MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 2013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016972	GTG	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
502	NC_016972	GGT	2	6	20266	20271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
503	NC_016972	GCCG	2	8	20276	20283	0 %	0 %	50 %	50 %	386836040
504	NC_016972	CTG	2	6	20312	20317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836040
505	NC_016972	GGT	2	6	20339	20344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
506	NC_016972	TCC	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836040
507	NC_016972	CCT	3	9	20425	20433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836040
508	NC_016972	GTC	3	9	20526	20534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
509	NC_016972	CGG	2	6	20538	20543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836041
510	NC_016972	GCCGG	2	10	20545	20554	0 %	0 %	60 %	40 %	386836041
511	NC_016972	TCG	2	6	20563	20568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
512	NC_016972	ATGG	2	8	20616	20623	25 %	25 %	50 %	0 %	386836041
513	NC_016972	GGC	2	6	20629	20634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836041
514	NC_016972	GTC	2	6	20754	20759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
515	NC_016972	AGCC	2	8	20820	20827	25 %	0 %	25 %	50 %	386836041
516	NC_016972	CAC	2	6	20886	20891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836041
517	NC_016972	TTC	2	6	20897	20902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836042
518	NC_016972	CGG	3	9	20908	20916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
519	NC_016972	CGG	2	6	20941	20946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
520	NC_016972	GCG	2	6	20958	20963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
521	NC_016972	TCG	2	6	20973	20978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
522	NC_016972	TCGC	2	8	21009	21016	0 %	25 %	25 %	50 %	386836042
523	NC_016972	CGGTG	2	10	21067	21076	0 %	20 %	60 %	20 %	386836042
524	NC_016972	GCT	2	6	21172	21177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
525	NC_016972	CGG	2	6	21189	21194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
526	NC_016972	CGC	2	6	21196	21201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836042
527	NC_016972	CAG	2	6	21251	21256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836042
528	NC_016972	GGC	2	6	21284	21289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
529	NC_016972	CAG	2	6	21296	21301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836042
530	NC_016972	CGG	2	6	21316	21321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
531	NC_016972	GGT	2	6	21335	21340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836042
532	NC_016972	TGC	2	6	21354	21359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
533	NC_016972	GGC	2	6	21362	21367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
534	NC_016972	CGC	2	6	21380	21385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836042
535	NC_016972	GGC	2	6	21395	21400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
536	NC_016972	GCT	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
537	NC_016972	GGT	2	6	21482	21487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836042
538	NC_016972	CGGC	2	8	21531	21538	0 %	0 %	50 %	50 %	386836042
539	NC_016972	CGG	2	6	21548	21553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
540	NC_016972	CATCTC	2	12	21654	21665	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386836043
541	NC_016972	TGC	2	6	21667	21672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836043
542	NC_016972	GTGG	2	8	21693	21700	0 %	25 %	75 %	0 %	386836043
543	NC_016972	GGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
544	NC_016972	TGG	2	6	21766	21771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836043
545	NC_016972	GGCG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
546	NC_016972	GCG	2	6	21889	21894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
547	NC_016972	GCA	2	6	21899	21904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836043
548	NC_016972	GGC	2	6	21921	21926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
549	NC_016972	GCC	2	6	21930	21935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836043
550	NC_016972	GTGC	2	8	22031	22038	0 %	25 %	50 %	25 %	386836043
551	NC_016972	TCG	2	6	22042	22047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836043
552	NC_016972	GAC	2	6	22068	22073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836043
553	NC_016972	CTGC	2	8	22172	22179	0 %	25 %	25 %	50 %	386836043
554	NC_016972	CGG	2	6	22211	22216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
555	NC_016972	GCC	2	6	22267	22272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836043
556	NC_016972	GGC	2	6	22278	22283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
557	NC_016972	CTGTC	2	10	22302	22311	0 %	40 %	20 %	40 %	386836043
558	NC_016972	GCT	2	6	22376	22381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836043
559	NC_016972	CCG	2	6	22429	22434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836043
560	NC_016972	CGG	2	6	22553	22558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
561	NC_016972	GCG	2	6	22618	22623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
562	NC_016972	CCGG	2	8	22628	22635	0 %	0 %	50 %	50 %	386836043
563	NC_016972	CGG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
564	NC_016972	GCA	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836043
565	NC_016972	AGC	2	6	22702	22707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836043
566	NC_016972	TCC	2	6	22711	22716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836043
567	NC_016972	CCG	2	6	22747	22752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836044
568	NC_016972	GCG	2	6	22764	22769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836044
569	NC_016972	CG	4	8	22774	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
570	NC_016972	CAG	2	6	22806	22811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836044
571	NC_016972	CG	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
572	NC_016972	CGA	2	6	22891	22896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836044
573	NC_016972	CCT	2	6	22897	22902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836044
574	NC_016972	CGGC	2	8	22979	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
575	NC_016972	CAC	2	6	23039	23044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836044
576	NC_016972	GGT	2	6	23045	23050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836044
577	NC_016972	CCGGCC	2	12	23055	23066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836044
578	NC_016972	GCT	2	6	23080	23085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836044
579	NC_016972	CCG	2	6	23130	23135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836044
580	NC_016972	GCC	2	6	23168	23173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
581	NC_016972	GCC	2	6	23345	23350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
582	NC_016972	ATC	2	6	23351	23356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836045
583	NC_016972	AGC	2	6	23414	23419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
584	NC_016972	GTGAG	2	10	23433	23442	20 %	20 %	60 %	0 %	386836045
