836022
2	NC_016972	GTCG	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	386836022
3	NC_016972	GCGG	2	8	1264	1271	0 %	0 %	75 %	25 %	386836022
4	NC_016972	GGCC	2	8	1285	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
5	NC_016972	CGTC	2	8	1913	1920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016972	TGAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016972	CGAG	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016972	GGCT	2	8	2472	2479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016972	TGCG	2	8	2740	2747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016972	CGCC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	25 %	75 %	386836023
11	NC_016972	CCGG	3	12	3149	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	386836023
12	NC_016972	TCCT	2	8	3307	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	386836023
13	NC_016972	CGGC	2	8	3477	3484	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
14	NC_016972	CGCC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	25 %	75 %	386836024
15	NC_016972	CCGG	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
16	NC_016972	ACCC	2	8	4172	4179	25 %	0 %	0 %	75 %	386836024
17	NC_016972	GCGG	2	8	4241	4248	0 %	0 %	75 %	25 %	386836024
18	NC_016972	CAGT	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	386836024
19	NC_016972	CCGG	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
20	NC_016972	CGGC	2	8	6362	6369	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
21	NC_016972	GTAA	2	8	6811	6818	50 %	25 %	25 %	0 %	386836026
22	NC_016972	GCCG	2	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
23	NC_016972	ACGG	2	8	7706	7713	25 %	0 %	50 %	25 %	386836027
24	NC_016972	CGGT	2	8	7800	7807	0 %	25 %	50 %	25 %	386836027
25	NC_016972	GGGT	2	8	7884	7891	0 %	25 %	75 %	0 %	386836027
26	NC_016972	CGGC	2	8	8721	8728	0 %	0 %	50 %	50 %	386836028
27	NC_016972	GGCG	2	8	8905	8912	0 %	0 %	75 %	25 %	386836028
28	NC_016972	GCGG	2	8	8945	8952	0 %	0 %	75 %	25 %	386836028
29	NC_016972	GACG	2	8	9504	9511	25 %	0 %	50 %	25 %	386836029
30	NC_016972	TGCG	2	8	10071	10078	0 %	25 %	50 %	25 %	386836029
31	NC_016972	CGGC	2	8	10836	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	386836031
32	NC_016972	CGAC	2	8	11474	11481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016972	GCTG	2	8	12225	12232	0 %	25 %	50 %	25 %	386836032
34	NC_016972	CGCC	2	8	12341	12348	0 %	0 %	25 %	75 %	386836032
35	NC_016972	GCCG	2	8	12814	12821	0 %	0 %	50 %	50 %	386836033
36	NC_016972	GCTG	2	8	13077	13084	0 %	25 %	50 %	25 %	386836033
37	NC_016972	CGGC	2	8	13739	13746	0 %	0 %	50 %	50 %	386836034
38	NC_016972	CGCC	2	8	13749	13756	0 %	0 %	25 %	75 %	386836034
39	NC_016972	CCGG	2	8	13820	13827	0 %	0 %	50 %	50 %	386836034
40	NC_016972	CGTC	2	8	13889	13896	0 %	25 %	25 %	50 %	386836034
41	NC_016972	GACG	2	8	14548	14555	25 %	0 %	50 %	25 %	386836035
42	NC_016972	CTCG	2	8	14832	14839	0 %	25 %	25 %	50 %	386836035
43	NC_016972	CCCG	2	8	15182	15189	0 %	0 %	25 %	75 %	386836036
44	NC_016972	GCCG	2	8	15256	15263	0 %	0 %	50 %	50 %	386836036
45	NC_016972	CACG	2	8	15371	15378	25 %	0 %	25 %	50 %	386836036
46	NC_016972	CCGG	2	8	16243	16250	0 %	0 %	50 %	50 %	386836036
