MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	TA	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	379793807
2	NC_016942	TC	3	6	757	762	0 %	50 %	0 %	50 %	379793807
3	NC_016942	AT	3	6	773	778	50 %	50 %	0 %	0 %	379793807
4	NC_016942	TA	3	6	1401	1406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016942	AT	3	6	2193	2198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016942	TA	3	6	2718	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016942	TC	3	6	2878	2883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016942	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016942	CT	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	379793808
10	NC_016942	TA	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	379793808
11	NC_016942	AC	3	6	3156	3161	50 %	0 %	0 %	50 %	379793808
12	NC_016942	TA	3	6	3416	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	379793809
13	NC_016942	CT	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	379793809
14	NC_016942	AT	3	6	4349	4354	50 %	50 %	0 %	0 %	379793810
15	NC_016942	TA	3	6	6098	6103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016942	TA	3	6	6121	6126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016942	AG	3	6	6812	6817	50 %	0 %	50 %	0 %	379793812
18	NC_016942	AT	3	6	7000	7005	50 %	50 %	0 %	0 %	379793812
19	NC_016942	TA	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016942	TA	3	6	7457	7462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016942	TC	3	6	7778	7783	0 %	50 %	0 %	50 %	379793814
22	NC_016942	AG	3	6	8210	8215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016942	TA	3	6	8969	8974	50 %	50 %	0 %	0 %	379793815
24	NC_016942	AC	3	6	11255	11260	50 %	0 %	0 %	50 %	379793817
25	NC_016942	GT	3	6	11427	11432	0 %	50 %	50 %	0 %	379793817
26	NC_016942	AT	3	6	12054	12059	50 %	50 %	0 %	0 %	379793817
27	NC_016942	AT	3	6	12775	12780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016942	AG	3	6	14140	14145	50 %	0 %	50 %	0 %	379793818
29	NC_016942	TA	3	6	14146	14151	50 %	50 %	0 %	0 %	379793818
30	NC_016942	CT	3	6	14190	14195	0 %	50 %	0 %	50 %	379793818
31	NC_016942	TA	3	6	14752	14757	50 %	50 %	0 %	0 %	379793819
32	NC_016942	AT	3	6	14876	14881	50 %	50 %	0 %	0 %	379793819
33	NC_016942	TC	3	6	15043	15048	0 %	50 %	0 %	50 %	379793819
34	NC_016942	TA	5	10	15079	15088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016942	CT	3	6	15183	15188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016942	AC	3	6	15458	15463	50 %	0 %	0 %	50 %	379793820
37	NC_016942	TC	3	6	15840	15845	0 %	50 %	0 %	50 %	379793820
38	NC_016942	CT	3	6	15955	15960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016942	AT	3	6	18153	18158	50 %	50 %	0 %	0 %	379793823
40	NC_016942	AT	3	6	18398	18403	50 %	50 %	0 %	0 %	379793823
41	NC_016942	TA	3	6	19053	19058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016942	TA	3	6	20088	20093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016942	AT	3	6	20212	20217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016942	TG	3	6	20244	20249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016942	AT	3	6	20632	20637	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
46	NC_016942	TA	3	6	21199	21204	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
47	NC_016942	AT	3	6	21386	21391	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
48	NC_016942	AT	3	6	21591	21596	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
49	NC_016942	AT	3	6	21884	21889	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
50	NC_016942	TA	3	6	22116	22121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016942	CT	3	6	22320	22325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016942	GA	3	6	22342	22347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016942	TA	3	6	22417	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016942	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016942	TC	3	6	22632	22637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016942	AT	3	6	23217	23222	50 %	50 %	0 %	0 %	379793826
57	NC_016942	TA	3	6	23441	23446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016942	TC	3	6	23967	23972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016942	TA	3	6	24197	24202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016942	AT	4	8	24264	24271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.