585	NC_016972	TGC	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836045
586	NC_016972	CGG	2	6	23514	23519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
587	NC_016972	CCG	2	6	23529	23534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
588	NC_016972	TTC	2	6	23591	23596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836045
589	NC_016972	GGA	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836045
590	NC_016972	TGGG	2	8	23648	23655	0 %	25 %	75 %	0 %	386836045
591	NC_016972	CG	4	8	23673	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
592	NC_016972	GCG	2	6	23726	23731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
593	NC_016972	GAC	2	6	23752	23757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
594	NC_016972	CTG	2	6	23785	23790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836045
595	NC_016972	GCG	3	9	23881	23889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
596	NC_016972	CG	3	6	23899	23904	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
597	NC_016972	CGA	2	6	23911	23916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
598	NC_016972	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
599	NC_016972	CGA	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
600	NC_016972	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
601	NC_016972	GAC	2	6	24028	24033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
602	NC_016972	CGG	2	6	24038	24043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
603	NC_016972	CCGG	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
604	NC_016972	CGA	2	6	24201	24206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
605	NC_016972	GAA	2	6	24244	24249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836045
606	NC_016972	CCA	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836045
607	NC_016972	GGC	2	6	24342	24347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
608	NC_016972	GTG	2	6	24380	24385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836045
609	NC_016972	GTG	2	6	24409	24414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836045
610	NC_016972	GGC	2	6	24418	24423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
611	NC_016972	TCC	2	6	24494	24499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836045
612	NC_016972	GAGT	2	8	24547	24554	25 %	25 %	50 %	0 %	386836045
613	NC_016972	GCC	2	6	24575	24580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
614	NC_016972	AGG	2	6	24581	24586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836045
615	NC_016972	GCG	2	6	24590	24595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
616	NC_016972	CGA	2	6	24636	24641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
617	NC_016972	GGT	2	6	24669	24674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836045
618	NC_016972	GTG	2	6	24725	24730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836045
619	NC_016972	CCG	2	6	24761	24766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
620	NC_016972	TCG	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836045
621	NC_016972	CGGC	2	8	24825	24832	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
622	NC_016972	GGTG	2	8	24834	24841	0 %	25 %	75 %	0 %	386836045
623	NC_016972	CTG	2	6	24857	24862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836045
624	NC_016972	CCT	2	6	24884	24889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836046
625	NC_016972	CGT	2	6	24914	24919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836046
626	NC_016972	G	6	6	24955	24960	0 %	0 %	100 %	0 %	386836046
627	NC_016972	GGGCAG	2	12	24996	25007	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836046
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753	NC_016972	TCGAC	2	10	29379	29388	20 %	20 %	20 %	40 %	386836053
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756	NC_016972	CGC	2	6	29539	29544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836053
757	NC_016972	GAC	3	9	29548	29556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836053
758	NC_016972	GACGCC	2	12	29561	29572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836053
759	NC_016972	GCT	2	6	29578	29583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836053
760	NC_016972	CGT	2	6	29590	29595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836053
761	NC_016972	AGC	3	9	29631	29639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836053
762	NC_016972	GCT	2	6	29641	29646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836053
763	NC_016972	CTGAAG	2	12	29687	29698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386836053
764	NC_016972	AAG	2	6	29783	29788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836053
765	NC_016972	TGC	2	6	29796	29801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836053
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767	NC_016972	CGCCC	2	10	29926	29935	0 %	0 %	20 %	80 %	386836053
768	NC_016972	ATC	2	6	29969	29974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836053
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770	NC_016972	GC	3	6	30040	30045	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
771	NC_016972	CGG	2	6	30085	30090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836053
772	NC_016972	GCT	2	6	30126	30131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836053
773	NC_016972	GCGCC	2	10	30163	30172	0 %	0 %	40 %	60 %	386836053
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780	NC_016972	CAG	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836053
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785	NC_016972	GGC	2	6	30626	30631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836053
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789	NC_016972	CCCT	2	8	30718	30725	0 %	25 %	0 %	75 %	386836053
790	NC_016972	CGA	2	6	30739	30744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836053
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830	NC_016972	GGA	2	6	32229	32234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836054
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836	NC_016972	GCA	2	6	32359	32364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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842	NC_016972	TCC	2	6	32595	32600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836055
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857	NC_016972	CTCCGA	2	12	33068	33079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386836055
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866	NC_016972	CGG	2	6	33370	33375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836055
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869	NC_016972	GCGCT	2	10	33450	33459	0 %	20 %	40 %	40 %	386836055
870	NC_016972	CGG	2	6	33491	33496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836056
871	NC_016972	CCT	2	6	33498	33503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836056
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879	NC_016972	CGA	2	6	33682	33687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836056
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882	NC_016972	GCT	2	6	33757	33762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836056
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