47	NC_016972	GCGG	2	8	16373	16380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016972	GGGC	2	8	16514	16521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016972	CTGC	2	8	16548	16555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016972	CTGC	2	8	16863	16870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016972	CGGT	2	8	16998	17005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016972	CCGG	2	8	17062	17069	0 %	0 %	50 %	50 %	386836037
53	NC_016972	GCGG	2	8	17474	17481	0 %	0 %	75 %	25 %	386836037
54	NC_016972	GCCC	2	8	17626	17633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_016972	CGGC	2	8	17747	17754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016972	CGGC	2	8	18722	18729	0 %	0 %	50 %	50 %	386836039
57	NC_016972	GCTG	2	8	18805	18812	0 %	25 %	50 %	25 %	386836039
58	NC_016972	TCGC	2	8	18942	18949	0 %	25 %	25 %	50 %	386836039
59	NC_016972	GTGC	2	8	19124	19131	0 %	25 %	50 %	25 %	386836039
60	NC_016972	GGGC	2	8	19265	19272	0 %	0 %	75 %	25 %	386836039
61	NC_016972	GGCG	2	8	19348	19355	0 %	0 %	75 %	25 %	386836039
62	NC_016972	CGGC	2	8	19471	19478	0 %	0 %	50 %	50 %	386836039
63	NC_016972	CGGG	2	8	19791	19798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016972	CGGG	2	8	19846	19853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016972	TCGG	2	8	20041	20048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016972	GCCG	2	8	20276	20283	0 %	0 %	50 %	50 %	386836040
67	NC_016972	ATGG	2	8	20616	20623	25 %	25 %	50 %	0 %	386836041
68	NC_016972	AGCC	2	8	20820	20827	25 %	0 %	25 %	50 %	386836041
69	NC_016972	TCGC	2	8	21009	21016	0 %	25 %	25 %	50 %	386836042
70	NC_016972	CGGC	2	8	21531	21538	0 %	0 %	50 %	50 %	386836042
71	NC_016972	GTGG	2	8	21693	21700	0 %	25 %	75 %	0 %	386836043
72	NC_016972	GGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
73	NC_016972	GGCG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
74	NC_016972	GTGC	2	8	22031	22038	0 %	25 %	50 %	25 %	386836043
75	NC_016972	CTGC	2	8	22172	22179	0 %	25 %	25 %	50 %	386836043
76	NC_016972	CCGG	2	8	22628	22635	0 %	0 %	50 %	50 %	386836043
77	NC_016972	CGGC	2	8	22979	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
78	NC_016972	TGGG	2	8	23648	23655	0 %	25 %	75 %	0 %	386836045
79	NC_016972	CCGG	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
80	NC_016972	GAGT	2	8	24547	24554	25 %	25 %	50 %	0 %	386836045
81	NC_016972	CGGC	2	8	24825	24832	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
82	NC_016972	GGTG	2	8	24834	24841	0 %	25 %	75 %	0 %	386836045
83	NC_016972	GCCG	2	8	25505	25512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016972	ACGT	2	8	25533	25540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016972	GCGG	2	8	25666	25673	0 %	0 %	75 %	25 %	386836047
86	NC_016972	CGGG	2	8	25817	25824	0 %	0 %	75 %	25 %	386836047
87	NC_016972	CGGG	2	8	25957	25964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016972	TCCG	2	8	26343	26350	0 %	25 %	25 %	50 %	386836050
89	NC_016972	GGGC	2	8	26415	26422	0 %	0 %	75 %	25 %	386836050
90	NC_016972	CGGC	2	8	26544	26551	0 %	0 %	50 %	50 %	386836049
91	NC_016972	GGGC	2	8	26852	26859	0 %	0 %	75 %	25 %	386836051
92	NC_016972	GAAG	2	8	28603	28610	50 %	0 %	50 %	0 %	386836052
93	NC_016972	AGCG	2	8	28613	28620	25 %	0 %	50 %	25 %	386836052
94	NC_016972	GAAG	2	8	28720	28727	50 %	0 %	50 %	0 %	386836052
95	NC_016972	GACG	2	8	28987	28994	25 %	0 %	50 %	25 %	386836052
96	NC_016972	CGGC	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	386836052
