MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 2013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016972	GC	3	6	37682	37687	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1002	NC_016972	CGA	2	6	37730	37735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1003	NC_016972	CCG	2	6	37748	37753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836058
1004	NC_016972	GGC	2	6	37784	37789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1005	NC_016972	CAT	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836058
1006	NC_016972	TCG	2	6	37852	37857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1007	NC_016972	GCA	2	6	37859	37864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1008	NC_016972	CGG	2	6	37868	37873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1009	NC_016972	GCCG	2	8	37965	37972	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1010	NC_016972	CAG	2	6	37980	37985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1011	NC_016972	GCG	2	6	38008	38013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1012	NC_016972	CCT	2	6	38063	38068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1013	NC_016972	GTC	2	6	38123	38128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1014	NC_016972	CCT	2	6	38144	38149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1015	NC_016972	GC	3	6	38206	38211	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1016	NC_016972	CTC	2	6	38217	38222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1017	NC_016972	CAC	2	6	38256	38261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836058
1018	NC_016972	CGT	2	6	38288	38293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1019	NC_016972	AGC	2	6	38308	38313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1020	NC_016972	TGG	2	6	38323	38328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836058
1021	NC_016972	GCCC	2	8	38336	38343	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
1022	NC_016972	CAG	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1023	NC_016972	CCT	2	6	38408	38413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1024	NC_016972	CGG	2	6	38417	38422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1025	NC_016972	GGCGC	2	10	38427	38436	0 %	0 %	60 %	40 %	386836058
1026	NC_016972	TCG	2	6	38494	38499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1027	NC_016972	CTC	2	6	38553	38558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1028	NC_016972	CAG	2	6	38568	38573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1029	NC_016972	CG	3	6	38579	38584	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1030	NC_016972	CGT	2	6	38591	38596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1031	NC_016972	CTT	2	6	38598	38603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836058
1032	NC_016972	GGC	2	6	38604	38609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1033	NC_016972	GC	3	6	38608	38613	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1034	NC_016972	GCG	2	6	38665	38670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1035	NC_016972	GCT	2	6	38733	38738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1036	NC_016972	CG	3	6	38777	38782	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1037	NC_016972	CCAGC	2	10	38811	38820	20 %	0 %	20 %	60 %	386836058
1038	NC_016972	CGG	2	6	38864	38869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1039	NC_016972	CTCGCG	2	12	38916	38927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836058
1040	NC_016972	GGTC	2	8	38939	38946	0 %	25 %	50 %	25 %	386836058
1041	NC_016972	CGG	2	6	38972	38977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1042	NC_016972	GTC	2	6	38997	39002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1043	NC_016972	CTGC	2	8	39003	39010	0 %	25 %	25 %	50 %	386836058
1044	NC_016972	TGC	2	6	39016	39021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1045	NC_016972	GTG	2	6	39093	39098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836058
1046	NC_016972	CGCC	2	8	39152	39159	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
1047	NC_016972	CAG	2	6	39163	39168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1048	NC_016972	GGC	2	6	39188	39193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1049	NC_016972	GCC	2	6	39205	39210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836058
1050	NC_016972	CG	3	6	39227	39232	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
1051	NC_016972	GCAGC	2	10	39251	39260	20 %	0 %	40 %	40 %	386836058
1052	NC_016972	GTA	2	6	39303	39308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836058
1053	NC_016972	CCCG	2	8	39378	39385	0 %	0 %	25 %	75 %	386836058
1054	NC_016972	TTC	2	6	39412	39417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836058
1055	NC_016972	CTC	2	6	39507	39512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836058
1056	NC_016972	CGT	2	6	39605	39610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836058
1057	NC_016972	GGC	2	6	39667	39672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836058
1058	NC_016972	TCGA	2	8	39685	39692	25 %	25 %	25 %	25 %	386836058
1059	NC_016972	GTA	2	6	39699	39704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836058
1060	NC_016972	CGGCAC	2	12	39710	39721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836058
1061	NC_016972	ACA	2	6	39767	39772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386836058
1062	NC_016972	CAA	2	6	39803	39808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386836058