97	NC_016972	AACG	2	8	29223	29230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016972	ACAG	2	8	29269	29276	50 %	0 %	25 %	25 %	386836053
99	NC_016972	CCCG	2	8	29475	29482	0 %	0 %	25 %	75 %	386836053
100	NC_016972	ACCT	2	8	29855	29862	25 %	25 %	0 %	50 %	386836053
101	NC_016972	CCGG	2	8	30618	30625	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
102	NC_016972	CCCT	2	8	30718	30725	0 %	25 %	0 %	75 %	386836053
103	NC_016972	CGGC	2	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
104	NC_016972	TGGA	2	8	31897	31904	25 %	25 %	50 %	0 %	386836054
105	NC_016972	GCCG	2	8	32324	32331	0 %	0 %	50 %	50 %	386836054
106	NC_016972	CTGA	2	8	32345	32352	25 %	25 %	25 %	25 %	386836054
107	NC_016972	GGCC	2	8	32569	32576	0 %	0 %	50 %	50 %	386836055
108	NC_016972	CGCC	2	8	32641	32648	0 %	0 %	25 %	75 %	386836055
109	NC_016972	CCGC	2	8	33116	33123	0 %	0 %	25 %	75 %	386836055
110	NC_016972	ACGG	2	8	33146	33153	25 %	0 %	50 %	25 %	386836055
111	NC_016972	CCGG	2	8	33354	33361	0 %	0 %	50 %	50 %	386836055
112	NC_016972	CGGT	2	8	33825	33832	0 %	25 %	50 %	25 %	386836056
113	NC_016972	CTGG	2	8	34008	34015	0 %	25 %	50 %	25 %	386836056
114	NC_016972	TGCT	2	8	34031	34038	0 %	50 %	25 %	25 %	386836056
115	NC_016972	GCCC	2	8	34221	34228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_016972	GGGC	2	8	34237	34244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016972	CGGT	2	8	34434	34441	0 %	25 %	50 %	25 %	386836057
118	NC_016972	TCGG	2	8	34593	34600	0 %	25 %	50 %	25 %	386836057
119	NC_016972	CGGC	2	8	34633	34640	0 %	0 %	50 %	50 %	386836057
120	NC_016972	GCGG	2	8	34697	34704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016972	GGGC	2	8	34814	34821	0 %	0 %	75 %	25 %	386836058
122	NC_016972	ACGG	2	8	35071	35078	25 %	0 %	50 %	25 %	386836058
123	NC_016972	ACGG	2	8	35086	35093	25 %	0 %	50 %	25 %	386836058
124	NC_016972	CTTC	2	8	35651	35658	0 %	50 %	0 %	50 %	386836058
125	NC_016972	CGGC	2	8	35788	35795	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
126	NC_016972	CGTC	2	8	36170	36177	0 %	25 %	25 %	50 %	386836058
127	NC_016972	GGTG	2	8	36872	36879	0 %	25 %	75 %	0 %	386836058
128	NC_016972	ACGT	2	8	37036	37043	25 %	25 %	25 %	25 %	386836058
129	NC_016972	CCGG	2	8	37233	37240	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
130	NC_016972	GCAC	2	8	37276	37283	25 %	0 %	25 %	50 %	386836058
131	NC_016972	GAGG	2	8	37482	37489	25 %	0 %	75 %	0 %	386836058
132	NC_016972	CCGG	2	8	37645	37652	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
133	NC_016972	GCCG	2	8	37965	37972	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
134	NC_016972	GCCC	2	8	38336	38343	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
135	NC_016972	GGTC	2	8	38939	38946	0 %	25 %	50 %	25 %	386836058
136	NC_016972	CTGC	2	8	39003	39010	0 %	25 %	25 %	50 %	386836058
137	NC_016972	CGCC	2	8	39152	39159	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
138	NC_016972	CCCG	2	8	39378	39385	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
139	NC_016972	TCGA	2	8	39685	39692	25 %	25 %	25 %	25 %	386836058
140	NC_016972	GCGG	2	8	40231	40238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016972	CGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016972	GGGC	2	8	41033	41040	0 %	0 %	75 %	25 %	386836059
143	NC_016972	GGGA	2	8	41065	41072	25 %	0 %	75 %	0 %	386836059
144	NC_016972	CGGG	2	8	41304	41311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.