1063	NC_016972	GGT	2	6	39875	39880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016972	GAT	2	6	39884	39889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016972	AG	3	6	39892	39897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016972	CTG	2	6	39916	39921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016972	TCA	2	6	39967	39972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016972	AG	3	6	40003	40008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016972	GC	3	6	40014	40019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016972	CGG	2	6	40047	40052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016972	GGC	2	6	40125	40130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016972	CGG	2	6	40163	40168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_016972	CGA	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016972	CCG	2	6	40184	40189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_016972	GCGG	2	8	40231	40238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_016972	CGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_016972	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_016972	GTC	2	6	40278	40283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016972	CCCCA	2	10	40328	40337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1080	NC_016972	TGCGC	2	10	40349	40358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_016972	CGG	2	6	40380	40385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_016972	ACG	2	6	40462	40467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016972	CGCGG	2	10	40498	40507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1084	NC_016972	ACGGCG	2	12	40550	40561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016972	CGG	2	6	40695	40700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_016972	AGA	2	6	40718	40723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836059
1087	NC_016972	GC	3	6	40736	40741	0 %	0 %	50 %	50 %	386836059
1088	NC_016972	CGG	2	6	40754	40759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836059
1089	NC_016972	GCG	3	9	40765	40773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836059
1090	NC_016972	GGC	3	9	40800	40808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836059
1091	NC_016972	GGC	2	6	40812	40817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836059
1092	NC_016972	GCCCG	2	10	40831	40840	0 %	0 %	40 %	60 %	386836059
1093	NC_016972	CGA	2	6	40882	40887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836059
1094	NC_016972	GTT	2	6	40902	40907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386836059
1095	NC_016972	CAG	2	6	40923	40928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836059
1096	NC_016972	CGG	2	6	40950	40955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836059
1097	NC_016972	TCG	2	6	40957	40962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836059
1098	NC_016972	ACC	2	6	40975	40980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836059
1099	NC_016972	GGGC	2	8	41033	41040	0 %	0 %	75 %	25 %	386836059
1100	NC_016972	GGGA	2	8	41065	41072	25 %	0 %	75 %	0 %	386836059
1101	NC_016972	CCG	2	6	41110	41115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836059
1102	NC_016972	CCA	3	9	41118	41126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836059
1103	NC_016972	GCCGC	2	10	41139	41148	0 %	0 %	40 %	60 %	386836059
1104	NC_016972	CGG	2	6	41225	41230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016972	CGC	2	6	41243	41248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_016972	GGTCGA	2	12	41258	41269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1107	NC_016972	CGGG	2	8	41304	41311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_016972	CCGG	2	8	41344	41351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_016972	ACGGGG	2	12	41389	41400	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836060
1110	NC_016972	CGGGG	2	10	41471	41480	0 %	0 %	80 %	20 %	386836060
1111	NC_016972	CG	3	6	41528	41533	0 %	0 %	50 %	50 %	386836060
1112	NC_016972	TCCCCG	2	12	41540	41551	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386836060
1113	NC_016972	CGGG	2	8	41584	41591	0 %	0 %	75 %	25 %	386836060
1114	NC_016972	CGG	2	6	41599	41604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836060
1115	NC_016972	CTC	3	9	41618	41626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836060
1116	NC_016972	GTC	3	9	41633	41641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836060
1117	NC_016972	TCC	2	6	41648	41653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836060
1118	NC_016972	GGC	2	6	41657	41662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836060
1119	NC_016972	CGG	2	6	41668	41673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836060
1120	NC_016972	TCG	2	6	41727	41732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836060
1121	NC_016972	GTC	4	12	41756	41767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836060
1122	NC_016972	GCG	2	6	41789	41794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836060
1123	NC_016972	CCT	2	6	41824	41829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836060
1124	NC_016972	CGG	2	6	41876	41881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836060
1125	NC_016972	CA	3	6	41894	41899	50 %	0 %	0 %	50 %	386836061
1126	NC_016972	GGGC	2	8	41921	41928	0 %	0 %	75 %	25 %	386836061
1127	NC_016972	GTG	2	6	41987	41992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836061
1128	NC_016972	TCC	2	6	42071	42076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836061
1129	NC_016972	GCGA	2	8	42146	42153	25 %	0 %	50 %	25 %	386836061
1130	NC_016972	GCT	2	6	42162	42167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836061
1131	NC_016972	CGCT	2	8	42168	42175	0 %	25 %	25 %	50 %	386836061
1132	NC_016972	CTCG	2	8	42206	42213	0 %	25 %	25 %	50 %	386836062
1133	NC_016972	TCC	2	6	42220	42225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836062
1134	NC_016972	GCA	2	6	42227	42232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836062
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1250	NC_016972	CGA	2	6	45458	45463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836068
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